Spg021590 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg021590
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold9: 8028592 .. 8041024 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg021590
SyntenySpg021590
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACTCGACTTCCTGCTTTATTTCTCGGTTTCGTCTTGCTTTTTCTCGGTTCGGGACTTCAATCTTTGGCTATTGGTGTCACATTTCAGGCTCGCTTCAGCACAATTGGGTCTCTTCACCTCTTCTCCGTCCAAGACATCGAGATGACTCCAAAAACTTCGTAATTGGCCCGAATTAATACCAATTAGCATGATCGGCTCCCGACACGGCCTAAGCTCAATTAACTTGTAAATAGGACAAGTAAAGTATAAAATGACTCTAACCAGCTTAGATTAGAGGCGATAAAATATGACTATTTAGGTCCTATCAAAGCTTTAAGTGTCCCCATGACTGAGCAGCAAGCACCTCATCATCGCGCAGGTATGTCCTTGAAAGAAAATATGTTTAAAGAGAAAGAAAAGGAGATAAAGGTATTTGTATTTATGTGTTTCTCATGTACTAATTAATGAGTGATGAGGCATGGTGTCATATGTGATTATTGTCTTTGTCATGTAACTGTCGACTTAGATGATTAAGGAAGTTTAATTTTTCTGAGTGTGGAAATTTGAAAAAAAAAACAAACATATGCCTCCACGTATAAGGGGATCAGGCAGGCGTGGTCGGCCAGCGAGAGGAAGAGAACCCTAGGGTAGTAGACCCACCATTAGGGCAGCCAATGAACAATAATGAGGACTCCCTGCTAGAACCACAGGTGGGTTAGGAGGAGGAACCGCTAGCCCAACTAGCTAGTAGAATAAACTACGACAATATTGTTGCTGCAGACCATTTGTGGCTCGATTGGATTCAAACCAGAACAATATGACTGAAGAAGCTAAATGCTTGCGGGATTTTAGAAAGTACAACCCCCGCTCCTTTAATGGGTCGCCCAAGGATCCAACCAAAGCAGAATTATGGTTATCGCCGATGGAGACTATATTTCGGTATATGAAGTGTCCGGAGGGACAGAAGGTGCATTGTGTTGTGTTCGTTTTGACAAATGATGCACTCTTATGGTGGGAGTCAGCAGAAAGGTCCATCAACACAAGTAGGGGCTCGATGACCTAGTCGCAGTTCAGGGAGTCATTTTTTCGGCAGTACTATCCAGCTCCGACTCGCTTTAGGAAGCAGGCATAATTCTCGAATTTGACTCAGGGCAGTCGATCGGTGGAAGAGTATGAGAGGGAATTTACCAAATTGTCCCGTTTAGCCCCAGAAATGGTTGATAATGAGGCCAAGAAGGCATAACGTTTTATCATGGGACTGAAGGACGAGGTTCAGGGGATTGTGGCGGCTCTCACACCACCAGATTATGCCACAGTTCTGCGAGCTACTTTGATTGATAATCGTCCAGGTAGTGGATCTCAAGCCCCTTCAAAACCTGGTTCCTCATCTGGGCAGAAGAGATGAAGGATTAAAATTTCTTTGGCAGTGGAAACAATCAAGACCAAACTCGAATTGAATTTCAATTACGCAAAACCAATACGTTGGCAAAGTTAAAAACAGAACAATTCTATAGATTTAACTATATTAGATTAAGCATGCATTCTAAAATTCTAAACCTTTTAGAATTGGAAACTTGTTGAAGAACAATTTTCTTCTCTATACTCCTTTGGTGAAGACAATGATCACGGCGAACACTACTACAAGCCTTCACTGGTATTCTTTATGGGATTAGGGAAGGTGAGAATGGTGGGATTCTCTCTAGCAGGGAAAGATCAAATCTTTTGAGAAAAAATCTTTTTCTCAGGGAGACCTTTCTGTCAAATTGCACAGAATGAGAGTGAGCAAGTTCCCTGGCCTCACAGGCCTGAATTGATGGAAGAACTCCAACTTCCCCAGGCGTGTAGCAATCAGTTATGGGAGATGGAAGACCAAGCAAAGGCCACGTGGAGATGATAACTGACCATTAGTTATCGTAAAATTAAATTAAATTTGTTTTTATTTAATTAATTAAAAAACAATTAATTCATTAATTAAATTTAATTTAATTCAATATTTCATTTAAATCATATCTAAATGAACATCTCCCATATAACCTCTAGTTTTAATTTAATTAAATCAATTAAATTAATTAATTAATTAATTAATTATTAAATTAAATATCACATACTTAATTTAATCTAATAATTGAATCATATTCAATTAAATTTCTCTCATATACTATAGTTTTAATGTACATCTAATTCACATTAATTATAACCTATAGTTTTAATATGAATGAAACTCATATTAAATTTAATATTTGAACTCCTTCAAAATAAATTTATATTATAAAGTTTAATTAAAATATAACTTTATATTATAATGTATTACCATACATTATATCGTTTCCCTTAGTAAATTTGAGCATTTCAAATTACTTTATTTATCTCAATACCATTTACGAGCTACCAGTGGGTCCTAATGGACCTATAGATTGAAGCTCCAACGATATGAGATTAATTGGCTAAACTCATTAACCAAGTTAATAAGTATTTGTTAACTGTGGGGCACTCCACTAAAGACCCACAACTGCACTCTTCTCACTGTAAAATATTTCTGTGTCCATGGATATCGACCATAACGTAAGTCAATCCTTCACGAGTGTTCGTGACGCCAGCTGGGACAAATTATCGTTTTATCCCTAGGTTACCTCTGGATCCTTAAGTACCACTGATCCCTCTAATGAACAAGTTGTTTAGGGTCCAACCATTAAACAGGAGTTCCTCTCAGGCCAGGAGAGGACAACACGCCTTTGTTCCAGCCCCGGAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTACTTACCCCAATAGGGGAATGAGTGAATTCCATCTTGTACTGTTATGTCCCCAACCTCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATAGTAGGATTATTGAGTCGCCGAACATGCCACTCTCACCCATACAAATCTAAGGACAATCCCTCCTGAAAAAGGGTTCATAATAGACTCAGGATTGAGATTGAGTTACCTAGGTCATCCTATTGAAATAGAAACCTAAACTAGTTAACGGTGTTACATCTAGTGGTTACTATTTCGTGGTCCGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCCCACTCGCATGTCTCCTATATGGATGCTTTGGATCGTTGTATCTGTATCGAATACAAAGTGGGTCGTATCCCATGTCCCCAAGATAAGGTACCTAGTCTTATCCTTATACTATAAACCATTTAGGTTGTTACTTGTGTAGGATTGGAATTCCATAATTCCGTAAAACAGAAGCGGGATTGGGATCGATTCGTAATTAATTTTGTTTAATAAAAAATATCAATACATTGGTAATAAACTTAGAACTATTCTAGATTTATATTAAGGCTAAGCATACAGAAATATTAGATCTAAATCTAATTTATATAGTAACAAGTTACTTACTCTCGTTGACGACCCTGATTAAATTCACCAACTGCTTATGAAATAATCACGAACTATTGTGAACACTATCACTATGGCTATACCGGTATGACTCTGAGACTACTAGAGGCAGGAGACTGGTGGGAGCCTTTGGGAGAATTCTCTGAGAGTAGGAGAATGAATGGGGTGCCTTTCACCCTACCCCAGGGGTCCTATTTATAGGTAAAGGCCAAGACTTTTTCCTAATAAGAAAAGGAAGGACTTTTCCTAATAGGAAAAGGTCTCTAATTTTAATAAATAATTAATTAATTCCATAATTAATTAACTACCCAATTAAATATCATTGGGACCTAATGGACCTACAAATCAGAAGCTCCAACGATACGAGACTAATTGGCCAAACTCATTAACCAAGTTAGTCAACATTCGTTAACTGTGGGTCACTCCACTAAAGACCCACAACTGTACTCTTCTCACTGCAAAATATTTATGTGTCCACGGATATCGACCATAACGGTAAGTCAATCATTCACAAGTGTTCGTGACGCCAGCTGGGTCAAATTATCATTGTACCCCTGGGTTACCTCTGGATCCTTAAGTACCACTGATCCCTCTAATGAACAAGTTGTTTAGGGTCCAACAACTAAACAAGAGTTCCTCTCGAGCCAACAGAGGACGGCACGCCTTTGTTCCAACCCTGGAATCAGCCCTTAAGAGAACACACATCTACTTTCCTCAATAGGGGAATGAGTAAATTCCATCTTGTATTGTTATGTTCCTAGCCCCCATTCGGTCTTACCCCTGAAATGGTAGGATTATTGAGTCGGCGAACTGGCCATTCTCACCCATACAAATCTAAGGACAATCCCTCCTAAAAGGGGTTCATAACAGACTCAGGATTGAGATTGAGTTACCTAGGTCATCCTATTGAAATAGAAACCTAAACTAGTTAACGACGTTACATCCAGTGGTTACTATTTCGTGGTCCGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGATACCCCCACCCGCATGTCTCCTACATGGATACTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACTTGGTGGGACGTATCACATAGTGTCACCAGGATAAGGTACCCAGCCTTATCCCTATACTATAGACCTTTTAGGTTGTTACTTGAACACCGATCCCCGTATGTTCCCACATACTAGTTCAAGTTTCATTTAAACAACCTTGGATCTTAGTTTACTGGATTTAGGGTTTATTAATGCAAACTCAATTATTCAATAACTAAATTACTGAATCACTCAAATAACACTTTATTGAGATCGATTAATTTGTTTCATTTATTATCTACGAGTTTTAGGGCATAAAACCCAACAACTTGAACACTGATCCCCGTATGTCCCCACATACTAGTCCAAGTTTCATTTAAACAACCTTGGATCTTAGTTTACTGGATTTAGGGTTTATTAATGCAAACTCGATTATTCAATAACCAAATCATTGAATCGCTCAAATAACGCTTTATGGAGATCGATTAATTTGTTTCATTTACTATCTACGAGTTAATCTCGCATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCACCTTCTAGCTCGTAACGGGTACTGAGATTATTTAGTCTTAAATATTAAGGGATTT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mRNA sequence

ATGACTCGACTTCCTGCTTTATTTCTCGGTTTCGTCTTGCTTTTTCTCGGTTCGGGACTTCAATCTTTGGCTATTGGTGTCACATTTCAGGCTCGCTTCAGCACAATTGGGTCTCTTCACCTCTTCTCCGTCCAAGACATCGAGATGACTCCAAAAACTTCCAAGCACCTCATCATCGCGCAGAATTGGAAACTTGTTGAAGAACAATTTTCTTCTCTATACTCCTTTGGTGAAGACAATGATCACGGCGAACACTACTACAAGCCTTCACTGAATGAGAGTGAGCAAGTTCCCTGGCCTCACAGGCCTGAATTGATGGAAGAACTCCAACTTCCCCAGGCGTGTAGCAATCAGTTATGGGAGATGGAAGACCAAGCAAAGGCCACACCCACAACTGTACTCTTCTCACTGCAAAATATTTATGTGTCCACGGATATCGACCATAACGTTGGACCCAGTCGCCTCAGGCCCCTGCACTCCGACAAGCTGCAGAAGCCAACTGCCACCGCGAATTCGTCGTCACCGTCGTTTGCTTTGTTCGTTGCACGTAGGTGGGAGTTGCAGCAACTTCAATCTCGTTTTGGGTCTAGTTTGGGGCACATGAAATTGATGTACTTTAAGAGGTGCCTACAGAGAACTGAGGGACATGAAATTGATGTACTTTTGTCGAGGAGTGTTGAAGTCTTCACTACTACAAATATGGGATTCCATGACACTAAGGGAAAAGGAAATAAAGGAACCACCGCCATCGTCATTTCCTCTCCGATCACGTCACCTCTGCTGCTTGCAACCTCCGCCTCCGACCCAATTGACAAGCGCCACCGCCTCTCTCCTTCTGCAGCTATTGATGTCATAATCTCAGACTGGTTGAAGCCAACTGGGGTGATGTTGAAATGCGACCCTGCTAAGTCTCATGCTCATGTTGTCTGTGCAGTTGGAGTGCTTCAATCCTTGAAAGATGAGTGGCAAAATATTCCACCAAGCTGGGAAACATCAAATGATCCCCGTGGAACTCCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGACTCGACTTCCTGCTTTATTTCTCGGTTTCGTCTTGCTTTTTCTCGGTTCGGGACTTCAATCTTTGGCTATTGGTGTCACATTTCAGGCTCGCTTCAGCACAATTGGGTCTCTTCACCTCTTCTCCGTCCAAGACATCGAGATGACTCCAAAAACTTCCAAGCACCTCATCATCGCGCAGAATTGGAAACTTGTTGAAGAACAATTTTCTTCTCTATACTCCTTTGGTGAAGACAATGATCACGGCGAACACTACTACAAGCCTTCACTGAATGAGAGTGAGCAAGTTCCCTGGCCTCACAGGCCTGAATTGATGGAAGAACTCCAACTTCCCCAGGCGTGTAGCAATCAGTTATGGGAGATGGAAGACCAAGCAAAGGCCACACCCACAACTGTACTCTTCTCACTGCAAAATATTTATGTGTCCACGGATATCGACCATAACGTTGGACCCAGTCGCCTCAGGCCCCTGCACTCCGACAAGCTGCAGAAGCCAACTGCCACCGCGAATTCGTCGTCACCGTCGTTTGCTTTGTTCGTTGCACGTAGGTGGGAGTTGCAGCAACTTCAATCTCGTTTTGGGTCTAGTTTGGGGCACATGAAATTGATGTACTTTAAGAGGTGCCTACAGAGAACTGAGGGACATGAAATTGATGTACTTTTGTCGAGGAGTGTTGAAGTCTTCACTACTACAAATATGGGATTCCATGACACTAAGGGAAAAGGAAATAAAGGAACCACCGCCATCGTCATTTCCTCTCCGATCACGTCACCTCTGCTGCTTGCAACCTCCGCCTCCGACCCAATTGACAAGCGCCACCGCCTCTCTCCTTCTGCAGCTATTGATGTCATAATCTCAGACTGGTTGAAGCCAACTGGGGTGATGTTGAAATGCGACCCTGCTAAGTCTCATGCTCATGTTGTCTGTGCAGTTGGAGTGCTTCAATCCTTGAAAGATGAGTGGCAAAATATTCCACCAAGCTGGGAAACATCAAATGATCCCCGTGGAACTCCCTAA

Protein sequence

MTRLPALFLGFVLLFLGSGLQSLAIGVTFQARFSTIGSLHLFSVQDIEMTPKTSKHLIIAQNWKLVEEQFSSLYSFGEDNDHGEHYYKPSLNESEQVPWPHRPELMEELQLPQACSNQLWEMEDQAKATPTTVLFSLQNIYVSTDIDHNVGPSRLRPLHSDKLQKPTATANSSSPSFALFVARRWELQQLQSRFGSSLGHMKLMYFKRCLQRTEGHEIDVLLSRSVEVFTTTNMGFHDTKGKGNKGTTAIVISSPITSPLLLATSASDPIDKRHRLSPSAAIDVIISDWLKPTGVMLKCDPAKSHAHVVCAVGVLQSLKDEWQNIPPSWETSNDPRGTP
Homology
[Close]
BLAST of Spg021590 vs. NCBI nr
Match: XP_011652328.1 (probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 70.5 bits (171), Expect = 3.2e-08
Identity = 31/45 (68.89%), Postives = 33/45 (73.33%), Query Frame = 0 

Query: 295 VMLKCDPAKSHAHVVCAVGVLQSLKDEWQNIPPSWETSNDPRGTP 340
           + + CDP K H HVV A  VLQSLKD WQN PPSW TSNDP GTP
Sbjct: 54  IRVGCDPCKLHDHVVDAASVLQSLKDGWQNTPPSWGTSNDPCGTP 98

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spg021590 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_011652328.13.2e-0868.89probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g49770 [Cucumis sat... [more]
BLAST of Spg021590 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg021590 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg021590 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg021590.1Spg021590.1mRNA