Spg032598 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview


Name	Spg032598
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Unknown protein
Location	scaffold11: 9015406 .. 9021329 (-)
RNA-Seq Expression	Spg032598
Synteny	Spg032598

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

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ATGCGAATTGACTCAGGTGACTTATATCCAAGTTCTTTCTTTGATGTAGGTAGAGTATAACCTTCTTTTAGAAGCTTCTTCTGTGGTGAAGAAAGTTCAGGTCTTTCATCAAAGATCCTTAGATTTAAACTCAGTGTGAGTTGTGAAGTCATATCCTGCTTTTGCTAGAAGCTTGTATACCTTAGGGTCATATCCATCTTTTATCTGTCTCTCAGGCAAAATCATTTTCATCTTGTTAGTCTCAGTTTTATCTTAACCTCTTTCTTTGTGATCTTTGTAAAAGGCATAGTGAAACTTTGTTTCTGTATTTTGATGTCACCAACCTTCAAGTTTCTCAGACATTCTACGAAAGGTGATTAACCCTTTTTGTGTCGAGATAGAGGGACGTACCGTAGGACAGGTGAATTCAAAAATTTTTCATCCTCTAAAATCTTAGGTTTTGGGGGTTCATAGACATTCCACCCATTTCCAAGTCGGGTACTTTCACATCTTCAATAGCCTTTCTTGCATCAGTTTGTGGCTCTAAATTGAGTTTATCACTCTTTTTTATTAAGGGTATTTCTGCATGCATAATTTCCCCCTGTGTTGTCGCTCTTCATATAAAACTTTGCATTAGTGAAATGAGACTCAACTTCTAAAAATGGGTTAGTGTCAGCTTCAACTTTCCTGATGCCATTTGATAGAATTTGAAGCACCAGTGCAATGTAGAAGTTATCACTCCATTACCATGGATCCAAGGACAACCTAACAACAACTTATAGGTGGTCTTGGAATCTATGACGTTAAACAAGGTATCAGCTTTTAGGTCCCTAATGATGAGTGATGTGGATTTTTCCTTGCCACAAGTGTACGGGTCAAGTTTTAATATAGTGTTTTCGTGATTACACGAGTGTCGTCCTCTGGATTGGTTTTCTAGTGAATTAATTACCGTGAATAATCTAGTCCAATTTTATTTATAGAGCAAAACTTATTGAAAAAGATAAATCTAAAGACAAAAACATAAAATAAATTCACTAACTTCCCTTTGGAAGTGGATCCCACTTCACTAACTTCCCTTTGGATCTGAAGTCCTTTCATAGATTCATCAAGTTTTAGACTCATTGCTCTAGACTCCTCAATATATTTTTGAAGTAAACTTTCTAAGGGAGATTTTTTAAGGGGTATAACTTAAAAATGAAAAATTGAAAAATGGTGTTGGTTCTTCGGGCTAAGATTCCCTAACGGGCCACCCAAAATTATAAAAAGCCATTCAAATCAATTAAAGCATCAACGATAATTAGGCTCTCAATTAGATGCAAACACCAAATGTAACGACTACATTAGGGGTTTTGATGAGAGGGCATTTTTGTAAATAACTCAAGTTTGGAGTTAGCCCTAAGTCTCCTTTCTTTGTCTTTGAGCCACACGCATAGTAGCCCTTTCTTTCTCCTCCTTCACGCCAAATCAGTCCACAGCCACCAGCCCTCCTTCCAGTGCATTTTCTTCTTCTTCTTCGTTCATCCGTGAGCCTCCCCTGCAGCGTCCTTCGGCCGGTCAGCAGGTGTCCTCCACATCTCCGGCGTCGGCAGCAAGCTTCTCCGATGAGCGTGGGGTCGGCGGCGGACAACAGTGTGGTTGCGGTGTTCGTCTTCGGTGGGTGTTTGCGGTTTCATGCGCTTTAAAAGGGTAGTTTCAGCGTGGTGGTGGTCGGCAGCGGCGTTTTCTTTCCAGCGACGTCTCCGTTAGGAGCGGTCAGCTTCGTTCAGGACCATATCTTGTTGTTTTCCGACGTTTCGTTCAGTGGGTAAGTGCTTAGAAGTCGTTTCATGGCTAAAAATAGCGTTTAATCAAATATCCACTAACTTTTGGGTGCGTTCAGGAAGCTCTTCTTTTAAATTCTGACGATTCAAGCATTGGGTCTTCGAGTTTCAACATCTTTGAGCAATTTCGGCTTTGGGTAAGTGTCTTACATTAAGGATTGAGGTTGATTTTGATGTTTAATCAATTACCCATTGATTCTTGTTGTTGGATTCAAGGTACACTTAGCATTTGGAGGCTTAATCGTCAATTTGGAGCGGAATTTAAAGCCCGGACAGCAAGCATTAGTTTCTGTTTTGGTGTAAGTTGGGTGAATTTTATCCCCAAAATTATTTGGCCCTAATCGTTGTAAGTCTATGGATTTTAAGAATGTTTTTCCCTTTTTGTGTAGCTTGGTTTAAGGCTTTGAAAGCTAAGGAGTTATTTTGGATTGTATCAAGTATTTGATATGTTAGGGTAAGTAGCCATTGGATTAAGTTTTATGCTTGAACCCATTTAATTGTGTACTTAGATGTGCAAGCATGAGTTGGATTTAAGATCTAAGTTTTGCCCTTGGATTCCAATAAGCATGATTGATTCATTTTGAAGCAAGAGAATAGTATGAAAATGTTAAGGTTAGTTGTAGCATGTTGAGTTAGCCTTAACGTAAGTAGTCGTTGGATTTAACTCTATGCATTGTATCATGTGATTGAAAAGTGGCAAGACTAGCATGGTTTGAGTTTGAGCTTAAGTTTTTTCCTTGGTGTAAGTAGCTTTTGGACATGACATAGTTGCTTTTGGAACCGTTGTATGCTTAATGGTAGTGAAATGAAGTCTTGGATGAGTTTTCATGCTTAGGTCTAATTTTTCGTGGAAAGTTGTATGCTTACTTGAACATGATTTAAGTGTTGCTTACTTGGACATGACTTAAGTGTTGTTATGCTTATAGAATTAAATAAGTGTGATATGTTGTGATGAGTCGTGAGGCATGACAATGATATGAGGACCTTTTTGTTTTTGTGGCATCTTCTGATTCACAACTAAGCATGTTTGGGATGTTTGATTCATGACTGTTTCTGGATTGTGTTTATGTTATTGGAGGATGGGCTAAATGTTTGCTGGAGTTGTGATTGAAGTAGATGTGAGATCTGGCTCGTTGAATTTATAGAAGTGCATCATTCTTGTTTTCAGATGCAAGGAAAAATTGTGGGTTCCCTATATGTACGTCGTTATGCTGCCGAATTTTCGGTAGAATTCGATGGTCCTAAAGTTAAGTTTAAATACCTTTGGGTATTAGTGTACTAGAGTACCACGTGACTGACAAGGACTGAACCTAGTGTAGGGACCTTAGTCTCCATTAGGGCCTTAGATGGACTTAAAAGATCCTTAAGTCTTATGTTAACTAGAGTGTTTTCCTTCCCCATCTCAGGGCTAATAGAACCCAGTTTTCAGGCACGTTATCATGCATTCTATCAGTTGACTGTTAGAGCCCAGTTGCAGGCACGTTATCGTGCGCTCTCTCTGTTCAGGACGATGTTAAGCCCATGTTCAGGCACGTTTTCGTGCACCAGTCGCTCCATCGAGTTTTCGATGTTGAGCTCATATTCAGGCACGTTTTCGTGCACCAGCCGCTCCATCGAGTTTTCGATGTTGAGCTTATGCTCAGGCATGTTTTCATGCACCAGATTGCTCCACCGTATTTTCTGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTGAATGTAACTGTTGACCGAACATTAATGAAATAATATTGATATATTTTCATTAAATGTTATTAGTTATTTTATATTTGTTTTTGCCTAAAAATAACCCTAATCCAATAAACTAGACATCCTAGGCTGTATTATGAGTCTTGAACTATATGTAGCGACATATGGGATCATTGTTCAAGAAACAGCCTAAAGGGTCTATAGTATAGGGATAAGACTGGGTGCCTTATCCTGGTGACACTATGGATACGGCCCACTTTGTATTTGATACAAACGCTACGATCCAACGCGTTCGTGTAAGAGACATGCAAGTGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACCGGACCGCGAAATAGTAACTACTGGTTATAACACCGTTAACTAGTTGGTTTTCTATTACACTAGGACGACCTAGACAACTTAGTCTTAATCCTGAGTTGATTATGGACTCCTGCTCATGAGAGATTGTCCTTTGATTTGCATGGGTGAGAGTGGCCAATACGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGGAGCTGAGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCTGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTGTTCCCTTAAGTGGTTACTCCGAGTCTTGAACAAAGGGCCCTACCCTCTCAATGGCACGAGAGGGTTTTCTGTTTGATGGTTGGACCACAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGAACTGGTACTTAAGGAAATAGAAGTAACCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCCAGCTGGTGTTACGGACACTCGTGAAGGACTAACTAGTCGATATTGGTCTATGTCCATGGACACAGAAAATATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGAGTCTATAGTGGAATGTACACACAGTTAACGAATATTGATTAATTTGGTTAATGAGTTTGACCAATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGATCTGCAGGTCCATTAGGTCCCACTGGTAGCTCATAAAGTAATTTGAGGCAACTAAGTAATAAATGTAAATTGAAAATGTTCAATTTACCAAGGGAAACAAATATAATATATATTGATATATTATTATGAGAGAAATTAATATTTGAAGAAATTCAAATATTAATATAAATTTATGGAAGTTTGAAAGAGTTCAAATAATGAATTAATTAAATTAAGGCCTAAAATCTATTTGGGCAAATTAATTAATTCAAGGCCGGAAATTAAATATGTGATATTTAATTGGTGGTTAATTAATTAAAGAATTTATTAACCGGGAATTAATCAATTATGGAAATAATTAATCACTTAAGGAAGTGATTAATCATTTATGGAAATGATCTAATCACTTATGGAAGTAATTAGTCATTTGTGGAAAAGATTAATCAATTGTGGAATTGATTGATCATGGATTGATTAAATAAGGAATAAGATTGAATCAATTTTGGAAAAGATTGATTTAATTGAATATTTTATTCATGGTCTCTCTTCTATAAATAGAACACTAGACCTAATTGGTCAAGGATACTCTCCTCTTTCTCTTACAATCATAAGACAAGACCTAGAATTCTCTCTAGCCTCCCTCTTAGAGAAAGACTCCCACAAGTCTTTTGCCTCCTAGACTTAGAGACATACCGGTGTAACCTCTGTGGTCATTGTGTCAATCAAGAAGAAATTTCCAGCGATTATAAGACAAGGAGGCTGCTGCGTTTTCGATCGTTGGAGCGTCGTTGGCGAAGAACGGTCAAGTCTTCAACGAAGGTTTGTAACGGTTCTTGCCCTTTTCTTTAGAAAAGCATGAAAATAAATTTAGATTTATTTTTCAGCATGTTTAAACCAATTTTCCATCAACTTTAAAGTGTGTTTAAAGTGTATTTGAGTTTTTCGTAACGGCATTTTAATGTTAATAAATATACAGCGTAAGGTCCTTTCGATGCGCTTCCGCTGCATGGGGACTTTTATTCCCTTCATTTTCATGATTCAGGGGTGTTGTGTTGGGATAGGTGTAGTTCGACTAGAGGTTGCCAGCTAGTCTCTAGTATACTTGCCTTACCCGACTGACCCACACAACACTCTAGTTGGCACAGGTTGGGGATAGGTAATCACCCTAGACAGAACATTTCATGAACCCAGTTATGGTCCTAGGGTTAGAAACCCGAATGACTGTTCCAGTTAGGTCCCTATGATGAACTCAAGTTTCATGCTATTAGATTTCATGTTTTCAGATCTCATGCCTTCATTTTCAGCCCTTAAGTGGGCTACTTACTGAGTATATTCTTATATACTCACCCATGCTACATGACTTCCCTTTTCAGGTGGTACTTGATGACATCAGGCGAGTGGCGAGGGCAGTGACTTGGCTAGGCTATGGGATGCAGCTGCAAATCATGTCTCTAGAAGTCTAG

mRNA sequence

ATGCGAATTGACTCAGCCACACGCATAGTAGCCCTTTCTTTCTCCTCCTTCACGCCAAATCAGTCCACAGCCACCAGCCCTCCTTCCAGTGCATTTTCTTCTTCTTCTTCGTTCATCCGTGAGCCTCCCCTGCAGCGTCCTTCGGCCGGTCAGCAGGTGTCCTCCACATCTCCGGCGTCGGCAGCAAGCTTCTCCGATGAGCGTGGGGTCGGCGGCGGACAACAGTGTGGTTGCGGTGTTCGTCTTCGGAGCGGTCAGCTTCGTTCAGGACCATATCTTGTTGTTTTCCGACGTTTCGTTCAGTGGGAAGCTCTTCTTTTAAATTCTGACGATTCAAGCATTGGGTCTTCGAGTTTCAACATCTTTGAGCAATTTCGGCTTTGGGTACACTTAGCATTTGGAGGCTTAATCGTCAATTTGGAGCGGAATTTAAAGCCCGGACAGCAAGCATTAGTTTCTGTTTTGGTATGTGAGATCTGGCTCGTTGAATTTATAGAAGTGCATCATTCTTGTTTTCAGATGCAAGGAAAAATTGTGGGTTCCCTATATGTACGTCGTTATGCTGCCGAATTTTCGGTAGAATTCGATGGTCCTAAAGACGATGTTAAGCCCATGTTCAGGCACGTTTTCGTGCACCAGTCGCTCCATCGAGTTTTCGATGTTGAGCTCATATTCAGGCACGTTTTCGTGCACCAGCCGCTCCATCGAGTTTTCGATGTTGAGCTTATGCTCAGGCATGTTTTCATGCACCAGATTGCTCCACCGTATTTTCTGTCCATTAGGTCCCACTGCGATTATAAGACAAGGAGGCTGCTGCGTTTTCGATCGTTGGAGCGTCGTTGGCGAAGAACGGTCAAGTCTTCAACGAAGGTGGTACTTGATGACATCAGGCGAGTGGCGAGGGCAGTGACTTGGCTAGGCTATGGGATGCAGCTGCAAATCATGTCTCTAGAAGTCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCGAATTGACTCAGCCACACGCATAGTAGCCCTTTCTTTCTCCTCCTTCACGCCAAATCAGTCCACAGCCACCAGCCCTCCTTCCAGTGCATTTTCTTCTTCTTCTTCGTTCATCCGTGAGCCTCCCCTGCAGCGTCCTTCGGCCGGTCAGCAGGTGTCCTCCACATCTCCGGCGTCGGCAGCAAGCTTCTCCGATGAGCGTGGGGTCGGCGGCGGACAACAGTGTGGTTGCGGTGTTCGTCTTCGGAGCGGTCAGCTTCGTTCAGGACCATATCTTGTTGTTTTCCGACGTTTCGTTCAGTGGGAAGCTCTTCTTTTAAATTCTGACGATTCAAGCATTGGGTCTTCGAGTTTCAACATCTTTGAGCAATTTCGGCTTTGGGTACACTTAGCATTTGGAGGCTTAATCGTCAATTTGGAGCGGAATTTAAAGCCCGGACAGCAAGCATTAGTTTCTGTTTTGGTATGTGAGATCTGGCTCGTTGAATTTATAGAAGTGCATCATTCTTGTTTTCAGATGCAAGGAAAAATTGTGGGTTCCCTATATGTACGTCGTTATGCTGCCGAATTTTCGGTAGAATTCGATGGTCCTAAAGACGATGTTAAGCCCATGTTCAGGCACGTTTTCGTGCACCAGTCGCTCCATCGAGTTTTCGATGTTGAGCTCATATTCAGGCACGTTTTCGTGCACCAGCCGCTCCATCGAGTTTTCGATGTTGAGCTTATGCTCAGGCATGTTTTCATGCACCAGATTGCTCCACCGTATTTTCTGTCCATTAGGTCCCACTGCGATTATAAGACAAGGAGGCTGCTGCGTTTTCGATCGTTGGAGCGTCGTTGGCGAAGAACGGTCAAGTCTTCAACGAAGGTGGTACTTGATGACATCAGGCGAGTGGCGAGGGCAGTGACTTGGCTAGGCTATGGGATGCAGCTGCAAATCATGTCTCTAGAAGTCTAG

Protein sequence

MRIDSATRIVALSFSSFTPNQSTATSPPSSAFSSSSSFIREPPLQRPSAGQQVSSTSPASAASFSDERGVGGGQQCGCGVRLRSGQLRSGPYLVVFRRFVQWEALLLNSDDSSIGSSSFNIFEQFRLWVHLAFGGLIVNLERNLKPGQQALVSVLVCEIWLVEFIEVHHSCFQMQGKIVGSLYVRRYAAEFSVEFDGPKDDVKPMFRHVFVHQSLHRVFDVELIFRHVFVHQPLHRVFDVELMLRHVFMHQIAPPYFLSIRSHCDYKTRRLLRFRSLERRWRRTVKSSTKVVLDDIRRVARAVTWLGYGMQLQIMSLEV

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spg032598 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg032598 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg032598 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg032598 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 18..71
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 18..63

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spg032598.1	Spg032598.1	mRNA