Spg028722 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTCCGAACTTTATCCAGAGAAAGGAAAAAGAAAAAGGTGCCTTCCGAAAGCAAGCTTTTTATTTCTCACTTCTTCATTCTTATTTCTGACAGTCGAACCCCCCCACCAGCACGCCCCCTCAATTCCTTCTCAATCTCCCTCACTCTCAGCTCTCTTTTCAGGTCCCCTTGGCCCTCAATTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACAATCGCACAAAAGAATCGTCAGTTCTTGGCATTTCCAGTGTGGCAATTGCACATACACCGCCGGCAAGGTGATTTTCTCTTCACTCTCTAGCTTCCACCCTCTTCTACATGTTCAAATAAGTCTAAATTTGCACTTATGATGATTTACAAGGCTTTTCCTGTGTTCATACACACAATCCCAAGTTAACCCACGATCCATTTGAGAATCGACACACATTATTCCTGGGCACTTCGTATTTGGAGACTCTTACAATCCCAACTTTTCCTTTCCTGTACAGTGAAGCAAGTTATTTTAGGTAGATGCATACACTGAATTTGCATAGACCCTCTTTCGGGCATCTCTGGCTACATTCGAATTTGCGGAGCTGTGCTAGACGGTTAGGACACATCCCAATCTCTACTGCTCGCGGCTTAGTTTCCAGGTATTTGTATGGTTTCCTAGTCGTCATGAGTATGTTGCAAAACCATTTCTACAGGGTTTATACAATTAGGAGTAAGGGAAACAAAGAATTTAAGATCATGAATGTGAAAATGAATGCATGTTGGTATCTCATGATTACTAGTTAATAGTATAATAATTCATACATCTTAGAATGTAAAATTATCGAAATGTGTTAGACCTCAATCTCAATTTTTTTTTTTGTTTAACAAGAAACAAAACTTTTCATTGATATAATGAGAAGAATGAGAAGAGACTGTTGCTCAGAGGATACAAACTCCACAAGGAGTGAGAAAGAAAAGTGGTAAGAGAAAGCAATAAAAGATTAATTCGGGCTGTCATCTTGTTAAATGGAGTTGGACTTCCCCCCCCCCCCCCAATATGGGGCCTGGGTATCGATTCATTGAGGCAAAGGAACAATGCTCTTCTCATTAAATGGTTGTGGAGATTTTCCCAAGAAGAGAAAGCTTTGTAGAGAAAGGTAGTTGATAGTATTTATGGCAGTGAACCTAGTGATTGGACGTCTATTCCTCCATAAGGGGCCTCAAAGGCAAGACCGTGGGTTGAAATTGCTAAACGCAGTGCCTCTTTTTTGTGAATTTCTTTATGTTCAAGGTGAAAAGTGGGGGGAGAATTTATTTCTGGAAGGATAAATGGGTGGGCAGTACTCCTTTGAAGGATGCCTTTCCAAACCTTTTTCATGTAATGGTTATTTTATCTTAATGTAGAGCTCGTCTTTTGTGCTGTAATGAATTATAGTGACCTGTTAGCTTTCCCCTTTGTTAATGACTCAACAACTTCAGGAAAATTACTGCAATGTCTGCATCTGTGTCACAAGATTCTGGGATTTCACTTGCATCAGTAACAATCCAGCCTCCATCTCACCCTACCTATGATTTGCGTGGCATCATCAAATTAGCCCTTGCAGAAGATTCTGCTGACTTCGGTATGATAAATTATTTTATTGTTATTATTTTTTAATGTTCTGTGAATTATGATGATGTTTGGGTTTACCTACCTCCCACTCATTGTGATGCAAATTGCATCTGAAGATTAAAAAAACAAGCAGGAATTAGTTGCTGAAATTTTCTGTTGCCAAGTTATCCAAAGCATAAGTTTTGCTTCCTAGCCCCTTGGTATGCTTTTGGTCTCAAGTCTTATTTTGGTCGGAAAGAAGTTTATAGATGCATTCAAATCATCAATGTAATTAGATTTTCAAACTAAGATCTACTTGAGTTAGTTCTGTTTTTTTCCCAAGTGAAGCTGCTGTGACAGAGGTCCAGTAAGGCAATAGAATTTAAGCAATTCCCGTTGAAGGATCTCCTAGCCAATGCTTGTAGATCCAACTCTTATGCCATGATATTCTACTACTTTCTTTATGATTTTTCTATTTTTTTTTCCTCTGTGAGGGGTATTCTCAAATCTGATTTTAGATTAATTTCCAGTTTCCAGCAACTGTTCTAATGGGCCAACTTCCAACGACATAGACCTACCCTGCATCAGATTGATTATATCTCCTGCATGTTATGTCATGCCTAAGTTTCTTTTTTAAGATTTCTTTCCTCAATGCACCATGTTTGTATCAATTTGACAGGAACCAAAAAATTGAAATAAAAACCAAAAAGTTGAAATAGAAATTGTATTGATGACTTGCAGAATTGTGAATAAGAAATGTGGAAAAGATACCCCCCAAGTAATTTGAGGAGCTTGGATACATCCTCTTAAACAAACTCAAGCTCAAACAACTAATTAATTGCTTACCTTCATCCCCTCCCACTCACTCTTTTTGTAATCACTTTCTACTAATAGACTCCTTAACTAATGACTAACATATAAATCCTCAGTATCCTAGTAATATTTCTAACATCTATCCTGATAGTATTCCTAACACAAATGCAGGTGATGTAACTTCTCTGGCAACCATCCCTTCTGACATGGTAGTGGATGCTTTCTTCTTGGCCAAAGAGGACGGCATTGTTGCTGGTATTGCTCTTGCAGACATGGTATTCCAGGAGGTTGATCCTTCAATTCGGGTAATATTGATATTTTCTCTCCCCCGTTTTGGTTCTTGTTGAGTTATTTATGTGAGTGTGTTCTCATTCATCTTAATCCACATTTCCTCTTCAGGTGGAATGGTCTCAAAAGGATGGAGATTATATTCATAAAGGACTACAATTTGGAAAAGTTTCTGGTGAGAGTAGAAAATCTCCAGGAAAACTCTGTTAAGTTGTTAACCATAGTGTTGGTATGGGATGCGCTCCAAACACGTGAATTGAAGTGTTTGATTTTTAAATTCTCTTAATTACTTTTATACATGTTGGGACATGCTCGTGAGAAAGGGTTGGATGGCAGTTTGGTTTGGTTAGCTTTTCAAGGCTCTTCTTCAACGACAGTTTATTTAGGAAGTTCCACAACACTTTATCCTTATCCAAGTTGTATAGGGGATCTAGCTAGTAAGATCTTTGTCCTCCATAGAAAAATGGCTATGGTGCTTTCCTTTCAAGCTTGCATTGCCATATGAACAGGCATGTTTGTTAATCTGCTGGGTGGCTACAACCTTTGTGACTTAAGGCGCATTGAGGGTCATGGTAAAAAATTTAAGTGTATCAATAAACTCTATGAACTTTCTCTTTGGAAACGAGTCTCACATTTGTTTTTGGAAGGACCATTAGATGGATATCAAATCCCTTCATAATATGTTATCCGCACTCTTAATTTTCCCCTCTAAATGATTCATTTATTTAGTTGATTTCACTATTTTAAGGACGATTCTCCTTCCCCTTTCCACCATTTCCATTTTAGAAGACCTCTTTTTGAACATGAATCTTGGAGTTATTCATTTTGTCCTCCTTGTTACATAGAGTCATGGTCGATTATTTCCCTCTTCCTTTTATGCATCAGGACTCTTCCTCAACCTTGCTAAACAACCATTGTTGGCGTCAACATTGGTAAGCAAAGGATGAATTCTCAAGTGTCTAAGTTTGGCTGTAGAGTTGAAAGGTCTACCCTTCTTCGATATTGGTTTTCCCTTAGCTGGTAATCATTGAGCTTTATCCTTTTGGGAGCCTCAGGTGGATAAATTAAAAGCAAAGTTGGAAAAAATGGAAGAACCTCTCCTCTCAAAACGGGTAGCCTAACTATGGTAACAATCAATTCTTAATCTCCTCCCTATCTATTGTTTTTCTCTCCTCAAAACCCCCATTGGCATTACTAAATAGATGGACAAATTGGTTAGATAATTATCTCCCTTGTAGCTATTTAGTTAAAAGTGGATGACTTTGCTCCCTTTGCATAATGGGGACTTGGGGATTGGCGTGTTTCACCAAAGGAACAATGCCTTTCACCTTGAATGGTTGTGGATATTTACGCAAGAAAAAAGAGCTCTCTGGAAGAAAGTGGTCACCTATGTGGAACATGATGGTTGGATGACTTTGCTCCTTTTGGCAAGTCTTAAACCAAAAGGGAAGGCAAAAGGGAGACCTTGGTTTGACATTCCAAGAATAGTTCCTCTTTAGTCAGATTCATGGGCTTCTAGGTAAAGCAAGGGCTGACAATAAAATGCTTATTCTCTGGAAAGATAGACGAGGTGGGATCAAGCTTCTTAGCTCAATCAATCCCTGATCTCATCAGCATCTCTTTGAAAAAAGAACTCTACCATTGCTGATTGTTGGAATGAAAATCAAGACAACTGGGACTTGGGCATTATAAGAGGCTTCTTTGACAGAGAGCTTGATAGCTAGCTGGGCTTAGTGAACAAAATGGATTTGGTGCAGCTTGGGGGGGGCTGAAGAAAGTGGCATGATCCTTTGATTCTTCCTCCATATCGAACTTCCTAAAACTTGCAGAAACTATGCCCGAGCTAAAATCTCCCCATGTTAACTTGATATGGCAGTTTAAATGTTCCTAAGAAAGTGAATGTCTTCTTTTGAATTTTGATCCCTTGCTCATAGAGGACTAAACACCCTTGAGAAGATCTTGAAAAAATGTAGCCAGTGCATGCTTTCTCCGTCTTCATATCAGTGAATCTTTAGACCACTTACTTCTTCATTGTTCTTTTGCCTTTGAGGGTTGAGCCTTTATCCTCACGGAATTGGGTTGCTTAGCATACCTGCCTAAATATGTAGATGGGTCGCTTCTTAAGGTTCTAAAAGGTTGGCAATTGAAAGGCAAAGCTAAGATTTCGTGGAATTGCATAGGTAGGACACTTTTGTGGGGCATTTGGTTGGAAAGGAACCAAAGAGTGTTTGAAGGTAAACATCTTCCTTTGACGGTTTTTGTAATAGTGTACAGATCACCTCTTCGTCATGGTGCTACAAATTTGAGAAGAGAAACAGATTTCATTGATAAAT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Match: KAG5562804.1 (hypothetical protein RHGRI_005508 [Rhododendron griersonianum]) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 3.8e-06 Identity = 37/82 (45.12%), Postives = 47/82 (57.32%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. NCBI nr
Match: KAG5562805.1 (hypothetical protein RHGRI_005508 [Rhododendron griersonianum]) HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 3.8e-06 Identity = 37/82 (45.12%), Postives = 47/82 (57.32%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. NCBI nr
Match: XP_012072203.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Jatropha curcas] >XP_012072204.1 nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Jatropha curcas] >XP_012072205.1 nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Jatropha curcas] >XP_012072206.1 nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Jatropha curcas] >KDP38043.1 hypothetical protein JCGZ_04686 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 4.9e-06 Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. NCBI nr
Match: XP_024027582.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X2 [Morus notabilis]) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 4.9e-06 Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZU32 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=QPT PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.4e-08 Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0IZS0 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os09g0553600 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 2.5e-08 Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 30/31 (96.77%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZD2 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495096 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06 Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0B9 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495096 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06 Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DP46 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022503 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06 Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251ITM9 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Manihot esculenta OX=3983 GN=MANES_17G006600 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06 Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251ITV3 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Manihot esculenta OX=3983 GN=MANES_17G006600 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06 Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.2 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.0e-09 Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.1 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.0e-09 Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.3 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.0e-09 Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg028722 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.4 (quinolinate phoshoribosyltransferase ) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.0e-09 Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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