Spg024260 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg024260
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold4: 19967193 .. 19973064 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg024260
SyntenySpg024260
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGCGACAAATTCTGCAGCCATTTGCCTTTGCAATTCAACTCTCAGCTCCTTTAGCCTCAGCTCTAGGCGCTATAATGGGCACCTTGACTTTGAAGAGCAGCATATCATTTCTGGCCATATTCAGGATGACCTTGATGTTAATGGCTAATGTGACTGAAATTTGCAGTGTTGCAAGGACCTAAGAAAAAATATATTAGAAAGATCTCGGTTAAGCGCAAATACACGTTGTCACATGTAGTAATAAAACTTGGAGGTATTCCAAGTATCGGTTCTATAGGGACTCTACGGTAAAATTCATATTTGAGAAGAAACTACTCAAAAGCACAACAAAGGTAACCAAGTAAAATGAGGATGATTGGTAGTTTGGATTTTAAGAAAATAACAAATAATGAAAACGGAATCCAATTTAGTTTTAGTCTTAAGTTAAGCTAACTATCGAATTGTGTCCACATAGCAACCACATTCTACCTTGTGTGTTGAATCGGGTTTAACACCTATTAAGCCTTGTATCAAGTATAATTATGAGACTAAGCAACTAGACTCATATGTCTATGGCTAATTTGGACTTAGATAATTTAGCATACAATCCTTTAGATCCTATAGTTGTTGTTTTAGCAATACTGAAGTCCTATGTCTTGGCCCTTCATCCTATATCCCCATTTACAAAAATCGATTTTGCCTGATGATAACTCTCCAAAAGGGAGTTATTATTTGTCTTTAATGGGATAGAATGAATCTTACTAGTGCTAAATAAACACGATTGTCATTGAATTTCTACTTGTTTTAAGATATTTTGGGAAACTAATGTCTTGTACCTATTTTGCAAGAAAAATACAAATGTTGAGAAGTTGCGGCAGCAAAACATATGATCGACAACACATGTGCAAAGTTATCCATGTCGGCTGACAGAACGACTTGTTGGATTCTCGCATCAAATGAAATTTATAAACTAGCTCTATGCTACTTTATAGTAGGTAGTGATTGGATGTCCACAGGGAAGGGATAATTCTTTTTAGCTCAAGTTTTTATGGATAATTGGAATGGGAGGTTTTAGGAAAATCAATTAATGACATGGCAAGAATATTAAAATGCCGGAAATTAAGATTGCATAAAAATAAATGCAGAAATCTAAAAGCAGGAAACAAAATAATCAATTTTGCAACATCATCGGATTAGGGATTCATTGGATTGTTTGTTCCTTCAGTTTCATCGATTGCTCTATTGATTGATTTTAGTGAATATTAATGAGTATGATATTGCTTCTTGACTAAGTGGATTCTCCATCTTACCTAGTCTGAGTCTAATCAATTAATTAACCTAATACTCTGTCGTAATTAATTAACTAATTAATTAGAGTTACGTACACTACCCCTCATGCATTAGTGATGTGCACAAAATGCCCTACCGCAAGTGTACGGGTCAAGATTTAATATAGTTGACAGCGCGCATAGTGAGCTTCTTTTCCCGGTTATTTTAGTTAGTCTCTGAGATTAAATTGGCCAAAATTATGCACTTAATGTTTGTTTTGTAGGAAATTGAGTTTGGCATGAAAAGGAGCATTTGGAAGTTATTCGGGTGTTCGGGACCTAAAAAGAGGCAAAGGAATCGAAAAGTGAATGAAAATCGAGGCTTAAAGTGAGTGAAGACCCGAGAGGTAGCGTCGAGACGCTGCCTCCTTAGCGTCTCGACGCTACACAATTTCCTTATATAATTCTGGCGGTAAAGAGGACAGCGTCTAGCGTTTCGATGCTATCAAAATTCTTCCTATAAATACATCCTTATATTGCACGGCTAATGAAAGTTCAATTTGAGAGTTTTTAGACCTAATTTCGACAAGGGGCATTCTGTGGGAGCTAAAGCTGGGCCAAAGAGTGGGAACCAAGCTTGAAGTCATGGAGATCGTGACGGGGACGTGGCGGTTTCAACGGATTTAAGAGTTTTTACTTTCTTTACCTTATCTATTGTTGTTTTGATGGCTTTTGATTCAAGTTGTGTTGGTAGTTCAATGACTATGAGTAGCTAAACTTGTATGTCTTAGGGATTGATGTAGTCTTTTAGGTTTATGGATTGATTATTGGGATGTTTTGTGCCTTTATTTTATTCATGTGATTATGGTTAAATGCTTTCAATTAATTGGCCATTAGTTGAATGATTTAGTGTTGAATCTTGCTCGGGAGAAAGGATTTGGCTTAGACTTTGCTAATTGCATGACTAAGGTAGAATTCTATGATCAGGAGATTTAGAATAACTTTAGAAGTTGTAAAAAGAACTAAACTCAAAGTCTTGCATGTCAATGAACTTAGATTGAGATATCAAGTTTATTATATGGTGAGAATCAATTATGCTCGGGAGAGATATTTGTGATTTAAGGTTCTTTGACTTACAAAATAATTGCATGTTAAAAACTCACTCCCTTTAATTAATCCTAAATCTAAATTGACAAAATCAAATCCCTAAGAATTCTTCCAATTGAATTTTCATCCTTTAATTTGAATTACCTTTTGATAGTTCTCATCCTAGTGTGATCTCTAAATAAAATTGGGCAAAAGTATTCACGGTAATTAATTTAACTAGAAAACTAATCCAGAGGACGACATTCGATTTTCAAATCACTATATTATTACTTGACCCGTATACTTGCGGTAGCAAAATTGTGCATCAAGTTTTTGGCGTCGTTGCCGGGGATTGGCATATTTAGTTAGATTAATATTGTGAAAAAATTGATTGGTCTTAATTTAGGGTGTATTTTTACTTTTTTTAGGTAGTTGTTTTTTTCGTTATTTGTTTTATTTTCGTATTTGTAGTTTTCTATTTTAGTGTTTTCCTTATTCATTTTGATTTTTTTTCCTTATTTGTTAGTTTCTTTATTTGTCTTTGATTTTTTCCTTTTAAGTTAGTTTTTTTCCTTGTTTGATATTTTTCTTAATTGTCTTTTCCTTTTTTTGATTTTGCATTCCTTATTTGTTAGTGTTTCCTTTCTTAGTTTATCTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTAGCTGTTTCCTTTTCTATTTCTTTTTCCTTATTTGTTTTCTTTCCTTTTTTATTATTTCTTTTTTTTTTAGGTTAGGCTAGATTGCGTATGCGAAAGGATAGGGATTTAGCCTTAGTACCTTTGGACCCCAAGATTGAGAGGACCATTAGTAGACTTCGAAGTGAGACTAAAGATCTTGTCCAAATGGTCGATCCAAATCCTCCTGAGGAGCCTAAGCCCATTAGAGATTATGTTCAGCCCGTGTTTCAGGGGCAACAGTCAGGGATTGTTTATGCCCGATCAATGCCCAACAACTTTGAGCTGAAAAATCGGTCTCATTCAAATGCCTCTTGATTGTGCATTCAGAGGATCACCCACAGAGGACCCAAATTCTTATCTGAAATCTTTTCTAGACATTTGTGGGATGGTAAAATTAAACGGTGTTACTGAAGATGCCATTTGCTTACGCTTGTTTCCTTTTTCGTTGCAGAACAAGGCCCGAGATTGGTTGCAGTCTATTCCCTCTGGAAGCATCACCACTTGGGATGCTTTGGTCCAGGCCTTGTTGAAGAAATTCTTCCCTCGTGCTAAGACGGTCAAACTGAGGACCGAAATTGGAACATTTCAGTAGCAGTTCGACGAGTAGTTTTTCGAGGCATGGGAGATCTATGAGGAAGTGCCCTCAGCATGGATACCCTGACTGGTTGCAGATCCAATTCTTTTATAATGGTTTAAATCCTAGTACTAAGACTATTGTTGATGCAGCTGCAGGTGGGACTCTGTTGTCCAAGACCGTGGAAAATGCACGTACGCTACTGGAGGATATGGCTACCAATAGCAATCAGTGACCATCTGAGCGGTCTACACCAAAGAAAGTGACAGCTGGGGTGTTTGAGATTGATAATGTAAGTGCTCTACAAGCCCAGATGTCCTCCCTAGCTAATGTTTTCCTTAAGTTTTCAGGTACAGGAAGCACACAGTCCATCAAGTTAGCTGCTGCTATTGCATCTCAATCTCAGGAGGAGACCACCATAGAACATGTTCAGTATGTAACAAATTCTAATTTTAGGGGATAAATAATTCTACACCCACACACTATTACCCTAACAATAGGAACAATGAGAATTTTTCTTATACAAACAATAAGAATGTTTTAAACCCTTTTGGATTTGCCCCTAAAAAGAAAGAAAATAAACAATCTCTTGTGGATCTTGTTGGAGCTTTTATTGCAGAGTCAAGTAACAGGACCAATAAGCTTGAGGAGGCAGTGATCGCCATTAACACCACGGTGACTGACCACAGTGCAACCATAAAAAATATTGAAACTCAGTTGGGGCAACTTGTAAGTGTTTGACGAGACTTGTCGAAGGTCTGAGCCAAATAAATTTATAATCTACGACACTATAACTATTTTGTAGAAATAGTGGTTGGGGTCGAACATAGGGAAGGGGATTTAGCAGATGCAGAATTTTGGGTTCATGCAACAGGGGATTTGAATAATTGGATGCAATAAAATAAAATGTTGAATGTAAAAGAGACAGAATAATAAAACATACGATAGAGAGAAATAAGATGGAGATCAATATCATAAAAGGATTGCTGGATTGGGATTTCTTATGCTTGAATGTTATTTCACATTGGCTTCCTAGTTTTCTCTAAAAATCATTCTATACAGCTTTTATTAGTCCAGTTAGGTTCTTGGTTACTCGGAGGACCCCTGATAACTCTCCAAAAGGGAGTTATTTAGACCTTATTTCTATATTGATTTGTGTGTCTTTTATGCTTAATAGGGTTGCTTTTAGATGGATATTATATGTTTTAACCCATTTGGAAGAATGGAAGTTTTGGAAATTATTTTGTGCAGAATATGTTGCTGGGCGTTGGATTGGGTTGCTTTTAGACCTCTAACGTGTGTTTCCATGCATTTTATGAACTAAGTAGCTTTAGGCGTTGGTTAGGAACATGTAGTTGCCGTGCTTAATCTCTAGTAATAAATATTGATTTGATGCATCTTGATTAATTGTTGTGTTCATTTCTATTTTATGCCCGCCTGGCCAGCCGGTATGAATACCTCTCTCTAGTTTCAGGGATGATTTAGGGAGTGTGGCGGTTAATCACACTAGATCATTGTGTATTGGTGAACGCCAGTGACTGAGCTAGGGATAGCCAGTTGCCTAGTGCTTAATCGGTAGAGCTTCATTGGAGTTGAAACATATTCTAAAAAATCCGAAGTTCCGGGAGGAATCCGCTAATAAGACTGCGAGAGTTTTGCATGATCAATAATATTGCTAGAGCATCTTTTAAAACAATTACTAAAACATGACCAGCGCCTGTTTCTAATCTGTCGGCCTATTTGTTTATTTTTTGCTCTGTCATTTCTTTTGCTTCAGCATTCTATAAAAACCAATCATTTTAACCATTCTTGAAACCATTGAAAAACTAAACAAAATAGATAAAGTGAAAGCTAATTCAGACCTTGGATTCGATAAATACTTATTACTTGTTGCGGACTGTGTATACTTGCACAGAGTTCTAGAGCATTTTTATAACTTATTTTTACTCACTCTGGAAACCCAACAAGTTTTTGGCGCCGTTGCCGGGGACTTGAATAAGTTTTTATCTGATCTGTTTTGTGTATGTGTTTTAGTGGTTTGGTGCTAGAACTTTTTGATTGTTTCTTTTGTTTTTGCAGGTGTGAGTTTGGTGCATGAACGATCCGCCTGGGGTAAGGTTCGAGCTTGATCCAGAAATCGAGAGGACATTCAGGATAAGAAGGAGAGAGCAGCATAGACAGCAAAATCAAATGGCTGACGTGCCGCGTCTCCCGCAGGGTCCAGAAGATCCAGTTGATCCCCAACAGAATCGTGTGTTGTAG

mRNA sequence

ATGCGACAAATTCTGCAGCCATTTGCCTTTGCAATTCAACTCTCAGCTCCTTTAGCCTCAGCTCTAGGCGCTATAATGGGCACCTTGACTTTGAAGAGCAGCATATCATTTCTGGCCATATTCAGGATGACCTTGATGTTAATGGCTAATGAAATTGAGTTTGGCATGAAAAGGAGCATTTGGAAGTTATTCGGGTGTTCGGGACCTAAAAAGAGGCAAAGGAATCGAAAAGTGAATGAAAATCGAGGCTTAAAGACCAATAAGCTTGAGGAGGCAGTGATCGCCATTAACACCACGGTGACTGACCACAGTGCAACCATAAAAAATATTGAAACTCAGTTGGGGCAACTTAATATGTTGCTGGGCGTTGGATTGGTTTGGTGCATGAACGATCCGCCTGGGGTAAGGTTCGAGCTTGATCCAGAAATCGAGAGGACATTCAGGATAAGAAGGAGAGAGCAGCATAGACAGCAAAATCAAATGGCTGACGTGCCGCGTCTCCCGCAGGGTCCAGAAGATCCAGTTGATCCCCAACAGAATCGTGTGTTGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCGACAAATTCTGCAGCCATTTGCCTTTGCAATTCAACTCTCAGCTCCTTTAGCCTCAGCTCTAGGCGCTATAATGGGCACCTTGACTTTGAAGAGCAGCATATCATTTCTGGCCATATTCAGGATGACCTTGATGTTAATGGCTAATGAAATTGAGTTTGGCATGAAAAGGAGCATTTGGAAGTTATTCGGGTGTTCGGGACCTAAAAAGAGGCAAAGGAATCGAAAAGTGAATGAAAATCGAGGCTTAAAGACCAATAAGCTTGAGGAGGCAGTGATCGCCATTAACACCACGGTGACTGACCACAGTGCAACCATAAAAAATATTGAAACTCAGTTGGGGCAACTTAATATGTTGCTGGGCGTTGGATTGGTTTGGTGCATGAACGATCCGCCTGGGGTAAGGTTCGAGCTTGATCCAGAAATCGAGAGGACATTCAGGATAAGAAGGAGAGAGCAGCATAGACAGCAAAATCAAATGGCTGACGTGCCGCGTCTCCCGCAGGGTCCAGAAGATCCAGTTGATCCCCAACAGAATCGTGTGTTGTAG

Protein sequence

MRQILQPFAFAIQLSAPLASALGAIMGTLTLKSSISFLAIFRMTLMLMANEIEFGMKRSIWKLFGCSGPKKRQRNRKVNENRGLKTNKLEEAVIAINTTVTDHSATIKNIETQLGQLNMLLGVGLVWCMNDPPGVRFELDPEIERTFRIRRREQHRQQNQMADVPRLPQGPEDPVDPQQNRVL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 152..183

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg024260.1Spg024260.1mRNA