Tan0006035 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0006035
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG08: 20332859 .. 20336128 (+)
RNA-Seq ExpressionTan0006035
SyntenyTan0006035
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GCGATTGTAAATGGTAAATGAAAAAGGATACCTTCTATGTTTTATTAGACATCATCATATTGAATACATTACGCCTGACAATATTTCAATTAACTTTATTTATGCAGAATCGTTCAATAATCAAGTTTCTGGCTCAAGAAAAGAATGGGAGATAAATGGAAAAGGGGTGGTTTTGAAATTAAGGAAATCATTTAATTTAGAAGGAAAAAAAGAAAAAGGCATTTCCCCTTTCTTCTTCGTCTTTTTTGTTTCTTCTTCTCCCCGTCGACGCCATCCTTCGCCGCCGCCCAACGATCTCTCTATTGTGTTCTCAGTCCTAGCGTCGATGACAATCGTGCGCGAGACCCACAACCCAGCTTCATTGTTAGTGTGTCGTTCTTGTGATTCCTTGTGCGTGCAGTTGCTTTCGACTTGAGAATCAATGCTACAGAGGTCGGGTTTCTCAAGTTATAGCGGATGGTTGACTCTCCTTCGTGCATCCAGCGCATGGTAAGTTCTGGACTTTTAGGCTAATTTATGTAATTTTGTATTAATTTATGAATTATTTTAGACTCTATTTCAGATTACCCACAACCTTGAGACCTTGATTTTGGGTGATGGGGTCCAATTAGAGTCAACTTTAGCAAGGGATTCAAGAGAATTTTAGTAAAAATTTATAGTCTCAATTTGGATACATTAAGATTCAAATATGGTGTTGGGTTCGATACCAATTAGTCCATCCTTTCCGATTACATATAGTAACTTCAAGCCATTTATGTTGATGTTCAAAGTTTCCTTCAAAATTAAAGTTCAAGAATTGTGAATTCGCCATATTAGTTAACTTAAACAAACTAATTAGAGAATATAGAATTATGAGATGAAATGTTTGATGGAGTTTGGTGGCTCTCAGGACAAAGCCAAATCTTTAAAAGCGCTGATGTGTGATGAATTATGCCTCCCTAGCAACCATTTTCTTCCCCTTCCCTTTATCACATCTACAAGGTCAATCACACAAAAATATTCGAACTACAACTCTCCTACCTCTGTTTTTCATAAAATTATGTCCACAAATCAATTATGTGTGTATATATATTCTCCAATTTCCATCAATTAAACAATTCCAATGTAAGATTGTTTTCATGAGTCATCCATCATCAGCTTTACAATTATGTTTTTCTGTTAAATTTAGCTAAAGGCTATTTTTAAAATTATTTTAGAATATTTGTGTGTATATATAACACCATAAATATAGTGAGAAGAATGGAATTTACCATCCATAAGAGAAATATACTAAAGTCTGATTACTTAAGCCTAATTCAAATCTAGATTAAATTCAAACTAATTTTTTACAGTAGAAAATTGGTATCGTCAAACAAGCTTATTATTAGGTTAATTAGATTCTTTTTTTCACCCGTAATGAATGTCTTTTTGTATGGAACTCGCAAGTATTGCTTCAAATCCCAACCCAACTTGTCGAACAATTAGTCTTAAGATTCTTCATTTCACCATTAAACAACAACCAAAACAAAACAAGTTCAAGAGAGTTTATAATTTGTTAACGAATGAAAACATGTTCCATAAAAAGAAAAGAACTCATGAAAGAAAAAAAAGAGTAAGTTTGGTATTGTTTTTGTTTTGAAGCTTATCCCTATACAGGTTTTTTGTTTTTGTTTTGGGTTTCGTTTTGGTTTCTCTGACTTGCTGACGTTGTTGGATTGTGGCCAAAAAGCATGGTGGCTATGTTTAGTTACTCTGATTTATGGGAGTCTGTTGTTTTCTTGTTTAACAGGTTTAAGAAAATTTTGGTATTGTCATAGTTACGTTGTTATTCTGCCGAAATAGTCAGAGCATACAGGTTGTAAGTATAGTGGTGTTCCTTGAATAATGCCTTAGATAATCTTCATCTTAATCCAACACAACTTTTCAAATAATTAGCCATTAAGATTCTTACTTTTACCATTAAACAACAACAAAAATAAAACAAATTCGAGAGAGTTCATAATTTATTAACGAAATTGCTATGTTCATCTGATATTAGCATACTCTTTCTTTTGTACTTTTTCTTTGTTTCATTTTGCTTTCTACCTTGTTTATCCACGTTTTATATTATATTTCAAATATGGTAACAAATCAATTAACCCTTTCTTATTTATGTTTAGGTACCCATTCCCCCTCATGGTTTTCGAGTTGCATTTCTTCATTCTTTCTATTCCTCCTACTAAAGATTTTTTGTTATTCTAATGATATGTTCATTGCCATTTTATTATTAGTTGGATTGTCATTTACACATTTATTCTCAGCATGTATAACAATAGGTTGTGAATTTCTGATTCCAATACTAGACATAAAGTTCTCACCTGTACATTTTGACACTTATATTGTCCACTTATCCCATCATTTTGCGTAATGGTTGAAGGTCATGATCTGTACTAATTACTAGAGATTGAAAGGAATTCGTAAATTCCAAACTATTATATTGTTTTTACTTTTATACAACATTATTCATTTATGATATGATCTATCTTGGATCTTATTATTATTTCTCTCTATAGGGTTACTATATTATTTAGCTTTTGTTTTGGTATGGGATTGTGCTCGATATCTATTTGATCGTTAGCAGGTATTTGCTAATGGACATAATGCTATTATCTTATGTTTTCACATTTTAGGTTATTTTCTATTTGCTTAGCATGTGATGAATTACTTGGATTCCCCTCCAAGACATTTAGAATGAGGCACATCTCGAGTTTTTTATGTGTTTAAGAACGTCGAATTTTGACAACACTGTTCATCGGTTGCCAATTTTGGATTTTAGCTGGGTTGATTCTTTTGAGTCTAGTTCTCTACAATTTCTTACATGACCTCTTTTAACTTCCCTTCAATGCAGGCAAGAATTTTGACACACTGAATGCCTCTTATTTTCTCAAAGTCGGTGGCCATTTTGTTATATCGATCAAATTAAATCGATCAAATTGAGTGCATGATTAGCATTTTGTTAAAAATGTAAGATTGGGTAATATTCCATATATGCAAAGATGACATGTCTTGTATCGAACTTTTGCAGACAACCTGTATAGACTCAACCATTCTAGCAGAGGCACTGTTTGCTAGTGAGGTGAATAAGTTAAAAGCTTATCAATTCAAACCCACTGAGCAAGTAACTCTCGAACCATTCGAGCGAGATCATGCTTGTGTTACGTTGTTTGTATTTATTGCACCCAAGAAACAGAAACATGTTGTGTATATTACATAATGGGATTTGGATTTTAATGGATGGTTAGACAACTGTAG

mRNA sequence

GCGATTGTAAATGGTAAATGAAAAAGGATACCTTCTATGTTTTATTAGACATCATCATATTGAATACATTACGCCTGACAATATTTCAATTAACTTTATTTATGCAGAATCGTTCAATAATCAAGTTTCTGGCTCAAGAAAAGAATGGGAGATAAATGGAAAAGGGGTGGTTTTGAAATTAAGGAAATCATTTAATTTAGAAGGAAAAAAAGAAAAAGGCATTTCCCCTTTCTTCTTCGTCTTTTTTGTTTCTTCTTCTCCCCGTCGACGCCATCCTTCGCCGCCGCCCAACGATCTCTCTATTGTGTTCTCAGTCCTAGCGTCGATGACAATCGTGCGCGAGACCCACAACCCAGCTTCATTGTTAGTGTGTCGTTCTTGTGATTCCTTGTGCGTGCAGTTGCTTTCGACTTGAGAATCAATGCTACAGAGGTCGGGTTTCTCAAGTTATAGCGGATGGTTGACTCTCCTTCGTGCATCCAGCGCATGGCAAGAATTTTGACACACTGAATGCCTCTTATTTTCTCAAAGTCGGTGGCCATTTTGTTATATCGATCAAATTAAATCGATCAAATTGAGTGCATGATTAGCATTTTGTTAAAAATGTAAGATTGGGTAATATTCCATATATGCAAAGATGACATGTCTTGTATCGAACTTTTGCAGACAACCTGTATAGACTCAACCATTCTAGCAGAGGCACTGTTTGCTAGTGAGGTGAATAAGTTAAAAGCTTATCAATTCAAACCCACTGAGCAAGTAACTCTCGAACCATTCGAGCGAGATCATGCTTGTGTTACGTTGTTTGTATTTATTGCACCCAAGAAACAGAAACATGTTGTGTATATTACATAATGGGATTTGGATTTTAATGGATGGTTAGACAACTGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGTAAATGAAAAAGGATACCTTCTATGTTTTATTAGACATCATCATATTGAATACATTACGCCTGACAATATTTCAATTAACTTTATTTATGCAGAATCGTTCAATAATCAAGTTTCTGGCTCAAGAAAAGAATGGGAGATAAATGGAAAAGGGGTGGTTTTGAAATTAAGGAAATCATTTAATTTAGAAGGAAAAAAAGAAAAAGGCATTTCCCCTTTCTTCTTCGTCTTTTTTGTTTCTTCTTCTCCCCGTCGACGCCATCCTTCGCCGCCGCCCAACGATCTCTCTATTGTGTTCTCAGTCCTAGCGTCGATGACAATCGTGCGCGAGACCCACAACCCAGCTTCATTGTTAGTGTGTCGTTCTTGTGATTCCTTGTGCGTGCAGTTGCTTTCGACTTGA

Protein sequence

MVNEKGYLLCFIRHHHIEYITPDNISINFIYAESFNNQVSGSRKEWEINGKGVVLKLRKSFNLEGKKEKGISPFFFVFFVSSSPRRRHPSPPPNDLSIVFSVLASMTIVRETHNPASLLVCRSCDSLCVQLLST
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Tan0006035 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Tan0006035 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Tan0006035 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Tan0006035 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0006035.1Tan0006035.1mRNA
Tan0006035.2Tan0006035.2mRNA
Tan0006035.3Tan0006035.3mRNA