Spg021589 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTCTAACCTCGGCCTTTCTGTGTTTCTCTTCAATTTGGTTTCGTAAGTCTGTCCTTACCGCACGACTACTGTTCTGGGTTGATTCCGAGCTCCCTAGCACCATATAACCTCTAGATTTCATCCCCTTGACTCTGTTGGTTGCGTTGTCAATCTTCTTTTTCTTCAATCTTCATTCTGACTCTGCAGTGTACTCCACTGGTTCCTTCTCATTCCTTGGAACCCTAACTAGCATTTTCTCTTGAACTTTGGAGTCAGAACCAGATTTATCCAAGATACATAGTATCTTAGACAAATTTTTATCCATTATGCTCACCTTGTCCTCAAGGGTGGCAATTTTGGCATCGACCTGCCTCTCTTGGGAAAGAGGTCGAGGAGACCAAGGTCAAGGCTGAGGCCAAGGAGATCGGGTCCTAGGTCGAGCATGACTCTCTTCCTACGACCTCAGCTGGTGGTGGTCGCTTTTTCGAAGTTTCTGCTCCTGGATTCTTCTTTTCTTCTCCATCATCTTACCCGTTAGGTAATCGATGTGCAAACTGCCCTGGCAAGTCTTCCCCATAGATGGCGCCAATTGTTGATGTCACAATCCGGGTAGGAAGAACTCACCTGATCTTCATGTGACACCAACGGTAAATTTATTTGAAGGGGGGAAGACGTGGCCTGCAAAACAAGGAAACTTGCACACCGATGTGGTGTTTTCCACACCGCCTCCAATGCTTAAGTGAGCAAGGAGAAAGATGAGAAGCTAGAGTAAGAGTGGAGAGAGTTTAGAGAATAGAGTTTCAGATCCCTTCTTCAAGGGTTTATATACCTTCTCTGGTATTTAGGGTTTCTAGGCATCTAAAGACAGATTCGGGTTGAACCAAGTCGAACCGGACTGACCAAGGACACCAAGAACCGAACAAAGGGAGGGAAACTCAGCATGAGATTAGGCTGGCCTAATCCCTTCGGCCTACTTCTCCAGGGTCCGCTTCCTGGTTGTGTCTTTGGATTGGTGTTGTGATATCCTCGTTAGCTCCTTACGTTTCAGAGTGGTCCTGAATTACCTATAACAGAACTTTAAAAAGAATACAGAATAATAAAATTTTGTAAATCTAAGTCAATTTGATCAAAAAAATTAAAAGAGTAAGTAATATTATTAAATTTCAGATTCATTAACTCGATTTCAACTAGACATCTAGAATGATTAAAAGAGAATAGAGGATAAGACAATTTTCTTTCTTAAAGATCGATGGATGGATCTCACCCTTTTAATTGTTGAAACTCAGGATAAAAAGAAAAGAAGAATAATCGAAAAAGAGAGTAAAGTTCTCTTTGCTAAATGCTTTAAATTATACTCAGACAAACAAAAAGGATGCTTTAAGTTAAATACAGGATAAAATTTTAGTAATAAGAACTAAATGCTCTTATGACTCCAATATAAATTACTTCCAAAAGAAAGAAAAAGAAAAGGTTTTGCTCAAGAAAAACATTTAATATTTATTCTTAGAATAAAATTCGATGTTGTCCTCAAAATTTGTATGTTATTCAATTTTTTTTCTCTAATCTTTAATTAATATTCTATGTTTAAAAATTACTTTGTATAATAATAAATAACTTTTTAAAATATAAGATTGATGTTCCATTTTTGTGGTTTTATAGAATAGAATAGCTTAAGAATTTAGACACAAGTTTTTGCCCAAGATCTGAAATCTACGTGCATAAGTATTAAAAGCTATGCCAACATGAACACATAGGTCAACTGGCATAAAATTGTACGAACGACCAAGAGGTCTATGGTACAAATCCTCACTCTTCACATGTTTTCAATTTTCAATAAAAAAAATGCTATTATAATGAAATCAATAACAAGGACCATGTTTTTTCTAATATAATGCAGATTTTTTAGTGAAAAAATTAGTAAATTTAAATGAAGAGAAGTTGCCAATTTTAGGGACTAAAATAAAATATTAAAAAGTTTAAGGACCAAATCAAGAGAGATTGAATTTAGGAAAGTTTCAACTTTTACCTTTTTATTTTTAACTCAATAAAGATGAGATAGTTGTTTTTTTCAGTTCAACAACATTTGAGGGAATGAGATTCAAATCTCTTGCCTCTGAAATTTTTTTAAAAAATTAGTCTTACGTGCATTGAGTGGATTGTAAAAATAGAAGCTTGCTATGAAATTAAGGTGACTTTACAAAAAGGACAACAACACAAGGATTGAATTTTTGTTCGGATGGTGAACTTTAGGAGATTTATTAAATGGTGAATCAATTTGTTAGAGTTTGATTTTTATTGAAAAGGGTGGGTTTTAGGAGATTTTTACTTGTGTCCATCTTAAAATTTTTGTAAATTCAGTATTGTAATGTCTCAGACCAAAGATTTGGAATCTAGATTCGACCCTTGATGACCCACCATAATTGTAGTTGTCTTAGGGTGTGTTTGGTTTAACTTTTCAAGTGTTTAATTTTGAAAATAAATCATTTTGAAAAAATTTAGTGTTTGGCAACCACTAAAAATGACTTATTAGAAAATGAGATTGATAAATAAACCATTTTGAGGGAAACACTTGAAACCAACTTTTTAAAAAAGACTTCTTGAGTAAATTACAATAACTTGTGTAGAAAAACATTTGTGAAGAAATGCAACCAAACATATGAATGTTTAAATTCTAAACAATTTTTATACAAAATGTTTTTTAAAAAATGCATTCTTGAAAACCATTTAAATTAAAATGTATTCCAAAACAGACCCTTAAATAGCTTTTAAGAGTAAAGATCGTTCCCACCAACATGGATCCTTTTAGGATGTTCTATCCTCACTCACATGTTTTCGAGTAAAATTTTAAGTTCTTATAATATTTTTTTTTTTAGTTTAACAACATTTTGGGGTGGAGGGATGCAAGCCTTTAACCTCTTGGTTGATGGTACAGGTCAATTACTGTTGAGTTATGCTTGATTTGACCAAGTTCCTATGATTAAGCCATTGAAAAAAATAGTTTTATATCTTCAAAGATTCGAACCACAGTTCTCTTGATTATTAATACAAACTTTATATTAATTGAACTATGTTGGTGTTCACAATTAAAGAATATAATTAAGTCTAAAGTTCAGTTTGGTGAAACTAAAATAATCTTATAATAAAAATTAGTTTCACCATAGTGGGAAGAATATAACTGGTAATTTTACGATGTTGAACATTATTATATAGTGAATTTAACAGCCTGAAAGGGCCACGGTGAATAACTTTTCCAAATTTACAAGGAGGGGTAAAAACTAAATGACCTTTATTTGCTCTTGTGTATGCCCTCTAGAACTGAAGAGTGCTGGGGAAGTTGTTTTGAAGAGGGAAAAAAAATGAGAGAAATTAAAATGGAGAGTTTATGAAAAGGAGCTGAAGAGAAGGTGAGCTTTTTAGCAGTGCCCATCGTCATAGAGTTTGTTCTTCAATACCTTTTGCAGGTAGTGATTGTCATCATCGTTGGCCATCTCGGCGACGAGCTTTTGCTTTCTGGAGTCTCCATTGCCACTTCCTTCGCTCGCGCCACTGGCTTTAGCCTCCTCGTAATCCTTGTTTTTCTTTGTTTTAAGACCATGTCATTTTGTTTTTGAGCTTCGCGTGTTTTTCCTCCTTTTTTTTTATCCTAACAAAATACCTTGCTTTTTGTGACGCCCGAACATATATAACAGATACATGAATGAACTGAGACCATGTTTGAATGAGAGAAAGTCCGAACATATAAAGTATGGTTAAGATAAACTTAAAAAATTTATAATAACTAATGTTCACACATAAATTCAAAGATGAGACACGTGAAATAATTTCGATTTATATTGATGATGTATGCGTGTGAGTGTGCACTCTCTAATACATAATCCTCTGATTCTCTCTCTTGTGTGTGTTTCACTCGAGGACTGGAATGCTTGTTTTTGAATTTGAAGTCGGCTCAAGGGCTTTGCAGCTTGTTCTTAAGATTGAAGTTGTCTCAAGAGCTTTGCAACTTGTTCTTGAGATTGAAGTTGTATCAAGGGCTTCGTGAGTTCAAGGAGTCTTTTGATTCTGGAAGTCTTCAAGAAGCTTTAGTCTTTCAGAGTCTTGAAGGTTTGTTCTTCAGAAGGATTTGAGTTCTTCTAGATGGCTTGAGGTAAACTTTAATCTTCAAGTCTTCAAGAGGCCCTGAGTTTCAATCAGTTTTGCAGTAAGATTTAAAGAGGATCTGAGCTTCGATCTTCAGTTTTGCAGCAGGAGTTGAAGAGGATATGAGCTTTGTTCTTTGGTTCTACAGTGAGATTTGAGGAGGATCTGAGGTTTGATCTTCGATTTTGCAGCGGGATTTGAAGGGGATCTGAGCTTTTTTCTTCAGTTCTATAGCAGGATTTGAAGAGGATCTGAGCTTCAATCCTTGGTTCTGAAGCGGGATTTGAAGAGAATCTAAGCTTCATTCTTCATTTCAACAGCTAGATTTGAAGAAGATTGGAGCTTCAATCTTCGGTTTTGCAGGAGGAGCTTCAATCTTCAGAGTCTTCTGAGAGCTTCCTAATCTTCCTCTTCTTCCTTTCTTTCTGCCCCCTCCAAATGAGAGGCAAGACCTCCTATTTATAGAGTTTTCAAAAGGCCTTCGTGGGCTTGGACTTGATTGCATTTGGGCCCATCCACGGGGTTGGGCTTGATTGCATTTGAGCCCATTCATGGGTTTGGGCTTGAAATTTTGGGCTTCAGGCCCAATTACCTTAATGAATTTGGATTTATATTAAACCTAATTTGATGAACTTAGTACATTTTAATTTCATGAACTTAGAAAATTACGTGAAAATTTTCTATACCAACAAATACCTATACCAACATGGTGCATCTTCCTTTTCGGTGGCTCAATTATAGAAACTTATTCAGAGTGAAGTGTGTTTGACTGGGGAATGGTGACCTCCTAAGAATTTTCCTAGGAAGCATGTGGTGAGGAGGACAAAACGTCGTAAAAGAACCTTGTGTTAATCTGTGTGGACAATCTTCACTA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MALTSAFLCFSSIWFRKSVLTARLLFWGGNFGIDLPLLGKRSRRPRSRLRPRRSGPRSSMTLFLRPQLVVIVIIVGHLGDELLLSGVSIATSFARATGFSLLVILSAQGLCSLFLRLKLSQELCNLFLRLKLYQGLREFKESFDSGSLQEALVFQSLEVRFEEDLSWEWLELWKLYVGKHMGQNNIKSLEFILIVAKFLSFWCVVGAALALGISSCLNVILLGLYVFFSPSCKKTRAPFSREAILSIREFFRLAVPSAVMTCLEWWSYEVILLLSGLLPNPKVETSVLSICFSITYLHFFIPYGLAATVSTRVSNELRAGNPEAAKVAVRVVGILGIIESTIVSVTLFGCHNIL Homology
BLAST of Spg021589 vs. NCBI nr
Match: XP_022141867.1 (protein DETOXIFICATION 1-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 271.9 bits (694), Expect = 7.6e-69 Identity = 176/328 (53.66%), Postives = 201/328 (61.28%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. NCBI nr
Match: XP_022141869.1 (protein DETOXIFICATION 1-like isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 271.9 bits (694), Expect = 7.6e-69 Identity = 176/328 (53.66%), Postives = 201/328 (61.28%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. NCBI nr
Match: XP_022141868.1 (protein DETOXIFICATION 1-like isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 271.9 bits (694), Expect = 7.6e-69 Identity = 176/328 (53.66%), Postives = 201/328 (61.28%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. NCBI nr
Match: XP_022141871.1 (protein DETOXIFICATION 8-like isoform X5 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 267.7 bits (683), Expect = 1.4e-67 Identity = 169/286 (59.09%), Postives = 181/286 (63.29%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. NCBI nr
Match: XP_038889426.1 (protein DETOXIFICATION 8-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 266.9 bits (681), Expect = 2.4e-67 Identity = 174/316 (55.06%), Postives = 205/316 (64.87%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FHB6 (Protein DETOXIFICATION 16 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX16 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 7.7e-40 Identity = 133/351 (37.89%), Postives = 181/351 (51.57%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIA5 (Protein DETOXIFICATION 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 1.0e-39 Identity = 122/345 (35.36%), Postives = 176/345 (51.01%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIA1 (Protein DETOXIFICATION 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX5 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 160.2 bits (404), Expect = 4.2e-38 Identity = 125/329 (37.99%), Postives = 185/329 (56.23%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RWF5 (Protein DETOXIFICATION 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 156.4 bits (394), Expect = 6.1e-37 Identity = 127/331 (38.37%), Postives = 183/331 (55.29%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SIA4 (Protein DETOXIFICATION 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 1.0e-36 Identity = 113/343 (32.94%), Postives = 171/343 (49.85%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CL18 (Protein DETOXIFICATION OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012127 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 271.9 bits (694), Expect = 3.7e-69 Identity = 176/328 (53.66%), Postives = 201/328 (61.28%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CK03 (Protein DETOXIFICATION OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012127 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 271.9 bits (694), Expect = 3.7e-69 Identity = 176/328 (53.66%), Postives = 201/328 (61.28%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CLS8 (Protein DETOXIFICATION OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012127 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 271.9 bits (694), Expect = 3.7e-69 Identity = 176/328 (53.66%), Postives = 201/328 (61.28%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKI4 (protein DETOXIFICATION 8-like isoform X5 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012127 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 267.7 bits (683), Expect = 6.9e-68 Identity = 169/286 (59.09%), Postives = 181/286 (63.29%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CJB5 (Protein DETOXIFICATION OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012127 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 263.8 bits (673), Expect = 1.0e-66 Identity = 171/343 (49.85%), Postives = 204/343 (59.48%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. TAIR 10
Match: AT5G52450.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 5.5e-41 Identity = 133/351 (37.89%), Postives = 181/351 (51.57%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. TAIR 10
Match: AT2G04040.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 7.1e-41 Identity = 122/345 (35.36%), Postives = 176/345 (51.01%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. TAIR 10
Match: AT2G04090.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 160.2 bits (404), Expect = 3.0e-39 Identity = 125/329 (37.99%), Postives = 185/329 (56.23%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. TAIR 10
Match: AT2G04100.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 156.4 bits (394), Expect = 4.3e-38 Identity = 127/331 (38.37%), Postives = 183/331 (55.29%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021589 vs. TAIR 10
Match: AT2G04050.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 7.4e-38 Identity = 113/343 (32.94%), Postives = 171/343 (49.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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