Tan0006727 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAAAAATTTGTTCACGAGAATTTATGGAAAAAGAGAGGGAAAAAAATGATAGGGTGGTAATTTTTTTAATGGAATTCAATTGGATAAAGCGCCGATGGTCCATTTCCAGTCTCTCTCTCCCCCCCTCTCTCTCTCTATTGTTCACATGGGCATTGGCTCTATAACTACACTATTATGCGCTGAATATACTACATTTCCGATGATTCTGTACGGAATAGGTGGCCATTGATGCAAAGCTTATTCACAATCTTGATTTGACCGACGCTTCAATTTATCAAGCTCTTGCGATCTTGTTTATTACCGAAGTATCATTCTCTTTTCTGTTATCTCTGTTCTGTTTCATTATTTGGGTGGTTGTTGTTTTGCTTCCTTATTCTTGGGGTTTATCTGATTGATTGTGTTTTGGGTTTGAAGAGAGCTGTTTTCAAGCTATGGACTCTGCAATTCAGGCTTCACCTTCTCCAGCTTCGTCATCTGCATTTCGTAGTCCATGTCTCACTTCTGCTTCTCAGAACTGCAAATTTCCGTTGTAAGCTCATTTTCGTTTTGCTCATCATGTATCTGTTCCCGTGATTATGGTGTGAAATGGGTGTTTTTATTTGCATTTCATGTGTGTTCATCTATCTGTTTTGTGAAATACTGAAGTTGTTTGCTCGGATTGTCTTGTTATATAATTCAAAAGCGGTTGTTCGCAGTGGAGATTCATTCCCAATTTCTCCACCGTGGTTATGCGAGCTTCAATAATTCAATAATGGGGCTAGTAGCTTCTTAGCGAGTTGCGGACTTATTTACTTCGCAGTTGCATATTTTGCTCATGTAATATGGGGTTATTGAAGTTAGCATTCCTGGTCTTTGGTTGACACAGAAGGTTTTTGATCTCAGTCCACTCGTGGCGCATGAATGCCATAGTGAGCTGGTCAGATTCCGGCTAACCGTAGGGCTTGTGACTCACCCTGGCCTGAGATTGCCCTCTTCTTTGTAATGGGCAAGGATGGGGTTACACGATCAGGTTACAGAATAGCATCAGGGCAATGAAGTAGCTCGACTGAGAGGAAGTGGGGAAGGTGATCGTCGGCCATTCATCAATTCCGAAATTGCCTCTGGTGCCTTTCCCTCACTCATCGTTCCTTGTACTTTAGTTACGATCTAACTAAAGTCCCTTCTTCTTTTTTTTTTTGAAAAGCTATAGTTAGTTACTTCTTAAGGCAAATAGAATGAAACCTCCCAGCCGAACATATATCTTCTGTATATCCTTGCCCCGGGGGGGTGGGTAATAGGGTTAGGATCTAGAATCAAGAATGCACACAACCGGTATTAGTAGCAAAGTTAGTAATCAGGATCAGGAATAAGCCACTCTGAACTACCCATTCCTTATGTGTGCCGATCAATTTTCTTCCTGAACCTATCGCCCTCTGTGCTTACTGAGAGAGATCAAGTTCAAAATAGTTTATGGATTTGCACACACTTTCTCTGAGGTTTGGGGTGGTTGTTGTGGTCCTCCTTCCTTTGACTGTGCTAGTGCTGTTGACTGGAACTGTCTACCTGTGTGTGTGAGGTATGATGCCATTGCCATTGTTGGATGGGGACAGACAATAGCTGCTACAGACGATAAGGTACTTTTCTGAAGAACATCAGGTCCAATTCCAAAGGCACTGAGTTAACCACAGCGGGGTTCTCATCAATTGTTCAGTTACTTCAGTTTGCCGACATATTAAGAGCTCAAGTAAAATGTTTTTGTAATAGTCAGAAACAGAGAAACTTAATGAACTTAATCACGTCCATTTTTCAATATTTTGCTCCCTCTTCTCTTAAATGGTTTCTTGGCGTTTATGTATTCACCAATCTTATCCATGATTGTCTAATGTATTTTGATAGTTCGAGTTCCAAATAGTACAATACTGAGGTTCCTGTTTTATTATAAATTATATTTTACTTATTTTTCTCTGTAGACTCAACCTTTATATTTATGTTGTTTTATTATATTTAGGCTATACTTTGTTATGCTAGATTTTTAAATAAAAATATGTTTCATCGATAATGTGTGCTTAAGGTGTGGGGATCAAAAGAGCTGCCTGCACATCAATTAGGCCATTCATTGAACGAGTGCTCTAATAAAGGTCCCTATAATGGAAGTGTGAAAGCTAGGGTCTCAGAATCATATATAAGAGTTTTATAATCATGTTTATGCATCAATACGTTGTCAAGGTTGAAGAACTATGCCTTATATGGTTTCACGTGAATTGATTTAGTATAGTAGTGAGCATTTGTATTCTTTTTCCTGCACAGGCCAACTTCCAGAGTAACGGCTTCCTCTAAAAGAATGCATCGTGGCTTCAGGCTCCATATGGATGCTTGTCCTAATTACGTCTCAAAAAATCACGTAGTTTCCAGATACTCTTCAGAATGGCCTGAATCACAATCCATATTCTCTAAGCAATCTCTCAACAAGTATTTTCTGCCTTTGAGAGCATTGGTTGCTTCAAACAGTCAAGATATTTCAGCTGCACCTTTAATTGGTGATGACAAGGTTGGAGTGTTGTTGCTGAACCTTGGAGGTCCAGAGACTCTTGATGATGTGCAGCCTTTCTTGTTTAACCTCTTTGCTGACCCGGTATCATGCCAACAATCCATTTCACTTCTTAGTATGAAGTTTGAATTATTCAATCTTTTATTAGATGGGGTGAAACTTTAAGAAGTTTGTTTTATCTTCTTGCTGTTCATCAATTAAGTTTCTTTAAGCCTTATTGGCTAAATGTCCTTACTTATTTGCATGGATTTTCACTTTGTTGTTTTATTATACCTTCTCAGTTTTCTCTAAATTGGATATATTCGTTTTTATCTATCATTGACTCTAACCTGTGATAAATTTTTGCCATAAGAAATGTTGATAGTTGTACTTACATGTTTTTATAGGTATAAAACCCTCTGATAGCCGTACATATATTTATCTTGTATATGGGTTAACAGTTTTTATAGTACTTAATTGTCGGGACTATAATGCTTTCATCACATAACACAATTAAAATTGTGAAACATCATATTTTTAATAGGATATAATACGATTGCCACGGTTGTTCCGTTTCCTCCAAAGACCATTGGCACACTTTATTTCAGTTCTAAGATCGCCCAAGAGTAGAGAAGGCTATGCCTCAATTGGTGGTGGTTCTCCTCTGCGAAAGATAACTGATGCACAGGCAAGATATTCTTCTTTGTCTTCTTCTTCTTCTATTTTTATTTTAATGTACAAGTCTGCATGTATCCACCATCATTGTTGTTTAACAATAGAGATTACAGAAAAAGATTAGAGAAATACTGAGAATACTGTCCGCATCTTCACCCTCTTGTTCAGTGCATGGTTTGTGAGTGTAAATGCGAGATGCATTGCTTGGAGATATGTTTCCTTTTGTTTATGCTTGTTTTATCCTTTTGAGGTCTGGCATAGATGTGTTTTGCAGAAACTTATCATAAAGAGCACGCCTTTATACTTATTTTTTCTTTTTCTTTTCCTTTTATAATTTATAATTTCATGTTTGTCAACATTAATCTTTGACAAAATCAGTGCCTTTTTTCATTTCGAATTCTCAGTTTGAAATGACATAAGAATTCAAGTTAAATAAGATGCTTCTTGAAATCTATGAACTTTGTTAACATCCAATATGTTCTAGAGACAATCTAAGAAACTTGGGGTTGGTTATCAAAATTTTAGAAGATAAGAGTCGGTCAAAATGTTTGTTCAATTGTATAGTTAGCATGCTTAATGATTGTTGATGGGAACATGCAGTTGAATATAGGTTCACACAGAATTGGTTTCTTCTTGTTGAACTTTTTTTTTTTGTTTTCATCTGTATATCTTTTTTGGTCAGGCTGAAGAGTTGAAGGCGGCCTTATGGAAAAAAGATGTTCCAGCTGAAGTGTATGTTGGTATGCGTTACTGGCATCCGTTCACTGAAGAAGCAATTGAACAGGTAGACATTTCTTTCTTATATTAATGAAATAAGATGTTGGTTTTTGAACGTCTTCTTGTTTCCACTGTTTCAATTGCGACAAAACATGTTGCTGTATGCTCAATATAAGGTTGGAAAATAGTTCAAACTGTAAGCAGGTTTTTGTTGCTCGTCTTAGCACCGAGTTAGAATATCGAGCTCCACCACATACTTTGCCCAAGTTAATTCAGCTTCAATCTCTACTACTATCAAGAGACTTTTTTCCACCACATCCACCCATTATTTGTTGTGATAATTTAGAGACCAAGTCCTTAGCTCGAATACCAATTTTTCGGGCCTGTTCCAAATATATCGAAATTCATCTTCATTTCATTCAGGATTAAGTGGCTGACTACTGACTGCCTCAGAAGGCCACTCCTTTACTCATACTTCCAGACTCCAGTTCCCGTGTTCCAAACTCAAGGCTTGCTAACCTCCCCACTAACTTGCAAGTGGTTGTGATGAAATGACCTTTTCCATGCAGTGTTATATTATGTTAATAATTTATTAGTCAGCTATTTATTTATCTGTCCTTTGTACTTTTTTCTGCTAGCCAGTCCATAACTTCTTGTACCTTAGGCACAATTGATTCAACTCTTTGATCTATATCTGTGTTTGAGAACCAATTCTCAAACATATATCTTAACCCCAATTTCAGTCGACAAGTGGCGGTTCATTGAAACAATCTTTTACATTCAAGTAGAGGGTAAATTATTGGTATGGTGAAATGGCTATCTTGTAAGCTTACTATACAAGAGGGTCCCATGTTTGATTCTCAATACATTCAAGTGGAGGGCACTGGATATTTAATGGCACCAATAAAATGAAAGAGGGTGGTACATTCAAGAAGGACTTGTTGTTAAGCTACAAAGCAACTGTGAACATCTTCTGGTATTTCGGGCATTGTAATTTTGAGGGGAGCTCTTTGAAGAGGCAGAAGAAACTAGGAGAAACTGTTTTCCAATGCTTGGTGGTAGTATGTTAGGCTACGGGAGAAAACCAAAATCACGA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BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DIV0 (Ferrochelatase-2, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0361200 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 776.9 bits (2005), Expect = 1.4e-223 Identity = 381/419 (90.93%), Postives = 402/419 (95.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2Y3Q5 (Ferrochelatase-2, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=HEMH PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 776.9 bits (2005), Expect = 1.4e-223 Identity = 381/419 (90.93%), Postives = 402/419 (95.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04921 (Ferrochelatase-2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 748.4 bits (1931), Expect = 5.4e-215 Identity = 390/532 (73.31%), Postives = 431/532 (81.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69TB1 (Ferrochelatase-1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os09g0297000 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 526.2 bits (1354), Expect = 4.4e-148 Identity = 250/339 (73.75%), Postives = 295/339 (87.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P42045 (Ferrochelatase-2, chloroplastic OS=Hordeum vulgare OX=4513 GN=HEMH PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 526.2 bits (1354), Expect = 4.4e-148 Identity = 250/339 (73.75%), Postives = 295/339 (87.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. NCBI nr
Match: XP_022947333.1 (ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita moschata] >XP_022947334.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita moschata] >XP_022947335.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1025.4 bits (2650), Expect = 1.7e-295 Identity = 509/528 (96.40%), Postives = 519/528 (98.30%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. NCBI nr
Match: KAG6605357.1 (Ferrochelatase-2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1023.8 bits (2646), Expect = 5.1e-295 Identity = 508/528 (96.21%), Postives = 518/528 (98.11%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. NCBI nr
Match: XP_023533357.1 (ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023533358.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023533359.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1023.1 bits (2644), Expect = 8.6e-295 Identity = 509/528 (96.40%), Postives = 517/528 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. NCBI nr
Match: XP_023007154.1 (ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita maxima] >XP_023007155.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita maxima] >XP_023007156.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1022.3 bits (2642), Expect = 1.5e-294 Identity = 508/528 (96.21%), Postives = 517/528 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. NCBI nr
Match: KAG7035317.1 (Ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1015.0 bits (2623), Expect = 2.4e-292 Identity = 508/540 (94.07%), Postives = 518/540 (95.93%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G6H7 (Ferrochelatase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451226 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1025.4 bits (2650), Expect = 8.4e-296 Identity = 509/528 (96.40%), Postives = 519/528 (98.30%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L275 (Ferrochelatase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499733 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1022.3 bits (2642), Expect = 7.1e-295 Identity = 508/528 (96.21%), Postives = 517/528 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D7G7 (Ferrochelatase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018063 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 994.6 bits (2570), Expect = 1.6e-286 Identity = 497/528 (94.13%), Postives = 509/528 (96.40%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E153 (Ferrochelatase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496275 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 992.6 bits (2565), Expect = 6.1e-286 Identity = 497/527 (94.31%), Postives = 511/527 (96.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2U9 (Ferrochelatase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496275 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 992.6 bits (2565), Expect = 6.1e-286 Identity = 497/527 (94.31%), Postives = 511/527 (96.96%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. TAIR 10
Match: AT2G30390.1 (ferrochelatase 2 ) HSP 1 Score: 748.4 bits (1931), Expect = 3.8e-216 Identity = 390/532 (73.31%), Postives = 431/532 (81.02%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. TAIR 10
Match: AT2G30390.2 (ferrochelatase 2 ) HSP 1 Score: 740.3 bits (1910), Expect = 1.0e-213 Identity = 390/542 (71.96%), Postives = 431/542 (79.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. TAIR 10
Match: AT5G26030.1 (ferrochelatase 1 ) HSP 1 Score: 513.8 bits (1322), Expect = 1.6e-145 Identity = 244/363 (67.22%), Postives = 306/363 (84.30%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0006727 vs. TAIR 10
Match: AT5G26030.2 (ferrochelatase 1 ) HSP 1 Score: 513.8 bits (1322), Expect = 1.6e-145 Identity = 244/363 (67.22%), Postives = 306/363 (84.30%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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