Tan0009867 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTGTCTCTAAACTCCAAGCTTGCGCTGAGAATGAAGCAAATGAATTGATCAAGAAGTATGATAAAAATGGTGATGGTGTTCTCACTAAAGAAGAGCTACGACAATTCTTCCTCCACACTGCTCGAGGTTCAACGCAACTCAACGAAAAAGCATTTATATCTAAGATCCCAAAAACTAATGACAATGGTGTGCAGAAGCTTAGCTCAAACCCTCATATAAAACTAAAAGAGCAACCACAAGACAAAGCTCAAAAATCCTCGACCAAAGTTATTTATGGAAAGGCATCCAACATGTCCTTTAGTCGAGAGCAGATGAAGGAGATTTTCAAATATCATGACAGCGATAAAGATGGTTTTCTCAACACAAAGGAGGTAACAAAAGCCTTTAGTTTTCTAGGCTCAATCCTTCCTTTCTACAAAGCGAAGTATGCTTTGGCTCATTTTGATGCGGATAAAGATGGTCTTATCAGCGAGGCTGAACTTGACAAACTCATAGATTATGCCATTAAAATCGTCAAGAAGAAATGAGGATGTAAGCTACTTTCTTGTGAATATATTCTACGTATGAACGTAATTGTAACTTGAAGTCAACCATTGAAAAGAATAACTTAAAATAAAATGAAATAATTTCTTTATTATCAATATTAATTTTTGTTGTTTATTTTTCTTTGGGAATAGTATTTGAGCAAGCACAAGAATGTTATCAGTACGATCATAATCTATACACCAGTTCAAACTATATCAAAAGTTAGAATTTGGTGTGTCTTCTCATTCAATCCATCAATTGCTTTTAGATTATATAAGAATCTCACTCACTATATATATACAAAACGATCCTCAAACTTATGCGGATAAACTTGCATCTTTCATAAACCATATCAATTAAGGTTTGAAAACTGATACACATGGAATGCATTGTATATTTCTATATGAACTCATATCTATGTATAAAATCATTATTCCAATAATTAATAAATATAATTTTTGTTGTAAAATTGGAGGAAAAACCGAGTACCGAAACTTTACCAAAACCTATAATAATAATAATAATAGTAATAAAGAAAAGAAAGGGGAAATGAGAAATAAAGATAGTGGAATTATATTACAAAATTAAATAAGGAATAAAATAGAGAGAAAGTGGGAGAGAAAAAAATGGATTGGAGAGAACTTCACTCAATCTATAGCCTTTGTTGTTGGGACACATGAGAAACACTTTGGCTATGGATAATTTGCCACATGGCATGAGTATCAAAGGAGCATGTGGAATGAATATTTATATGTGTAATGTTTATCATAATTTTCTCAGTTATCAATCCTCGATACAATTTTAATGGAAAAGACAAATATACACACATCCTACATTGTGGATAATGATTTTTTCATAAAAAGATAATAATTTTTTGAAGTATAATTGACCAGGAGTATTCTTGAAATAATATACACACATACCTATACATATATTCGGAAATAGTTAGCATACAGGTAAAAGGAAAAATTAAAAACCCTTGAAAATATGGTATATATGAGACACGAAAGACCTAATTGTAGTGTCTTTCTTTTAGTTAATTTTTTTTTTATTTTACAAAATGTACACAATTATTTATTTTCTAAAAGAAAACACAACAACAAATGTTATTAGTTGGCAATTTGTCCACCCATGGTGTATGCAAATTTCTTTTGCAAACTGAAAGTTACAAACGAAAATGTACGAACATTTATTTATATATCATAAGGCAAAAAAATGAGAATTTATTTACTATCCCAAAACTTTTTCCTCTCTCTCCCGTAAGGAAATAAATAATACATAACTTATGGAGCTTAATTATTTACTTCTTCATTTAAACTACATACTTACAGAAGCTAAACTTAGTGGATAGAAACGGATTGTACAGTAATACTATATCTCGTATTAACAAAAAAGAAATTTAATCAGCATAGAACATCAAGAAAATGAACTAATTCCGCAAAAGAATTTCTGTGGGAACAAATTAGTGTAATCAACAATGAATCCTAATGTTTAAAAAGTTCCAATATATGGATTTAGCAACATAACTCTTTTGGAGCATGTTGCACACGTAAGATGCAGGAGAATATTAGGGAAATGTTAAATTTTCTAATAGAATTTGAAAATCAAAATCATCTACTAAGTACAACTAATGCCTAAAATTCAAGGAACTCCAACCTGATGAGAATATTTCAAGCAGACAACTTTAAAAACATTCTAAAGAATGTCACCTTTTTCCTTTATATTGTTAACATTTTACAACGTGGTCAATATGGACAATTGGGTTGTAATCTGTAACACCTAATATTCTTAAATAATTTTATTCTTTTTAAGTGGACAATTAGTTATTAAATTATCAGTTGATTATTGTATATTAGTTGGGATAGATTGAAGTTTGGGAAGTTTGAAAGGGACAAGATGAAAAGAAAGGATAAGTTTTTGAAATTTTTGACAATTTAAGGCAAAAAAGAAAAGGAAAAAAAATCTCTATCAACCTGAAATTCTCCTCCTTCTTTCTTCTTCTTTTTTTCTTCTCTCCTCTTTCCCTCCCGACCTCCTCCCTTCCCGTCGACTACCTCTCTTCCCATCGTTCGAGTAGCCACGCTGGACAGCAACCCGATCACCACATGTCGACATCGTCGAGTCCTTATAGTTGAAGCTCAAGACTGTCATAGTTCCCTCCTTGCGTCTCTCTCTCTCTTAATGCTTCTCCCTCTCCTCAACTGATACCACTCCAACATTCGGTGAAAGTACGAGCGGTGGTGGCGATAGCAATTCTGGGTAGCACTTTTTGGGCGATTTTAGTTCTTTTCGAAATGGGTAACACTCCTTTTATCGTGGGTCAGTATTTCGAAAATGATTTGAAGCTGTTCATGGGATGTAAAATTGAAATGAAGGGCGTTGTTTTGGTGGTTGAAACTAACCCACAATAGTTTGAATTCCTTTGTCGATTAAAGGTTGTTTTAGCCGCGGTTAGTTCATTCAAGGTGTGATAGCACACAAAATGTGTTATCCTTAGGCTTATACTTTACTAGTTTTTGTGATAATTTCAGGGTTTTTACGTGTATAAATCATCCAATTTCAGGTTAAGAGCTTCTAACAGAGCAATTGGAGAGATTTGAAAGTATTCGAGATCAAAACAAGGGCTAACGGAGCTCAAAAAGTGAAGCAAATAGAAGAAGAAAGTCAAATCTAGCTTGTTGACCCGAACCTAGGGCGTTGCAACGCCATTCTAGGCGTTGAGACGCTGAATTCGTGGATGTTTGGCTTAGAGAAGTCGTGGTGACGGTGTTGCAACATTGGTTTGCAGCGTCGCAATGCCGGTTTGATAAGAGAGTGTGCGCGTGATGTTGCAGCGTTGCAACGCCGCAAATAATTTCCTTTTTTATTTGTCGCCTAGGGCATGGCGTTGCAAAGCTATGCCCAACGTTGCAACGTCGTGCCGATTTTATTATAAATATAACATTTTGTACCCTTTGTTAGGGGAGCCGAATTTGATAGATTTTTGTACCTAATTTCGAAATACACACTCTAAAAGGAGAAGAAGAGCATTCATTGGGAGCCAAGACGTGAGTGGAGGCTCGAGATCATGACGGGAGCTGGGGAACGGGGGACCGACATCGCAAATACGAGTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTGTAGCCTAGTTTATAGACTCTTTTATGGCTTTAGCTTGTTTGTTTATGGTGATTATGAGCAGTTAATTGTCGTAGTTAGGGGATTGGTGTAGCCTGTTATGAACTTATTTAAGTATGTTTTGAATTTTGATTGTGTTGCTTTATTTTTGGTAATTCGTTCTTAAGTTACTTGTTTTTCTTTGGCCAAGTCTAGCATGCTTTGTTGGTTTAAGTGGATTCGAGAGAAAAGACTTAGATTAGAGCAAAATTGCCAAAACCCTGAGTAAATTTAGGCACGAGAGTGATTTAGGTTCTCTGAGAAACGTTTTAAGAAGTTGTTTCATGTCGTGCATGCTTTTAAAATTCATAAGGTAACTTTAGGATTTATTGTTATGCATGAGAATCACTAAAGATCGAGAGATTCTTTTGAGTATCTTTACTTCTTGTTTATAATCTCGCAACCATAGTTCTTTGCATGTGCTAGAAATTAACTTGTGAAATCAATCCCCTAACAATTTTGTCATATTCGTGTCTCCACTTGTATATTTATTTTTTTATCTTTGTTTTCATCTTATTTCCAAGTTTTGTTGCTTTAGATAAAATTTAAAATAAGTTTCTTGGTAATTAATCAATCTAAAAACCCATTCCTGAGGATGATAGTCTATACTCAAATCACTATATTAAAACTTGACCCGTACACTTACGGTATTCCAATATTATTTTACGCAACAAGTTTTTGGCATTGTTGTCGATTAGTTTTAGCCGCAGTTAGTTCATTCAAGCTGCTATCTATAAGGCGTCATGATCATGATTTTTTGGTGAGCTCCCTTTGAGCGCTATAGTTTTTATCTTAGTTGAAGTTATGCTTGAGATTGGAGTTATTCAACATTGGTTTTATGATTTTTATTTTAAAACTTATCCATAGTGTGTTGGGATTTGTTCAAAGGTTACTCATTGTGTTTGAAAGTCATGTTGTTGAGCTCGGACCAATTTGACATCAAATTCAACAAGTGAATGTGTTGTTGGGGGCAAGTTTATTGAGTAATTTATGTCTCAAATCTATTGAGCTCATGTCTAGATTTTAGAATGGTTTGTTATTTATTGTTAGGACTTTGTTTGAAATCGTTAGGACTTTGTTTGGTGATTTCAGGTTAAGTAATGTAACGCCCCAGGATCTCCTGCGACCTGACAACGTCACCATATCATCCATGACAGCTTGTAAGAGTGAAGACATTATCCCCACAAACCAACACGGTGTCCTTTCAACATGTTTTGTCCTCACTCACATGCTCCCTAGGAAAATTCCCAGGAGGTCACCCAACATAGGATTGCTCCAAGCCAAGCACGCTTAACT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BLAST of Tan0009867 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SU00 (Calmodulin-like protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CML2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 1.7e-04 Identity = 38/145 (26.21%), Postives = 63/145 (43.45%), Query Frame = 0
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BLAST of Tan0009867 vs. NCBI nr
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BLAST of Tan0009867 vs. NCBI nr
Match: XP_022951798.1 (probable calcium-binding protein CML11 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 231.1 bits (588), Expect = 1.4e-56 Identity = 126/176 (71.59%), Postives = 143/176 (81.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. NCBI nr
Match: XP_023538396.1 (probable calcium-binding protein CML11 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 229.6 bits (584), Expect = 4.1e-56 Identity = 125/176 (71.02%), Postives = 142/176 (80.68%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. NCBI nr
Match: XP_023002657.1 (probable calcium-binding protein CML14 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 1.0e-54 Identity = 123/176 (69.89%), Postives = 139/176 (78.98%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KM01 (probable calcium-binding protein CML11 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496473 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 233.0 bits (593), Expect = 1.8e-57 Identity = 126/176 (71.59%), Postives = 142/176 (80.68%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GII5 (probable calcium-binding protein CML11 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454483 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 231.9 bits (590), Expect = 4.0e-57 Identity = 126/176 (71.59%), Postives = 143/176 (81.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GIQ8 (probable calcium-binding protein CML11 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454532 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 231.1 bits (588), Expect = 6.9e-57 Identity = 126/176 (71.59%), Postives = 143/176 (81.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KK48 (probable calcium-binding protein CML14 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496448 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 4.9e-55 Identity = 123/176 (69.89%), Postives = 139/176 (78.98%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GJT8 (probable calcium-binding protein CML11 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454533 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 222.2 bits (565), Expect = 3.2e-54 Identity = 120/174 (68.97%), Postives = 139/174 (79.89%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. TAIR 10
Match: AT4G12860.1 (EF hand calcium-binding protein family ) HSP 1 Score: 48.5 bits (114), Expect = 1.2e-05 Identity = 38/145 (26.21%), Postives = 63/145 (43.45%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. TAIR 10
Match: AT2G41100.1 (Calcium-binding EF hand family protein ) HSP 1 Score: 42.4 bits (98), Expect = 8.7e-04 Identity = 44/207 (21.26%), Postives = 85/207 (41.06%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0009867 vs. TAIR 10
Match: AT2G41100.4 (Calcium-binding EF hand family protein ) HSP 1 Score: 42.4 bits (98), Expect = 8.7e-04 Identity = 44/207 (21.26%), Postives = 85/207 (41.06%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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