Spg028722 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg028722
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionQuinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating]
Locationscaffold7: 14557244 .. 14580592 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg028722
SyntenySpg028722
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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mRNA sequence

ATGGGAGATTTGAGACTGAGGCTTCAGGAAATGTTACTCTGCAAACAATACAGAAAATTGGACAAACTGGGGTTACTTACATATCCAGCATTTACTGTTGGCCTTAGCAGTAGAATCCTTGAGCCCACCTTCACCTGCTCCCTTCAACGTCAAGGTGCTATAATTGGTGCGCTGACACATTCTGTAAAAGCACTTGATATTTCTCTAAAGATTGACACGGAGTTGGCCCTTCAAGTTGGAAGACGTACAAAACGAGCCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGAGATTTGAGACTGAGGCTTCAGGAAATGTTACTCTGCAAACAATACAGAAAATTGGACAAACTGGGGTTACTTACATATCCAGCATTTACTGTTGGCCTTAGCAGTAGAATCCTTGAGCCCACCTTCACCTGCTCCCTTCAACGTCAAGGTGCTATAATTGGTGCGCTGACACATTCTGTAAAAGCACTTGATATTTCTCTAAAGATTGACACGGAGTTGGCCCTTCAAGTTGGAAGACGTACAAAACGAGCCTGA

Protein sequence

MGDLRLRLQEMLLCKQYRKLDKLGLLTYPAFTVGLSSRILEPTFTCSLQRQGAIIGALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA
Homology
BLAST of Spg028722 vs. NCBI nr
Match: PPD82016.1 (hypothetical protein GOBAR_DD21054 [Gossypium barbadense])

HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 1.4e-08
Identity = 46/77 (59.74%), Postives = 48/77 (62.34%), Query Frame = 0

Query: 10  EMLLCKQYRKLDKLGLLTYPAFTVGLSSRILEPTFTCSLQRQGAIIGALTHSVKALDISL 69
           EMLL K Y K DKL L TYP         +L PT      R     GALTHSV ALDISL
Sbjct: 302 EMLLLKPYIKSDKLELPTYP-------GALLTPTVYSFAFRH----GALTHSVTALDISL 361

Query: 70  KIDTELALQVGRRTKRA 87
           KIDT LAL+VGRRTKRA
Sbjct: 362 KIDTGLALEVGRRTKRA 367

BLAST of Spg028722 vs. NCBI nr
Match: KAG5562804.1 (hypothetical protein RHGRI_005508 [Rhododendron griersonianum])

HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 3.8e-06
Identity = 37/82 (45.12%), Postives = 47/82 (57.32%), Query Frame = 0

Query: 5   RLRLQEMLLCKQYRKLDKLGLLTYPAFTVGLSSRILEPTFTCSLQRQGAIIGALTHSVKA 64
           + + + ++ C  Y  L +LG+L +P                        + GALTHSVKA
Sbjct: 407 KTKFKPLVACSLYANLVELGILGFPI----------------------ELCGALTHSVKA 466

Query: 65  LDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           LDISLKIDTELAL+VGRRTKRA
Sbjct: 467 LDISLKIDTELALEVGRRTKRA 466

BLAST of Spg028722 vs. NCBI nr
Match: KAG5562805.1 (hypothetical protein RHGRI_005508 [Rhododendron griersonianum])

HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 3.8e-06
Identity = 37/82 (45.12%), Postives = 47/82 (57.32%), Query Frame = 0

Query: 5   RLRLQEMLLCKQYRKLDKLGLLTYPAFTVGLSSRILEPTFTCSLQRQGAIIGALTHSVKA 64
           + + + ++ C  Y  L +LG+L +P                        + GALTHSVKA
Sbjct: 363 KTKFKPLVACSLYANLVELGILGFPI----------------------ELCGALTHSVKA 422

Query: 65  LDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           LDISLKIDTELAL+VGRRTKRA
Sbjct: 423 LDISLKIDTELALEVGRRTKRA 422

BLAST of Spg028722 vs. NCBI nr
Match: XP_012072203.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Jatropha curcas] >XP_012072204.1 nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Jatropha curcas] >XP_012072205.1 nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Jatropha curcas] >XP_012072206.1 nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Jatropha curcas] >KDP38043.1 hypothetical protein JCGZ_04686 [Jatropha curcas])

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 4.9e-06
Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA
Sbjct: 323 GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 353

BLAST of Spg028722 vs. NCBI nr
Match: XP_024027582.1 (nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X2 [Morus notabilis])

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 4.9e-06
Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA
Sbjct: 343 GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 373

BLAST of Spg028722 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZU32 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=QPT PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.4e-08
Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELAL+VGRRTKRA
Sbjct: 318 GALTHSVKALDISLKIDTELALEVGRRTKRA 348

BLAST of Spg028722 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0IZS0 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os09g0553600 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 2.5e-08
Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 30/31 (96.77%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRT RA
Sbjct: 341 GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTNRA 371

BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BZD2 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495096 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06
Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA
Sbjct: 347 GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 377

BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E0B9 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495096 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06
Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA
Sbjct: 299 GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 329

BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DP46 (Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022503 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06
Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA
Sbjct: 299 GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 329

BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251ITM9 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Manihot esculenta OX=3983 GN=MANES_17G006600 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06
Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA
Sbjct: 322 GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 352

BLAST of Spg028722 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251ITV3 (Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Manihot esculenta OX=3983 GN=MANES_17G006600 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 61.2 bits (147), Expect = 2.4e-06
Identity = 31/31 (100.00%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA
Sbjct: 327 GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 357

BLAST of Spg028722 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.2 (quinolinate phoshoribosyltransferase )

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.0e-09
Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELAL+VGRRTKRA
Sbjct: 251 GALTHSVKALDISLKIDTELALEVGRRTKRA 281

BLAST of Spg028722 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.1 (quinolinate phoshoribosyltransferase )

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.0e-09
Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELAL+VGRRTKRA
Sbjct: 318 GALTHSVKALDISLKIDTELALEVGRRTKRA 348

BLAST of Spg028722 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.3 (quinolinate phoshoribosyltransferase )

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.0e-09
Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELAL+VGRRTKRA
Sbjct: 312 GALTHSVKALDISLKIDTELALEVGRRTKRA 342

BLAST of Spg028722 vs. TAIR 10
Match: AT2G01350.4 (quinolinate phoshoribosyltransferase )

HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 1.0e-09
Identity = 30/31 (96.77%), Postives = 31/31 (100.00%), Query Frame = 0

Query: 56  GALTHSVKALDISLKIDTELALQVGRRTKRA 87
           GALTHSVKALDISLKIDTELAL+VGRRTKRA
Sbjct: 297 GALTHSVKALDISLKIDTELALEVGRRTKRA 327

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
PPD82016.11.4e-0859.74hypothetical protein GOBAR_DD21054 [Gossypium barbadense][more]
KAG5562804.13.8e-0645.12hypothetical protein RHGRI_005508 [Rhododendron griersonianum][more]
KAG5562805.13.8e-0645.12hypothetical protein RHGRI_005508 [Rhododendron griersonianum][more]
XP_012072203.14.9e-06100.00nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic [Jatropha... [more]
XP_024027582.14.9e-06100.00nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic isoform X... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9ZU321.4e-0896.77Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Arabid... [more]
Q0IZS02.5e-0896.77Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating], chloroplastic OS=Oryza ... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S3BZD22.4e-06100.00Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Cucumis melo OX=3656 ... [more]
A0A1S4E0B92.4e-06100.00Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Cucumis melo OX=3656 ... [more]
A0A6J1DP462.4e-06100.00Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase [carboxylating] OS=Momordica charantia O... [more]
A0A251ITM92.4e-06100.00Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Manihot esculenta OX=... [more]
A0A251ITV32.4e-06100.00Quinolinate phosphoribosyltransferase [decarboxylating] OS=Manihot esculenta OX=... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G01350.21.0e-0996.77quinolinate phoshoribosyltransferase [more]
AT2G01350.11.0e-0996.77quinolinate phoshoribosyltransferase [more]
AT2G01350.31.0e-0996.77quinolinate phoshoribosyltransferase [more]
AT2G01350.41.0e-0996.77quinolinate phoshoribosyltransferase [more]
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg028722.1Spg028722.1mRNA