Tan0001645 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGCCTTGTGCATTGATCTTCTTATCTTTTGCTTTGTTGTTGGGAGTCTCTGCGGAGCAATGTGGACGGCAAATGGGCGGCGCTGTTTGCCCAAACGGGCTGTGTTGCAGCCAATTTGGGTGGTGTGGCACCACCGATGCCTATTGCGGATCCGGTTGCCAAAGCCGATGTCGCTCAAACCTGACCCCGACTCCGACTCCGACCAATGGAGGCAACATCGGTAGGCTCATCAGCCCCGCCATTTTTGACCAAATGCTCAAATATCGCAATGATCCACGATGTTCTAGCAATGGGTTCTACAGTTACAATGCTTTTATTGCTGCTGCTCAGTTCTTTAGTGGCTTTGCTACAACTGGAGACGATGCCGCTCGTAAAAGGGAGTTGGCAGCTTTCTTGGGCCAAACTTCTCATGAAACCACCGGTAATTTAATTAAATCATGTTTCTGGTTAGAAATAGACTTATTTGATAATTCATTTCTGTTTTTTTTTTTCAAAATTTAAAAAGCGTTTTTAAAATTGAGTTCAATTTTAAAACTATAAAGAGTAGTTTCTCTAATTTGTTCCCTCTTATATTTAAACTTTTCTCAAAATTCTAAAACAGATATTTGGTTTGTTGGCAAATGTTGCTCATTTGTTTTCTTTTGCGTTTTAGGTCCTATGTTCTTCTCCTAGGAACTAGGAAGAACAAAACCGTGCCATTATATTTTAATTTCCATTTTTAAAATATATTTATATATGTTTTAATATTTATAATTATACTTTTATATGTTTTACTACATGTTTATATTTTAAACTATAAAAAAAAAAAATAATTATCAAACAAACTTTTGTTTTTATTTCTTGTTTTATAAAAAATAAGAAACAAGAAACATAAACATTATCAAACAAACAGAATCAAAATTAATTAATTCATATGATAAAATTGAGTGGTTTGAAAATGATGGTACAGGAGGATGGGCAACGGCACCGGATGGACCATATGCATGGGGTTATTGTCAAATAAGAGAAATTAATCGGGATACTTATTGCTCACCCAGCTCGCAATGGCCTTGTGCTCCGAACCAGCAATATTATGGTCGTGGACCCATCCAAATCACTCAGTAATTTTTCAACTTTATTCTTAACTTTTTTTAATATAATGTTTTAATTTTATTCTTTTATGTTTTCAAATCTTATCTGTCAGATTTTTTTTTCTTATCACAATTAAGCTATGTTTGACCTTTTTTTTATCATATCTTTATTATCATAGATGTGTTATACAAATGATAATCATTTTTATTTTGTTCTGTTTTTTTAAGAGTTCACTAGTTTCATGTTATTGTGGGTTGGGCGTAAAGTTATTATTAATCAACCATTATGCTATTTTGAGTTGATCATACAAATTACCTAATATCTTATGCTATTTTGATTTAGTAACTACAACTACGGGCAAGCGGGTAGAGCATTGGGATTGGATTTACTGAACAATCCAGATTTGGTAGCCACAGATGCAATCATAGCATTCAAGACAGCCATTTGGTTTTGGATGACACCATAAGGAAATAAACCGTCGAGCCATGATGTTATTATTGGTAGATGGCAACCATCAAATGCTGATAGAGCTGCTGGAAGAATTTCTGGTTATGGTATCATTACTAACATAATCAATGGAGGAGGGCTTGAATGTGGAGGCCGTTCTACTAATGCAGTGGCTAGCAGAATTGGATTTTACAAAAGATATTGCGACATATTAGGTGTTGGCTATGGAGACAATTTAGACTGTAACAATCAGAGTTATTAAATGTAATAAACGTCAATATTTATTAAATGTAATAAAAACATCTATGAGTGATGAGACTTATGATGTGTAATAGAATGTTTTGCTTTCCTCACCTTAATAAAAGCAAACTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTATTTTTCAGTTCACCGACATGGAAGGGAAGATATGAACCTTTCTAAACTCTTAAACAGAGGTATATGCCTTAACAACTAATGCTTAAATTGGCAACACAAACATCTCATGATGTAACTCTGTTGTGTTGTAACAACATATGCCAATATAAATATAAATTAATCTTTCTCCCCTGTTTTAATTTTATCTTTTGAAAATAAATAGTCTTTTAGTCTGCATCTTGCATGTAATGTTTATCAATAGATCAGAGTGGCGCCAGTGGAAATCGTGGCTCATGTACCACGATGGCCCATAACCTACATGTTATAGATATCACAGGATCGAAACTGTCTCTTATAAAATCCCCAATTTTTATTTAATAAAAAAAGAAATTTGAAAACAAAAAGATTAATGAAAACATTAGTTGTTTAGAGTGTATCATATAACATATTTATAGATCTCTCGATAAAGTTGAAATTTTTATTTATAAAAAAAGAAATTTGAAAACAAAATGATTTTTTATAAATTTTATAAAATTATCATTTTATAATATAATATTATATAATTTATAATATATTATATTATTCATATTTTAATTTAACAAAATTAAATTGAGTTTATAACATGAAATATTTTATTTATTGATAGTTTTATCTTTGTTTAATATAATTCTGCATGAATTCGGATAAAGTAGAAACATAAAAATGTTGTTATCAGAATTTCTTCTATTTGGATCATAGAATTCGAAAAACAGTTTTCGAAAACACATCTGTCAAACACGTATTCACTAAATTCAGTGAATCTGAAAACATAAAACAGAATTCGGATTGCATACCAAACAAACCCTAAGTGTTTAGAAAGACAAGATTTTTTAAAACTTGAACCATTGAAAAACATAATTCCAAAGAACATTATTTAATGATATTAATGATGGGTTGGATTTATAGTCTGGTATATTAAAAAAGGAAGATGAAAGATTAGCGATAAAGAGGAAGAATCAAAATTTAAAGAGGAATATGAAAGATTAAAAGACAATATGTGAAGGAGGAAAGAGGAAAGGTTAAAAGGATAATATTTTGCACATATTAAAAAAAAATGAAAAGGTAAAATTGGACACAAAAAATAACTTTTCTCTCTATGCCTTTTATATAACTATAGACATATAATCCTCAAACAACTCTTAAAGAAATATTTTATTAAGTGTTTGAGTATAATATTTTATAAAATCATATTTAGTTACTAATTTTAACTTCATATTTAGAAATATGTAAATAAATGTGCAAGAGATTATACTAGAATCCAAGGAATCGAAAACTAAATCAGACGAGTTCCATTCAATTTTTATTGTTATTCAAATCGAACCAAACTTTAATTAAAAAAAAAATGGAATCAACTTGAGAATTATTATGAATTGAAGGGGCAAAGAAGAAATGTGTTTAAATAGAGAGGGCAGGTTTGCAAATAATTAATTGTAATACTTGGTCGGTCAATAGTAATAAGGCTAATGACCATAAATTTGTAACCATATGTAATGAATACTTCCGTTGACTTGTGGAATTTTTATTATTATTATTATTATTTTTAGTATAATAAGTAAGACAAATTTAAGAAAAGAAACTTTCAAAAGGGTCGAAAGGTTCCCTCATCCAACTTGTGGAAATTGTATCTTGAAAGCTTTGAAAGTAACGGATGAAATATCTACCATTATAGAACTAGATATTTTTCACATCTACCATACCTCAAAAGAAATTAATGCGCGCTTCCATCTCTCAACAAAATTGAATGAACTAAGGTTTCATTTGTTTTTTAATTTTAAAAATTAAGCATATAAATACTATTTTTACCTATATCTTTTTTTGTGTTAACTTATATAGTTATATATATATTTAAAATCCATGTCAAATTTTGAAAATTACAAAAAAAAAAATCAAAATTTTATTTTTATTTTTGAAATTTTAGCTTAGGGATTCAAATGTTTTTCTACAAAAGAAAATGAAAAGTATTATAGAGAAGATGAAAATCATTCTAGAGATTGGAAAAATTGTACAAAAATAAATACAAATTTCAAAAATTAAAAATTGAAAACCAAATACTAAATGATTATCGTGACCAATTATTTGAGTCTTGTTTATATTTTTTTAATTTTAGTTTTAATTTATAGTTTTTTTATCTTTTCTTGTACAGAGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAGTTCTTAAAGACAAAAAGGGATAACCAAACTGCTTCTAGTTTTAGTTTTTGTCTTTTTATAATATATATAACAAGCAAACATAATTCTTTTTTTTGTAATGTCCAAATTTTGAACCTTATGATACATATGTTATACAGAGATGAAAGGCATATACAAAAGCAGATATATGATAGAAAGAGCAAAATAAAAGTCATAAGAGAGAAATGATGAAGGGATATGGGTTTTTTTTTTTTCTAACAATATGTTGGGTAAAAATTTCAAATATTTGATCTCTTGATTGAAGGTATTTGTTTTATGCCAGTTAAATTATGCTCATGTTATGTTAAAAAGAGATGTAAGAGAAACTCAAATAAACTGTCCAATAATTATATTTTTTTAAAATATAAAACTAAAATTAAAAAAGTTGGAATTTGAATTAGTCATCAAATAACACTTTAATAAGAACCAAACAATATTGCTAAACAGTTTACTTACATGTTTTTAGCTAAAGAGGACATAGTTCAACTAACATCTCGAAAATCAAGAAGTCTGTGGTTTGAATCCATCAATCTTCTATTATACTAAAAAAAATCATCCATTTTAAGGGACTTAACACATTAGTTCGAATTAAATTTACTTATCTGGACATATGATCAATCAAAATTTCCAACATAAGTAGAAAAGAATCAATAATACCCCTCCCCTAAATTTCTAGTAATATTTGTTAAATCAACAATCAAGCCAAAAACTTAAGCTAATAGATTAGAGTAAATTTAATAATATATTAACAATACTCTAACACTATTGTTGGCACATTTAAGTTTCTTCCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTGTACAAATTGATGTCATTCTCATTAATATCTCTATCATAATAAGTCTGGGTGGA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BLAST of Tan0001645 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P08252 (Endochitinase A OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=CHN48 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 422.2 bits (1084), Expect = 6.6e-117 Identity = 200/294 (68.03%), Postives = 232/294 (78.91%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P52406 (Endochitinase 4 (Fragment) OS=Solanum tuberosum OX=4113 GN=CHTB4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 416.8 bits (1070), Expect = 2.8e-115 Identity = 203/297 (68.35%), Postives = 231/297 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P93680 (Endochitinase OS=Persea americana OX=3435 GN=chi1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 416.0 bits (1068), Expect = 4.8e-115 Identity = 192/292 (65.75%), Postives = 227/292 (77.74%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P24091 (Endochitinase B OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=CHN50 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 415.2 bits (1066), Expect = 8.1e-115 Identity = 197/293 (67.24%), Postives = 230/293 (78.50%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. NCBI nr
Match: RXI06367.1 (hypothetical protein DVH24_018409 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 565.1 bits (1455), Expect = 4.8e-157 Identity = 273/415 (65.78%), Postives = 313/415 (75.42%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. NCBI nr
Match: XP_022132657.1 (LOW QUALITY PROTEIN: endochitinase-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 2.7e-152 Identity = 267/386 (69.17%), Postives = 306/386 (79.27%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. NCBI nr
Match: XP_023886131.1 (endochitinase-like [Quercus suber]) HSP 1 Score: 535.8 bits (1379), Expect = 3.1e-148 Identity = 257/407 (63.14%), Postives = 304/407 (74.69%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. NCBI nr
Match: XP_022132794.1 (endochitinase A-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 527.7 bits (1358), Expect = 8.5e-146 Identity = 268/461 (58.13%), Postives = 304/461 (65.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. NCBI nr
Match: XP_022926868.1 (endochitinase-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 509.6 bits (1311), Expect = 2.4e-140 Identity = 232/297 (78.11%), Postives = 256/297 (86.20%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498KG52 (Uncharacterized protein OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_018409 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 565.1 bits (1455), Expect = 2.3e-157 Identity = 273/415 (65.78%), Postives = 313/415 (75.42%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BUG0 (LOW QUALITY PROTEIN: endochitinase-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005462 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 549.3 bits (1414), Expect = 1.3e-152 Identity = 267/386 (69.17%), Postives = 306/386 (79.27%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BU42 (endochitinase A-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005566 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 527.7 bits (1358), Expect = 4.1e-146 Identity = 268/461 (58.13%), Postives = 304/461 (65.94%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EJE5 (endochitinase-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111433851 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 509.6 bits (1311), Expect = 1.2e-140 Identity = 232/297 (78.11%), Postives = 256/297 (86.20%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KUS6 (endochitinase-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497387 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 4.4e-140 Identity = 231/297 (77.78%), Postives = 254/297 (85.52%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. TAIR 10
Match: AT3G12500.1 (basic chitinase ) HSP 1 Score: 400.2 bits (1027), Expect = 1.9e-111 Identity = 192/299 (64.21%), Postives = 228/299 (76.25%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. TAIR 10
Match: AT4G01700.1 (Chitinase family protein ) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 3.7e-70 Identity = 117/220 (53.18%), Postives = 158/220 (71.82%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. TAIR 10
Match: AT1G02360.1 (Chitinase family protein ) HSP 1 Score: 257.3 bits (656), Expect = 2.0e-68 Identity = 116/227 (51.10%), Postives = 158/227 (69.60%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. TAIR 10
Match: AT2G43610.1 (Chitinase family protein ) HSP 1 Score: 188.0 bits (476), Expect = 1.5e-47 Identity = 113/303 (37.29%), Postives = 156/303 (51.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0001645 vs. TAIR 10
Match: AT2G43590.1 (Chitinase family protein ) HSP 1 Score: 187.6 bits (475), Expect = 2.0e-47 Identity = 105/281 (37.37%), Postives = 154/281 (54.80%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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