Spg028281 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg028281
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold8: 26320762 .. 26324433 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg028281
SyntenySpg028281
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTGGCGGTGGCCATCATCGACAACGACGGGAGTTGGCTGTGGCTCGTTGGAGGAGGGTTTGAAGGAAGTAAGGTTGAAGTCGATGCTGGCGGTGGCGACGGCAACCAACAAGAAGAGGAGAGAGAGAGGGATCGGTGGTGGGAAGAAAACTAAAAGTGAGAGAGAGGGATTTTTCTCGTGAAAACCGGAAGAGAGAGGGAAGAAAACCATATTTTTTTAAATTTAATTTAATTATTATTTTAATTTTTAAAAAATAGTATTTTATTTTTTGAATGTGTCACGTTAGCACTGTTAACTGCCACGTTAGCACCATTAAAAAAATTAACGGTACACGGACTCAATAGAACCATTTTCGAAATAGTAGGGACTTGATTGTCCGATTTTGAAACCTAGGGACCTATTGGAAACGAACTTGAAACATGAGGGACCAAAAAGGTATTTTACCCAAAAATCAATTTCCTTCAGTTTTGATCAAGTGTCAATTACTTCCCTGTACAAGTGATGTTAGCTTTTTTCAAAATCAATTTCATACAAATGCCATGAAATTTCCATAGGAAATATCATCTTTTTCTCTTCCTTCAGATTTGCCTAGTTCTTTATATTGGCTGATTTCTTCCATTGTCTGTTAATATTCATAGAATTGTTTGATAATGTTTAATTTCTCTACATATTGAATAATTTCTTATTTTGAGGTATAACTATCTTGTAGTTATGGTAGCTATATAATCTAAGTTATTATTCATAGAATTGTTCGATAATGTTTCTCTACACGTTGAATGATTTCTTACTTTGTGTTATGGCTATCCTGCAGTTATGATAGCTATATAACCTAAGTTGTTATTCATAGAATTGTTTGATAATGTTTCTCTTCACATTTGTTGAGTTCAATCGTTTGAATCAACCTATAAAAGCTGGTTCAAATGTTTTGGGAAATTTCTTCGGGACTATTGGAAGAACTTGCAACCTTTGTCCCTTAAATTATGATGATTGGAGATAAAGGTACCAAATGTATATAAGGATGAAGATTGGAAAATCATTAAGATATGTAAACCAAAGTATATGTTATGTTTTTACTTGTATCTATATTATGTTTTTTGTATACTCATTTGCTTCATTATTTTCAGTCAAAATTCATTGTTCAAGAAAAACATAAAAACTGATGTTTGTCTTCATTATCTAGAAAATGGGGTGGCTATAAATGTACTCTACAAGGACAATATGTTTCAAAGATGTGATGGTAATTTTCTTTATATATTTGTATTGCTTCGCAGGTTGTAGTTCACATATTAATTTGTTTTTTTTAATTATAGAAAGAAGAATTGGGAAGAGACCCCACCACAGTAGAAGTATTTTTAGCTGCACATAAGAGGAAGGACAAAAGTTACATGGATGAGGAATTTGCTAAAATTGTTGTAAGTTAAAAGTTAATTTTAAATTTTTTCAAAACTTTATAGTTCACAAATTTCAGTTTTATTCTCTGATAGGAAAAATTTCAAGAATTTATGAATCAAAATGTAGATAGCTCAGAAGTTATGCCTTCTCAAATGGAGGTGCTTGAACAAGTCATGGTTTTGAAGTGGCAGGGATATGGTCAGATATGAAAAAAGTGCTTTCAGTATTGGATTAAATTAATTGTATGCAAGGTGGTAGTACTAGTGGGACATCTTTGGATAGCAATTCAAGAGAGGAATGAAATATTATAAATTGGTTTATTTTAGAATTACACAATTTTAATATATTTTTTTTGTTAATTTGTTAACAGGATCAAGGAGAAAATGCATCTGGGAATAACGAAAAATCAAGATCGAGTTCGCACGAGTCTCTGTAATGACATGTTTCAAACTTAAAAACTAAATGATGATAATGAATAAGTAGTTTAGATCTTCTTTATTGATGTTGAACATATTTTGTAGGCATTTTGTGTTAATTTCAGTCAATACTTTATAGGTATTTAAATATACTTCATCTTCAATTTTTCTATCAATATATACTTGATTGGTATTTTATTACTTCATCTGGAAATTGTTACCTATTATTGTTTGTAGCTTTACTTTTATTCTCATTACTTAATTTTGACTATTGTTGTTGAAATTTTTGTAGTATAATTTTTAAATTTGTCATAACATAAAACACTAATAACTACTTGTTTTTCAATAATTTTAAAATGTAAAATATTGTAAAATTGATTTAAATTACAGGTACCATATAAATTGTTGCAAAATAGGTACAAAAAGTGTTGCCATATAAGAAAAAAAAAAGGCTAAATTATAAAAAATACCCTTGAACTATGAGTTTTGTTTCAAAAATACCCATGAACTTTAAAAATTTTAAAAAATACCCTTGAACTTTTAGAATTATTCAAATATACCCATGTCGTTAGAAGTCTAAACAGAAAAGTAACGTGGACAGTTAAAAATTCAAAATTAAATCACCTGGTGCTATGTGGCTTTAGTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAAATCCAAAACCTTAAACAAATCTCCAGTCTTTGCTCCCAATTTTTAGTGATTTTCGGCCAGTCATGTAAATATGTGTCCAAGCTTCCATTCGGCATGTAATCACACACCAAAAACAACTTCATTCTTGTAGCACCCAAATTTAAAAAAAAAAAAAAAGGAGTGGGCTCGTTGCCCGGTCAAAGGGGGAAACGGGGGGAAAGTTTCCTTTCTCTCCCCGATAACTCTCTTCCTCTCGTTCTCACTCTCTCTCTCTCTCTCGTGCACCAGACTATCGCCGCCTTCGCCGTCGACGTCGTGCCACTCTCCTCCGTCCACGCTCATCGCCTGTCGTCGCCAGTGAACACTCTTTCTCTCTCTCCCGTTTCCGTCCCGCTCGGCCTCACGTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGTTTGCAGTATCGTCGTTGCCATCCCTCGCTGCACGCCGCCGTCGCCTCTCGCCTCCGGTGAGTCTCCTTTGTTTCTTCTCTCTCTCTCGCTCGCTTCTCTCCCTCGGTCTCACACTCTCTCTCTAATGTTTGTCTCCCTCTCTCTCGACTGCAGCCACCACAAGCCACCGTCGCCGCTCTCAGTATCGTCCGTCGCCGCCACTGTCTGTAACAGAACCCTTTGTCGCCGCCTTTCAGATCTGTTCATCGCCACCGTTCAAAATTCCAGCCTAGTCTTTTAAAGATTTATTAGGTAAGGATTGGTTGGGTCTTTGGTCTTAATATTCTCTGTTTAAATGGAATTGAATGTCAGATTATGGGCAGGTGGTTTGAGTTGAGCTAAGACTTTTGTGGTGAACCGATTTAATTTAAAAGTGGTGCGAAAATCTTCCCAAAATCTCGGTTGGGTAAGGAACTCGGGCCTTAAACTTTTGTATCTTTACTCTTGGCGGACTGTATCAGGACCAAATTTATTGTTAAATTATTAGGAATTGTGGGATTGTTAGGAAGATCTGTGGGCCAAGCTATTTTTATTTTATACCGAGTTATTAAGGTAAGTTAACTTGTTGAAATTAAACTGTAATTATGCATTGTTGTGGCAGTTGTGTTTCTGGCATGAGATGTTGTTTATGTATGATTGGAGACTGAGATGTTATGATGCTTTTGTTTTCGAGAATATGGCTGCTGCGTACTTGTGTTGTGTGATAGATGCGAATGCATGGCTGTTACATTTTATGGTTGACTGA

mRNA sequence

ATGGTGGCGGTGGCCATCATCGACAACGACGGGAGTTGGCTGTGGCTCGTTGGAGGAGGGTTTGAAGGAAGTAAGAAAGAAGAATTGGGAAGAGACCCCACCACAGTAGAAGTATTTTTAGCTGCACATAAGAGGAAGGACAAAAGTTACATGGATGAGGAATTTGCTAAAATTGTTACTATCGCCGCCTTCGCCGTCGACGTCGTGCCACTCTCCTCCGTCCACGCTCATCGCCTGTCGTCGCCAGTGAACACTCTTTCTCTCTCTCCCGTTTCCGTCCCGCTCGGCCTCACGTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGTTTGCAGTATCGTCGTTGCCATCCCTCGCTGCACGCCGCCGTCGCCTCTCGCCTCCGACTGAGATGTTATGATGCTTTTGTTTTCGAGAATATGGCTGCTGCGTACTTGTGTTGTGTGATAGATGCGAATGCATGGCTGTTACATTTTATGGTTGACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGGCGGTGGCCATCATCGACAACGACGGGAGTTGGCTGTGGCTCGTTGGAGGAGGGTTTGAAGGAAGTAAGAAAGAAGAATTGGGAAGAGACCCCACCACAGTAGAAGTATTTTTAGCTGCACATAAGAGGAAGGACAAAAGTTACATGGATGAGGAATTTGCTAAAATTGTTACTATCGCCGCCTTCGCCGTCGACGTCGTGCCACTCTCCTCCGTCCACGCTCATCGCCTGTCGTCGCCAGTGAACACTCTTTCTCTCTCTCCCGTTTCCGTCCCGCTCGGCCTCACGTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGGTTTGCAGTATCGTCGTTGCCATCCCTCGCTGCACGCCGCCGTCGCCTCTCGCCTCCGACTGAGATGTTATGATGCTTTTGTTTTCGAGAATATGGCTGCTGCGTACTTGTGTTGTGTGATAGATGCGAATGCATGGCTGTTACATTTTATGGTTGACTGA

Protein sequence

MVAVAIIDNDGSWLWLVGGGFEGSKKEELGRDPTTVEVFLAAHKRKDKSYMDEEFAKIVTIAAFAVDVVPLSSVHAHRLSSPVNTLSLSPVSVPLGLTFFSLSLSLGLQYRRCHPSLHAAVASRLRLRCYDAFVFENMAAAYLCCVIDANAWLLHFMVD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR004252Probable transposase, Ptta/En/Spm, plantPFAMPF03004Transposase_24coord: 25..60
e-value: 9.4E-7
score: 29.0

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg028281.1Spg028281.1mRNA