Tan0019671 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAATCTCTTTCTCTCTCTTCTGCAACTATTTCATCATCTCCACAAGCTTCTAAAGATAAAGAAAAGAATTAATGGAAAGCAAGAATTAATTCTTAGGTGTGATTAATCTTATACTCCTCCTTCAATCCCATGGACATGATTATTATTATTATTATGATCACACAAAAAACCCTCATCTTCTTTTTCTTAATGGCTCTCTCCTTTTTTCTTCCTTCAAACAAAACCCTCTTTCATGGCTCCTCAAATTAACCACCTTTCTTCACCTAATTCCTTCAATCTATGGCTACTTCTCATCACAAAAACCTCGCCCTAATCCACGATTCGACAACGGTCCAACCGCTCGGGTTTCCGGGTCACCGGATATGACAATGGTTCCTGCCCAAAACCACCTGATCTCCAAACACCATCCTTGCGGCGGCGGTTATGTTGGTGCCTGCGGCGGCGACCATCTCATCAGTGGTGGTGGTCCATTTATTTGTGATCAGTTTTTTTATTATTATTATTCTTCGTTAGGATCTGATCCTTATCTAATTGCTCTTGATCCTCCCATGGCGGAAGATGATTCCACAACTAACAGTCTTAATGAAGAAGCCCCCTCTAATATAGATGATGGGTGGCTTCAATTGAGTATCGGTGGCGGCGGTAGCGGCGGTGGAGGAAAATATGATCAACGAGGGTTGATGAGACCTCGAAGAACCTCCAGTTTGGTGGAGCTAGATCTATTACCCGGCGGCGCCGCCACCGGAATCCGGGATATTCCGGCAAATTCTAGGTGGGTTTCGGATTTCTTGAGTCCTGAAGCTGCCATGGCAGCTCGGACCGGGACGGGAACGGGGACGGGGACGCCGTTATTTTTTAGAGCTTCTAGTTCATCCAACTTTGTACAGCAAGAGATTAATTGGGCATTTAGGCCGATGACCGGAGTCGGCGTGCCTCAGGTCCCGTCTTCATCCTCCCCGTCGACGTCGGCGGCGTCGTCTTCTTCTTTTCTACCGGTTGGTGGTCGGCGGAGTTCTTATGTGGGTCGGCCATTTATCCAATTCCAGAGCTCCAGGGTGGATGCCGTCGCGGCCGGGCCAAGCTCCGACGTCAGAATTATAAATCCTCCCCGCCGGCCCCATTCTGGTATTTGGTTTACATTAAAAGCCTTAGAAAATCAGTAAGTAGAAAAAATTAAAAAAAATTAAAAAAAAAAATTATTTCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTCTTCTTAATTACAAATCTAAATCAAATTGTTGTCTAAAGCTTTGAATTTTTTGGGTTTGTTAATGCAGAGCAAAACAGCCATTCTTGCCTCAGATATCAAAAAACTATCTGAGAATCAAGTGAGATTTTCTCTCTCTAATTAACCTAATTAAATTGCTCTTTTTTATTTTATTTTTCTTCCCTTTGACTTTATTATTTCTCTCTCTTCCCTTTTACTTTCTCTCTTTTTTCTAATTTTGATTGAACTTTTAAAGTAGAAAGCACATAAGAATGCTGAAACTTTTTGGATCATCGTCTTTTTTTTTTTTCCCATATGACTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTCTTTTGAATCTATAGGGATGAAATGATGACAGTTCGTTTGGTTATGAAGTATTTGGTTAATAAGCTGCATCTGGATAGCGAATCAGAGGTATTTATAACACAATAATCTTCTTTTATTTCTCTTCATCATCATTTGCCAAATTTCATTATATATTACATATCAACATTTTAAGCTTTTATAATTAGATTTAATCAGAATAAGAAAGAAGAAGATAGAAATGGCTGATATTTTAGGAATGGAAAACTAAGAGTAATTAAGTCGGGTTTGATATTTTTTTTTCTTTTTTGAAAATTGTGCTTGTTTTCTCGTTATTTCTCTACAATGAATTTAACTTCATCTTTCTTAAGAAAATATCTGAATTGATGGCCAAATTCTAAAATAAAAACAAATTTAAAAACTTGACTTGATTTTTGAAAACATATGTAAAAAGATGATATTGAAACCAGTAAACCATGGGTGGAATTAGCATCTATGAGTTTAGTTTTCAAAAACTAAAAATAAAATACTAAAGGGTTATCAAACGAGCCTAAATTAATTATTTAGTGGTAAATTATATTTGCATTTAAAGGTATTGTTTGGATTTATGGTTTGGTGTTACTAACCTGATGGAAACATCAAAACTAAAGTAGGGTTTTTGTAGGCTTGTAGTGAGGTTAATTAATTAATAACCCATCCTTCATTTTTTTTGTATTGTTACACTAAATATCTTTATATATATATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTACAAAAACTAACTTTTTAGTGGTTAATTAAGGTGGCTAGTTATTAAGACTTGAACAAATTGCTAATTATATATATTTCTAGTTTGCAGATTTTGTTATCATACCCTTGTGTGTGTGTGTTTTTTTAAAAAAATAATGTTCTGTAATTTGCAAGATTTACAAATCATATATATATTTCTTAAGAACTAATTTTGAAATCCAGGAGTATGATAATTTTCTGATTTTACAAAAATAGTAAAAGTTTGTGTGGTAGTTCATAATTATGTATTATGAGTGCCTTAGAGAGAGATAATTATTAATTTAGGGTTAAGTTAAGAGATAAAAAAAAAATATTCTTTTCTTTCTCTCTCCTTTTTATTTTGAAAAAACAGGTGTTAAATCCCATACGAAATTATAGACAACATATTTGGAAAGATTAAATTTACTCTAAGGAAATTATAATTTAGAAACCATCAGATTTTATGTGTTGTATCCATCACTAGTGGATTCAAATGAAAGTCATTAGCAAACAATTAATTAATATGAGTAATTTGTAAAGAAAACAACTTACCAACTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTTTTTGAATTAAAAACCTTAAAAATAATGAAGATTAATGGAGGAACCAAAGGCAAAGACAATGTTTATTATCAAATAATTAGACAAAAATCTGCATCTCCCGTAGAACAGGAGAATTAAATATTAACAAGACTTTAGCTTTAAGACTGCTAGCTAGCTTGTCTCTTTTAATGTGTATTGCTTTTAAGGTTTCCATGTTTTTTTTCTTGTTTTTTTAGCATTTCTTGGACCAAAAGACTTGTGTTCCAATAGTCTATAAACATGAAACTAACTTAAATTGTTAATATAGTTTCAATTTTTTAAATGTTTTTTTTAGTTAGGATAAATCTAATAGTTTGATTTATCATTAATATTTATGAGTTAAGAAAAACAGAATGTTTTATATAGAATGCTTGACTCTCTCTTGTTTTAATATTACATGAAATTATTAATAATTTTAAACTTATTAGGGTCATCCTATTTCACAATTATCTCTTTTATGTTTTCTGTTTTCTTTTCTATTCTCAAGACTGATGTTTGTTCAACCAACAATGCCTTTTTTTTAGTTCTCCTTTTTCAAAATGTCAATTTTGAAATCTTAATAAAATTTTGAAAATTACCCTTTTATTTTTTTAAAATTAACAATAATCTTATTAATGCTTTAGAAAATGATCACAAAATACCAAAAATTAATAATAAATTAAGATAACTCTTTAAAACCTATGAAACCAAATGAAAACAGACCCAAAGTTTTTGAAGTAAATTAAATCATGTAATTGAAAAAGGAAGGAAAAAAAAAGGAAACTTCATATTTTTTTGGTAGCTTGTCATATGTCATATGTAGATGAGTTTCTATATATTTTAATATTAATATTTCTTTTGTACTATTTATACTAGGAATGATAGATTATCAAATATAAGATATATGATAGTTTACCATTATGTCACTTTTTTAAAATAAAATCTTTTAAATGAGTCTGAATATAGAAATTCCAATTTGTGTGTTTTTTTACAAATTTCTTTAAAAGAAAGGAAAATAGAAACCTTGAGGATGTGTGTGTACATATATACATACCTAAATTAGAGAGAATTAAATGCATTTAACAAATGAAGGTGAAAGTACACATAACAATTTAATAGACTATGATTGCTGAAATGTTTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTATGATTGCTTGCATTATAAAAAGTGTTGGTTAACATGGATGAATTAATAACTAAAATTATTCATAGTAATAATATAGATATGTAAATTGATAAAAGCATTTCTTTTCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTGGAAAGTGATAAAAGCATTTCTAACGCTTATCATTATGCTTTTCAAGCTCATGTAATATCAATAGTTCTTCAGTCTTCACTAACTTATATAATATATAATAGCACATAAATTATATAATATTCTAGAATTTATGAACCTGTTTATTCTCAATTTTCAAATTTTGTAAACTTTATCTATCTATCTATATGTTTCCAAAAATATAATAAAAAATATGTACAAATTAATAAGTTTACTTTTTTATAAGAAAACTAGAAATGAATATACTATGAAATAAACCCTTAATTAGAGAGTACTATTTAGTTTAGCTTTTTTTTAATAAGCAAATTAGACCCATTATCTTAAAACATTTTTGAATGCCTTTGAATTTTGAGAGAGGCAATTAAATTTTACTATTTAATTTTTAAAGGAAATTAAACTTTACTATTTGTTAGGGAAAAAAAATTACTATTACTTTTAATAGATTGGTGAATTTGGTGCACACATATTTACTCTGTTGAAAATAGGGTAAAAGCTTAGATTTCAATAAACATAGATTTTTTAAAATTCATAAATCAGGTTTTTTTAAGAACATAAGAGTGTTATTATGTAATTATCTTTATTTATTTCTTATCGTTATAGGTATTTTAATCTCTTTTTTTTTTTATAGATTAAATATTTTACTTATTGGAGATAGAATTTCGAGAAATCAAATTGCTAGTTAATTTTCATCTTATTATACAATAAAGAACATAGATCTTGGTCAGTTTATAGATTATTTTACTATTTTCAGTAATTAAATTATAAAATTAAAAAATTAAAAAGAGGTG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CAATCTCTTTCTCTCTCTTCTGCAACTATTTCATCATCTCCACAAGCTTCTAAAGATAAAGAAAAGAATTAATGGAAAGCAAGAATTAATTCTTAGGTGTGATTAATCTTATACTCCTCCTTCAATCCCATGGACATGATTATTATTATTATTATGATCACACAAAAAACCCTCATCTTCTTTTTCTTAATGGCTCTCTCCTTTTTTCTTCCTTCAAACAAAACCCTCTTTCATGGCTCCTCAAATTAACCACCTTTCTTCACCTAATTCCTTCAATCTATGGCTACTTCTCATCACAAAAACCTCGCCCTAATCCACGATTCGACAACGGTCCAACCGCTCGGGTTTCCGGGTCACCGGATATGACAATGGTTCCTGCCCAAAACCACCTGATCTCCAAACACCATCCTTGCGGCGGCGGTTATGTTGGTGCCTGCGGCGGCGACCATCTCATCAGTGGTGGTGGTCCATTTATTTGTGATCAGTTTTTTTATTATTATTATTCTTCGTTAGGATCTGATCCTTATCTAATTGCTCTTGATCCTCCCATGGCGGAAGATGATTCCACAACTAACAGTCTTAATGAAGAAGCCCCCTCTAATATAGATGATGGGTGGCTTCAATTGAGTATCGGTGGCGGCGGTAGCGGCGGTGGAGGAAAATATGATCAACGAGGGTTGATGAGACCTCGAAGAACCTCCAGTTTGGTGGAGCTAGATCTATTACCCGGCGGCGCCGCCACCGGAATCCGGGATATTCCGGCAAATTCTAGGTGGGTTTCGGATTTCTTGAGTCCTGAAGCTGCCATGGCAGCTCGGACCGGGACGGGAACGGGGACGGGGACGCCGTTATTTTTTAGAGCTTCTAGTTCATCCAACTTTGTACAGCAAGAGATTAATTGGGCATTTAGGCCGATGACCGGAGTCGGCGTGCCTCAGGTCCCGTCTTCATCCTCCCCGTCGACGTCGGCGGCGTCGTCTTCTTCTTTTCTACCGGTTGGTGGTCGGCGGAGTTCTTATGTGGGTCGGCCATTTATCCAATTCCAGAGCTCCAGGGTGGATGCCGTCGCGGCCGGGCCAAGCTCCGACGTCAGAATTATAAATCCTCCCCGCCGGCCCCATTCTGGTATTTGGTTTACATTAAAAGCCTTAGAAAATCAAGCAAAACAGCCATTCTTGCCTCAGATATCAAAAAACTATCTGAGAATCAAGGATGAAATGATGACAGTTCGTTTGGTTATGAAGTATTTGGTTAATAAGCTGCATCTGGATAGCGAATCAGAGATAGAGATAAGATGTAGAGGGCAAGAAGTGCTTCCATTTTGGACATTGCAGCATGTGAGAGATAACATTTGGGCAACTTCTTCATCAGAATCACTTTTCACTTTGCTTCCTGACTCCTCAACCACACATCACCTAATGCTCCTTCACTATGGAAGGAAGGATTAATTATTAATTAATTAATGTCCTTCTCTAATTAATTATTTTTTTATTTATTTTCCCATATTATTTATTTTTCTTTTCTTTTTTAATGTTTTGCTCCCCCAAGTCCCTTTTGTGCTACTCCCTTATTTGCTATATCATTTCAACTTTCCTTGTTTTC ATGACAATGGTTCCTGCCCAAAACCACCTGATCTCCAAACACCATCCTTGCGGCGGCGGTTATGTTGGTGCCTGCGGCGGCGACCATCTCATCAGTGGTGGTGGTCCATTTATTTGTGATCAGTTTTTTTATTATTATTATTCTTCGTTAGGATCTGATCCTTATCTAATTGCTCTTGATCCTCCCATGGCGGAAGATGATTCCACAACTAACAGTCTTAATGAAGAAGCCCCCTCTAATATAGATGATGGGTGGCTTCAATTGAGTATCGGTGGCGGCGGTAGCGGCGGTGGAGGAAAATATGATCAACGAGGGTTGATGAGACCTCGAAGAACCTCCAGTTTGGTGGAGCTAGATCTATTACCCGGCGGCGCCGCCACCGGAATCCGGGATATTCCGGCAAATTCTAGGTGGGTTTCGGATTTCTTGAGTCCTGAAGCTGCCATGGCAGCTCGGACCGGGACGGGAACGGGGACGGGGACGCCGTTATTTTTTAGAGCTTCTAGTTCATCCAACTTTGTACAGCAAGAGATTAATTGGGCATTTAGGCCGATGACCGGAGTCGGCGTGCCTCAGGTCCCGTCTTCATCCTCCCCGTCGACGTCGGCGGCGTCGTCTTCTTCTTTTCTACCGGTTGGTGGTCGGCGGAGTTCTTATGTGGGTCGGCCATTTATCCAATTCCAGAGCTCCAGGGTGGATGCCGTCGCGGCCGGGCCAAGCTCCGACGTCAGAATTATAAATCCTCCCCGCCGGCCCCATTCTGGTATTTGGTTTACATTAAAAGCCTTAGAAAATCAAGCAAAACAGCCATTCTTGCCTCAGATATCAAAAAACTATCTGAGAATCAAGGATGAAATGATGACAGTTCGTTTGGTTATGAAGTATTTGGTTAATAAGCTGCATCTGGATAGCGAATCAGAGATAGAGATAAGATGTAGAGGGCAAGAAGTGCTTCCATTTTGGACATTGCAGCATGTGAGAGATAACATTTGGGCAACTTCTTCATCAGAATCACTTTTCACTTTGCTTCCTGACTCCTCAACCACACATCACCTAATGCTCCTTCACTATGGAAGGAAGGATTAA MTMVPAQNHLISKHHPCGGGYVGACGGDHLISGGGPFICDQFFYYYYSSLGSDPYLIALDPPMAEDDSTTNSLNEEAPSNIDDGWLQLSIGGGGSGGGGKYDQRGLMRPRRTSSLVELDLLPGGAATGIRDIPANSRWVSDFLSPEAAMAARTGTGTGTGTPLFFRASSSSNFVQQEINWAFRPMTGVGVPQVPSSSSPSTSAASSSSFLPVGGRRSSYVGRPFIQFQSSRVDAVAAGPSSDVRIINPPRRPHSGIWFTLKALENQAKQPFLPQISKNYLRIKDEMMTVRLVMKYLVNKLHLDSESEIEIRCRGQEVLPFWTLQHVRDNIWATSSSESLFTLLPDSSTTHHLMLLHYGRKD Homology
BLAST of Tan0019671 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G3XKQ9 (Protein LAX PANICLE 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=LAX2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 124.0 bits (310), Expect = 3.4e-27 Identity = 105/336 (31.25%), Postives = 151/336 (44.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M9Y4 (E3 ubiquitin protein ligase DRIP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DRIP1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 85.5 bits (210), Expect = 1.3e-15 Identity = 47/110 (42.73%), Postives = 64/110 (58.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94AY3 (E3 ubiquitin protein ligase DRIP2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DRIP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 7.4e-14 Identity = 44/110 (40.00%), Postives = 59/110 (53.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LS86 (Probable E3 ubiquitin protein ligase DRIPH OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g23060 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 6.1e-08 Identity = 50/173 (28.90%), Postives = 82/173 (47.40%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. NCBI nr
Match: XP_038880904.1 (uncharacterized protein LOC120072580 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 491.9 bits (1265), Expect = 4.8e-135 Identity = 269/369 (72.90%), Postives = 293/369 (79.40%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. NCBI nr
Match: XP_004152316.2 (uncharacterized protein LOC101223230 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 480.7 bits (1236), Expect = 1.1e-131 Identity = 265/371 (71.43%), Postives = 288/371 (77.63%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. NCBI nr
Match: XP_022972063.1 (protein LAX PANICLE 2-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 451.8 bits (1161), Expect = 5.4e-123 Identity = 247/362 (68.23%), Postives = 270/362 (74.59%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. NCBI nr
Match: XP_022932677.1 (uncharacterized protein LOC111439151 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 422.2 bits (1084), Expect = 4.6e-114 Identity = 236/363 (65.01%), Postives = 261/363 (71.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. NCBI nr
Match: KAG6597691.1 (Protein LAX PANICLE 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 413.7 bits (1062), Expect = 1.6e-111 Identity = 236/368 (64.13%), Postives = 263/368 (71.47%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I8S9 (protein LAX PANICLE 2-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470706 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 451.8 bits (1161), Expect = 2.6e-123 Identity = 247/362 (68.23%), Postives = 270/362 (74.59%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EXF4 (uncharacterized protein LOC111439151 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439151 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 422.2 bits (1084), Expect = 2.2e-114 Identity = 236/363 (65.01%), Postives = 261/363 (71.90%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BXD1 (uncharacterized protein LOC103494623 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494623 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 2.0e-107 Identity = 213/288 (73.96%), Postives = 230/288 (79.86%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KYQ8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G008840 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 391.7 bits (1005), Expect = 3.2e-105 Identity = 224/320 (70.00%), Postives = 242/320 (75.62%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GX93 (uncharacterized protein LOC111457668 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457668 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 1.4e-84 Identity = 201/363 (55.37%), Postives = 235/363 (64.74%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. TAIR 10
Match: AT5G13250.1 (RING finger protein ) HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 4.9e-45 Identity = 130/311 (41.80%), Postives = 174/311 (55.95%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. TAIR 10
Match: AT1G28080.1 (RING finger protein ) HSP 1 Score: 110.5 bits (275), Expect = 2.8e-24 Identity = 50/83 (60.24%), Postives = 68/83 (81.93%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. TAIR 10
Match: AT1G06770.1 (DREB2A-interacting protein 1 ) HSP 1 Score: 85.5 bits (210), Expect = 9.6e-17 Identity = 47/110 (42.73%), Postives = 64/110 (58.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. TAIR 10
Match: AT1G06770.2 (DREB2A-interacting protein 1 ) HSP 1 Score: 85.5 bits (210), Expect = 9.6e-17 Identity = 47/110 (42.73%), Postives = 64/110 (58.18%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0019671 vs. TAIR 10
Match: AT2G30580.1 (DREB2A-interacting protein 2 ) HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 5.2e-15 Identity = 44/110 (40.00%), Postives = 59/110 (53.64%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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