
Tan0000493 (gene) Snake gourd v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTAGTGGATTTCTACTTGAAGCAAATCGAGGCCCTAAATCCGGTGCTTAGGAGCGTGGTGGAGGTGAATCCGGAGGTGAGGGATGAGGTCGACAGGGCGGACCGACGACGGAGAGAGGGAAATGTAAACCGGTCATCGGTTGGAAGCCTCGACGGCATTCCGGTGCTGGTGAAGGATACTATGGCGACGAAGGATAAGATGAACACGACGGCCGGATCGTATGCATTGTTGGGATCGGTGGTGGCTCGGGACGCTGGCGTGGTTGAGAAGCTGAGAAAAGCAGGGGCGGTGATTTTGGGGAAAGCGAGTTTGAGCGAGTGGTATTCATTTCGGGCTCTGGGCCACGTGCCCAATGGCTGGTGTGCACGTGCCGGTCAAGGTGTGGTAAGTTCTGTCCTCTTGCCTAGTATCGCACCATGAAACGAAATAACTTTTTTAGGGCATGTTTGGGAGTGATTTTGGAGTGACCAAAATCGCTTTTGACATGTCTAAAATCACTTTTCTACCAAAAGTGTGATGTTTGGCAATATTAAGCAAATGATTTTAGAAAAATCCAAAATCACTTGAAGTGATTCATGGTCAATCACTTGAGAGGTGATTCCCAAATGATTTTTGTCAAGTGATTGTAATTTAAAATGACTAATATTTCATTTTTTGAAATAGAATACTTTTAATGACGGGTAAAAACCGTCATCTTTTGTCAAAATTCATAAATTTCCATAAAAAGGTGAATTTTCTCAAAACTGACAATTTTCTCTCTCTAAAGTTTTTATAATATGTATCTTACTTTATTTTTTTTTTTTTGTCTTTTTATTCATATTTTTCACTTTCCTTTCTCTCTAATAGTTTTAAGTCTCCTTGAATTTTTTTTATTTCTAATTTTTGTTCCTCCCTATAATTTTCGTACGTACCTTTTTAAAATTTTGTCTATAATGATTTTTATCTATTGCTCTACTTGTCTATAACTCTAATTTTTTTCTCCTCATTTTAGTTTTTCTTCCTAAAATTTTGATCATTTTGCATTTTTTTTTGTTTATCTCTCTATCTTTGAATTTTATTCTCTTTATTAAAATTCTCTAATTTTTTTGTCACTTTCTTTAAAATTTTTATCCCTTCATATTTCTAATTTTTATCCCTTCAAATATTAGAATAATTTATAACTAAATACTTTTTAAACATATTAACTAGGATTAAATCACTTAGCTTAAAACACTTTATGTTAAAGTCGTTTCCCAAATATGTCTTTTAAAGATCACTTAATTGTATGAAAATCACTATTAAAAATGTAGAACCAAACATGAAAAATGATTATATGGAAATCACTTTTAATAAATCAATTATAGACAAATCAATTACATTAAAATCAATATTTCTAAAATCATTCTCAAACATGCCCTTAGATTAAATAGTCCGCTCTAGATTTATGACTACTAATATATATATTTTTTTAGTCTTAAAACATATAATAAAGAAATGTCTAAACTTATAAGAAAGTGGCTAATTTATTTTAGGTAAAATACCTTTTTTGTTTTTGAGCCATAGCTACGTTTAAGAAAGTGGCTAATTTATTTATTTATTTTAGCTACGTTTGGTGTGGCTACCTTTTTTTTATTTTAGGTGTGGTGTTTTTGTTTTTTTATTTTTTCAAATTTTTATATAAAATCAATATTTTCTTCATATTTGAATGACTTTTTAAATTAAAAAGAAAAAATATTCTCTCATCTCTCATCCCTCCACCTTCCTTCCCTTCTTCCTTTCTTTTTTCTCTCTCCCACAACATCTTCCTCATTTTCTCTCCTATGTACTTCACTTTTTTTCATTCTCTCTAATCTTCAAACATGGTGGATCCCAACTATCCACCCTTCAATCTACAAATATGAAACAAATCCAAAAATTCTCTAGCTTTCTTTTTCCCTCAATCTTCTCCAATCACCAATCATCCAAAATCAATTTTACAATCACTATCTTTCAGATCCATTTCAGTTTTGAAACTCTAGATTAAGCTTAAGAGATTTCTATGTAAAGGTCTCATATATACTAAAGTATAGAGGAGAGAGAGTGGGGAAGAAGATGTTGTGGGAGAGGGAAAAAGGAAAAAAAGAAAGAAGAAAGATGGAGGGAGGAAAGAGGAGAGAAGGTGGTGGGAGAATTGAGAGAGAAAAATTATTTTTTTAATTTTAAAAAAATCATTCCATATTAAAAAAATATTGATTTTATATAAAAAATTGAAAAAAGAAGAATTAAAAATAGAAAAAAAAAAGAAACATCAGTGACTTTTTAAAGTTATTTCTCAAAATTTATGGACTAAAAAGAGTGAATTTTAAAATTCAGGGACCAAACACACCTATTATTCAAAATTCAATGACCAAAAAGGTATTTTACCTTTTATTTTAACAATTTAATTTTTGATTGATACATTTGCAAATTTTTAATCTAAGGGTTGATTGACTTATTTGACATATTTTTTAAAAAAAATTGAAAAAATTATTAAATACAAAATTGAAAATTTTGATTCCTATGAAGCATAAAATTCGATTTTATTGAATATATGAGAGACGACACAAAATTGAAAATAAAAAATTTAATTAAGTAATAAATTGAAAGTTATCTAATATTCACAAACTTAAAATTTGAGACCTGTTATATACATAAACTTAAATTTCAAGGCTTATCATATGCAAATTTAAAACTTTAATTTAAAGACTAAATTTGTTGGACTTTTTTATTATTATGGTAGATTTTAAAATTTTTTAAAAAAATATTACATTTTCCAAACTTATTATAAGAACATTGTTGTTTTAATAAGCTGGTGGATGATGTCTCGACCATCACTGATATTTTTTTATAAGATTTTGTTAGAGATTCTATATATAAAAGATTTGTGAAAATAGAAGAATGAATTAAGAAAATTAGAAAAAAAATGAATTAAGAAAAATGGTTTAAAGAAAGATGGGAGATTTTTTTTTTTACATTTAAATAAATAATTTAAAAATAAATTCAATGAATTATTAAAAAAATATATCAATCTTATTGATCTTCTTTACCAAATTATATTTAGAGAAAATATAAAACTTATTATAAACAAACAAAGGTGTATTTCTTACCAATGCTCAGTGTCCAAATATACAACTCATCTCTTGCCATTTAGCCTAGTGGCTTATGGTGGTTTATGAAAAATACACAATTGGTGAAAGAAGCCTCCAATTCTTTTTCTTCTCTCCCACTTTCTCTTTAATTTATTACTTATTTAATTTATCATAAATTTCCACTATCTTTTGTTTATATTATATATATATATATTCTAATTCTAATTTCCAAATACTTGAATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATATTATATTATTAATATATTATATTAGTATTTAAATATTGGTAAAATTATACCCGGTTTTCATCCTATTTTTACAACACGTTATCAGCACGAATCTTTGCCGATTTTTCCACTGAAGGTAGGTCCTTCGGGTAAGACATTTTTTTAAATAATAAAATGTTATTTTGCATGTTTAATTAATTTCCTAATGTAAATGAAATTTCTTTTTATATAGTATTACTATGGCAAATTTTGCAAAATTAGAATTTGCGGCCCTGGATATTAATGGAAATAACTACTTGTCATGAGTTCTTGATGCTGAGATCCATTTAGAATCCATGAAATCTTGGAGAAACAATTAAAGAAGGAAATGATACATCAAATCAAGAAAAAGCGAAAGCCATGATCTTCCTTCGCCATGATCTTCATGAGCGATTGAAAATTGAGTATCTTACAATAAAAGATCCCTACATTCTATGACAAGGCTTAAAAGAAAGGTATGATCATCAAAAAACAGTTATTCTTCCAAAAGCTCGTTATGATTGGATGCACTTGAGGTTGCAGGACTTCAAATTAGTAAGTGAATATAATTCCGCACTCTTCAGAATTAGTTCAAAACTAAAATTATGCGGAGAAAAAATTATCGATGTTGATATGTTTAGAAGACATTCTCCACTTTTCATGTCTCGAATATGCTCCTGCAGCAGCAATATCGAGAGAAATGCTTTAAAAAATATTCAGAACTAATTTCATGTCTTCTCGTGGCTGAACAAAATAACGAGCTATTAATGAAAAATCATGAATCTCGACCAACTGGAGCAACACCATTCCCTGAAGTGAATATTGTGAATTTCAATAATCGTGGTCGAGGTCGTGGTCGTGGTCGAGGTCGGGAGCGCGGTAGAGGAAGAAATACCTATTTTCGTGGTGGGCATTATAATTTTAAGAAACCCACACAAACTGATGATCATAAAAGAAAAGCTCAACAAGATAGAAGTTCAAAAGGTGATGAACATAAATGTTTAGGTGCGGAATGGTGGCTTTGGTCACGCACTGCCGTGACGTCAAAACACCTTGTTGATCTCTATCAAGCTTCCCTGAAGGAAAAAGGAAAAGGGAAGAATGTGGAGGTGAATCTTGCCATTCAAGAAGATGATGTGTTTGATCCCTCCAATATGGTGCATCTTGATGTGGCTGATTATTTTGAATCTCCTGGAGAGAAAATTGATGCAATCAAACAAGTAGAGAATGCTTTGTATGAAGATATATAATTAAGTACTCCTTGTAATTATAGTATGTTTTTTTTTCTTGTTTTTGTATATATATTTAGAACTTTTTGTAATCGCTTCTCCTTTCTTATCAATGAAGAAATATGAACAATTTCAATATGTTGAGTAACCCGAAAATGAGCAATGAGGATTTATGTCTAGCAGATTGCGCAACTACGCACACGATACTCATAAACAAAAAATATTTTTCAAAATTGACAATGCTGGAAGCAAAAATCAATACTATATCGGGTTCTGCAGACCTGATTGAAGGTTTTGGAAAAACAAGTTTATCTTACCTAGAGGAACAAAATTTTCAATTAATAATACTTTGTTCTCTAGCAAATCAAAAAGAAATCTATTGAGTTTTAAAGATATACGTAATAAT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ATGCTAGTGGATTTCTACTTGAAGCAAATCGAGGCCCTAAATCCGGTGCTTAGGAGCGTGGTGGAGGTGAATCCGGAGGTGAGGGATGAGGTCGACAGGGCGGACCGACGACGGAGAGAGGGAAATGTAAACCGGTCATCGGTTGGAAGCCTCGACGGCATTCCGGTGCTGGTGAAGGATACTATGGCGACGAAGGATAAGATGAACACGACGGCCGGATCGTATGCATTGTTGGGATCGGTGGTGGCTCGGGACGCTGGCGTGGTTGAGAAGCTGAGAAAAGCAGGGGCGGTGATTTTGGGGAAAGCGAGTTTGAGCGAGTGGTATTCATTTCGGGCTCTGGGCCACGTGCCCAATGGCTGGTGTGCACGTGCCGGTCAAGGTGTGGTAATTAATGTGAGACTTTATTTGCATATTAATTTCAACATGATGAATTGCAGGCCTATAACCAGGATGGTGGCGGATGCAGTTTATGTGCTTGATGCGATTGTTGGTTTTGATCCGAGAGATGCCGAGGCCACAAGTGAAGGCTCCAAGTTCATACCTCAAGGTGGATATAAACAATTTTTAAATCCCAATGGGGCCAAAGGAAAAAGAATTGGAGTTGTTAGCAACCCGTTTGCAGATAACTTCTCTTCAATGCAAGTTTTTGAGAATCATCTTCATACATTAAGGCAAAGAGGTGCTGTCATAGTGGATCATCTAGAAATAGCAGACATAAATATAATATTGAGTCCCAAAAGGAGTGGAGAACTAACAGTTATGCTGGCTGATTTCAAGCTGTTGCTAAATGATTACCTGAAAGATCTCATTACTTCTCCAGTCAGATCACTTGCAGATGTCATTGCATTCAACAATAAGAATCCTGAATTGGAAAAAATCAAAGAATATGGACAAGCTACCTTCATTCAATCAGAGAGAACAAATGGGTTTGGGGAGAAGGAAAAGAAAGCAGAGGAAATGATGGCAAATCTCTCTCGAAATGGATTCGAGAAGTTAATGAGAGAAAACGAGCTAGATGCGATCGTTACGCCGGGATCTGGCTGCATTTCGGTGCTCGCAATCGGAGGATACCCTGGAATTACTGTCCCTGCAGGATATGATGCTAAAGATGGTATGCCATTTGGGATCTGTTTTGGAGGGTTGAAGGGCACAGAGCCTAAGCTGATTGAGATTGCTTATGCTTTTGAGCAGGCTACTATGATGCGAAGGCCTCCATTTTTAAATTCAATGGATTGTCAAGTCTCATACGGTAGCAGTTGA MLVDFYLKQIEALNPVLRSVVEVNPEVRDEVDRADRRRREGNVNRSSVGSLDGIPVLVKDTMATKDKMNTTAGSYALLGSVVARDAGVVEKLRKAGAVILGKASLSEWYSFRALGHVPNGWCARAGQGVVINVRLYLHINFNMMNCRPITRMVADAVYVLDAIVGFDPRDAEATSEGSKFIPQGGYKQFLNPNGAKGKRIGVVSNPFADNFSSMQVFENHLHTLRQRGAVIVDHLEIADINIILSPKRSGELTVMLADFKLLLNDYLKDLITSPVRSLADVIAFNNKNPELEKIKEYGQATFIQSERTNGFGEKEKKAEEMMANLSRNGFEKLMRENELDAIVTPGSGCISVLAIGGYPGITVPAGYDAKDGMPFGICFGGLKGTEPKLIEIAYAFEQATMMRRPPFLNSMDCQVSYGSS Homology
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A1P8B760 (Probable amidase At4g34880 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g34880 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 402.5 bits (1033), Expect = 5.8e-111 Identity = 225/459 (49.02%), Postives = 301/459 (65.58%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9URY4 (Putative amidase C869.01 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=SPAC869.01 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 153.3 bits (386), Expect = 6.1e-36 Identity = 138/490 (28.16%), Postives = 212/490 (43.27%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D4B3C8 (Putative amidase ARB_02965 OS=Arthroderma benhamiae (strain ATCC MYA-4681 / CBS 112371) OX=663331 GN=ARB_02965 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 139.0 bits (349), Expect = 1.2e-31 Identity = 133/481 (27.65%), Postives = 207/481 (43.04%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B0TDK7 (Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A OS=Heliobacterium modesticaldum (strain ATCC 51547 / Ice1) OX=498761 GN=gatA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 2.3e-14 Identity = 115/473 (24.31%), Postives = 191/473 (40.38%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B1WYP3 (Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit A OS=Crocosphaera subtropica (strain ATCC 51142 / BH68) OX=43989 GN=gatA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 81.3 bits (199), Expect = 3.0e-14 Identity = 113/474 (23.84%), Postives = 187/474 (39.45%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. NCBI nr
Match: XP_004147067.2 (probable amidase At4g34880 [Cucumis sativus] >KGN61906.1 hypothetical protein Csa_006769 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 674.5 bits (1739), Expect = 6.0e-190 Identity = 350/473 (74.00%), Postives = 383/473 (80.97%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. NCBI nr
Match: XP_008457657.1 (PREDICTED: putative amidase C869.01 [Cucumis melo] >KAA0045710.1 putative amidase [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ99570.1 putative amidase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 673.7 bits (1737), Expect = 1.0e-189 Identity = 352/473 (74.42%), Postives = 382/473 (80.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. NCBI nr
Match: XP_038902577.1 (LOW QUALITY PROTEIN: probable amidase At4g34880 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 657.1 bits (1694), Expect = 9.9e-185 Identity = 351/471 (74.52%), Postives = 376/471 (79.83%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. NCBI nr
Match: XP_022146104.1 (putative amidase C869.01 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 640.2 bits (1650), Expect = 1.3e-179 Identity = 336/451 (74.50%), Postives = 363/451 (80.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. NCBI nr
Match: XP_015893444.1 (probable amidase At4g34880 isoform X2 [Ziziphus jujuba]) HSP 1 Score: 570.1 bits (1468), Expect = 1.6e-158 Identity = 294/414 (71.01%), Postives = 343/414 (82.85%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LPL7 (Amidase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G264010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 674.5 bits (1739), Expect = 2.9e-190 Identity = 350/473 (74.00%), Postives = 383/473 (80.97%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BIC8 (Putative amidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold123G001400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 673.7 bits (1737), Expect = 5.0e-190 Identity = 352/473 (74.42%), Postives = 382/473 (80.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C5Z2 (putative amidase C869.01 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497305 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 673.7 bits (1737), Expect = 5.0e-190 Identity = 352/473 (74.42%), Postives = 382/473 (80.76%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CX64 (putative amidase C869.01 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015398 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 640.2 bits (1650), Expect = 6.1e-180 Identity = 336/451 (74.50%), Postives = 363/451 (80.49%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P4AAW7 (probable amidase At4g34880 isoform X2 OS=Ziziphus jujuba OX=326968 GN=LOC107427572 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 570.1 bits (1468), Expect = 7.7e-159 Identity = 294/414 (71.01%), Postives = 343/414 (82.85%), Query Frame = 0
BLAST of Tan0000493 vs. TAIR 10
Match: AT4G34880.1 (Amidase family protein ) HSP 1 Score: 415.6 bits (1067), Expect = 4.7e-116 Identity = 224/413 (54.24%), Postives = 299/413 (72.40%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Snake gourd (anguina) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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