Spg020597 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg020597
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold9: 14999238 .. 15005634 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg020597
SyntenySpg020597
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGTTCAGCAAGGTAAATCTCGTGGGTCTCTCTGTCTTCGCATTTTTCAACCGTAGTCTCGTGGGTAAATCTCTTTTCTTCTCGTTCTTGGTTGATTAAGATCCGGTCTTAAGCCTTCTTGATTTCGTTTTGGTCAGATCTCGCGTGGCCAACAGTTCGTAGCCCTGTCTTTTGCGTTTTCGCCTCTATTCAGCAGCGTTTTAAGGTGTTGTTGGTGCCGTTGGATGTTTTTGGTAAGCTCAATCCCTTACCCATGCTCCTTTGGACCTTTATTCAAGTTCAAGCAAATACCCACTCGCTATGGATTCCGTATTTCAGGATTTAAGGTCTTATTAGCTGCTGTCCGACGCCGTCTTTGCTCAATTCGTGGCTGTTTCGTCGTCGCTTTGCGATTCTGGTAAGTTTAGCTCTCACCCATCCTTGTTTAAAGCTTAAAGTAAAGATACCCATTCGTTTTAGGTGCTGGAGAATTAAGGTTGTGTTTGATTTTCTTATCTGCAGTGGTGCCTGAGTGTTCGATTAAGTTCGATACACTTCAACTCGAATATCCACTGCCGAAGGAGCGTTCTAACACGTTGTTCGATGTTAGATGTTGCGTGATTTTACCGCAAGCGTACGGATCGTCACAAGTAATATAGTGATTTTGAGTATCGAGTATCGTCTCCACAGGGATTGGATTTATTCAATTAATTACCATGAATAATCTTGCTATGCTTTATTTAGAGAACAACATCTAATGCCGAAAATATAAACTAACAAGCTAATCTAGAAAGCAAAAGATAAATGGAGACACAATTTGGAGAGATAATTCTTAGAGGGTCGATTTCATCAATTGGACCTTTAATGCTTAATCAATTAACTAATATGGATTATCTAATCAATTGATTCATAAGTCTAGAAGCCTAATGACAAGGACTCTGCTGTCGGTTTCCTCCTATCTCATACCTTTCAGTAAAGAATCTCCTTTCGGTTTCCTCTTTATTTACTTAGCATGACATTACGACCCTTCAATACAACTCCTAACGTTATTTATCTTATCCCGTGTCACTCGGGTAAATAAACGTCAGTCATGCATTCAGTTCTAGTCTAAGCTTCTCTCCGTCGAGTTTCCACTTAGTAACGATTCATTTAATCAGTGATCAGTTCATTAAAAGCATTAAGGACAAAATGCACAAATGAACAATAATGACAATTAAACCAAATCAATTCATTAATTCAGCAAATGTTCAACAACTAAATCAATCTCAAAGAATTTAGGAATTAACTACTCATAATCACTAAAATCCAATAATTCCTAATCACAACAATTCTAGAAACTAAAACATAAAGGAAAAGGGAAGAGAAATGCTCATAAAAGTGTCGATCTCCTCGATCCCGCGCTGACCTCCATCGATCCCAAGCTCCAAAGATCTTCAACAAAGCTCCAAAACTCTCCCAAAAATCCCCAATTTTAGTGTGAACTCTAGAATGGGGTGAAAACCCACAAATTGGCTCCTCAAACTTGGATGCAAATGGCCCCTTTTATAGTTGTTCAGCAGGCGCAGCATCGCGACACTACGTCACAGCGTCGCGACGCTCTGTTGTCACTTCTGTCTTGGGCTCCAAGTTGTCGCAGCGTCGTGACGCTACATGGACAGTGTCGCGACGCTGTCCTATTTCTAGAACTTCTCCGTGCGGCTGCCAAGCGTCGAGACGCTCTGGCCTTGGTCTTCAAAGAATGGCCCGATTTTGACTCAATTTTTGGGCCTCCAACTTTCTTTTGGCCCAAATGCTTCATGTCATGGATCTTGAGCTCTTTTCTTGACCCAACTTGATAATTTTAAGGCTTGGAATTCATGAATTTGGGCTTCTAACTCATTCTTCTTGGGCTTTTGGACTTGGATCTTTTAATGTAATTCTTCAAATTGCTCCAAAAAGCCTCCGAAATCATCCAAAATCTCTTAAAATTCCAGTTTTGCTTCCTTGGCTCGGTTTTCTGAAATTTAAACATAAAATAGCATTAAAGTACACAATTCAAGCATAAAACTAGCTAAAATTAATAAGAAAATTATAGCATTTATGCATGTCATCACACCCCCAAACTTAAACCTTTGCTAGTCCCGAGCAAAGCTAAAACCATATATATGAATCAACTATTTCAAATGCATGACTCTAAGTTTAATGATCAAAATAATGAACCCTAACAATTAAAGGAAATATTAAAACACATTCATTCATCACGAGATTTAAATTTAAACTCTTCATCCCTTGCGTGTGTGTGTGCGAGCTTCCTTATTAGGTCTTTACTAGCCTAGAAAAGGTTTATAGAATCCTCAGTTCATCTTCCCCCTACACTGGCCCTAAGCTCAAATTATCCAGCTTCCCAACAATCAAGAAAGCAATATCCCACTAAGGTGCCTGAAACAACGGGGTATGTCTCCCCCAAACTTGCATTTTTATGCTTCTAATGGCACTAGCTTTCACACTACGATGCAGGGACCTATAACCCGAATTTTATTCTTGGTTGGCCTAACTGATCACACCGCAGGTAGCTCTTTTTGCCCCTAGCTTTTTAAACATAGCAAGTTTTTTTTTTATTCGCTATACTTCTTTTTTTTTTTCATTTTCTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTTCTTTGCAGGCTAATAAACATGATTTTTTCTCCCAAGTAAATAAGATCTTAAGCATATGGAGTGACAACAAACATCTAGATAATATAATCCAATTCTAAGCATTCAAAACCATATAAGTAGGCTAAGTAATCAACATGTGCAAGGAAATCAAAGCAAAAATTTAAATTTACATGAATCTTGAACATGCTTTCACATTTCACAAAAATTGAACAAAATTCATTATTTAGATCATATCATAGACCATCCTCATCAAAACAGATGCAATAGAATCATCATGAAAATTTTCAATAAGCTCAGATCAGAACAGCAAAGCCTCCCCCCCAAACTTAAATCATACATTGTCCTCAATGTATTAATTATCCAGACTAATTAAGCATGCATAAGGACAATTAAAAAGATAAAGGGAGAACGGTACTGCCTTGGGATGTGAGAGAAACCATGGATGTCAGCCTTCAACATCATTGGGGTTGTTTTTGGAAGAAATTGTGGTCTCAAGCTCCTTAAAAAATTGATCAATGGGAACATAAGATCAACATGCTCTAACTACAAAAAACTGAAAAACAAAGAAAAGAAAATTAACGGAAAAATAAACTTGGGTTGCCTCCCAAGAAGCGCTTGTTTAACGTCTCTTAGCTAGACGTGTTTCTGCGTCTTTCAAGGCACGTAAAAATTCTCGTATTTCTTCGGGCCCTTCTTCCTTGAATCAATGAAGCACTCTATCGCTAGCAAGCTTACTAGCTTTTCATGGGCCCCAGAAGCAGAAATATTTTTGGGATTTTCTTTTAATAAAAGCATAAAAGGAGAAATATCTAAATAAAGGGATTCTGACTCTGACTCTGACTTATGAGAATAAGAAAAAGAACACTCATTATCAAGGGAGGATGGAGAGGATAGAACAGACAAAGGTCTTTCAACCTTAAACTCTATCTCTTGAAACTCCTCAAACACTACAGGCTCAATTTCTTTTTCTTCCTCACAAACTTGTTCTTGGTGGGTGCTAGAATTATCCAATTCTTCCTCGCAATCTACACAGCTTACCCCTATGTGCTCAAACTCAGCAAAATCGAAAGAATTAGGCTCCTGAATGGGTGCTAACGAATCAGTGGCCACATGACTCACTAGACAACCTATGGAAGTGGATCCTACTTCCTTTTCTTCCTTTTGGGTCTGGAGTCTCTCCATAGATTTTTCTAATTCTAAATTAATAGCTCTACACTCTTGAATAAAATTTTCAAGCAAGCTCTCTAAGGAAGACTTTGAAGGGGATGAAAGCCCCTACGCAGCGAAAGTGCATCGAATGGACCTTACGTCGTATATTAATTAACATTAAAATACCGTTACGAAAAGGTAAAATAAACTTTAAACATGCTTTAAAGTTGTTGGAAATTGCTATAAAAATGCTGGAAAATTAAATCTAAATTTATTTTCATGCTTTTCTAAAGAAATGGGAAAGAACCATTACAAACCTTCGTTGTAGACTTGACCATTCTTCGCCAACGATGCTCCAACGAACGAAAACGCAGCGACTCCTTGATTTCTTCGCTGAAAATTTTCTTCAAAGACACAATAACCACAAGGGTTACACTGGTATGTCTCTAAGTCTAGGAGGCAAAAGACTTGTGGGAGTCATTCTCTAAGAGGGAGGCTAGAGAGAATTCTAGGGTCTTGTCTTGTGAGTCTAAGAGCAAGAAGACTACTAAACCAATTAGGTCTAGTGTTCTATTTATAGAAGAGTGGCCATGAATAAAATATTCAATTAAATCAATCTTTTCCAAAATTGATTCAATCTTATTCCTTATTTAATCAATCCAAGATCAATCAATTCCATAATTGATTAATCTTTTCCACAAATGACTAATTACTTCCATAAGTGATTAGATCATTTCCATAAATGATTAATCACTTCCTAAGTGATTAATTATTTCCATAATTGATTAATTCCCGATTAATTAATTAACCACCAATTAAATATCACATATTTAATTTTCGGCCTTGAATTAATTAATTTGCCCAAATAGATTTTAGGCCTTAAAATTAATTAATTCATATTTGAACTCTTTCAAACTTCCATAAATTTAATGTGACTCAAATTTATATTAATATTTGAATTTCTTCAAATATTAATTTCTCTCATAATAATATATATATTATATTGTTTCCCTTTGTAAATTGAATATTTTCAATTTACATTTATTACTTTGTTGCCTCAAATTACTTTATGAGCTACCAGTGGGACTTAATGGACCTGCAGATCAGAAGCTCCAATGATGTGAGATTAACTGGTCAAACTTATTAACCAAATTAATCAATATTCATTAACTGTGTGTACATTCCTCTATAGACTCACAGTTGCACTCTTC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mRNA sequence

ATGTTCAGCAAGGTAAATCTCGTGGGTCTCTCTGTCTTCGCATTTTTCAACCGTAGTCTCGTGGATCTCGCGTGGCCAACAGTTCGTAGCCCTGTCTTTTGCGTTTTCGCCTCTATTCAGCAGCGTTTTAAGGTGTTGTTGGTGCCGTTGGATGTTTTTGGTCTTATTAGCTGCTGTCCGACGCCGTCTTTGCTCAATTCGTGGCTGTTTCGTCGTCGCTTTGCGATTCTGGCGCAGCATCGCGACACTACGTCACAGCGTCGCGACGCTCTGTTGTCACTTCTGTCTTGGGCTCCAAGTTGTCGCAGCGTCGTGACGCTACATGGACAGTGTCGCGACGCTGTCCTATTTCTAGAACTTCTCCGTGCGGCTGCCAAGCGTCGAGACGCTCTGGCCTTGGGACCTATAACCCGAATTTTATTCTTGGTTGGCCTAACTGATCACACCGCAGGGCATAAAACCCAACAAACTTTTCTTCTATGGAAGCGGATTGCACTTCACTCACCTCCTCTTGGGGCTGCAATCTCCCTTGGAATTTTTCTAGAGCTAATTTGGGTGCACTATTATCCTCAATATAATCTTGAAGCAAATTTTCTAGGGGAGATTTTTCTTCTAAAGGGGGATAATGTGACTTTGATAGACAAGGGAATAATCGACACACCAAATTTGGCCAGGTTTCAAAGGACACAGGAAGCACGCCAAGGTGGTTTTGTGTGCGGCATCCACAAAATGCAGGAGCAATTACAGATGCATTCCAGCAGGATGGAGTTTGCTGAGAGGCAATTCCAAACCTTATGGAATTATGTTAAGAGAAGGGATGCTGCACTGAAGGGGGCCTTGAAATCAAATTTTTCTAAACCATATCCAGTCCTCCCGATATTCCCTGATGATCTGTTGAACCCCTGGATTCCCCCACCGTCTGTCGAGAGAGAAAGAGATGAAGAAGAAGATCCTGGTCAGGAGGATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTCAGCAAGGTAAATCTCGTGGGTCTCTCTGTCTTCGCATTTTTCAACCGTAGTCTCGTGGATCTCGCGTGGCCAACAGTTCGTAGCCCTGTCTTTTGCGTTTTCGCCTCTATTCAGCAGCGTTTTAAGGTGTTGTTGGTGCCGTTGGATGTTTTTGGTCTTATTAGCTGCTGTCCGACGCCGTCTTTGCTCAATTCGTGGCTGTTTCGTCGTCGCTTTGCGATTCTGGCGCAGCATCGCGACACTACGTCACAGCGTCGCGACGCTCTGTTGTCACTTCTGTCTTGGGCTCCAAGTTGTCGCAGCGTCGTGACGCTACATGGACAGTGTCGCGACGCTGTCCTATTTCTAGAACTTCTCCGTGCGGCTGCCAAGCGTCGAGACGCTCTGGCCTTGGGACCTATAACCCGAATTTTATTCTTGGTTGGCCTAACTGATCACACCGCAGGGCATAAAACCCAACAAACTTTTCTTCTATGGAAGCGGATTGCACTTCACTCACCTCCTCTTGGGGCTGCAATCTCCCTTGGAATTTTTCTAGAGCTAATTTGGGTGCACTATTATCCTCAATATAATCTTGAAGCAAATTTTCTAGGGGAGATTTTTCTTCTAAAGGGGGATAATGTGACTTTGATAGACAAGGGAATAATCGACACACCAAATTTGGCCAGGTTTCAAAGGACACAGGAAGCACGCCAAGGTGGTTTTGTGTGCGGCATCCACAAAATGCAGGAGCAATTACAGATGCATTCCAGCAGGATGGAGTTTGCTGAGAGGCAATTCCAAACCTTATGGAATTATGTTAAGAGAAGGGATGCTGCACTGAAGGGGGCCTTGAAATCAAATTTTTCTAAACCATATCCAGTCCTCCCGATATTCCCTGATGATCTGTTGAACCCCTGGATTCCCCCACCGTCTGTCGAGAGAGAAAGAGATGAAGAAGAAGATCCTGGTCAGGAGGATTGA

Protein sequence

MFSKVNLVGLSVFAFFNRSLVDLAWPTVRSPVFCVFASIQQRFKVLLVPLDVFGLISCCPTPSLLNSWLFRRRFAILAQHRDTTSQRRDALLSLLSWAPSCRSVVTLHGQCRDAVLFLELLRAAAKRRDALALGPITRILFLVGLTDHTAGHKTQQTFLLWKRIALHSPPLGAAISLGIFLELIWVHYYPQYNLEANFLGEIFLLKGDNVTLIDKGIIDTPNLARFQRTQEARQGGFVCGIHKMQEQLQMHSSRMEFAERQFQTLWNYVKRRDAALKGALKSNFSKPYPVLPIFPDDLLNPWIPPPSVERERDEEEDPGQED
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 241..261
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 302..322

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg020597.1Spg020597.1mRNA