Spg028255 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg028255
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold8: 27758923 .. 27764180 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg028255
SyntenySpg028255
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACACGTGGCACAGTGCTGACGTGGCATCTGACGTGGACGGTCAACGGTCAAAATGATGACGTGTCAGATGACGTGGCACCTCAAACGGTCAAATTTGCTGACGTGGCGGATGACGTGGAAGATGGCGTGGCGAAACGTGGTCCAATTAGATTGCGACACGTGGCAGCTTGATTTTTAAAATAATATATTGGTCAAACGGTCAAATTTTTAAATTATAATATTATTTTATTATTAATTTTTATATTTTTTATTGCAGCCAATCAGAGACTGTGGCAGCCAACGGCTAGTTTGGCCCTTTTTGGTCTATTTAAGGCCTGAAAAAAATTCAAAAAAATGGGGAAAAATTTCTGAAAAATACTACTCATCTTGGAGAGCATTCTTACCATTTTTTTGAAATTTTTGAGCTTCAACTTTTCATTTTTTCATAGCCATTTGAGGGTTTTTAGTTGTAAGAAATCCTTTCTTACAAGATTGTGAGCTTTGATTTGTGTATCCACTCTTTGAGAGAGTTTTTCTTCTTTGTTCTTCATCTTCTAAATCTATTGTAAGGGTTTCTCTTGATCCCGAAAAAGAGAGTTTGTAACGGTTTGATCCTGAACCGTGGAAAGGATCGGGTTTGTTCTTGCTCCCGGAAAAGGAATGTTGTAGCGGTTGGACTCTGACCGTGGAAAGAGTCGGTTTTTTCTAGTGGAATACCCAAGAGGAGCTTGGGGAGTGGAGTAGGCCGGGTTGTGCCGAACCACTATAAATTCTCGGTGTCTATTTCTCTATCCCTATCTTATTTTAATTTTTGCAATTAATTTGTTATTATCTTTTATTTTCTAAAATTAATTGTAATAATTTATTCCGGTTGTTAATTGTACCTATTTCATTAATTAGGTTGATAGAATTCTATTTTCCATATTCCTTATCAACTTTTCATATTTAAATCAAATAGGATACTTGAATTTGCTAGCTTTAATTTTCTTGATTAAATTGAGTTGAAATTATTTGCATGAAATTTGTATGAATTTCTTGTTTAAATTACTTGCATAAAAAAGGGTTTGTAACTTTGTTTAATTGGGCCCACTTTAGCGTAAAGTTTTATTAAATTCGAAGAAACCCTATTCACCCCCCCTTTAGGGTTGCCATACCGATCCAACACAATAAACTAAGAATCCATGACTATATTGTGTATACTTGAAGTTTATATGTGACATAAGTATGGATCAAGTTTAAGCAAATAGTCTAAACGATCTATAGTATATGGATAAGGTTGGGTACCTTAATCCTGGGGACACTATTGGCGCGACTCGCTTTGTTATTTAAAGACAGACGATGTGATCCTAATCGTTCATGTATAAGAAATGTGAGTGAGGGCATCCTATTCAAAGAGTTTGCATAGAGATCGGACCACGAGATAAGTCACTTTCACTTTACCAACACTGTTTACTGTTGAAACTGAACATCTCATACATATAACCTAGGTAACTCGATCTTAATCCTGAGCTAACTATGAACTCCTGTTTATTTAGGATTATCCTTTGATTTGCATGGGTGAGAGTGACCAAACATCGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGATAAGACTAAATGGATAGCTGGGGACATAGCTTTCCAAGATGGAATTCACTGCTACCCGTTTTAGGGTTACTAAAGGTTGTTCTCTTAAGTGCTGACACCGAGTCTTGAATAAAGGAGCCCCGCCCTCTCATAACCTTGAGAGGGACTTGGTTCAGTGATTGTATCGCGAACTAGTTGTTCATTAAAGGATCAGTGGAACTTAAGGAACAAGATGTAACTATAGGGGTAAAACGGACATTTGACCTAGCTCTAGTTACGAACAACCGGTGAAGGGTCGACTTACTAATCATGGTTATTTAAAGTGGACAAGAAATATATCTACAGTGAGGGGAGTGCAGCTACGGGCTATAGTGGAGTGTCCCGGAAGCTAACGAACGATGAATGACTAGGTTAATGAGATTAATCGGTTATCATCATTTCGTTGGAGCTCATGATCTATAGGTCCATTAGGTCCCTCTACTAGCTCAATAGGAATAAAACTTGGAACAATATGATAGGTTAATATTTGAAACGTTCAAATTCGGAAAAGGATACAAAAGTCGCTTATATACGATATTTAACGACATATTAGTTTAATTATGAATTAAACTTAAAATGAGAATTATATATTTAAATATGATTTAAATATTAAACACGTGAATAGGGATTCATGTTCGAGAAAATTCGTTGGGAGAAAGAAACCAAGATTGCACAAATGGTATTAATTTAATATGAGATATTAAATTAAATAAATGATATTTAAATTAAAATAAAAGTAAAAACAAAAGAAAGTGGGATCATTCAGAATTTTATTTGCAAATTTTGAATTTAAAAGAAATTAAAAAAATTAGCAAATTTTGGAGGTGGTGCTTAATGACTAATCACTTGTAATTAGCCTTATTGCACCACCTAATCTTGTGACTCAAAATGATCCCTATTTGTTGTCAATTTTTTGTGCAATTCTTGTGCATGATTTTCCTCTATATATAGAGGATGAGCTGATGAGAATGAGTGAATTTCTTCAACCTAAAATGCTGCCAAAATTCTCCCAAGAACTTCTATGTTCATACTCTCAAGCTTGCATAACCCATAAGCTTTCATTTCCAATTCCTATCAATTGAGGATCCCACAATCCGTTCCAAGGCCTGAGGATAGTAGAGAAGATCCAAGTGGTTGTCCAAAAGGCATTCGTGTGAATTATAAAGCATCGAATTATACGAATTGGGAGCTTCAAGAGGTAGGTACCTTATTACTCTGTTTTTGGTACTTATGAACAACATGACTTCAAGAATTAAATTGATCAAATTGTGTGCCTAAGATCGAAAATTGCTTCTGCATGTGTAATATAAACACCTACATGATCAAGTCTTATGGCTTTGAACAAAACGTTGATGAGCCTTGTGTCTACAAGAAGATCATCAACAGTTCTGTAGCATTCTTAGTTTTGTATGTGGATGATATCCTCCTCATTGGGAATGACGTAGGTTATCTAACTGACATTAAAAGTTGGCTAGCTTCTCAATTCCAAATGATGGATTTGGGAGAAACTCAATATGTTCATGGGATCCAAATTGTTTGGAATCGAAATAACAAAACGCTAGCCCTGTCTCAAGCTTCTTATATCGACAAGTTGTTGGTTCGATATAAGATGCAGAATTTCAAGAAGGATTTATTACCTTTCAGGCATGAAATTCAATTGTCTAAGGAACAGTGTCCTAAGACACCCCAAGAAGTTGAGGACATGAGAGGTATTCCCTATGCCTCAACAGTAGGCAACCTAATGTATGTTATGTTGTGTATTAGGCCTGACATTTGTTATGCAGCATGGTTGTCAGTAGGTATGAATCCAATCCAAGATTCGATCACTTGACAGTCGTGAAGAATATCCTCAAGTATCTTAGAAGAATGAGGGACTATGTGCTCGTGTATGGCGATAAGGACTTGATCCTTACAGGATACACTGATTCTAATTTTCAAACCAATAAGGATTCGAGGAAATCTACATCAGGATCAGTTTTCACCCTCAATGGAGGAGCTATAGTTTTGCGTAGCATCAAACAGGGATGCATAGTAGACTCGACCATGGAGGCCGAATATGTAGCTGAAGGGATAAAAGCCCTTGCGCAGCGGAAACTTTTCAGAACCTTAACTTCGTTTTAATTTAGGATCAAAATACCGGTACGTTGGAATAAAATTACAGCAGTAAATTCACAATAAAACTACTGATAATCATGAATAAAGCATGCTAAAAATACTCTAAATACTCTAGATCTAATCTAGATTGGACCCTAATGATCCTAGATCAAGATTACTCACTTTAGAGGATGTTCTTGATCGTTTCGCCAACAAACCCTTGTGTAGTCCGAAAATTCCAGCAACAAAACCTCCCTTTAATGCTGCAATTCACCACGAACACTACCATGCAGTAGCACCGGTATCCTCACGGGGAAAAACGTTGATTGCTTGTGGGAGCAAGGTAAAAATTTAGGAATTTCCTTGGGAGAAAAGTCTCTGTATCGCTAGAGAGAAAAGAGAACGATAGATCCAAAAAATGGAGCAAGAGAGAGAATGAAACTTAGGGTTGTATCGTTAGAGAGGCTTTAGGGATATATCGTAAAAAACTGACCCAACTCCCTTAAAACCCTCACTCCCAACGTGTACTGTTTAGTGGGGAAGAAAAAATCAATCAGTTACTTTAACTGATTGATGAATATTAATATTAATTAATAATAAATTAATATTAATATTTAATAATAATTAATTTAATACTTAAACTAATTATTATTTATGTAAATCATATTTTACATAAACATTCCCACATAACCTATAGTTTTAAAGTAATTTAATTAAATCAAATTTAATTAAATTAAATTAAACAAAATATTAATCAATTCAACAATTAATTAATATTGTAATTAAATATCACATATTTAATTACATCTCTCTCAATTAAACTATTGTATTAATGTACATCAAATGTGCATTAATTATAACCTATAGTTTTTAATATGAATCAAATTCATATTTAAGTTTAATATTCGAACAACTTCGAATATTCAATTCTCCCTTAGAATTTCACCTCAATGCCCCTAGTGAGCTACCGGTGGGACCTAATGGACCTATAGATCAGAAGCTCCAACGATATGAGATTAATTGGCTAAACTCATTAACCAAGTTAATCAATATTCGTTAACTGTGGTTCACTCCACTATAGAACCACAGCTGCACTCTTCTCACTGCAGATATATTTCTGTGTCCACGGATATCAACCATCAACAGCAAGTTAGCCCTTCACGTGTGTTCGTACCCCAGCTAGGTCAAATTACCGTTTTACCCTTGGGCTACCTCTTCATCCTTAAGTACCAGTGCTCCTTTAATGAACAACCTGTTTGAGGTCCAACCAACAAACAGAAGTCCCTCTCGTGCCATAAAGAGGGTAGGGCCCATTGTTCAAGACTCGGAGACACCACTTAAGGGAACACACCTCTACTAATCCTAATGTTGGGAAGGAGTGAATTCCATCTTGTAAGACTATGTTCTCAGCTCCCCACTCGGTCTTGTCCCCAAAATGGTAGGCTTATTGAGTCGGCGAATAGGCCACTCTCACCCGTACAAATCAAAGGACAATCCCTCATGGATAGGAGTCCATAATCCACTCAGGATTAAGGCCAAGTTGCCTAGGTCATCCTAG

mRNA sequence

ATGACACGTGGCACAGTGCTGACGTGGCATCTGACGTGGACGGTCAACGGTCAAAATGATGACGTGTCAGATGACGTGGCACCTCAAACGGTCAAATTTGCTGACGTGGCGGATGACGTGGAAGATGGCGTGGCGAAACGTGGATTATCCTTTGATTTGCATGGGATCCCACAATCCGTTCCAAGGCCTGAGGATAGTAGAGAAGATCCAAGTGGTTGTCCAAAAGGCATTCGTGTGAATTATAAAGCATCGAATTATACGAATTGGGAGCTTCAAGAGGTAGGTACCTTATTACTCTGTTTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGACACGTGGCACAGTGCTGACGTGGCATCTGACGTGGACGGTCAACGGTCAAAATGATGACGTGTCAGATGACGTGGCACCTCAAACGGTCAAATTTGCTGACGTGGCGGATGACGTGGAAGATGGCGTGGCGAAACGTGGATTATCCTTTGATTTGCATGGGATCCCACAATCCGTTCCAAGGCCTGAGGATAGTAGAGAAGATCCAAGTGGTTGTCCAAAAGGCATTCGTGTGAATTATAAAGCATCGAATTATACGAATTGGGAGCTTCAAGAGGTAGGTACCTTATTACTCTGTTTTTGA

Protein sequence

MTRGTVLTWHLTWTVNGQNDDVSDDVAPQTVKFADVADDVEDGVAKRGLSFDLHGIPQSVPRPEDSREDPSGCPKGIRVNYKASNYTNWELQEVGTLLLCF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg028255.1Spg028255.1mRNA