Tan0003465 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0003465
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG01: 28195127 .. 28200140 (-)
RNA-Seq ExpressionTan0003465
SyntenyTan0003465
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAACCGTCCTCCTCTCATAATTCAACTAATGGAACTTCAAGTGATGGATCTTCAAGTACTGATGGATTATTAAATTCTCAAACTCAGGTACAATTTTTATTTTCATTTATAATCTTTACATCTATTAAAAGTTATTAAAAAAATATTGCTGTTTTTGGACCATTTGCAAAAAGCATAGTTTGTCAAGCTAGTTAGGGTATAATTTTCCTTGTAAGTGAATGAATAAAAATTATGTTAATTTTTAGGTCTCATCTCGATAATGATTTTGTTTGTTAGTTTTCGTTTTAGGTCTAATTAACACTTTTGCTCTTGAATTTTCTACTTGATTTTTGTTTGATAAAATCATTATTCTTAATTTTTCTGTTCAAGTCTCATTTGTTAAGTATTTTGTTCTTAATTTTCAATAATTTTATTCTTCGTTTTTCTGTTTAGGAGTCTCTAGTTTTCAAAGATTTTTTTTTTCTTAGATTTTCTGTTTAGGTTTTAGGTTTTTTTTTGTTAACTATTGTTTTCTGTTTAGGTCTAGTTTGTTATGATTTTTTTTTTGTTTTTTTTAGATTTTCTTTTTAAAGATTATGTTTGGTTTTTCTGATTATGTTTTTATAAAACCTTTTTTTTAAAAAAAATATATTGAATTTTTAATAAATTTTTTTAAAAATTATTATTATAAAATTACTTTCTAAAGTTTTCAAAATTTAACTTTGAGTTTTTATTCCTTTTAAAAAGTAGATTGAAAAGTAAAGAAACACTAGTAAAACTACTAATATTTAAAAACTTAGTTTCTAAAATACAAAATCGCTAGCAGATTTGGTTTTAATTTTTAAAATTCAATCCCTGAGATTCTAATTCAAAATAGTATAAGTCTTAGAATCTAAGAAGATTAGGTTGGAAAGATGATTAATTCTAATAAATCTTAATTCAAATTAGAATGTTGATTTTAAAATTTTAGATTTAAATTTAACTTGTAAGTAAGTAAAAAAATAAACAATTTATCTAATAAAATAACCCTTTATTTCATTTCAATGCACTAAATTCATACTCCTATTTATGTTTAGGGCCATGTTCCAAACATGAGAAAGATATCTTCAGAAAATCAAGTTGATAATTCTTCAAAAACATCAGTTGATTTATCGTCAAATGCTCGGTCGCCACCGAGATCATCACCACAACCACAACTTCAACAACAACAAAACTCATTATCATTTAGAAATCATAATCCAAGAGGTCAACAATATTATGGCTCATCATATAGAAATCACAACAGAAATAGAAATAGTGAAAGTCAACCACGTTACAATAGAAGTGGTCAACAGCATCATCGTAATGATTGGTATAATCATTCCTATGTTGGTGGTTTTGAAGGTAGAACACCTTTTCTTAGGCCACATGGATTTGGTGGCCCCACCATCTCTCCCCAAGGTAAACTTCTATTTTATTCCTTAAATTATCCATCCTTAAATTTTTAAGTTTGTGTCAATTTCGTCTTTCAACTTTTTGATGTCAAATAAATCTTTAAATTTTTAATTTTATATCTAATAACTTTTTGACATATTTAAGATTTTTGAAAATTAATTGACTTATTAAATATAAAATTGAATTGAACCATAAACTTTTAAATTTGTGTCTAAATCATGAATTTTAAAAAAATATCAACTAAGTCAAGAATATGTTATGTAAAAATTGAAAATTTAGAGACCTATTAGACATATACATATTAGACACATTTCCAAGTTTAAGGACCAAATAGATATTAAAAATTTAGAGATCTATTAAAAAATTTAGTGACCAAATAGATACAACTTAAAAGCTTAGGGACTAAACTGGTGATATAACTTCTTTTATTTATGCTTTAAAGATATGATAAAATAATTTATTAAAACGACATGAAAAAACTTTAAATTTCTTTTTCCTCCCATATATTCACTAATCATCATTTATTATTTTTTTCTTTGGTATTATTAGGATTTTTACCTCCAAGGGCTCAATATATCCCTCCGAATTTCGGACCATTTAACCCTAACCCTTATTTGGTGCCGCTTCATCCACAAACCTATGAAGCAATGCATTATCAAATGCAAGGGTTATATTGGAGAGTTGTAAGTCAAGTTAATTATTATTTCAGGTATTTTATACTTTTTTTTAATATTATCCTATTGAGTAATCTATATTCATTATTATAAATTAATAATTAATATTTGGGTTTCATAACAATTAAATATTTCGATTTTTTAAATTAATGCAACTTTTTTGTTTTGTTTTTTACCTTATAAAAATTAGTTTGAATCTTTTAGTGAAATTTCAAGGTTAAAACAGATTTATATTTATCTTTTCAGTTTATACAAAGTTAATTATATAATAAAATGGTTATGAAATAAATATTAATTTTTAGAAACTTTATTTAATGAGGGCTTATTGGTGCAGCGACCAAAACTTGAGGAAAGATACATTTCTAAAGCAGCATATGGATGCTAATGGATGGGTTCCCATTACATTAATAGCTTCTTTTTATAGAGTAAGTGAATTTTTTTAATGTGTTTATATATTTTTAGGGTTTTATTTTTTTTATTTCTTCAATTTTATCTAATAATATATTTTTATTATTGTTATTATAAATGCTTTGTTATTACACTTATTAGAGACTTCATAGTGTTTTTAGTATAACAGGATTGAGAGATTCAAACAATAAATCTCGTGGTCGTTACATTTAAGATGTTAATTGAGCTATGCTTCCTCTAGCGAGACTTAGTTTTTAATTAGTGAACTTCTTACTTAAAAAATAAAATTATTTATTGTAGGTGTATAATTTTATTCTCTTTTTAGTCCTAAGAGGATTCAAACATAGTTTTTTATAACACTTGTCTCCATTTCCTATCTATTCCATAAAAATAAAACTAATTTTGTGATTATTTTGAAATTTCTCTCCTTTTGAAATTCCTTTCTATATCTATACTAGATAAGTAAAAATTCCAATAATATATTTCAATTTATCCAACAATATAGAAATAATGTAACTTTTATTACAATTTTTTTTAGGAAGACTTCTATTACAATGTTATTTTTATACTCATCTTTCTAATAATATTTATTTTATTTTATTTTACAGATGCAAGAGTTAACAAATGATATTCAATTTATCTTATTTGCATTACAAAGTTCAAGTGTTGTTGAAGTATCGATGAGGGTAAGTATGATGGGTGATTTCATAGGAGTTGTATAACTTTTTTAAAATATTAATTTTAGAATACAATTTGATTTAAACTTTTTTTTAAATGTAATTTTTTTTGAAGTTATTTAAATATGTGATTTTACTTGTATCACATATTTTGACAGCCATTTCTTTGTATTTTTTTATTATATTAATAACTCCTTTTCTTATTTTATTACTTTTATCTCATGTATTAGGGCCAGAAGATAAGGAGAAAAAGGTGATTATAAACAAATTTGCAGGACAAAGATTTACAAGAACCTGGGATTTCATGTACTTCATCCTCTTCTTGTTTGGTGTGGTTCAAGATGGACCATTTTTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGTTAATAATAATAAATCTATTTATAAGTTTAAATTTGCTTTATTTATGTATCTAAAGGTTATCAAAGTGGTGACCATATTGTAATGACAATATTATATATTAATTTTTCTTTTAGTATAATAGGGGTTGAGAGATTCGAATCACAGACTTTATGGCCGTTAAAACATTGAGGCACTTGCATGAATAGCAAAAAAATATAAATATTGCAGCCATGTCACTCATTAATTCAATTTGCAAAAATAGCAACAGAAAAAGACCCAACCCAACCAGAACGTATGACGTGCAAAGTAAAATATTTTTCGCGTGCATTTTTCAATATGAAGTATATTAATAGTCTATCAATAGTCTATAAAAATATATGATATACTAATGATATACCTTAAATGAAATATACTATTGATATACTATTATTATACCAAATATAAATTATATCAAATATATACTACTGTATTTAAAAAACTTTCTATCAACAATAGATCTAATATAGCAACAATATATCTAACCAAAAAATAATTGCATGAGTGATATATTATTTATTCTGTTGATTTCACTAATATTAAGCATATATCAATGTGATATACTACTGATATACTTTATTTATTATATCAACACAAGATATAACAAATAGTGATTTATGTTGACATACTTTATTCAGTAATATTAGGTATATCAACGGAATCTCAAAAACTATTGCTAGATTTACAAATGTCCTCCTTGTGTTTTTTAATATCGAGAAAAAAAGTATTTTATCAATAATAGATCTGATATATCAATGATATATCAAACCAAAAAGTAACTACATGAATGGTATGATATTTGTTGATTTCACTAATATTAAGCATATATCAGTGTGATATACTAAAGATATACCTTATTTAATATATCAACAGTATATCACAAATGGTGATTTATGTTTGACAGTGATTTATGCTGATATATTTTATTCAGTAATATTAAGTATATGATTTAAAAAACTATTGCTAGATTTGGAAATGTCCTTCCGTATTTTTCGAGAAAATAAGTAGTCTATCAACAATAGATTAAATATACTAATGATATATCTAACCAAAAAATAACTACATATGCTACTGATATCCGTTGATTTCACTAATATTAAGTATATATCGGTGTGATATACTACATATATATTTTATTCAGTATATCAACGATATATTACAAATAGTGATTTATGATGATATACTTTATTCACCAATATTCAGTATATCAGCAGGATCTTAAAACTATTTGTAACGTCTGACATTTCAGGTAGAGTAAATTTTAGGTTATGCTTTTAAGTTTCATGTAGAATTCATAATTTAAAACCAAATTGGAACGTTATATGTTATTTTGTGAGATGTGTTATTGTGTAGAAAGATGAAGTTGGGGCATTGTGATAGTTACTTGATAGATAATAGTAAAGCTAAAATTTTTTTGTTAAAATTTATAAATTTTGATAATATTATTTAA

mRNA sequence

ATGAAACCGTCCTCCTCTCATAATTCAACTAATGGAACTTCAAGTGATGGATCTTCAAGTACTGATGGATTATTAAATTCTCAAACTCAGGGCCATGTTCCAAACATGAGAAAGATATCTTCAGAAAATCAAGTTGATAATTCTTCAAAAACATCAGTTGATTTATCGTCAAATGCTCGGTCGCCACCGAGATCATCACCACAACCACAACTTCAACAACAACAAAACTCATTATCATTTAGAAATCATAATCCAAGAGGTCAACAATATTATGGCTCATCATATAGAAATCACAACAGAAATAGAAATAGTGAAAGTCAACCACGTTACAATAGAAGTGGTCAACAGCATCATCGTAATGATTGGTATAATCATTCCTATGTTGGTGGTTTTGAAGGTAGAACACCTTTTCTTAGGCCACATGGATTTGGTGGCCCCACCATCTCTCCCCAAGGATTTTTACCTCCAAGGGCTCAATATATCCCTCCGAATTTCGGACCATTTAACCCTAACCCTTATTTGGTGCCGCTTCATCCACAAACCTATGAAGCAATGCATTATCAAATGCAAGGGTTATATTGGAGAGTTATGCAAGAGTTAACAAATGATATTCAATTTATCTTATTTGCATTACAAAGTTCAAGTGTTGTTGAAGTATCGATGAGGATGAAGTTGGGGCATTGTGATAGTTACTTGATAGATAATAGTAAAGCTAAAATTTTTTTGTTAAAATTTATAAATTTTGATAATATTATTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAACCGTCCTCCTCTCATAATTCAACTAATGGAACTTCAAGTGATGGATCTTCAAGTACTGATGGATTATTAAATTCTCAAACTCAGGGCCATGTTCCAAACATGAGAAAGATATCTTCAGAAAATCAAGTTGATAATTCTTCAAAAACATCAGTTGATTTATCGTCAAATGCTCGGTCGCCACCGAGATCATCACCACAACCACAACTTCAACAACAACAAAACTCATTATCATTTAGAAATCATAATCCAAGAGGTCAACAATATTATGGCTCATCATATAGAAATCACAACAGAAATAGAAATAGTGAAAGTCAACCACGTTACAATAGAAGTGGTCAACAGCATCATCGTAATGATTGGTATAATCATTCCTATGTTGGTGGTTTTGAAGGTAGAACACCTTTTCTTAGGCCACATGGATTTGGTGGCCCCACCATCTCTCCCCAAGGATTTTTACCTCCAAGGGCTCAATATATCCCTCCGAATTTCGGACCATTTAACCCTAACCCTTATTTGGTGCCGCTTCATCCACAAACCTATGAAGCAATGCATTATCAAATGCAAGGGTTATATTGGAGAGTTATGCAAGAGTTAACAAATGATATTCAATTTATCTTATTTGCATTACAAAGTTCAAGTGTTGTTGAAGTATCGATGAGGATGAAGTTGGGGCATTGTGATAGTTACTTGATAGATAATAGTAAAGCTAAAATTTTTTTGTTAAAATTTATAAATTTTGATAATATTATTTAA

Protein sequence

MKPSSSHNSTNGTSSDGSSSTDGLLNSQTQGHVPNMRKISSENQVDNSSKTSVDLSSNARSPPRSSPQPQLQQQQNSLSFRNHNPRGQQYYGSSYRNHNRNRNSESQPRYNRSGQQHHRNDWYNHSYVGGFEGRTPFLRPHGFGGPTISPQGFLPPRAQYIPPNFGPFNPNPYLVPLHPQTYEAMHYQMQGLYWRVMQELTNDIQFILFALQSSSVVEVSMRMKLGHCDSYLIDNSKAKIFLLKFINFDNII
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..111
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..121

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0003465.1Tan0003465.1mRNA