
Tan0015455 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATACAATGGACATGCAATCTGTTTTTGTTTACAATATCTTGATTATTTTGATGCGGCTTTTGGAATTGTCATTAGAGGTGCAAGTTTGAGAAAATTTGGGTTTAAGAAAAATTGATTGGGCGTTCACAATCGGAGAGAAGATTGATCGGGATTCGGAGTTGGAGAAAAGAAAAGAGAAAAGGAAATTAGAAGAAGGGTAGAAAGGGGAATGAGAAAATTAGGCCTTCTTCCGTTCCTCTTCCTCGATTTCTAGGTCTGTTCGCAACTTCTCACGCTCCTCTTACGTTCCCCTTTGATTTCTGCTTTGAAGTTCGAGTTCTTCTTCCTTGCATTCGTGTTCCAGGTCTTTCTCTCTCTCTTTTCCTCTTTGAATCTGTACTGATTTGGTTTGCTTGTTGATTGCTGAAGTTCGAGTTCATCCGTGTTTGTTTCAAACTTTCAGTTCCAGTCGAAAGTATTCTTTGTTTTTTTTTTTTTGAAGTGTATGATCTTTTAATTTTATTTCTATTTTTTGGTCTTGGGATTGTTTTCTACTGATTTATTGTTCAGCTTCATCTACCTATATGATTAAATTTTTTGGGCGTGGTTTTCTACTGATATTTTGGGCGGTGCTCAAGTCATGTATGGCTGTTGTCCTTACGCCTTGGCCGACAGGTTCATGGGGCTGTCGCGATTAATGGGTTCTCTTTAGATTTGCTGAATTTGAACGCGTTGATCGCGTTGTATGGCAAGTGCGGGGACTTGGGTGTTGCACGGAAGGTGTTCGACGGAATGCCCGAGAGGACTGAGGTGTCGTGGTCCACCGTGTCTCTCTTTATTGTTGAGACAGAATAATTTGTTAAGATTTGGTTGAGTAGTCCACCGAGTCTTCTTCTTTATTAGTTGTTGTAACGTTGAGTTGTGAATTACAAACCAAGGCTCTAAATCTGCAGTCAAGAGAATATTTATTTGAAGTCCTCTGGTTGTCCCAATTGCTATCTTGAACCTTGTTTTCCAATCAATTGGGCCCAAATTGTCACCTGAAAAAACAAGATTTTCAAATTTGAAGCTCGTTTGGCCAATGGGAAGGCAAAATTTTCAAATGGGGTTGTGTAAAAAAGTTTCCTTTTTTGGCCTACCATGGAGAAAGAAAAGTGAAAAATGAGATAAAGGTCATTGCCAATGCAGCAACCTAAAAGAGACAGAACATTTGGATGTTGAACATGACCAATGGTTTTTGTGAGTTTTCCTCTCATCAGTAGAGGTTTTTGTGAGTTTTTGTTTAACGTTTCGCTGGGTCCTGCCTCTCTGTAGATTTAACCTCTTATTTTTCTTTACATTCCATGCAAGGTTTTGAGTGATATTATGATTGAGATCATCTCCTTTTGTTTTTTTTGTTGGAAATAACAAGTTTCTTTTCTTCTTGAAGTTGTAAACGATATGCTTGCTCTTCATGCTTTTGGATGATTTTGAGTTTGTATTCATTTCTGAATTTATTTTTTTATTAGATCATATCAGGCAAACACACACACACATATATATATTTGTATTCAACTTGTTTTCTGTGATTATTTTTGCATATGTTTTTGTTTTATGTCTAAAGAGCAGAATCATTAGCTAATGTGTTTGTGGCAATCAACTTGTAGGCTAATTATGAGCTATCGATAGATATTCTAGAAAAAGAGAGTTTTAAATACTAGTGGGACAAAGCAAGAAGTAAATTCTACAAACAGAGTTATCATACATATCCGTTTATGTTTCTGTTTTTTTTTCAAGAAACAAGTAACAAGAAATAGTTTGGAAAACTAATATCTGTTTATGTTTCTTTTTTTTTCAAGAAACAAGAAATAGAAAGAGTTATCAAATGTATTTCTGTTTCTAGTTTTGAAAAAACAAGAAGCAAGAAACAGGAAGTAGGAAACATAAATCAAAAAACAGGAATGTTATCAAACAGGGCCTTAGGGATTGTGGAAAAAGGAGGATAGACTTCTTTTGATAAAAAACCCTAATCTCTCTCCCCCCATAACATGCTCCGGTTGGTGTTCTCTTCCTAGCCGCATCATCTCCTCCATTTCTTCCTCTTGAGTGCTTCTTCTCCAACCCTTCTCACGCCAGCAACCCTTCTCCATTGACGACAACAAAGAAGACACGTTTTCGGTGAGCTTGGGTAGTGCGTTTGCAATCCGGCGACGACAACACCTAAGAATTGCCGCTTCTCCGCGCAAAGGGCGGCGCTGCCAGGACCCATCTCCAGTGTGTCTTCAACCCCAATTTCTCCTTCTTCGTCTCGATGAGATGCACGACACTATTCGCTCTTCTGTGCAATAGTGAGCATTGGCGTGTCTTGTGGCGGTAGATCCGACGCGTTTTCCTGCAAGCTAAGAAGTACGAATACGGATATGAGACACGGATACGACAAGACGCGGACATGACGACACACCATTTTTTAAAAATTTACGACACGAACATGACTTGGTGTGTTTATTAAAATATACATTTTTTAAAATACATATCATTTTTATATTTGAATTCAAAGTCAATAAGTTTATACATTTATATGCTTTACGAAATGATTTTGATGTATTTCTCTCTCAAACTTTATTATTTTTGTCCTATATTATTATGTGCCTATGTAGTATACTTGATGAGTGTTCATTATGTGTCTAACAAATATTGAATCTATATTGACCTTGTATAATTAGTTTCTTACACATATTTATTGTGCTAATAAGTGTTTGATATGTGTCCAACAAGTGTTGGACACAAACATGCTAGCCAAACTAAAGTGTCCATGCTTCTTAGCCAACAAGTTTTGTCTCTGGCAAGAACTGAGGTCTGTTTTGTGTTGGTTTCGTGCGGGCTTTTTGATGTTTTGAGTTAACCCATGGTATATGGCCCATTGTAGATTACCCATCACTCGTGGATCTCAGATCTGTGAAGTTTGAGTCTAATTGAAGTGGACCAACAAGGGGTCTAGACCGTTGGAAGGATTAAAGGGTAACATTCATTGTTTAACCCATTCGAACACTTAGATTGAATGCCATGAATCATGATTTAGTCTTTGACCTTTGGAATTGTCAATGTGTAGATTTGGACTGTCTTATCTAGTTCTTTAAGTTTGGCATTGGGGACAAAGTCATTTCAGTGTTCCTCCCTTAACAACTTTGGGAGTCCTTAGTTTTGATTGGTAGGTCATCAACTGTTATTGGATTTGTTTAGGTCAGACAAGAACACTTATAGGAGAATCTATTATTGCTTGTCATCACCTTTTAAGGTAAGTACCTAACCTACAAAATTCCATTAAGACTCCGTCAAAGGATTATAAGCATGAATGTTTGGGTTGCTGGGTTAAAGCTAAAGAAATATGAATGGTTGAGATGTCTGGAGATGTCTGTTTTGTTATAGTGTTCAGAATATTTGAGTTGTTTTTGATTGATTGATCGAGTACAATATACATAAAATGCTGGATTAGTCGACTATGTACCTGATTGGTTGGCAGTTTAGAGTACTTTTGAAGTATAGCATGTTTAAAATTACCATTTATGTTTAGTATGTTCAAAATAAAACAGGATGATTTTTATGTTTAGCATGCTTTAGATGGAATGGACTATTCAAAATTACCATTTATGTATAGTATGTTTAAAATAAAACAGGATGATTTTTTATGTTTAGCATGTTCTAGTCTTTTAGAGGGGTCTAACTATGGAATGGACTAGTAACAAATGCTATGATTTCTAGCATGTTTAAGGGGCCTCAGTTAAATGTATGTTTGTTCTTAATTTCACTGTTTTTATAAGATAATTAATTTAAATTTCATATCGAAAAAAATGTTATTTCAATTTAAATAAAAAAGTAAGAAAAATATAATTTATTTCCAATCTCCAATTGCCCCCCCTTTTTTCTCTATTCTCTCTCCTCTCGCGAACCGACCCTAACATCTTCGTAGCCATTTCCCGTCTGCACTCTGTAGCTTCTCGGACCACCTCTCACCCTTCTATCCTCCGTACCCTTCTCTTCCGCCAACTAGATCCCCCTTTGCCTGTTAGTTTTGGCCCCTCTTGGAGCAGATTGTGCTCCTCAGCCTGGGCTAGGTCGGAGCTCCGGAATCCATTTATCTTTTTTCCTGCTAGTCTTCAGGTCTCTTGGGGGTCTGCGAAACTACAAGAAAGTTAGTGTTATTTCTGTGAGGTAAGATCTGGGCTCAAGCAAGGGTGTAGTTTCGTGGTGGGACACTCGGAGGTCAATCCATGGCTTCTTACAGTTGCTGCATTGGTAAAGTGGATTTTAAAGTAAGTAAGGTGGAGGGAGGGGGTTGTCTGGAATCCAGTTCTGGAGAAGGAAGTTTGGTTCTTCCTCGCGATCAACTTCAATGGTTCTTGGAAGGTTTTGTTTCGTTATGCTCGCATACCAACTCCTTTCACCGGAGGAAATTTAGGAATGATAAGGTGATGTAACTACTTGAGTGTTTTATATTGTTTTTACCCAAGGGTTTTCTGTTATTTTAAATAGCTTGTTATTTAGGAAAGTTACCTACTGTTAGTTGTTTTTACCTTGGGGTTATTATTGTTTACCTTGGGGGGTTATTCTATGGTTAGTTGGCCATCTCTTGTATAAATACCCTTTGGGGTGATTTGTTTTGAATATAATTAAATCTTTGGTATTTTGAGTTACATCAAGTTGGTATCAGAGCTCCAAGATTCGGGGCATCAATGGCTGGAAGGAAACCTACCCCTATACTATTGGGAGAGGCATCGACTGCCGGACAAGAAGCGGAGGCCCAAAGCACCACCCACGGGAGGAGTGGTTACATCACCTATTTAAAGTTCGAAGAGGAGTCTCATGGGCAACATATTGTGTGTTAGGGCCACCCACGGGAGGCCGCAAAAGGATTCTGGTGGAGCTTGGAGAATTTCAGAATGGTTGGCGGGTTTTTACCAATATGTTAAAGAGATTTTTTGACTAGTCAGGCTGACTGTCCAATGGAGAGCATGCCGACATTCATTAGCCAAGGGGAG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ATGCCATCGGCTCAAGATCCATTCTATGTTGTAAAGGACGAGATTCAAGAATCTATCGATAAGCTGCAATCCAGCTTTCACCAATGGGAAAGGATATCTTCCGATCCGGGAGGGAGAGTACAACTCACAAAAGAGTTGCTCACTGCCTGTGAGAGCATTGAATGGCAGGTGGACGAATTGGACAAAGCCATTGCTGTGGCAACTAGAGATCCTTCTTGGTATGGCATTGATGATGCAGAACTTGAAAAACGAAGGAGATGGACAAGTACAGCTAGGACACAGGTTGGAAATGTTAAGAGAGTAGTGGGAGCCGGAAAGGAGCAAACAGTAACTGCTACTGCAAATAGCATGCGCCGAGAATTGATGAGACTACCTAATGCACATGAAACAGACAGATCAAACATATATTCAGTCCACCAAGCAAATGATGACTTCATCACGTCCGAATCAGATAGACAGCTGCTTCTCATAAAGCAGCAGGACGAGGAGTTGGATGAGCTAAGCGCAAGCGTGGAGAGAATTGGAGGCGTTGGGCTTACAATACATGAAGAGCTCCTTGCACAGGATAAAATTATCGACGATCTTGGAATGGAAATGGACAGTACATCAAATCGTCTGGATTTTGTTCAGAAAAAAGTAGCTGTGGTCATGAAAAAAGCCAGCGCCAAGGGCCAGATAATGATGATATTGTTCTTGGTGGCTTTGTTCATCATCCTTTTCGTGTTGGTGTTCCTCACCTAA MPSAQDPFYVVKDEIQESIDKLQSSFHQWERISSDPGGRVQLTKELLTACESIEWQVDELDKAIAVATRDPSWYGIDDAELEKRRRWTSTARTQVGNVKRVVGAGKEQTVTATANSMRRELMRLPNAHETDRSNIYSVHQANDDFITSESDRQLLLIKQQDEELDELSASVERIGGVGLTIHEELLAQDKIIDDLGMEMDSTSNRLDFVQKKVAVVMKKASAKGQIMMILFLVALFIILFVLVFLT Homology
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q946Y7 (Syntaxin-61 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SYP61 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 321.2 bits (822), Expect = 9.9e-87 Identity = 172/246 (69.92%), Postives = 203/246 (82.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9JKK1 (Syntaxin-6 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Stx6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 104.8 bits (260), Expect = 1.5e-21 Identity = 76/252 (30.16%), Postives = 130/252 (51.59%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O43752 (Syntaxin-6 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=STX6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 3.3e-21 Identity = 73/252 (28.97%), Postives = 131/252 (51.98%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R6Q2 (Syntaxin-6 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=STX6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 3.3e-21 Identity = 73/252 (28.97%), Postives = 131/252 (51.98%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZL19 (Syntaxin-6 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=STX6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 5.5e-21 Identity = 76/254 (29.92%), Postives = 134/254 (52.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. NCBI nr
Match: XP_038906665.1 (syntaxin-61 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 440.7 bits (1132), Expect = 8.6e-120 Identity = 233/246 (94.72%), Postives = 239/246 (97.15%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. NCBI nr
Match: XP_022139529.1 (syntaxin-61 [Momordica charantia] >XP_022139530.1 syntaxin-61 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 435.3 bits (1118), Expect = 3.6e-118 Identity = 230/246 (93.50%), Postives = 237/246 (96.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. NCBI nr
Match: XP_008460099.1 (PREDICTED: syntaxin-61 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 435.3 bits (1118), Expect = 3.6e-118 Identity = 231/246 (93.90%), Postives = 237/246 (96.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. NCBI nr
Match: XP_004154296.1 (syntaxin-61 [Cucumis sativus] >XP_031742420.1 syntaxin-61 [Cucumis sativus] >KAE8646703.1 hypothetical protein Csa_005407 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 434.5 bits (1116), Expect = 6.1e-118 Identity = 231/246 (93.90%), Postives = 237/246 (96.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. NCBI nr
Match: XP_022932071.1 (syntaxin-61-like [Cucurbita moschata] >XP_022932073.1 syntaxin-61-like [Cucurbita moschata] >XP_022932074.1 syntaxin-61-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 426.8 bits (1096), Expect = 1.3e-115 Identity = 226/246 (91.87%), Postives = 234/246 (95.12%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CD97 (syntaxin-61 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010422 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 435.3 bits (1118), Expect = 1.7e-118 Identity = 230/246 (93.50%), Postives = 237/246 (96.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CBB0 (syntaxin-61 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499013 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 435.3 bits (1118), Expect = 1.7e-118 Identity = 231/246 (93.90%), Postives = 237/246 (96.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EVC2 (syntaxin-61-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438398 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 426.8 bits (1096), Expect = 6.2e-116 Identity = 226/246 (91.87%), Postives = 234/246 (95.12%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ICW6 (syntaxin-61-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471400 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 426.4 bits (1095), Expect = 8.1e-116 Identity = 226/246 (91.87%), Postives = 234/246 (95.12%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KWW4 (syntaxin-61-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498955 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 417.2 bits (1071), Expect = 4.9e-113 Identity = 222/246 (90.24%), Postives = 232/246 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. TAIR 10
Match: AT1G28490.1 (syntaxin of plants 61 ) HSP 1 Score: 321.2 bits (822), Expect = 7.1e-88 Identity = 172/246 (69.92%), Postives = 203/246 (82.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. TAIR 10
Match: AT1G28490.2 (syntaxin of plants 61 ) HSP 1 Score: 240.4 bits (612), Expect = 1.6e-63 Identity = 137/204 (67.16%), Postives = 164/204 (80.39%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. TAIR 10
Match: AT1G16240.1 (syntaxin of plants 51 ) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 4.4e-05 Identity = 32/95 (33.68%), Postives = 56/95 (58.95%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. TAIR 10
Match: AT1G16240.2 (syntaxin of plants 51 ) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 4.4e-05 Identity = 32/95 (33.68%), Postives = 56/95 (58.95%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0015455 vs. TAIR 10
Match: AT1G79590.1 (syntaxin of plants 52 ) HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 5.7e-05 Identity = 58/258 (22.48%), Postives = 114/258 (44.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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