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Spg029073 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATTCAATCAATAATCCATTGCATGTACCTGAAGGACCAATCACAAGGAGCAAAGCAAAGAAGATACAAGAGGTTTTCACACTGCACGTTCAAAAGCTAGCAAATACACAACGAGAGGCCGAGAATTTTGAACCCAAATTTGTGTATAATGTTAGTTCAGCAAGTCAAGAAGAGAATGGGGTCAAGATGGCACGGGAAAAGTTGTGTAGTTTGGAAGATGTCACGGGGGACGAAAACAGTGTGCAGAATTTGTGAAGAGGTGGCTGTCCAACTTGCCTCTCTTGGGATTTCGTGATGTCAAAGGTTGTCAAACATTGCCATTATGAGGAGCGGATTTCATAGCACATATTTAAGACAATTTAAAGCAATTCTATCTTTTTAGTTTTAAGATATGGCTGCTCGTTTGATGTGCAATCAAGTTTTAAGTTCCTAGGTCTTATTTTCTACAATTTGCAATTAAGTGTAAATGAATGACTTTTGAGTTCCTTGGTCTATCCACGACCATTTGGCCTTTAAAATGGCTTGTAATACTCTTGAAAGCTCAGATTATGCATATTAAAAAGCTTTTTCTTATTCAACCCCTTTGGTGTTATCTTTTCTTTCAAATCTTGTTTTAGGTTTGATGTTCAACCGATTCATTAGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGTGAGTCGTCTTAGGATCTTTGAGTGACCATCATAGATTCTAAGTTTGATCTAAGAGTGATTCATCTTCTAACTAAACTCTTGGTTGGAATCATTCGATAAGTTTGTCTTATTTGTGTCCGTTTACAAGGATCCTAGAAGGACCTCTAGCTTTGTAAACTTAAGCATATTGGGCGCTTATCACTTTTGTTGCGGCAACCACATACGTCGATAAATTATTCTGTAATGTACAGTATAAATGAAATCCAATTGATGCTTAAGTGAGAAATAAACATGTGATTCTCTTCTGGTACTACACATGCGTTTGGAGTAGAACTAACAACATTCTGTTCAATTAGCTCATGCGTTGGCGCTGTTCTCTAATGACTTGCAAGTGATTGAGTTATTCCTAAAACAATCTAAGCACATTCATGAAATATCTCTTGCGGCAACATTAAATCTAATACAATCTAGACTACATGCAATGCGCTATCTTGCTCTACTTAGATAATTCCACATGCGTTACCTGTCAAGGATTTATCATGCTGCTACCGCATCCGGCTGGCCAGGCGGGAGTTAGTAATGAAAACATTATCGCATCTAAGCAGAAAGTATCAATACTTCATTCATTCAACTATAACGCATACATAATAATGTCATCACCACATGGGTGCCTTAAGCTAAGCCTTGATAAGAATAATTTAGCTCATGCTATAGAGGAAAGACATAATGTGAAACATTATGTCACAAACAAAATAATTGCGCTGGGACTCTATGTCTTCTTCTCTGTCTCTTTTCTCTCTTTTTGCACTTCTCCTCTCTGTCCGAACACCTACATCTGGCAGCTGGGCGATTATTTATAGGCTAAAGATGCTGACTTCTTCAAGAAATTGGCTTGCGTGCCCCAACCTTCTCTTGCCAGCTTGCACATCAGTCACACATCAGGGCGACCATCCATCCGGCTGTCATCGTACGATTCACGCTCTAGGATCTGCGCCTGCGCTGAAGATAACTTGGGCAAGGAAACAACTACAGAAACCATGCGTTAGCGGGTAAAGATATGCAATTTCCTGCCACATTAAGGAATACTCATTTAAAGATTTAGTTATCGCAACTCTCTACTTCCATGCGTTCAATCCGTGCATCTTTGATCTTTTCCAGCCTTATTTAGTTTAATTGTAGGAGAGAAATAACTTGCTTTTTGCAAGTTATCAAGATGACCTAGGTAACTCAGTATTAATCTTGAGTGTGTCATGATCTCCTTCTCATGAGGGATTGTCCTTTGATTAGCATGAGTGAGAGTGGCTTATACACCGACTTAATAAGCCTTCCTATTTGGGGACAAGACCGAGTGGGAGGCTGGGGACATGACAACACAAGAAGGAATTCACTCCTTCCCACTTCTAGGAGAAGTAGATGGGTGTTCCCTTAAGTGGTGACCCCGGGACTTGAACAAAGGGATCCCGCCCTCTCACTAGTTCGAGAATGACTTTCTGTTTAATGGTTGGACCATAAACATGTTGTTCACTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGAGACAAATGTAACACAAGGGTAAACGATAATTTGACCCAACTATGGTTACAAACACTCGTGAAGGATTGGCTTATCGGTATAGGTCTATATCCGTGGACACAGAAACGTTCTATAGTGAGAAGAGTTCAGCTGTGGGTCTTTAGTGGAATGACCCACAACTAATGAATATTGGTTAACCTGATTAATGAGTTTAATCAGTTAACTTCATATCATTGGAGCTTCTGATTTGTAGTTCCATTAGGTCCTACTGCTAGCTCGTAAAGTGTTATTAGGAACAATTATATCTTGAGAAAATTTGAATAGTTCAAATTCATATTAGGAATTAATTTAATTGTATGAGATATAATTAATATAATGTATATTGATGCATGAAAATATAAAATCTAATTTGAGATTAAACTTTATTATATTGAGAGAATGATATATTTGAAAGAGTTCAAATATATGGTGATATTTAATTAGAAGATGAATTAATTAATTATTCAATTTAGTTTAAATTAAATGAGATTTAATTAAACTATAGTATATGAGAGGGATGTACATTTGAATATGGTCAATTAAATAAGTGATATTTAATTGATTAATAATTAATTCATTGGTTGGTTTAATTAATTTAATTAAATGTGATTTAATTAATTTTAATTAAAACTATATATTATGTGAGGGTATTGCATTTAAATGTGCATGAGGTTAATTAATTATTATGATTCATTAATTAACATTTAATTAATTAATTAAATCAATTTTATATTATTTAATTAATTGATTCTTGATCTAACAGTTTAGATCTTTTCCTAACCTCACATTAGGGTTTCCTCACTTATAAAAGGAAAAGTTATGAGAATCCTAACACTAAGGCCACAAGAAGGCATTCTTGCATTCCCTCTAGCCTTCCTCTCATATTCTCTCAACTCAAGAACACAAGAACACAAAGGGAGAATTTTCTCTCTAGAATTTTTCCCATTCAAGATTAGATAGTCCCAAAACTACGTTCCTAATCTCAGAGTCATAGCGGGAAAAATCAATTGGTGGTGTCCCAATTGTTGACGCTTGGTCCCTATGAAATAAAGAAAGGAATTCTTGATATTTCAGAGACGACAATGACGGTATATATGTTTCCCCCCTTTAGATTAGATCTAAGGTTGTATGCTTAACTTTAATAAATAGATTAAGAATAGTTTTCTGAATCTTTTCCAATGTATTGATATTTTGGTAGAAATAAAATTAACTACGAAACGGTCCAATTCGCTTTTGCTAACGGAATTAGGGAATTCTAATCCTACAATTGGTATCAGAGCCGATCATAGATCTAATTTTGTTTTTCTAATATTTGCATTGGTTCAATGGTGGGATTGAATTGTTCATTTGATGTATGTTTTTTTTTTTTGCTAGTAGATGTTTAAGGTTTTGGCATATTAGATTTGCTCTTTTTCGTTGATTTGATCAATGTAAGGGCAGTGTTTTGGGCATTTAATTGCAAATCGAGTCTGTAAGTCTGTGTCGTTCGTGTTCTTGTGAAATTCCATGAAGAACTGAAGAAATCAAATCAAATTTGGCCAAGAATGAAAACAGGGAATGGAAAATTGGGAGAAGCAGAGGCTTCAATCGAGAAAAAAATCGGGCGGCCTAACGTCAGAATTCCGAGAAGGACAGAATAGCTGACGTCAACCCTAAGTCGTAGGTTTGGCGCGGTCCAGTAGGTTCAACATAGGTTCGACGCGGTCCAGTAGGTTCGGCGTTGGTTAGACACGTGTTCCTGGAGGTTCAGCAGTTGGGCGCGGGTCGTAGCGGTTTAGCCGGTTTCCAGCGGTCTTTGACCAGTTCACGCAAGGTTTTGACCGGTTTCTTTGAAATTTGAACGATTCAGTCGCGGTTCTTGACCGATTCGCGAGTTTCAGGCCCGGTTCTTGACCAATTTAGTAGATTTTGATCTATTCTCGAGTTTTTTTTACCATTTTCCTTTGGGTTTTGATCGGTTATGTTGGTTTTAGGCCGGTTCAAGTGGTTTTTGAAACTGGTTTAGCACATTTTAAGCCGATTCAAAGTGTTTTGAAGCTGGTTCAGTGCGGTTTAGCCCAGTTCTTGATGGTTCAAAGGTTTTGGACTGGTTCAAGGCTAATTTGGGCTGATTCACGGCTAGATAGGACAATTTTAGATTAATTATCGTAAATTTTCTTATGTATTTTGTCCTAGGATTCCAAAACCTGTCTACTTAGCTGTTTATTTGCTTTATGGATATCATATAGCTTAAAATCCCACCATAGGTTAAGCATATTCAGGCATATTTATATTATAATTGTTGTGATGTATGAATTATGCATGAATTTTATTTTCATGGATATTTAATATAAAGTGTTATATTAAATGGATGAAAATTGAGAAACATTGAGCATGTAATTACTTTAGTTAAAAATATAAGAGTTATATATTTATGAAAGTAATTTATATGCTTAATTAATTTTCATGAGCAATTAATATAAGAGTTATGTTAATGTATGGAAATGGAAATTGCATGTTTTGATTTTCTTGGATAATTAATTTAATGAGTTGGATTTATTAAATGAAAGTTGAAATGCATTGAGCATGACATTACCTTAGTTTAATATAATTGTTATATTATTGTATGTCATGGATGCTAGTGTATGGTTTATAAATTAATTATAATTCGATTGTTAATTTATGTCACCATAGTAGCATGTTATAAGGGTAACTCATTAAAATTTATAAGTGTTATAAATTTAATGAATAGAAACCGTTAACCTATAACAAAGATTTGCATGTAAACATAGGATCTTAGAAAAAATTGATTAATTTTAAATTTGTTTAAAATTAATTACACCTAAGACCCATTTCTAATAGGATTAGAATTTTTTTTTTGTCTTACTTAGTATTTTAATAAATTTAAACTATGGAGGGCAAATAGGACTTTGGTTATAAGGGAACTCTCTCGGTGGAGTTCTGTCTAGGCTGGAGGTATTTAAGTTGACGGTTTACGGAACACCTCCTACGTGGGAACTGACCCGGTACATGAGTTGGATTAACCACTGTCTTATTAGCATGCAATGTCACTAGGTAATTAAAAAGGTTTGATTGACCTAGACATTAGGATAAAGACCTAATTATAAGAGTTATAATAGGCATAGACTTAGATAGATTGAATTAGCCGGATTTATCTAAGTTAAATAACCCTAAAATACGGTAGGACATTTCAGTGGGAGGATAAATATAAAAACGAGATTTTCATATCGAGTTTTTATTCTCACGTTCCCCTGTGTTCACACCGTGAGATCCATGCTCGGCTTCGTGTCGCCTTTGGCGCGGCCTCCCTTCGGAAAGTGTTTGCATGAGTTAATAACAAGGTGAATGGGGAAAATGTCTATAGTAAGTGGGAGTGGGACACGTGTCAACGTATCCCTCGGTCTCCGCCCTTAGTTCACATCGTGAGAGTCATATGGTCTGCTTGCTTGTTGCCCTGGAGAAACAATCCTTTTGTTGGGTCCGATCATAGGATTCGGAACACCGTGAACTCCTGAAAAGGATAAGGACTCTTTGGTTAATTACCAACAATTGTCTTTCCCTTCGGTAGCCTGTTGGTGCGTGCCTTTGAGATCTGAAAGTGGGAGGGTTACACTTACAGGGATGAGTTAAATGCATTAATGAATCCTTGACTGAACAACAGTAACTAAACACTAACAGAATATGAGTTATTTCGGTGTCAGGGTTTGGTTGAGATTGTCTCAATTCAGAGGATGAGTATCTGACCACCTTTTGGTGGTTGTTGTTCTAAACCTCTGAAGTATCGTTGCAAAAACTAAATCACTAGTTTTCTAGGGTTTCTTTGATTCCTTGTGTGTTTATGCTGAATTTTGATTGGATTAGATGTAATGGGTTAGTGCGATAAATAATCAAGTAATTTGTTACTTCAACAATTGAATAATAATTGATGTGCATTGTCTTATGCCAATTTAATAAATAACGGTGATTATACAACAAACTTAAACGATTAATTTGTGGTGAATGATTTAAGATTAGTCTTAACAGAGGAATGTCCTCATGCCCCAAATGCCTAATTCATTAAGAAGTGTTCCTAATGAATATGACATTGGACCTTGCTCAGCCAAAGAAGACTTGTCCAAGGATAGTAAATTTGATTTACTAGTCTTGGAAGCGTGATTTGTGAAGAATGATGATTCTGCCTGAATACTTGATTCAGGGGTCACAAATCACATTTGTTCTTCTTATTAAAGGAATAAGTTCCTGGCAACAGCTAGATGCTGATGAGGCAACTCTCAAAGTTGGAACTGGAGAGGTTGTCTTGGCTGTAGCAATGGGGAACGTTAAGTTATTTTTCCCAGTGGGAGCAAATACATATTATTAGATAATGTGTATGTAATTCCTAAGATCAAAAGGAATTTGATTTCTGTATCTTATTTGGTGGAATAATGTTACTCTAAACCTTTCCCTGCTAACGCAATTTTAATTTTAAGAAAGGGAGTTGACATTTGTTTAGCTGGACTGGAAAATAACTTAAATGTTTTAAGACTAATCCAGAGTAAAACATTGATGAATACTGAGCTGTTTAAGACTGCTGCTACTCAAAGTAATAAGAGGCAAAGGATTTCTCCTAAACGAAAATACTTTTCTTTGGTGATTAAGGTAAGACCATATCCTCAATATGATTGAGAGCTTGGTTAAGAGTAGACTTCTAAGCAAGTTAGAAGATAACTCTCTACTACCTTGTAGGTGATAAGGGTAAAAAATATGCCTATTTTACTCTTATATTTAGCTCATTATCTTGTCAAAGTTGTATGTTTTAGATCAAATTTACTATTTCCGAGCTCAAAAAGTGTTAAAGTTGATGAATTAGGGAGTTAAGAGTCATGTATGCCAAAATTATGCTTATTTGTGCTTAAAAGGACCCATTTTGATAAGAATTTGACTTAGTTTGGTGTTTTGCAGAAAAACAGAGGATATCTGGAAAAACCCAGAAATGCGACTGCATTTCTGGCAAGGCAAAAACCAAATGCGACCGCATTTCTTGGCAGATGAAGGCAGTTTTGAGTCTGTCGCGGGTCATTTTGAACGAGTGTTTTATGCACCTAACTGGCTGTTTTGACTCCGAAACTGACTGGGCTACCTACCAACACATTTTTTGTGACTTTTCAACCACTCCCCACTCTATAAAAGGCCTCGATTCGAAAGGAAATTCAAGCAGAACTCACTGGGAAGAAGAGGGTGGTGACAGAACCCTAGTAGTAGACACCCATGAGTAG ATGGATTCAATCAATAATCCATTGCATGTACCTGAAGGACCAATCACAAGGAGCAAAGCAAAGAAGATACAAGAGGTTTTCACACTGCACGTTCAAAAGCTAGCAAATACACAACGAGAGGCCGAGAATTTTGAACCCAAATTTGTGTATAATGTTAGTTCAGCAAGTCAAGAAGAGAATGGGGTCAAGATGGCACGGGAAAAGTTGTGTAGTTTGGAAGATGTCACGGGGGACGAAAACAGTGTGCAGAATTTGCTAAAGATGCTGACTTCTTCAAGAAATTGGCTTGCGTGCCCCAACCTTCTCTTGCCAGCTTGCACATCAGTCACACATCAGGGCGACCATCCATCCGGCTGTCATCGTACGATTCACGCTCTAGGATCTGCGCCTGCGCTGAAGATAACTTGGGCAAGGAAACAACTACAGAAACCATGCGTTAGCGGGCCGGTTCAAGTGGTTTTTGAAACTGGTTTAGCACATTTTAAGCCGATTCAAAGTGTTTTGAAGCTGGTTCAGTGCGGTTTAGCCCAGTTCTTGATGGTTCAAAGGCTGGAGATCCATGCTCGGCTTCAAAAACAGAGGATATCTGGAAAAACCCAGAAATGCGACTGCATTTCTGGCAAGGCAAAAACCAAATGCGACCGCATTTCTTGGCAGATGAAGGCAGTTTTGAGTCTGTCGCGGGTCATTTTGAACGAGTGTTTTATGCACCTAACTGGCTGTTTTGACTCCGAAACTGACTGGGCTACCTACCAACACATTTTTTGTGACTTTTCAACCACTCCCCACTCTATAAAAGGCCTCGATTCGAAAGGAAATTCAAGCAGAACTCACTGGGAAGAAGAGGGTGGTGACAGAACCCTAGTAGTAGACACCCATGAGTAG ATGGATTCAATCAATAATCCATTGCATGTACCTGAAGGACCAATCACAAGGAGCAAAGCAAAGAAGATACAAGAGGTTTTCACACTGCACGTTCAAAAGCTAGCAAATACACAACGAGAGGCCGAGAATTTTGAACCCAAATTTGTGTATAATGTTAGTTCAGCAAGTCAAGAAGAGAATGGGGTCAAGATGGCACGGGAAAAGTTGTGTAGTTTGGAAGATGTCACGGGGGACGAAAACAGTGTGCAGAATTTGCTAAAGATGCTGACTTCTTCAAGAAATTGGCTTGCGTGCCCCAACCTTCTCTTGCCAGCTTGCACATCAGTCACACATCAGGGCGACCATCCATCCGGCTGTCATCGTACGATTCACGCTCTAGGATCTGCGCCTGCGCTGAAGATAACTTGGGCAAGGAAACAACTACAGAAACCATGCGTTAGCGGGCCGGTTCAAGTGGTTTTTGAAACTGGTTTAGCACATTTTAAGCCGATTCAAAGTGTTTTGAAGCTGGTTCAGTGCGGTTTAGCCCAGTTCTTGATGGTTCAAAGGCTGGAGATCCATGCTCGGCTTCAAAAACAGAGGATATCTGGAAAAACCCAGAAATGCGACTGCATTTCTGGCAAGGCAAAAACCAAATGCGACCGCATTTCTTGGCAGATGAAGGCAGTTTTGAGTCTGTCGCGGGTCATTTTGAACGAGTGTTTTATGCACCTAACTGGCTGTTTTGACTCCGAAACTGACTGGGCTACCTACCAACACATTTTTTGTGACTTTTCAACCACTCCCCACTCTATAAAAGGCCTCGATTCGAAAGGAAATTCAAGCAGAACTCACTGGGAAGAAGAGGGTGGTGACAGAACCCTAGTAGTAGACACCCATGAGTAG MDSINNPLHVPEGPITRSKAKKIQEVFTLHVQKLANTQREAENFEPKFVYNVSSASQEENGVKMAREKLCSLEDVTGDENSVQNLLKMLTSSRNWLACPNLLLPACTSVTHQGDHPSGCHRTIHALGSAPALKITWARKQLQKPCVSGPVQVVFETGLAHFKPIQSVLKLVQCGLAQFLMVQRLEIHARLQKQRISGKTQKCDCISGKAKTKCDRISWQMKAVLSLSRVILNECFMHLTGCFDSETDWATYQHIFCDFSTTPHSIKGLDSKGNSSRTHWEEEGGDRTLVVDTHE Homology
BLAST of Spg029073 vs. NCBI nr
Match: KAA0067206.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold418G00080 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 137.5 bits (345), Expect = 1.9e-28 Identity = 69/85 (81.18%), Postives = 75/85 (88.24%), Query Frame = 0
BLAST of Spg029073 vs. NCBI nr
Match: KAA0051909.1 (Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 2.4e-28 Identity = 68/85 (80.00%), Postives = 76/85 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of Spg029073 vs. NCBI nr
Match: TYK26105.1 (F15O4.13 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 7.0e-28 Identity = 68/85 (80.00%), Postives = 76/85 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of Spg029073 vs. NCBI nr
Match: TYK02449.1 (F15O4.13 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 7.0e-28 Identity = 68/85 (80.00%), Postives = 76/85 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of Spg029073 vs. NCBI nr
Match: KAA0059666.1 (Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 133.3 bits (334), Expect = 3.5e-27 Identity = 67/85 (78.82%), Postives = 75/85 (88.24%), Query Frame = 0
BLAST of Spg029073 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VL78 (RT_RNaseH_2 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold418G00080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 137.5 bits (345), Expect = 9.0e-29 Identity = 69/85 (81.18%), Postives = 75/85 (88.24%), Query Frame = 0
BLAST of Spg029073 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UEI2 (Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold60G003620 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 1.2e-28 Identity = 68/85 (80.00%), Postives = 76/85 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of Spg029073 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DRJ1 (F15O4.13 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold111G00130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 3.4e-28 Identity = 68/85 (80.00%), Postives = 76/85 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of Spg029073 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BWE8 (F15O4.13 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1738G00600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 3.4e-28 Identity = 68/85 (80.00%), Postives = 76/85 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of Spg029073 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UZP1 (Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold54G001110 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 133.3 bits (334), Expect = 1.7e-27 Identity = 67/85 (78.82%), Postives = 75/85 (88.24%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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