![](http://cucurbitgenomics.org/sites/default/files/styles/slideshow/public/carousel/101322_web.jpg?itok=EG-G51x6)
Tan0012680 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GACCATCACTTTAAAAAGAGGGCATTGTTTCTTGATCCTCTCACAAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAATGGAGGGTGGGTATTGTATGAAGGAGCAGAAGGCATGTGTAGGATGGGTTGAAACATACTTCAAGGACTGCCTCTGCAATCTGAGAGACGACATGTCGTTCGGGTTCGGTCTTATAAGTTTGATCTGTTGGGGCCTCGCTGAAATCCCTCAAATCGTCACCAATTTCCGCACCAAATCCAGCCACGGCGTCTCTCTCATCTTCCTCCTCACTTGGGTCGCCGGGTACTTCCTTACTTCTTCTTCTTCTTCATACGCTGTCGTTTTCATGATCCATTCTTCATCTTTGTTTTCCTTTTCAGTGACGCCTTTAATCTTCTGGGCTGCCTTCTGGAACCCGCCACGGTGAGTCACTCACTTCGAGTCCGAGTCCGACTCGAGTCGGTTTCTGCAACTTCTTCCCACTAATTTCCTTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTCATTTCAGCTCCCCACTCAACTCTACACAGCTCTGGTGAGTAACTTTTTTACTAACAAAAAAAAAGCAAAAACAATTTTTTTTCCATGTCTATCTATATGGAAACTTTATAAAGATTTATCTTTTTGCACACCTTTTAAAATTTAGAAATCTAATAGATACCGAACCGAGGCTAGCTTCATGAACCAAACCTTTCGTTATTTAATACATTCAAAAAAAAAAAATCCAACTTTAAAAAGAGATTATTTACAAATTTACTATCATTGAAAGAGGTTTTAATGGAATTTAATGTATTTGATTTTTCGGTACACTCTCTGGATCGGTTTTGAGATTTCATTTGCATAATTTTTAATATTTTTAGACACATCGATCTCGTTTTCTCTTTTTGTTTTTTTGAATATTAAATTTTAAGAGCACAAAAAATAATGGAAAGATAGCAATGAGAGAGTTCTCCACTTAACTTTTTTAAATGTGTTTATTTAATGGCCATTTTCGCCCTTTTTCGTTAAATGCAAGCCTTTTCCAATAATCTAATGGGTTGGTTTTTCGAGATCACTCTGATCCATCTTTACAAGTATTTCAAAATGTGTTTGTGCTAAATAAAGTAATCTTGTATTGTTGTTACTCTCTTTTTCTATTTTTTTTTTTAATTATAGTTTCCAAGCTTTTATGTTCGTGCCTATTGTCCATTTTCGGCTTTCTTTATTAGTAATTCTTTTTTCTGTTTTTATCTTCTAAAAATTAATTATACTTTTTAACAATTTTCTTTTGTTGTTTTTAGAAATATTTTTAAATCTTGGACAAATTTTAGTTATTAACGTGTGAATAAAAAATTAGAAAAGATAAAATTGGAGCTGTAATATTCATATTATAACTTAAACAAAGGAGTAAGTTTTTGAGTCTACAGTTAAAAAAAACGATATCAATATCTTGGAGAACTCAAAAAAAAAAAAAAAAAATCTTGGAGAAAAATTGATTTGATAAAAATTTGGAAAAAATTGATAAAGTGAAATATATTAAATTAAATATTGAAATATGTGGGAAGGAAAAAGAAAGAAATAAGGTTAAAATACCCTTTGGTCTTTCTATTATTGGTTTTATTTCATTTTCGTCCTAAATGTTTGATTTCAGTTTACTTCTAGATTGGTCTCTACTATTGTTAATTTTTTAAAAAAAAATAAATTAATTTTTACTCTATAAATTTTTGAAGTATGTTTAGCTGGTATTTTTTTGGTATTAAAATTATTATAATTATTTAACCAATTTTGATAAAAATTATCTATAGACCAATTTTAAAAATACAAGAACTGATAAAAAAAAAAATCAAAGGAAGGGGAATTAAAATGGTATTTTAACCAAGAGATATATAGACAATTTGTGATGTGATTATACATACGGTTCCCATGTGCAGCTTTACACAGCGAATACGATAGTTTTGGTACTGCAAAGTGTGTATTATGATTACGTCACTAGGTGGTGCAGCGACCGCAAGAGGAAATCTGACCAAACGGTATCGTTTTATTTCCCTCCGTCTTTTATTTTGTTAGGTTTTTGTTTTTCTAAACTATTCTGCATTTGCTATTTTTTTTTTTATTCTAGAACTTTCGAACTTGTCTTTTCAGTTTAAATGATTTTTATCTTTGCAGATATTATTACATTTCATTTTTAATCCTTTTTTAATAAGTAATTACTCGCTAAATGGGGTGCTTCTTTAAATGTGTATTTAGAAGGGAATTTTTTTTCTCTTAAAACTTAGCTAATTGTATTATTTGTCACTTTTAATTTTTTATTTCATCTAATTGAATATGCTAAATTTCAATGTGTTATGTAATTTTTATCCTATGTTCCATTTTCATTAAATTAACATGCTAATTTTAACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAAGTAGGAACCCTCAAAACCTGCTAATTCCAACAAAAACTAAGTCTTGCACGTAAATAAGCATAATTAATACATAAGATTGATGATGAAATAAATCTTTCAAAATTCTGAAATTTTCACAAGATAACTAACTTTATTGTCATTTTCCCTTTTTGTTTTTTCTTATGATAGGGATTAGGGAGATTTGAACCTCGTGATTATTAATACATTTGATTGAACTATGCTCTTTGACATATCATTTTCTCTTTCAAATATCAATAATTTTGTACTCGACATTAAGGGTGTACATAAGCCAAATTGAGTTGGGTTGTGGGAGTTTTTTGGACCAACCCGTAATACGAGTTGGTCATTTCTTCAACGCAACCAACCCTATTCATGAAATTAGCCCAACTCAATATTTTTGGATTGGATTGGGTTGGGTCACCGGGTTAATTTTTTAATTTTTTTAATTATTTTAAAATATTTTTTTCTTGAATTAATAACTAAAATTACATAAAATTCAAATATTAAATTTTAAAGTTCATAACATCTTAACATGTATTAGAAGTCTATAAGAAAAACATAAAAAAATTGACAAATAATTCATTTACATGTATATATGTAATTAAAATAAAATAAAAAGATATAAACTTCTGGTTGGGTTGGGTCAACCCGAGCCTAAAAAGGCCAACCAGAAGACTAATCCGAATTTTTTCGGTTCTCCAAACTTCTAACCCAACCCAAACGAAAAAAAAAAAAAAACTAACCCAACCCAACCCTTAGGATTGGATAGTTTGGGTTGCTCGGATTATTGGGTTATTTGTACATCCTACCAGACATGTTTTATATTGATTATATAGATATGGAAACATTTTTCATTAATTAACCGTTGTTTAAATGGAAGTCTATGGGTCAATGTTGTAACACTCCTTAATATATTTTAAGATAAATATTGTAATATTTATTCAAGTTTAAGATATAATTTTATATAACTAAAAAAAAAAGAAAAAGTTACAATAGGATAAAATCGAAAGCGTACAGTAAAAGTTAAAATGCACGTTGTCAAAGTAAAAATTTAGAATGTATAGAGTGTCGTTTTTCGAAATCAAAATTGAATGTCTTGGAATAAAAAAAACAATGTTTGTCATATATGGGTTGTTTGGCGTGCTGTTTTGGAATCAGAAACCTTGGGGTTCTGGAACCCTAGGGTTTCTTGGCTGGAAGGTTTCTGATTTCAGTAGGATATTTTGTTTTTCTAGATTCAATTTTTTTACTTGATAATTGTTTGTTGAAGTGCATATCAATATTTTAACCAATTATGTGGATCAATTGTTTCAATAATAGTTAAATATAGATGTGTAGTTTGTACGATTAATATTATATTTTACAAAATACTCAGAAAACTATTTTAGAAATTAAAAAATTTAAAGTCTATTTAATAAATTAGAGAATCTAAAACTCTATTTTATAAAGTATTCAAAAATCTATTTTGAAACTCTATTTTAGAGATTAAAAAAATTCGAAGTCTATCTAAGATATTAGAGAAAACTTTATTTCACAAAGTATTCATAAACCTATTTTTGGAACTCTATTTTACAAATTAAAATATTAGAGGTTTATTTAAGAAATTATGAAATTTAAATAAAATTGTTCATTGTATTTTAAAACATATTTCAATGATAAATGAGTTATAAAATTTGAATTCTCCTTTCTAACCTGAATTGGACTAAGCAGGATCCAATAGGATGTAATTTTTAGAAATTAAAATATTAAAAACTATATTTTGTATAGTATTTTAAAACGTATTTCAAACATATAATGGATTAAAAAAATTTGTTAGTGACCATTTTTGTTTAACTTTTAACCTTTTAAAAAATTGACTAGGTGGTTGGGTAGTTGGTTATTGGTGGTCGCGCGACGGTGATTGCACAGTGGTTAGGTCGTCGTGGGTCGTTGGAGTGGTCATCAGGGTGGTCATGTCGTCGAAGTGGTCGTTTGGTGGTTATGGCAGTAAATGTCAAGTGGTCGAGTCGCTAGAGTCATTGCCAGAATGATAAATATGATAGTTGAGTTGTTGGGTTGTCACTAAAGTGGTCACCAAGTGGTTGTCAACAATGGTTTTGGGTGGTTGGGTTGTCAGGCTGGAGTGTTCATCGAAGTAGTCATCGAGGTGATCGAGTTGCTAGGGTGGTCGGGTCATTGAAGTGATCACTAGGTGGTCATCGACAGTGGTTGCTAGGTGGTCAAATTTTTGGGGTGGTTGTCAACTATGGTTGTCAGGTTGTCGGAGTGGTCTTTAACTATGGTTATGAGTTGTTTAGTAGTCGAAGTGGTTGTTAGATAGTCGTTGTCGGTGGTTTGGACTAGTCAGGGTTGTAGTGGTTGGGGCATCAAAGTATCAAGTTGTTGGGGTGGTCGAGTCACAGGGGCGATCGTTAACTTAATCTATAGAGTTTTCATCGTAGTTATCGATGGAGGTAATCATCACAGTGGTCGGGTCGATAGTGTGGTCGTCGAAGTTTTCGTTATCGGTAGTGATCAAGCGGTCGTCGGAGTTGTCATTAGAGTTAGTCGGGTTGCTGGTGTGGTCGTCGAAATTTTCATCAGA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MEGGYCMKEQKACVGWVETYFKDCLCNLRDDMSFGFGLISLICWGLAEIPQIVTNFRTKSSHGVSLIFLLTWVAGDAFNLLGCLLEPATLPTQLYTALLYTANTIVLVLQSVYYDYVTRWCSDRKRKSDQTAEEEKTPLKGAKAVSYAGIPIPKPSPKAPRREFYYTSARSLAGSDTPPFRAFLRLPKSGPSALGNDSSSSDDESDTAAVSSNSTGTQPRPIPRSVGYGTFLAASANLPFQSKGFPDGFRGRKLLQEHTSHSGFGQLLGWLMAAIYMGGRLPQIWLNIKRGSVEGLNPLMFVFALIANATYVASIVVRSTEWEKIKANMPWLLDAVVCVLLDLFIILQYIYYRRFRRRRQSGGRDYEEATKHATL Homology
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q12010 (Probable vacuolar amino acid transporter YPQ1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=YPQ1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 1.4e-23 Identity = 95/333 (28.53%), Postives = 153/333 (45.95%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P38279 (Probable vacuolar amino acid transporter YPQ3 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=RTC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 102.1 bits (253), Expect = 1.4e-20 Identity = 87/327 (26.61%), Postives = 150/327 (45.87%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q95XZ6 (Lysosomal amino acid transporter 1 OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=laat-1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 96.7 bits (239), Expect = 6.1e-19 Identity = 90/342 (26.32%), Postives = 135/342 (39.47%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6ZP29 (Lysosomal amino acid transporter 1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SLC66A1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 3.1e-15 Identity = 80/353 (22.66%), Postives = 134/353 (37.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10482 (Seven transmembrane protein 1 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=stm1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 7.7e-14 Identity = 85/335 (25.37%), Postives = 141/335 (42.09%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. NCBI nr
Match: XP_008457880.1 (PREDICTED: probable vacuolar amino acid transporter YPQ1 [Cucumis melo] >XP_008457881.1 PREDICTED: probable vacuolar amino acid transporter YPQ1 [Cucumis melo] >XP_016902196.1 PREDICTED: probable vacuolar amino acid transporter YPQ1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 689.1 bits (1777), Expect = 2.1e-194 Identity = 345/378 (91.27%), Postives = 355/378 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. NCBI nr
Match: KAG6571402.1 (hypothetical protein SDJN03_30317, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 685.3 bits (1767), Expect = 3.0e-193 Identity = 342/377 (90.72%), Postives = 360/377 (95.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. NCBI nr
Match: XP_022971727.1 (probable vacuolar amino acid transporter YPQ3 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 684.5 bits (1765), Expect = 5.2e-193 Identity = 342/377 (90.72%), Postives = 360/377 (95.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. NCBI nr
Match: XP_023512444.1 (probable vacuolar amino acid transporter YPQ3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 683.7 bits (1763), Expect = 8.8e-193 Identity = 341/377 (90.45%), Postives = 360/377 (95.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. NCBI nr
Match: XP_022927971.1 (probable vacuolar amino acid transporter YPQ3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 1.5e-192 Identity = 340/377 (90.19%), Postives = 360/377 (95.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C6I6 (probable vacuolar amino acid transporter YPQ1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497459 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 689.1 bits (1777), Expect = 1.0e-194 Identity = 345/378 (91.27%), Postives = 355/378 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I2S0 (probable vacuolar amino acid transporter YPQ3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470396 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 684.5 bits (1765), Expect = 2.5e-193 Identity = 342/377 (90.72%), Postives = 360/377 (95.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LMT2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G295430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 7.3e-193 Identity = 343/381 (90.03%), Postives = 354/381 (92.91%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIZ5 (probable vacuolar amino acid transporter YPQ3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 7.3e-193 Identity = 340/377 (90.19%), Postives = 360/377 (95.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQD5 (probable vacuolar amino acid transporter YPQ1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022605 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 664.5 bits (1713), Expect = 2.7e-187 Identity = 339/378 (89.68%), Postives = 354/378 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. TAIR 10
Match: AT4G36850.1 (PQ-loop repeat family protein / transmembrane family protein ) HSP 1 Score: 464.5 bits (1194), Expect = 7.9e-131 Identity = 247/385 (64.16%), Postives = 292/385 (75.84%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. TAIR 10
Match: AT2G41050.1 (PQ-loop repeat family protein / transmembrane family protein ) HSP 1 Score: 243.8 bits (621), Expect = 2.2e-64 Identity = 159/377 (42.18%), Postives = 212/377 (56.23%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0012680 vs. TAIR 10
Match: AT4G20100.1 (PQ-loop repeat family protein / transmembrane family protein ) HSP 1 Score: 213.4 bits (542), Expect = 3.2e-55 Identity = 130/332 (39.16%), Postives = 175/332 (52.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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