Spg025190 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg025190
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold13: 41380497 .. 41385849 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg025190
SyntenySpg025190
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CCTTCGGTCGGTGTGTTTATATAAACATATTATGGTTAGGGATGGGCACCAATAATATTTCGCTAACTCTGCAATATCGATCATCGAGGGGTAATTCCTTTTAGGGTTTTGGGGCACAACAGCTATGGCGGAGCAGGAGGAGAAGAAGATGATCGGTGACGGTGAGAGTGAGACTAAGGAGGTTGGGTCCTTAGAATCTCTGTCGGAGCCGAAGCTGGAGCAACAACACGACAGTCTTCAATTTAGTACCAACATGGTAAGTTTAACAACACAATTACAATTTAATTTCAAACACTTTTCATTTTACTTCAACACAACCAGGTTCTCATTTTATTAATTATAATTATTTTATTTTTCTCCATTATTTTCAAAACGTCATTCACGCAGATCTCCTAATTCCATTATTTTCACAACTGTTTCTAAAATGATTTTCTGTTTTTAGAATAAACCTTTTCTATTAACTTATTTTCCTTTTTAGAATATGGACAGAAGTTTATTTTTCTTATCCTTGAAATTTGAGTTTGGTTATTATTTGGATGCCTAAGATTTTAGGAAAAAACATTTATTTGATCAAGGAGCAAGGAGCAAAGGTGAGAGTTAGTGACAATTACAAGGGCTAGGAGGCAGAAGGGATAGAAAAGGAGGCAGCGGCGATTATGGGTGGACGACGGATATGGGGTATTGGTAGAGAAGGAGGCGACAATGATTACAATGGATGGGTGGCGATAGGAGTAGAGAAAGAGGTGGCGCTGGGATAGAGATGGGAGAGAAGAACAAAACTTGAAAGGAGAGAGGGAGGAGAGTGAGAGAAGAAGTGAAGGATAGAGAAAGAGTGAGGGAGAAGAAATGACAGAATGAGAGGAGAAGAGATAAAAGGTTGTTAGGTTTGGGTTTGAAATTGATTTTGGGCTTGGAGTTTGGGCTTTAGACTATTTGAATGATGGACTATTGGGTTTTTAAATTTTACTAAAAGTGAAGGTTCTGTTCGGTTATTTTCAGTTTGTTAAAGAGATAACCCGCGCAGACTTAATAAAAAAAACTTGGTTTTTTGAGTAGCCAAATCAAGGAAATCGAACCATACTAGTCGGTTTGGCTGGGTTTGTCAACTCGGATCGGGTTTTGCACACCCCTAATCATGACTACATTTTGTTCTCTTTTCTCTTATTTTTCCTCCTTTCTTTTTCCACTTTTTTCTCCTTTTTCATTCACTATCACTAATTATACTAATGGATTGCTGACGCAACATTTATGATTTCTATTGCTGATAGAATCTATCACTGATAGAATCACGGTGATAGATTTCTATCACGGATAGAAATTTATAGCTAATAGAAACCAATAGTGTATTTGATAGAAACCAATACAAAAGATATGTACAAAATTATCACGTAATCAAATATATTATTGGTTTCAACTTCTGCTTTATGTTTTTATTTTCTTCCAATTCAATTTCCATGTTGTTTTGTTTCGACATCTATAAAAAAAAAAAATCAATGACATAGGTTTTAGAAACAAAAATGATAGGTTTTCTATCAATGATAGAAGATTTATATCTCTGATAGTTCTATCAGTGATAGAAAGATATCACTGATAGAAATCAATCTTTCTATTAGTGATAGAAGGTTTTATATCACTGATAGAAATCCTCTATCATCTAATTTGAACAACTCCAACCAAATCTATCAGTGATAGAAAACAATAGCAAATTCCAAACAAAATGCAAAAATAACTAATAGAATCTATCAATGATAGACTTGATAGAAACAGGAAGAAGGAAAAAAACGGGTTGGACGGGTTGGGTAATCATGTCAGATGGGTTTTTTAGTAATTTAGATGGACTGGATGTTAAATTTTGCTATTTTTGCAAATACTTTAATATGTTGCTAATGTTGCTATTATTTTGGTTGGGTTTGCTATTTGTGCAAGGAGCCCATATAATTTTCTTCTAAATTGCTTCCTATTTTATCAATAGGGAAAAGTATTTTTCTTTTCCACGTCTTAAATCACATTACAGTAGTACTTAATTTCTTAGAATTAAATTAGGAAGGTTATAGATCATTCTTTCTGTCTAGCAGCTGGTTAAATAATTGTTTAAAATTAAATCACAAGTTTAGTCTTTAATTTTTAAATTCGTGTTTTTAATTTTAAAGGTTTCTCATATAATTTTATAGGTTCTAAACTTTTAATTTTATGTCTAATAGATTCTTGAAAGTAGAGAAGATGACAATGAAGATGGAAATAAAGACGGAGAAGATAGAGGAGGAGAAAGAGAGAGTAATGAAAAACTAACTAAACCATCTAGATCCAGGGCAAGTCCTCATTTGTTCTCCCTTGCTCAAAACTTTTTTTTTTTTCTTTATTCTTTTTTTGTTAATTATTTTATCTATGACTCTTACTTTTTTAATTACTTAGGTATTGTCTGATAACCATTTAGTTTTTAAAAATTAAATTTATAAACATTACTTCCACACCTATATTTTCTTTGTTTTATTATCCAAGTTATTTAAAAATCTATGCCAAATTTTAAAAACTAAAAAAAGTACTTTTCAAAAACTTATTTTGTTTTTTTGAATTTGGTCAGTAATTCAAATGTTACTTTAAAGAAAAATCAAACCCATTCTGAGGAATTTGTGGGAAAACAAATAAAATTTTCAAAAATAAAAATAAAAAATTAAATGGTTATCTAGGATCTTATATAATAAAAATATTCCATAACTACACCTTTTATTCATTTATCTTATCAATAGATAGATATTTTTAAACAAATGTTAGAAGTTAATGATTAGTACAAAATTGACAATAAAAACTAAAATAGTTTTTATTATTTTTATTTTTCTAATAAGACTGAGATTTTATCACCTAGAGGCTAAAATAAAATATTTTAAAATTTAAAGATAAAAATAGAATAGAACATGGAATTTTGAGGACTTAAAATATATCTAATGCATGGCTTGTGTGTTTGAATATGGTCTTGCAGTTCTGTAGCGGGAGCTTGGAATCGGATGTTAGGAGCCTACACTCTGATCGCTACCGATTCAAGCGTATCTGTGGCGTAGCGGTAAAGTATTTGTGTTTTAATTCGTTCTCAACCGTCAACATGAGTATAGCTCAATTAATGTAAAATTATACTAAAGACTAAGAAATTTGTGATTCGAATCTTCCATCCCTACATGTTTTTTTTTAAAAAAAAATCGGAGTTAATCACACACCCAATTAATTCCCAATGGAACTTAATGTGGGGGGCTTGATAAAACTAAGCAAAATATTTTGCTGCATAGAGATTTGTATGAATCTCCCTACACACTACGTCACAAAAAAGTATTGTTCTAAAAATAATTTTCATATATTGATATTAGTTTATATCTTTTAATATTAAATTAGTTAAATAATAAATTCAGTTTTAAAAATTTTTAAGATTGTACCTAATGGGTCCATAACTTTTTTTTTAAAAAAAAAAGAGTTTCTAATAGATTACTTAGGTTCGGTTTGATAAATGGTTTTTCTTTTTAAAAAACTATTTTTGAAAATTAAGTTTATAAATAGGAAAAAATACTTTTTTAGTCCATGAGTTTTGGGGAATAGATGCATTTGGTCCCTAAGTTTTGAAAAAGAAATTGAGAGAAAACAAGCCTGATTTTTAAAAAATAAAAAATAAACAATCAAATATTATCAAACAAGGTACAACTTTCAATTTTGTGTCTAATAGGTTTTTGAATTTTAATTTTTTTTATCAAGTAGGTTCTTGAACTTTAAAAAATGACTAATAGATGAGAGATCCATTAAGCATCAAATTAAAAACTCAAGAATTTATAAGATAAAAAATTGAAAGTTTAATGGACAATTAGACACTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAAAAATAGGTGCTTATTATAAATAACTTTTAAAATTTAAATATCAAACTTATTAAGTTTCTTCAGTAAGAACGGTAAATAATTTTTCTATATAAATACATATAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTGAGATAAGTTCGATTTTTTTCCCCTTTCCTAAACATTGTGGATTCATTTTCTACCATCAATTTGTTTGAAAACTAATTTAATTTCCATCTCTATCACCAAAAAAGAAAAATTAAGTTTAAAGATAAATCTAAAACAAAGATTATGATATTAAAAATTTGTTATTATTTTATATTTTAAATTATTTTAAAAATATATCTTAGACATTGTAAGGGGCTCAGGTTTTCTAGGATTTGAAATGGCATGTGTAATACTATTTTATAAACTTTGGAAAGTTCAGAGTGCCTGACCCAACCTTGATATTTGTCTCTGGTTATGACTCATGTTTAGGGTCGTCCTGCTGCTTCGAGCTCATGGTATGATGGGACCTTTGCTTTGGAACCATCACCCACTTACAAAATGGTAAATTATTTCTTTATTAATTTATCTATCTCTGATTTGTTTAACTTCTCAAGTATTTAAATTTTAAAAAAGAAAATCATTTTGAAAATATTAATAGCGTTTGACAACCACTAAAAATGACTTATTAGAAAATGGTATTGGTAAATAAACCATTTTGAGAAAAACATTTAAAACCAACTTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAGTCTATACTATGCAACCAAACATATTAGAGTTTAAATTCTAAACAATTTTTATACAAAATATTTTGTAAAAAATGCATTCCAAATTAATCGACCCGTCCACTAAAGTTGATTTTAGATTGGGTCGGACGGACTCAAGTTAAACTTTGACTTTAGGCCAAGCTTGGGACATGGACCTCTAAGGAGGCTGGCTAGTAAGTTACCATTTATGAAATCATTATTTCATCTAAAATAAATTGATTTTTTTTCTTCATGTTTCTATTTTTTTTTTAAATCTTGATATAATTTTTGTAATTAATAAAAACAAGATTTTTGTTTTCTAATTTTTTGTCAGGATAAAGAAAGTGTAGAAGAAGAACAAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGAAAAGGGC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mRNA sequence

ATGGCGGAGCAGGAGGAGAAGAAGATGATCGGTGACGGTGAGAGTGAGACTAAGGAGGTTGGGTCCTTAGAATCTCTGTCGGAGCCGAAGCTGGAGCAACAACACGACAGTCTTCAATTTAGTACCAACATGTTCTGTAGCGGGAGCTTGGAATCGGATGTTAGGAGCCTACACTCTGATCGCTACCGATTCAAGCGTATCTGTGGCGTAGCGGGTCGTCCTGCTGCTTCGAGCTCATGGTATGATGGGACCTTTGCTTTGGAACCATCACCCACTTACAAAATGGATAAAGAAAGTGTAGAAGAAGAACAAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGAAAAGGGCAACGAAAGACTATCGCCGGCTATGAATCCTTTTAAAAGAAAGTTCACTGAACCACCTAGGCCTAAGATGAGTCCTCCCGATGAAGAAACAAAAAAAAAAGAGAACGTTTTTAAGAGGCTTAGGAATAGTTCCTTTATATTCTCCAAGTCTAAACAAAGTTTTGAGCATAAGATGAACAAATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCGGAGCAGGAGGAGAAGAAGATGATCGGTGACGGTGAGAGTGAGACTAAGGAGGTTGGGTCCTTAGAATCTCTGTCGGAGCCGAAGCTGGAGCAACAACACGACAGTCTTCAATTTAGTACCAACATGTTCTGTAGCGGGAGCTTGGAATCGGATGTTAGGAGCCTACACTCTGATCGCTACCGATTCAAGCGTATCTGTGGCGTAGCGGGTCGTCCTGCTGCTTCGAGCTCATGGTATGATGGGACCTTTGCTTTGGAACCATCACCCACTTACAAAATGGATAAAGAAAGTGTAGAAGAAGAACAAGATGGAGATGGAGATGGAGATGGAGATGAAAAGGGCAACGAAAGACTATCGCCGGCTATGAATCCTTTTAAAAGAAAGTTCACTGAACCACCTAGGCCTAAGATGAGTCCTCCCGATGAAGAAACAAAAAAAAAAGAGAACGTTTTTAAGAGGCTTAGGAATAGTTCCTTTATATTCTCCAAGTCTAAACAAAGTTTTGAGCATAAGATGAACAAATGA

Protein sequence

MAEQEEKKMIGDGESETKEVGSLESLSEPKLEQQHDSLQFSTNMFCSGSLESDVRSLHSDRYRFKRICGVAGRPAASSSWYDGTFALEPSPTYKMDKESVEEEQDGDGDGDGDEKGNERLSPAMNPFKRKFTEPPRPKMSPPDEETKKKENVFKRLRNSSFIFSKSKQSFEHKMNK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 131..153
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 74..153
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..31
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..34

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg025190.1Spg025190.1mRNA