Spg020347 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg020347
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold1: 22633988 .. 22639521 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg020347
SyntenySpg020347
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptide
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ATGGATACAACTCGCTTTGTATTTGATACAAACGCAATGATTCAACGCGTTCGTGTAAGTGACATGCGAGTGGGGGTATCCTATACAATGAGTTTGCATAAGATCGAACCATGAAATAGTAACTGCCAGTTGTAACACCGTTGACTAGTTAGGTTATATTTCACGAGGATGACCTAGGCAACTTAGTCTCCATCCTGAGTGGGTTATGGATTCATGTTGACGAGGGATTGTCTTTTGATTTATATGGGTGAGAGTGACCAATACACCGACTCAATAAGCCTATCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGGAGCTGAGACCATAATCACAAGATGGAATTCACTCCATCCCGGCTTTAGGGAAGTAGATGAGTGTTCCTTTAAGTGGTGTCTCCTGGTCTTGAACAAAGGGCCCTACCCCTTCACTGGCTTGAGAGGGGTTTCTGTTTGGTGATTGGACCACAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAACACTGGTACTTAAGGATATAGAGGTAACCCAGGGGTAAAACGATAATTTGACCCAACTGGTGTTCCGGGCACTCGTGAAGGACTAACTTGTTGTTATTGGTTTATATCTGTGGCACAAAAATATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAATTGTGGGTCTATAGTGGAATGTACCCACAATTAACGAGTATTAATTGATTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTAATCTCCTATCGTTGGAGCTTTTGATCTGCAGGTCCATTAGGTCCCACTAGTAGCTCGTAAAGTGATTTGAGGCAACTAAGTCTTGAATGTAAATTGAAAATGTTCAAATTTACTAAAGGGAAGAATATAATGTATGGTGATACATTATGATATAATTTTGAATTAGATTCAAAGTTATTTTATGAGAGAAATAAATATTTGAACGAGTTCAAATATTAATATGAATTTGATTCATATTAAATTTATAAGATATGAGAGAATTTGAAAGAGTTCAAATGTTAATATGAATTTGATTCTTATTAATAATATGATTTAATTAAATACTTAAAATTAAATATATGATATTTAATTGGGTAATTAATTATTAATTATAGAAATAATTAATAATTTATTAAATCAAATATAAATTTAATATTATTTTTAAATAATATTTTATTCATGACTCTCTCCTATAAATAGGCCTCTAAACCTAGGGTTGAAGGGACTGATTCATTCAATCCTCTCAAGCCTCCCTTTTCGAGAAAAAGGATCCCACCTCCTTGCCTCAAGATTATTCCTTGGAGTCAACCTTAGTGGTGGTGTTCACAAGAGAAGGTCCAAGGTGTTGGTGAAAATCGTTCAAGTCGTCAACGAAAGTTTATAACAGTTTTTCTCTTCGGTATTTTAATCTTGATTAAAATACAGTGTGAGGTCCTTTGAAATTCTTCCACTGCACTAGGGATTTCACCCATACACACAGAACTTTCCATATCTGTCTCGAAATTGACGCTGAAAACCCTCGTCTTTCCAATCGGAAGACCCTTCTCTATCTTTCTTCGATGGCCACCGCACGCTGGAACCTAAGGTCTGAACTTGCGATCGATGTCGATTTTGTCTAACTAGGGTTAAATATTTGGGAAATTTTTCGGAAAAAATATCCTGTTCTCCAATTGGAATTGGGGTGATAATTGGGGAATTTTGTGCCGTCTACAAACTACAGGTAATTTCATCTGAGTACGGCTATTTTGTGTTTTAATTAAGAACGCTTTGTTTGTTTCCCCTCTTGCCTTCTTTAGATTCGTTGTCTTGGGCGTTCGTTGTGAACTGCTACTATATCTACAAGTATTCTCAATAGAATGGTATAGAGAAACTATTGGTTAAATGCTTTTGAATTTATAACAACCCTGAAATTTGATTTCATTTTGTTAAAAAAAAAAAGTCAAAAAACCCTATTCTCCCCCTCTCTCCCTCTCTAACACTATCTCCTTCGGTTTAACACAGAACTCAGCCCCTCGGTCAATCTCTCCCTTGCTCTCTCACAACTCCACCTCCAGCCCGACGCCATCGAAACCCAGACCACCGCCACTCCGTTCCGCCACCAGATCCACCACGTTGCCCAACTGTAGTGTCGCCGTCTCTCTCTCTCCCCGGCCGCAACCCAGACCACTGCCACCCTACTGCCTGCACGTCGAAATCAATCTCAATCTATGGTTCTGGCCCTTGGGTTCTCTAGAGATTTCTATTAGGTAATGGTCAATTTGAATCCTTTCAGTCTCACTCTTAAAAGTACAGAATGGTTTTAACCAAGGTTGTTAAATCGTAAAATGGAACACTTATCAAAATAAATTTTAGTGTATCATGTATTGTAACGTATTGTGTATGACAAGTTTCAATTTGATAAGTAATATTTAATTTAAATATAAAAAAAAGCTTCACTTATGGAGGAAAAATTAATCATTTGCCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAGGGCACAAGAAAATAATTAAATTGGATAGTTTGTTAATTTAAAAATTTCTCTAGAAACGAGAAGGCTTGAAGCATATCTCATATCAAAGAAATTTTTTTTCACATTTCCTCATCTATTTTTTTTTATTTAATTTCTCTTTCTTCCCACTTGATGCATATCTCATATCAATCAAAGAAAAGTCTTATCACATTTCCTCATTTGTTTTTTATTTAATTTCTCTTTCTTCCAATTTAATTTCCTTTCACGTTTTTCCAGCTTTCTATTTCTCTTTTTCTATATTTTTTTTTTTGAAAATCTAGCTTTCAACTTTAACCATCTCTTTCTTCCCACTAAATATCCTACATAATAGGCTTTTCGGTTCACACTTTTCCATATTTCTTTTTTTTCCTTTCTTCAACCCTCTCTTTCATCCCACTTAATTTTCCAGACTTTTCATCTTCTTCAATAAAAAGCACGCTTCGTCTTCAAGTTTTGAGTTCCAACCTTCAAGTTTTTGACTTCTGAATTCCAGCCTTTTACGCTTGCTCCTTCTTCACGAGGGGTTTCTTCTCCGTCGCACGAACTTCTTCTCCGTCGCTTCATGAGGTTTTGTTATCAAGTAATCATAGATCTAAAATCACAGGTATTTTGAAAAAAAAAAATTAGGTTTATTGATTTTTTAATTGAAATGTTTCGATTCAACCACGATTCCCACAATTCAGAAACGTGTATCGTACGATTCATGGAATTTCCGATTCAAAACCACGTTTTGAATCGTTTTTCTCCCACGATTCAAATCGTGAAACGTACAATTTTAATCGTGAAACGTACAATTTTAATAACATTGGTTTTGACAATTGGGACTTCCTCTTTGTACTGTCAGAGGTTGATTTAGATTGAGTTAAGTTGTTTTAGCAGCGACTAAATTGAAGATTTGTGCATGGGCTGAATAATTTTTTCCAGCACCTCTTTTGTTCACCTAATCCCTTATGCTCACCTAAGCCTCTGGATATACAACACCCTTTTAGGCTCTAACCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTGTAGGCATTTTTCAGGATTGGTGTTATAAGTATTGATCGACCAAGTCTCGAAAATTATTGCAATTTGAATTAAGTAGGTGACATTACTGCTTGGGTGGCTTAGACTAGGTCGAATTATTATTCTGAATGTCCAAACTTAAATAATGTGCAAGATACCGATAATGCTTGTGTTAAGAATTGTTGAATGCCTTGAGTATATTAGACTGTAAAAATGTGGGAATGTCTAAACAAGAATGCTTGAATATATACATTGGGGTATGGAAGCTTGATCGTGCATGCTATGGGAATACTGATTGTTCTATAAATATGAGGTTGTTGATGTGGAACCCTTTGAATAAGAATGACCCGATTGTATTAAAAGCTTTCTACTTTGGTAAAATAGAATGTTCGGTCATGGATAAGTCTCGATTGCTTGAAAGCCCTGAACCTGTACGAGGAAAGTATTGTTGAGTTTTATGCTCTAAAACTTGTAGATAGTAAATGTAACTATCGAACATAAATAAAATATTATTTGATGTTTTTTCAATAAAGAGTTATTGTCTATATTATGTATATTTTGCCTAAATAACCTTAATCCAATAAACTAAACATCCTAGGCTGTGAGATGAGTCTTGAACTGTACGTGGAGACATACGGGGATCACTGTTCAAGAGACAGCCTGAAGGGTCTATAGTATAGGGATAAGGTTGGGTACTTTATCCTGGTAACACTATGGATATATACGACCCACTTTGAATTTGATACAAACGCAATGGTCCAACGCGTTCGTGTAGGGGACATGCGAGTGGGGGTAACCTATGCAATTAGTTTGGAGACAGGACCGCAAAATAGTAACCACTAGCTGTAACAACGTTAACTAGTTAGGTTTCTATTTCACTAGGATGACCTAGACAACTTAGTCTTAATCCCGAGCGGGTTATGGACTCCTGTTCACGAGGGATTGTCATTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGATTAGTACACCAACTCAATAAGCCTATCATTTTGGGGACAAGATCGAGTAGGGAGCCGGCAATATAAACACACAAGAAGGAATTCACTCCTTCCAGACTTTAGGGAAGTAGATGGGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCAGGTCTTGAACAAAGGACTCTACCCTCTCACTGGTCCGAAAGGGGTTTTTGTTTGGTGGTTGGACCACAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAACATTAATACTTAAGGATGTAGAGGTAACCTAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCCAACTGGAGTTACGAACACTCGTGAAAGACTAACTTGCTGTTACTGATCTATATCTGTGGACACAAAATTATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAGCTGTGGGTCTTTAGTAGAACGAAAATTGATTAATTGGTGAATGAGTTTAGCCGATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGGTCTGCAGGTCCATTAGATCCCACTGGTAGCTCGTAAAGAGATTTGAGGCAATTAAGTATTAATTGTAAATTGAAAATGTTGA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mRNA sequence

ATGTCTAAACAAGAATGCTTGAATATATACATTGGGGTATGGAAGCTTGATCGTGCATGCTATGGGAATACTGATTGTTCTATAAATATGAGGTTGTTGATGTGGAACCCTTTGAATAAGAATGACCCGATTGTATTAAAAGCTTTCTACTTTGGTAAAATAGAATGTTCGGTCATGGATAAGTCTCGATTGCTTGAAAGCCCTGAACCTGTCTTGAACAAAGGACTCTACCCTCTCACTGGTCCATTAGATCCCACTGGTAGCTCGCTTCCTAGGTTACCACTAGTCTCCTGCCTCCAGAAGTCTCAGAGAAATACCAGTGTAGCCATAGTGGTGGTGTTCGCCAGACTTGAAGAAGAATTTCTAGCGAAGATCAATGTTTGGGGTTACTTTGTTTCGCTAGAGAAGAACCAAGGCATTGGAGAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCTAAACAAGAATGCTTGAATATATACATTGGGGTATGGAAGCTTGATCGTGCATGCTATGGGAATACTGATTGTTCTATAAATATGAGGTTGTTGATGTGGAACCCTTTGAATAAGAATGACCCGATTGTATTAAAAGCTTTCTACTTTGGTAAAATAGAATGTTCGGTCATGGATAAGTCTCGATTGCTTGAAAGCCCTGAACCTGTCTTGAACAAAGGACTCTACCCTCTCACTGGTCCATTAGATCCCACTGGTAGCTCGCTTCCTAGGTTACCACTAGTCTCCTGCCTCCAGAAGTCTCAGAGAAATACCAGTGTAGCCATAGTGGTGGTGTTCGCCAGACTTGAAGAAGAATTTCTAGCGAAGATCAATGTTTGGGGTTACTTTGTTTCGCTAGAGAAGAACCAAGGCATTGGAGAATAA

Protein sequence

MSKQECLNIYIGVWKLDRACYGNTDCSINMRLLMWNPLNKNDPIVLKAFYFGKIECSVMDKSRLLESPEPVLNKGLYPLTGPLDPTGSSLPRLPLVSCLQKSQRNTSVAIVVVFARLEEEFLAKINVWGYFVSLEKNQGIGE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg020347.1Spg020347.1mRNA