Tan0013299 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGGAGATAAAGATGCCTACTATGTTGTACAGAAAGGGGATGTTTTTGGATTTTACAGGAGCTTGAAGGACCTCGAGGCTCAAGCTGGATATTTGGTAAGCGTTTCTACTTTTGTTTTCCTTGTAGTTGTATTTATGGATGTGTGCTGTATTTTTATGATCTGGGCTCATTTTCTTTTTTCAAATTTCATTGGACCAACGAGAGCTTGCTTTTTGGGGTTTTATCCTTTTGGTGAAATTATCCAGTTGGTTGCTTTGAAATTGTTGGTTTAAAGAGTTTTAATGGTGAGTTCGGCCTGTCTTCTAATTTAAACACTTTTAAAAAATAATTTTTTTAAGGACACATTTATAGAAATGGTTTGAATTGAAATCCTTGTTTGTTTAGTTACTTTTTTCTTAAAAATAATTTTAATCATAATTTGGTTGGTTGCTCTACTTCTAAAAGTGTGATTATACCAATAGTCAAGTTATGATAAGATAACATGATTCTAGAGTGATTCCTAATCAATCGCCTCTTGGAGAATCAACTTTTAAATGATTCTTTGAAAAATGATTATATGAAAATTCAATTATTTAAAAATGGATTTTTATTTGTCATCAAACACTCTAGATTTTTTTGAAAACTACTTTTGGCCATCCAAAATCACTTAGGAAGCTAATCCAAACGCACATTAAGTGAACTCTAGAATGTTGGGCTAAGGATATGTGAGTTCGCATCTCAGTTTTTTGTATGGTATATATGTTTGTGAAGTTAGTGAGCTTGTTAGGTTAATAGCAACTAAATAAGTGCTATTCTTAGTTGTATTGGATCAGCCTTTCTAGGGCCTAAGGATGAACTTCTCAAATTTAGTATGACACCATAACATGAGCAGAGGTCTTGAACATCGAATCTAGGAACCCTTTTGTCTATGGATTGTTTACCATGCCCCCAACCCCATTTCTCTTCCAACATCATGTTGTACATAGTGGCCAAATTGGCGACAGATAGGAACTTGCTTCTCCTTTTAACTTAGAGAGGAAAAGTAAAATAATCTTAAACTTGTTCACTTTCTTTTGAATATGTGGTTGATGTTACTTCTTCTCCATCTTACTAGATATTTGATCCTAATGCAACGATCTACAAAGGGTATCACTTATCTAAAGAAGTAGAGCAGTACCTTGCATCACATGGACTTCAGAGTGCAACTTACTCTATAAGTGCTGCTAATGTGACAAAGGATCTATTTGGAAAACTACTCGCTTGTCCTTATGAGGTAGAAGACAAGGCATTTTATGTTCTATAAACATCCAATTGCTTTAACAATTTAACTGTGCTTTTCCTTAAAAAAAACTGTTCCTTGTGGATCAGGTCGACCTTTTAGCTAAAGGCATTAAATTTTTTATTAAATGAGTTTGATCTAAGAATCCTTCTTGCTTTATTTACGAAACTGACATAACTATTAAACCTGAATGGGGACACTTCATTTTGCTTTCCTAATATTGTTGAATGAATTGTATATTGAAACGACATAGAGGTTGGGTTTGAAAATTCTGTTAGTGTTAGTTTTGCTCGACACTTATTTATATTTTTCCCAGCAACCATCCGCTACCAGAGGAAGAATGGCCGATGAATACCCCAAAGCTAAGAGACAACAAGTCCTTGAGAATACTGAATCTGTAAGTTCGTCTATCTCACCACAAAAAATTATTTTTAGTTGAAAATTTCCATTGAGCACTATGATTATGGAAAGGAAGGTATGCCCAGGATTCACGTGGCTGTTGTTTGTTGTCTTCAGATTTGATTGGGAAAAGGGATACATTTTCTTTACTTTCTTTACCCATGTGTGCAGATTTTGTAGTTTTTACTTCACAGTTTTCTCAAGTTTGTGACTTGAAGTGTAATTATTCTTTAGGTTTTATTTTGCTTGATTGAAGGCTTTTCTTGTAGGTTGCGTCCTTTTATTGTTTCTTTTTTGTTTGACCCTGGTATTCTTTCAATTTTTTCTCAATGAAAGCTCAGTTCTTAAAGTGTAGATGGTTACTTGCAATTACTCTCTCACCGATATTTTAGCAATTCAGATTTTTTTTTTTGTAATCTTGCTTAGCTGCGGAGTTGACTTTCCTCCCCTTTTTTGTATATTCTATCTTGCTAATGAAATGTCTTGTTTTCTATGAAAAACATTGCAGATCTTTTAATGTTATGTTGTCTCTCTGTTTGTTTCTGTTAATCACCAATCCACCCAATCCACCCAAAAGCTTAAGCTGATAGGTTATGGTAAATTTAATTATATCAATACAACACTAACACTCTTTCTCATTTGTGGGCTTGGAAATTTGAACAAAGGCCCAACAAGTGGAAATCAAACCCTCCCTCACACTTGTGGGCTTAGAAATTTGAACAAAAACCCAACAAATGCAAATCAATAATTGGGAGAAAGCGACTTCATCATGGTTCAAACATAGGACCTCTTGCTTTGATACCATGTAAATCACCAATCCACCCAAAAACTTAACCTGATAGGTTATGGTAAATTTAATTATATCAACACTAACCGTTTCCTTTCATTCCTCTTAAGGAAGGTTGTTTTTCTCAATGTTGCATGGTCTTTGCTTGTTTCCTTTCACTGCCCCTAAGGAAATTTGTTTTCTTATTGAGAAAAAGAAGGTAGTGGTATCATTAATTCTTCACTTTCATCAAGCCATTTAAGGGTTGTTTTATTTATTTATTTTCCCCTCTCATTTTTGGAGGGTGGTTGGGATGAGAGAAAAGAAAAGTTAACGCAATGGATCAGTCACCATTTCTTTAGTGAGGTTTGAATTGTTTGATTTTGGTCGGGCTATCTTTTACCTCATTCTTTTTGTGTTCTTCAGAGGTTTATAGGTGCCAACTGGGTCTCAACAGATTCATTGAAACAAGACATAATTTGGGATCATGGCTTTGAAGCTGAACCAGCTTCTTCGAGTCGTGTAAGTGTGTTTGATTTCTCTTTCAGTGCTTATTGATGACAAAATGTTTGGTTACAAATTTAAAGGGTGGTAAAAAGTGCATTGGCCGATCATGTTTGTTATTTCCTTATTTGTTAATATTGGTTATTTCCTTATTTGTTAAATAAGATTTCTTTGTATTTACTTTATAGGTGCTGGAATATTTATTTCCTTTTATGTAAATGTAGGTTTCTTCTATATAAGAAACCCTTATTCTTATTGTGAATATACATAAAAAATATTCTACTCTTGGTATTTTGTACATGGTATCAGAGTAGAAAACCTAAATCTGTCAAAAGAAAAAAAACCTAATTTCAAAGGATCTTACCACCGCCACCGACCAAACCTAACTTCGCCTTTGTCGTCGCCTTAGCCGTCGCCGTCGTCGTGTTTTTCTGCCAACCTAGAACACGAAGAACCGTGTAACACAGAAACCCATAATCGTCGAACACTCAGACTCGCGAACCCGAATTCGAGACTTACGCAATCCAGATCTGCGAACTCTGACCCGCGAACCCGACGCCTGCGACCCACCATCCAGACCCTCGATCTATATGGGTTTCTCCAAGGGCGTGGTTGAACGGTTTGGAAAAGTAGTTATGAGCTATGAATTTTGTCAAAGTCAAACTGATCATACTATTTTCTATAAACATACTGAAAATAACAAAGTTGTCGTTTTAATAGTGTAAGTTGATGATATTATTATCACAGAAAATGATGAAGCAGGATTGACCACCCTGAAGAAACAACTAGCAAACAAATTCCAAATTAAAGACTTGGGAATTTTGAAGTACTTTCTAGGAATGAAATTTGCTAGATCAAAATAAGGTATTCTTGTAAATCAAAGGAAGTATATCGTTGATTTACTTGAAGAGACAGGCTTACTCGGGTGCAGAACAACAAAAACTCCTATTGAGCCAAATTTGAAATTGCAGATTGCAACAGAAGAAGAGGTAAAAGACAGAAAAATATCAGAGACTTGTGGGGAGACTCATTTATCTATCGTCCTGACATTGCTTTTGCTGTAAGTGTGGTATGTCAGTTTATGCATGCCCCAAGACAATCTCATTTTGAAGCTGTTTACAGAATGCTAAGATATCTGAAAGGTACTCCTGGAAAAGGTATACTGTTTAAGAAACATGATAATTTACATGTTGAAGTTTTCACTGATGCTGACTGGGCAGGAAGTACAACAGATAGAAGATCTACTTCTGGGTGTTGTTCCTTTGTTGGAGGCAACCTAGTCACCTGGAGAAGTAAAAAACAGAGTGTGGTAGCTAGAAGTAGTGTTGAAGCTGAATTTAGAGCCTTAACTCATGGAATTTGCAAGGGCATATGGATAAAGCGATTATTAGAGGAATTAAAATTCATTCAGAACAAACCAATGCATAATTACTGTGACAACAAGACAGCTATTTCCATTGCCCACAATCCAGTCCTTCATGATAGGACAAAGCATATTGAAATTGATAAACATTTCATAAATGAGAAGATTGATGCAGGAGTGATATGCACTCCATATCTCTCTACTACAGAGCAAGTAGCTGATGTGCTAACAAAGAGTTTTCCCAAATTACAGTTTGACAAGATGATCTCCAAGCTGGCGATGGAAGATATATTCAAACCAACTTGAGGGGGAGTGTTGGTTATTTCCTTATTTGTTAATATTGGTTATTTCCTTATTTGTTAAATAAGATTTCTTTGTATTTACTTAATTATAGGTGTTGGAATATTTATTTCCTTTTATGTAAATGTAGGTTTCTTCTATATAAGAAACTCTTATTCTTATTGTGAATATACAGAAAAAATATTCTTCTCTTGGTATTTTGTACAATGTTAGACTATATTGATATAATTAAATTTGCCCTAAACCATCAGCCTAAGCTTTTAGTTTGATTGGTGATTTAAGATGATATCAGAGTAGGAGGTCCTGTGTTCAAACCCTTGCCAAGTCAGTTTCCTCCCCATTTAATATTGATTCCACTTGTTTAACTTTTCATCAAATTTCCAAGCCTATAAGTGAGGGG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ATGGAGGGAGATAAAGATGCCTACTATGTTGTACAGAAAGGGGATGTTTTTGGATTTTACAGGAGCTTGAAGGACCTCGAGGCTCAAGCTGGATATTTGATATTTGATCCTAATGCAACGATCTACAAAGGGTATCACTTATCTAAAGAAGTAGAGCAGTACCTTGCATCACATGGACTTCAGAGTGCAACTTACTCTATAAGTGCTGCTAATGTGACAAAGGATCTATTTGGAAAACTACTCGCTTGTCCTTATGAGCAGCCATCTGTTTCTAGAGGAAAAATGGCTGAAGATTACGCTGAAGCTAAGAGACCACAGCAAGTCCATGAGACTGTTGATAGTACCTATTTTCTTGAGTTTGATGGTGCTTCAAAGGGGAATCCTGGGCTAGCAGGTGCTGGAGCTGTTTTACGTGCTAGCAATGGAACTACGGTTTGTAGGTTGCAAGAAGGGGTTGGGATTGCTACAAATAATGTTGCTGAATATCGTGCTGTAATTCTAGGACTGAAACATGCTCTAAAGAGTGGCTTTAAACACATTTGTGTGCGAGGAGACTCCAAGCTTGTTTGTATGCAGGTTCAGGGTCTATGGAAGCTCAAAAATCCAAATATGGCTAATTTGTGTAAAGTGGCAAAGGAGCTCAAGGATAAGTTTGTGTCATTTGAGATCAACCATATCCCCAGGGAACAAAATTCCGATGCCGATGCCCTAGCAAACCGTGCTATACATCTCCGAGATGGAGTTGTAGTAGAAGACTGCAAGCATAAATGA MEGDKDAYYVVQKGDVFGFYRSLKDLEAQAGYLIFDPNATIYKGYHLSKEVEQYLASHGLQSATYSISAANVTKDLFGKLLACPYEQPSVSRGKMAEDYAEAKRPQQVHETVDSTYFLEFDGASKGNPGLAGAGAVLRASNGTTVCRLQEGVGIATNNVAEYRAVILGLKHALKSGFKHICVRGDSKLVCMQVQGLWKLKNPNMANLCKVAKELKDKFVSFEINHIPREQNSDADALANRAIHLRDGVVVEDCKHK Homology
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P9WLH5 (Bifunctional protein Rv2228c OS=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) OX=83332 GN=Rv2228c PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 1.3e-20 Identity = 56/126 (44.44%), Postives = 77/126 (61.11%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P9WLH4 (Uncharacterized protein MT2287 OS=Mycobacterium tuberculosis (strain CDC 1551 / Oshkosh) OX=83331 GN=MT2287 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 1.3e-20 Identity = 56/126 (44.44%), Postives = 77/126 (61.11%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P64956 (Uncharacterized protein Mb2253c OS=Mycobacterium bovis (strain ATCC BAA-935 / AF2122/97) OX=233413 GN=BQ2027_MB2253C PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 1.3e-20 Identity = 56/126 (44.44%), Postives = 77/126 (61.11%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9HSF6 (Ribonuclease HI OS=Halobacterium salinarum (strain ATCC 700922 / JCM 11081 / NRC-1) OX=64091 GN=rnhA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 100.5 bits (249), Expect = 2.9e-20 Identity = 71/197 (36.04%), Postives = 94/197 (47.72%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P54162 (14.7 kDa ribonuclease H-like protein OS=Bacillus subtilis (strain 168) OX=224308 GN=rnhA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 8.6e-09 Identity = 43/126 (34.13%), Postives = 61/126 (48.41%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. NCBI nr
Match: XP_038906129.1 (uncharacterized protein LOC120092011 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 449.5 bits (1155), Expect = 1.9e-122 Identity = 235/318 (73.90%), Postives = 244/318 (76.73%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. NCBI nr
Match: XP_022928161.1 (uncharacterized protein LOC111435064 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 446.8 bits (1148), Expect = 1.2e-121 Identity = 228/287 (79.44%), Postives = 242/287 (84.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. NCBI nr
Match: XP_022989146.1 (uncharacterized protein LOC111486303 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 446.0 bits (1146), Expect = 2.1e-121 Identity = 228/287 (79.44%), Postives = 242/287 (84.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. NCBI nr
Match: KAG6588976.1 (hypothetical protein SDJN03_17541, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 444.9 bits (1143), Expect = 4.7e-121 Identity = 227/287 (79.09%), Postives = 242/287 (84.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. NCBI nr
Match: XP_023529762.1 (uncharacterized protein LOC111792488 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 444.5 bits (1142), Expect = 6.2e-121 Identity = 228/287 (79.44%), Postives = 240/287 (83.62%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EJI9 (uncharacterized protein LOC111435064 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435064 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 446.8 bits (1148), Expect = 6.0e-122 Identity = 228/287 (79.44%), Postives = 242/287 (84.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JJ82 (uncharacterized protein LOC111486303 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486303 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 446.0 bits (1146), Expect = 1.0e-121 Identity = 228/287 (79.44%), Postives = 242/287 (84.32%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7N6 (uncharacterized protein LOC103487060 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487060 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 424.9 bits (1091), Expect = 2.4e-115 Identity = 210/257 (81.71%), Postives = 232/257 (90.27%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LHV8 (RNase H domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G829210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 415.2 bits (1066), Expect = 1.9e-112 Identity = 206/257 (80.16%), Postives = 229/257 (89.11%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D7M4 (uncharacterized protein LOC111018384 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018384 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 402.9 bits (1034), Expect = 1.0e-108 Identity = 226/372 (60.75%), Postives = 237/372 (63.71%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. TAIR 10
Match: AT3G01410.1 (Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 252.7 bits (644), Expect = 3.2e-67 Identity = 133/282 (47.16%), Postives = 177/282 (62.77%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. TAIR 10
Match: AT3G01410.2 (Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 252.7 bits (644), Expect = 3.2e-67 Identity = 133/282 (47.16%), Postives = 177/282 (62.77%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. TAIR 10
Match: AT1G24090.1 (RNase H family protein ) HSP 1 Score: 245.0 bits (624), Expect = 6.7e-65 Identity = 124/274 (45.26%), Postives = 182/274 (66.42%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. TAIR 10
Match: AT5G51080.1 (RNase H family protein ) HSP 1 Score: 228.4 bits (581), Expect = 6.5e-60 Identity = 113/246 (45.93%), Postives = 164/246 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0013299 vs. TAIR 10
Match: AT5G51080.2 (RNase H family protein ) HSP 1 Score: 228.4 bits (581), Expect = 6.5e-60 Identity = 113/246 (45.93%), Postives = 164/246 (66.67%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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