Tan0000546 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAAAAAAAAAACTTTGCTTTTTTATATATAAAACCAAAGCTGCTTCTTGTAAACTCTCTCACGAATTTCTCTCTCTGCGCCTGTCTTCGATTTGCACAGAGGGAAGAAGAAAATGGCGACGCCGGCGGTAGAGGGAGGTCCCGGCGGAGGAGGAGGAGCAGCCGTAGCACCTAGAGCAGGCCAACAGCAACAGCAACAAGGAGGCTTCGCTCAGTCTCTTACTGGAATCATAAGGATCGCCGTCTTTTGGTACTTCGCTTCTAAATTCTTCGCCCCCAAGAAGCCCTCTGATCCTGCTATTCTCATGTCCAATCTCTTTCAGAAGGGTGAACCGCTGGTAATTATGTACTTAGATTGTTAGATGTGTTGTTGAATAATTGAATTGAATTGAATGTTTGATGATTCCGTTGTACTTGTTGTTCTCTTTTGAACAATTTTGGATTTGATTTCCTTGAGAATATTGTATTTTATTTGTATGGCTTCTCTTCGAAATTCAAACTTAGCGTGCTGGATTCTGAGAAGGGTAGAGAATAGCTTTTTCACTATTGAAATTATAGTTGGCTTGGCCACTCATGTTTCCCGATGTTTATCGTTGAAGATTGAAGTGATTGAAAGTTTCACTGATATTGTTGACTACAGGAGTGAACCTAAAGCTTCTGTGTTGTGTGTCAAGCATGTGATGTAAATATTAAGCTTAATATAAATCGCTGCATTGAAATTTCTCTGAAGAGCTCGTACTGGTTCTTCAGCTGTTGAGTTCTTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTATCTTCGGGCATGCGTAAGTGTATGAAACCTCGTTTGCGTTATTTCACTCGTTGCACTCAATTCATGTGTAGTATACAAGAACATGTATGTTAAAAATCAAAGATATTTAATTTTCTTTATTCTAATGGGCACATCCACCTAACTCTACTAGGAAGATAATATAATTTTAATATTTTAGTTAGACAGCCACCATGGAGTTCGAACTCATTCCCTCTAACTCTCCTTACTTTTTTTATTCTCTAGTCTGAATGACCTCTAGCCAACCATGGTGGTTCAAAGGCTTTTGTTGAATATTATTCTTGGTGAACTGAGAGTTACCTAATTTGATATTTAAGCTGTTATTGCTGTAGATAATAAAACTTATCTGTTCTTAATTTCTTATGATAAATATTATGTAGGTTTTGTTACTTTTATCCATATGCAGCGGATTATTTTTCTGTCTATTTTTTACTTTTATTTATAGATCCTGTTACCAGTTGAATTAATTTCCTTCAGGATATGTGGGTGTATCTTTCTGAGCATGAAAGGTTTAATGACTTTGGAAATGAAGGTGCGCTTGTCTGGCATGAGAACGGTATACCTTATGCTGTGTGGGGGCAAGAAAGTAGCAGGTCTCTTTCATTTAAGTACTATCCATCTGAGGTACTGTTGAACTTATTACAGACAAATCTGTATATTTTCTTTTAGTCCCTTTCTTCATTCTTGATGTTAGAGGGGTTTGATACAATAGCTCTTCCTATAGGCCTTGAAACAAAATGGATCTTTGTATGCACATGTCTTCTTTGCACGGTCAGGATACACTCCAGACCCCAATGACCCAGAGTTTCAGCCTCTTGCTACATTTGGAAGGGCACATCGTAAGATCCTTATTTTTCCTTGTTATCTTGAGCTTTAGATTTTCCTGTTTTGTCTGTAATCAGGCAATGCATAATGTATGAGTACTTGAGGATGTGTACTTTAATTCATTTCAGCTATTGTGATGTATTTGCCCAAGTCAAAAGCAGATAAAAGGAGGAGTTTATTGGGTAATTCTGAAGGTTCTGATACGGGTGAAATTCTGAAAGAGGTGATTCCTTTACAGTTGAATAGTTTTGTTTGGTAACTTTTGTTCACTGATATAAAAGTCATGCATAGGTGTGAGGCATAAGGGATTCTAATTAGGCCACACACCCTTGAACGGTCACGTGCTTTATGTGTCTCTTGTTTTGTTTGGATGGGTTTTTCTATAATTACTATAGTCTTCTTATGAGGACAATCACATTTATTATTATTCTCATCATCGAGTACAATTCTTTGTCCGAAGTCACTGTATAAACCTAAAGAAAATTATCTAGAATCTGCTGAAAGATTGTTGATGTTCTGTTTTTGATGCTTGTACTTTATGAGATAGGGAGAGAAGCATGTTAATAATTTTGGCATTTAATATATTTCGTGTATTACTACTAAATATTTTTCACCGCATGTTAATACTTTCATTATTTAATATGCTATGAGTAATTAATTTGATAAAGATGTTATGCTATGCTATCATTAGTTATATCATATATGTATGGAAATTTGCATAAGTACCTTTGATAGGGGCCAGAGATATATTACCAACACTCCTTATGGGCACCAGGATTTTTAAGCTGTGTTTACTAGAATGCCATGAAATAGATTGCTCAAAGGGAATGAAATAATTGTGAATGGGATCATATTTTTAGTGTGTATTTTCCATTATCTATCCAATGATTCAAATTGCACTAGCATTTCTGTTCTGTTGTATTGTGGTCTAGTTTTCTTTACGGATTTCGTTTGATGGTATGCCAATACTTGGTCAATATTCAAGAAATATCATTCCTATTCTAAACAAGTGTCACTTTTGGTTGCTCAAGGTTGTTGATGATAACCAAGTTGATCTGAAAGATGACGGTCCAGTGGAGTGGGTTTCCTACTGGAAACCAAATGTTACTATTAATCTAGTCGACGATTTTTCACGGTGTGTTTACTGCATTTTAATCTTTAATCTCTGCAAGTTTTTAGAGCATTAAAATTATGAAAAATTATAATCGGTACAGTGAACCAGAAGGTTCTTGCTCATAGATTTGATGTTTCGTATTTTTTTTATCAGTTTCTTATTAAAAATATTTTTTGCTTTCATGATAAATGTTTTTTGTACTTTACTTTTTATTAATCAGTTATGTGGGATCTACTATGGTAACACAGACAGTAACACAGACAGCCACATGTTTTCTTCTTTATCTCTTATGTTGTGACTTGTGCATTATATTCCGATCTGCTAATACCTACAATTTTTTATTTTTTATTTTTTTGGCAGATATCCTCATAATGGCGTCCCTCCAAATATTGCTCCTTGTATCCTTTTATGTTCCTTTGTCCTTCTTCATGAATCTGGTTTTTTTCTTATCATCTTCAAGGCTGTAGAAGTAACAAAAGATATAAAAAAGTGGTTGATTGAAAGTTTAATTTAATTAGAGCATTTCAGTAGTTCTCATTAAGGGGTTGTTTGGGGCGTTGAGTGGGTTATAATAACATGAGTTATAATAGTTTGTGTGTTATTATAGTATGTGTAATCATATAATATTATTTACAATGCAGAGTAGTATAGTCTGGGGTTATAATAGTCTGTGTTTGGGGTGTCGAGTATTCCACAGGTTATAATAACACAGGTTATTATAACCTATGCCCCAAACATGCCCTAAGCTTTTATGCACATGCCTTTTTCATTTTGTGGAGTTCATGTTTGTTTGAGTTATCATGATTTTTGTCACAACTAAGTTGAGGGCCTTCTTAAGTTTTCAAGATATGATGGAAATTCATAGTTTTGTTATGGGTGATTGTGCTACCAGCTATGTAATGATGTTTGGTAGAAATCACAGGAACGTTACCATTACTTGCTTTGGGACTCCCATACTGTGGTGCACAAGATATACTAAAGAGACCCCTAGAAAGGTACCTCTTCAATTTTCCCTTCCTTTTCCCAATTCGCCACGTGCTCTATTGGGAATGGCTTGGGTATATCCATCTTTGGAGGACTTTTGGGTGGGGGAGAAATCCCTTGCCTCTCTTCTTCCCCCTTTTACCATCTTTCGAATATGATGTTATAGTTATAGTCTGTGGTGCCGGTCTTCGTTGGCCTTTCTCCAAAAGGGCCTCATTAGAGGCTGCTCTTTGCTCTTACTTTTAAGGGATTCCTTTGTTGTCTACGGAAAGAGGGATTCTCGCTTTTGGTCCTCTTCTCATTCTCAAGGATTTTCTTCTAGTTCTCTCCTTTCTTTTGAGAACGAACTTGGTGTCCCCGTCATCCTTTTGTTTTCTCTGCTCTGGAATATTAAGGTCCCCAAGAAGGTAAAGTTCTTTGCTTGATAGGTCCTGCATGAAAAAGTTAGTACTTTAGACCATGTGCAGGGACACTCTTCCTTCTTTTTGGGGTTTCAGTGCCTCTCCCTTTGTAGAGGTGGGAGGACCTTGACCATATCCTTTGGAGGTGCCATTACTCCTCGTCGATTTGGTTTTGGTTCTTGGACACTCTTAGCTTCTTTTTGGCTTGGAGTCGGAATTGTAGGGTATGATGGAGGAGGTTTGATGTATCTCCCTTTTAGGGAGAAGGGAAAAATTCTTGGAGAAGGGAAAAATTCTTTGGTAGGCCTTTTTCTCCTCCATTCTTTGCAGGATATGGCTGGAGAGAAATGGTAGGCTTTTTAGAGGAGGTGAGTGAGAGATATGAGGGGGAGTTGTGGGAGGTTATTAGGTTAAATGTTTCGTCGGCCTTGGTGGCTACTTTTTATAGTTATCAACTAGGTTTCACTCCTGTTGGGCTGTTTTTCTTATGTCAACTAAGTTTGCTTATTCAAAAGAAAAAAAAAATGAGAGATCAATTTCTTATTAAGGAAGAAAAAGATATACCATAAAGCAATAAGATAAACCAATTACTAATAATTTTTGTGTTTTTGCAATGAGTTAAAATCATCACTAGTACACCCTTCAGTATACTCATGATTCATGAACATGAAAGCAGTAGTTATTATGCTCTCGGAAATGTTTTCGGGAATGTTTTCTTTCATTTATTCATAATGAAAGTTGGTTTCTTCATCAAAAAATATTTCTGGGGCTGTTTATTGATGGGTTAGATGGACATTACATAAGGGTTGAAGATACGAAGCTCCTCAAACAGATTCTTACCCTTGGAGAAGATTAAAAGACGGATGT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ATGGCGACGCCGGCGGTAGAGGGAGGTCCCGGCGGAGGAGGAGGAGCAGCCGTAGCACCTAGAGCAGGCCAACAGCAACAGCAACAAGGAGGCTTCGCTCAGTCTCTTACTGGAATCATAAGGATCGCCGTCTTTTGGTACTTCGCTTCTAAATTCTTCGCCCCCAAGAAGCCCTCTGATCCTGCTATTCTCATGTCCAATCTCTTTCAGAAGGGTGAACCGCTGGATATGTGGGTGTATCTTTCTGAGCATGAAAGGTTTAATGACTTTGGAAATGAAGGTGCGCTTGTCTGGCATGAGAACGGTATACCTTATGCTGTGTGGGGGCAAGAAAGTAGCAGGTCTCTTTCATTTAAGTACTATCCATCTGAGGCCTTGAAACAAAATGGATCTTTGTATGCACATGTCTTCTTTGCACGGTCAGGATACACTCCAGACCCCAATGACCCAGAGTTTCAGCCTCTTGCTACATTTGGAAGGGCACATCCTATTGTGATGTATTTGCCCAAGTCAAAAGCAGATAAAAGGAGGAGTTTATTGGGTAATTCTGAAGGTTCTGATACGGGTGAAATTCTGAAAGAGGTTGTTGATGATAACCAAGTTGATCTGAAAGATGACGGTCCAGTGGAGTGGGTTTCCTACTGGAAACCAAATGTTACTATTAATCTAGTCGACGATTTTTCACGATATCCTCATAATGGCGTCCCTCCAAATATTGCTCCTTACTTGAATGTTGAGCCCACTACAGGAAACTACTATCCAACCATTTTCTTCAACGAGTTTTGGCTACTTAGAGATAAGTTGGTTCGAATCAACGAGACAGTGAATGAGCTGGTACTTAATCTTGAAGTGGCTCCCATAAGCATGACCAAGTGGCAGTTATTCCTTCAGATTGATCAGTCATTCCAGATTCACCGTAGCTATGGAAGCATGCTTGAAGGTGAGGCTGATGAGTTGAAGAGGGTGTTCTTGGAAGGAAATCCCTATCTCCTGGCAGTTACTATGGTTGTTTCATTACTTCATTCGGTTTTTGACATGCTCGCCTTCAAGAATGATATCCAATTTTGGAACAAAAATAAGTCGATGGAAGGACTTTCTGCAAAGTCTGTCATTGTCAGCTTTATATCTCAACTGATTGTCTTCTTGTATCTACTTGATAATGATACTTCGTGGATGATACTTGCAAGTTCTGGCATTGGTTGCTGTATTGAGTTCTGGAAGATAGGAAAAGCTATGCATATTGAGATTGATAGGAGTGGAAGGATACCTATGTTGAGATTTCGTGATCGTGAGTCATATGCAGGAAATAAGACCAAGGAGTACGATGATCTTGCAATGAAGTATTTGTCCTATGTGCTTTTCTTCCTTGTTGCTTGCTCATCTGTTTATTCACTCATGTATGAACAACATAAGAGCTGGTATTCTTGGATTCTTTCTTCACTTACAAGCTGTGTATACATGTTTGGCTTCATTATGATGTGCCCTCAGTTGTTCATAAACTACAAGCTCAAGTCTGTGGCCCATCTACCTTGGAGACAAATGACATACAAGTTCCTTAATACCATCATCGACGATCTATTTGCTTTTGTCATCAAAATGCCAACCCTACACCGGCTCTCGGTGTTCCGAGATGATGTCATTTTTCTTATCTATCTATATCAGAGATGGATTTACCCGGTCGACAGGAAACGTATAAATGAATTCGGTTTTGGTGGTGAAGAAAATCAAGGAGCCGAACCAACAAATGCGAATGCCATAAAAGAAGATGATGACAAGAAAACTAATTAA MATPAVEGGPGGGGGAAVAPRAGQQQQQQGGFAQSLTGIIRIAVFWYFASKFFAPKKPSDPAILMSNLFQKGEPLDMWVYLSEHERFNDFGNEGALVWHENGIPYAVWGQESSRSLSFKYYPSEALKQNGSLYAHVFFARSGYTPDPNDPEFQPLATFGRAHPIVMYLPKSKADKRRSLLGNSEGSDTGEILKEVVDDNQVDLKDDGPVEWVSYWKPNVTINLVDDFSRYPHNGVPPNIAPYLNVEPTTGNYYPTIFFNEFWLLRDKLVRINETVNELVLNLEVAPISMTKWQLFLQIDQSFQIHRSYGSMLEGEADELKRVFLEGNPYLLAVTMVVSLLHSVFDMLAFKNDIQFWNKNKSMEGLSAKSVIVSFISQLIVFLYLLDNDTSWMILASSGIGCCIEFWKIGKAMHIEIDRSGRIPMLRFRDRESYAGNKTKEYDDLAMKYLSYVLFFLVACSSVYSLMYEQHKSWYSWILSSLTSCVYMFGFIMMCPQLFINYKLKSVAHLPWRQMTYKFLNTIIDDLFAFVIKMPTLHRLSVFRDDVIFLIYLYQRWIYPVDRKRINEFGFGGEENQGAEPTNANAIKEDDDKKTN Homology
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O96005 (Cleft lip and palate transmembrane protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CLPTM1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 475.7 bits (1223), Expect = 7.6e-133 Identity = 246/568 (43.31%), Postives = 350/568 (61.62%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2NL17 (Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=CLPTM1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 471.9 bits (1213), Expect = 1.1e-131 Identity = 245/568 (43.13%), Postives = 348/568 (61.27%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DEL2 (Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog OS=Danio rerio OX=7955 GN=clptm1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 470.7 bits (1210), Expect = 2.4e-131 Identity = 261/623 (41.89%), Postives = 372/623 (59.71%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VBZ3 (Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Clptm1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 469.5 bits (1207), Expect = 5.5e-131 Identity = 243/566 (42.93%), Postives = 348/566 (61.48%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54RJ1 (CLPTM1-like membrane protein cnrB OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=cnrB PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 456.4 bits (1173), Expect = 4.8e-127 Identity = 260/617 (42.14%), Postives = 377/617 (61.10%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. NCBI nr
Match: XP_038881554.1 (cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1161.0 bits (3002), Expect = 0.0e+00 Identity = 575/601 (95.67%), Postives = 585/601 (97.34%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. NCBI nr
Match: XP_011653868.1 (cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog [Cucumis sativus] >KGN54751.1 hypothetical protein Csa_012477 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1147.9 bits (2968), Expect = 0.0e+00 Identity = 565/597 (94.64%), Postives = 578/597 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. NCBI nr
Match: XP_022967750.1 (cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1146.7 bits (2965), Expect = 0.0e+00 Identity = 563/595 (94.62%), Postives = 576/595 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. NCBI nr
Match: KAG6595710.1 (Cleft lip and palate transmembrane protein 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1146.0 bits (2963), Expect = 0.0e+00 Identity = 567/598 (94.82%), Postives = 581/598 (97.16%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. NCBI nr
Match: XP_023518298.1 (cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1146.0 bits (2963), Expect = 0.0e+00 Identity = 565/597 (94.64%), Postives = 580/597 (97.15%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L3N6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G443640 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1147.9 bits (2968), Expect = 0.0e+00 Identity = 565/597 (94.64%), Postives = 578/597 (96.82%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HVC1 (cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467178 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1146.7 bits (2965), Expect = 0.0e+00 Identity = 563/595 (94.62%), Postives = 576/595 (96.81%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BNS1 (cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491559 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1146.0 bits (2963), Expect = 0.0e+00 Identity = 565/595 (94.96%), Postives = 575/595 (96.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EYU8 (cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439877 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1144.4 bits (2959), Expect = 0.0e+00 Identity = 564/596 (94.63%), Postives = 576/596 (96.64%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EES0 (cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432571 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1143.3 bits (2956), Expect = 0.0e+00 Identity = 563/596 (94.46%), Postives = 579/596 (97.15%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. TAIR 10
Match: AT5G08500.1 (Transmembrane CLPTM1 family protein ) HSP 1 Score: 934.1 bits (2413), Expect = 5.6e-272 Identity = 458/591 (77.50%), Postives = 505/591 (85.45%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000546 vs. TAIR 10
Match: AT5G23575.1 (Transmembrane CLPTM1 family protein ) HSP 1 Score: 881.7 bits (2277), Expect = 3.3e-256 Identity = 429/593 (72.34%), Postives = 490/593 (82.63%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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