Spg021533 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg021533
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold9: 4828745 .. 4833550 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg021533
SyntenySpg021533
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TAAAAAGCTATGGAAGAAAAAAATAAAAAAAGCGGGAGATTAGAACAGCTAAAAAATAAGCGCGGAAGGTTGCAAAAAAAAAAAAAACCTTAGACCCGTTTCTCTCTTACGCCTCTCTCACATTTTCCTCTCGATCTCTCTCTTGTCTTCTCCCAAATCGACAGCACCAGCACCATGGTGCAGCCGGAGAACGCGTCCAATCGCCGCCATGCCTCAGCTACCCGCACACGCCGCGAGGAACACCAACGTCGCCGCCCCTCTCGGTGAGTTCTCTCTCCCATTTTGATCTCTCTCTCGACACTCTTTCCCTCTCTTTAATTAATAATCCCACCAACTGAAAGTGAGCTTGCGATTATCATCATCAACGGGGGGAGTCGACAAAGCCGTCGCACATAAACTTTTATTTTCTCCTTTCAAGGTATTTCGGTCTCCCTTCCCCCCGGGAGAAACTCCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTAATTATCATTCTTATTCACGATTTCAACCAGTCAAGAGATGGGTTTTTCTTTCCCTTTAACCATGGATTTTAAAACACAATATTGTCTCCTCTTTTTCTTTTTAGAATGCCCACAACATGTTTGATAAAATGCCTCAAAGATGATCTCACTTTTTTTCTTGGTGACTGCTGCTGTTATTGTTAACACCAAAAAATCAAAATGCTTGAAATTCTAGTTTGTTCGTTGGTTCAAAGTTTAAAATGGGATAATTCTCAAAAAGTAGTACATGTTAGCTTGGAACACACATCTGGTATGTTGTGTTTCAGTGAATGCTTAGAAAATGACACAACATTCTTTTGGTTCTTTTAAGTTGTTGACTTCATAAGTCTTTGGGATTCTTTTCTCTACTTTTTATTTGTTACTTCTTATCTTTGCTTGAAGGATACTCTTTGTTTGTACTGAGTTTTCTCTTTAACATCGACACTTGTGTAAGGGTATAGTATTGGTCAAAATTTTTATTGGTTTAATTTACTAGCTCATTCACTTAACTTTTAAGTAAAAACTTCTAGCACATACATATACAACAAAAGAGAGCAATTCAAAAGAAACAAGGTTATGTGCAAGAACTATGTACTGGATTTAGACATGATAGCAGGACAATGCTTGTATGTTGTATAAAAGGAATTGTGTAAAGAATATTTGTTGTTGAAATTTGATTGCAGGTTCAAGAATCAAATAAAGGAAAGAAAGCAAGAATGATGTGTGTGAAACTGAACCTTTTGGAATGAGTTTTCTTTGGTCTTTCCTTTTATTTTCTCTTTTGGATGCTAAAGTTAAACTTCAAGGATTAGAGGGAAATATTGAAATAGATTAAGCAAATGGAGGAACATAAAATCAAATGAAACTGATCAATATTTTAAACCAACCTTCTGATTTCCATCTTTGTAAGCTTTTTGTTCTTTTTTCCTTCTAGTCAAAATGCTACTATTTTATAAATTGCCATGTTTTCTAATTTCTTTGTCATCAAAGTATTACTATATGTTATTAGTTATTTGTTTATAAATGCATCTTCGTGTTTTCATATCTCTAAGAGTGCATGATGGAAGTGATACTCCATATATAATGCTTTATGTTCCTGTGATTAAATTTGATCAATTCGAAATTGATGCTTTATGTTTCTTTGGAAAGATGAAATTGAGGAGGGACCATTTATGAACCTGTTAGTTTTTCTTACCAAAACATATTGGATTACTTGTGTTTGTATGGGTGGTACATGGGTTTTGAGCCTTAAAAGTATGAGGACGAGAGAAAATTTATTGGAACCATGGAGTTCAGTTGGGTGAATTGATGATAACTTGTATTATATATGTATGAGTGCCTTGTAACTATATCCAGTGCTTGCTAAATGGAAACCTCTTGTCTAGTGATTGCCAAGTGCCACAACACGTCGAAATTCACCAAATGTAAGACTACTCACTTTATCTGATATTTCTCTAATTCTCTGTACTTTGGTTTGTGCCATAAGTTTACTACAGATCGCAATTGTGGTTGTGGTATAAGAAGTTGTAAGTTATTATTATCCCTGGTAATAAACTCATTTCGCACAAACTCGTTCTTAAGTGGTTGATTAGATTAAGTGTTGGAGTGTTATGACTATCCTGCAGTTATGGTAGTTATAACTTAAAATTAGATTGTAGATAGAAAAGTATAGAAGTTCATTTATTTGTTTATGTTGACTTCGTATGACTTGAGTATTATGACTATCCTACAGTTATGGTATCCATAAATTAATTAGTTGGTTGTATTGATAAGTTTGTTTACATTTGAGTTGTTACGTTTAGTTCTTTTAATAAGTTGTTATGTTCTTATGTTTACTTCCTTTGAGCATGAGACTACCTAAGTTGAAGGATTAGTCACATAAAAGTAGTTTGGTGGTGGTGGTGGGGGGGGACTTAGATGAAGGAAAATTTGTTAAAACATTTGAGTACAATAAAGTTAGACAGAATTGTGAATGTGGAATTAGAAAGGGCATCGGTATTGGACATGGGTTAACATTGATTGCTTTATAAGTTTAGTTGTTCATCTTTATAAGTTATGTTTATGTTTATGCATTTGAGATAAGTTCAAAAGTTTGAGTTGTTATAAATTTAGTTTCATTGAATTCTTATAAGTTTGGTTTCATTTGTTTTCCATTGAATTGTTGTGTTTATGAGGTTCAGTACATTGTTGCACTTAGTTTTTTCATTCAAAAACTTTCGATGATTTGAGATAAGTGCAAAATTAAAGTTTGAGTTGTTATAAGTTTAGTTTCACTTGTTTTCCATTGAGTTTTTATGTTTATGAGGTTTGCTACATTGTTGTACTTAATTGTTTTCGTTGATAAGTTGAGCCATTTCATTAAAAAAGTTTCAATGATTTGAGATAAGTGCAAATGATTGAGTTGTTACAAGTTTAGTTTCATTGAGTTGTTATAAGTTTAGTTTCACTTGTTTTCCATTGAGTTGTTATCTTTATGAGGTTCATTATGTTGTTTCAGTTAGTTCCTTTAATTCCTCATGCTAGAGTACCCATTTTAGGATTGAAAATAATGAGCACAAAATTTCATGTGATATTTCCATTGACAATCTTGTGGGCCAAATGAAGTCTAAAATTTTGTTGTGGCTTAATGAATTAGATGGGTGCTTCCATGATATGGTTTTGCTGGTATGTTCATTTAGCATTGTCAAAATTGTCAACTCTCCTTGCAAAAAGCGATTCAATGTACTATGACTTGTTCTCTCTCTTAGAATCTTGATTACTATGTCCTATTCTTTAGACCTTTTGGGGCTACGTTCTTGGGATGCTGATTGTTTTTATGAGTTTCTAGATTTCCAGACGGTGCTTACTTTGATGTTGATGATGCTTATATGTAATTTATATATGTTCTTGGAAAATTCTCTTGATGTCATGAGTTATTTGAACATGGTTCAATTTTGTGAGTTAAGTAAAAACATCGAACAAAAACTAAATAGAAGAATAAGCTATCATCATTATCCAATCCACACAAAAAAAATTCAAACAGTAGTGAAAATGCACCTTTATTTCTTGTTTTTTGTGCTATATGGTTTAGGAATCTTTTGGACCATTTTAGGAGTAATTTAATTAGGTAAGTAACTCTTATAGTTGGTGTTGTGTTCATTGCTTTGAAAATTTTGGGGTTTAGGGTTAAGAGACAAAAGTACAAATGTCTAAGATAGCTTGAGAATAACTAATGGTCATTGGGTGTTCTTTAATTTGTAGCTTTGACCATTTCAGACTCTGGACAGCAGTTATTTAAGGATTTTATTACTGGTAGGTGAAATCCAGCAAGCATGTTGGATCGTTTGAAGTAGTCCGGTATGGTTTCCGAAGCCTTTAAGCCTTGTGAATGCCCTTTTAAGTGCTGAAATTCAAATTCTATCATTTGAAAGGTTGTTGTTGTAGTTTGGATTGATTTAGAGTTTTCTCGATCACTCTCAGGCACTTTGAGCAACATTCCCTCGAGGACTAAGGTGGTTCTTGGGTAAGTTTCTCTTCTTATGGTTTGTTTAAGAAGGCCTTAAGCTAGCCTTTAAGATGGATTTCGAGTGAGATTGTTTAACTGTTTTATGTTGAGAAGTTAGGCTTAGCTATGAGTAATTTTATTTGAAGTTTGAACTCTTATTATTTAATAAAATTAAGTTGTCCCTAGCAAATGAGTTGTATGTTTTTACTAGTAAGTTGTGAATCTGATGTTGGTTGTGAATGTGAGATCTGACTCGCTTTGTTTATGGAGGTTAGGTTTTTGTTGTGAATTTGTGATGTTGTGGCATGCGACCACTAACCACAGTTTGTTTAGCTTCGATTTAGATTGCCCATAGCATGATATATCATTTTTAGAAAAATTTATTATTTTTGTCATTTAAGCATTGTGTCTATTTAGTATACTTAACAAGGGTTTGAAATGAACCTACAACTAGTGTTTGTCGCATATCAATTGTGCTAACAAGTGTCTAATACGTGTCCAACAAGTGTCGGAGTGTCCAAGTGTCCGAAACGTGTCGGACACAGACACGCTAGCCAAACTAAAGTGTCTGTGCTTCTTAGCCCTCTAATGAATCCGAATGGCAGGAATAGGCTCCTTGAATCAAATTATATGTATGTTGTTATCCCATCAGCTGAGTTTTGAGCATGTTGAATTGATGCATAGAAGAGTCATACTGAATTATGCTTGATGTTGTGATGTGAACTTATTCTGATAAGTATGTTGTTTTGTTGTGATTGATTGAAAAACATGAGTATAATGTTGTGAGTATGCTGCACTTTTGGTTTTTGCAGGGTTAGAAGCATGGCATGA

mRNA sequence

ATGCCTCAGCTACCCGCACACGCCGCGAGGAACACCAACGTCGCCGCCCCTCTCGACCTTTTGGGGCTACGTTCTTGGGATGCTGATTGTTTTTATGAGTTTCTAGATTTCCAGACGGTGCTTACTTTGATGTTGATGATGCTTATATCTTTGACCATTTCAGACTCTGGACAGCAGTTATTTAAGGATTTTATTACTGGCACTTTGAGCAACATTCCCTCGAGGACTAAGGTGGTTCTTGGGGTTAGAAGCATGGCATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCCTCAGCTACCCGCACACGCCGCGAGGAACACCAACGTCGCCGCCCCTCTCGACCTTTTGGGGCTACGTTCTTGGGATGCTGATTGTTTTTATGAGTTTCTAGATTTCCAGACGGTGCTTACTTTGATGTTGATGATGCTTATATCTTTGACCATTTCAGACTCTGGACAGCAGTTATTTAAGGATTTTATTACTGGCACTTTGAGCAACATTCCCTCGAGGACTAAGGTGGTTCTTGGGGTTAGAAGCATGGCATGA

Protein sequence

MPQLPAHAARNTNVAAPLDLLGLRSWDADCFYEFLDFQTVLTLMLMMLISLTISDSGQQLFKDFITGTLSNIPSRTKVVLGVRSMA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg021533.1Spg021533.1mRNA