Spg020012 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg020012
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold5: 28977676 .. 28981479 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg020012
SyntenySpg020012
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTTGATCTCGAGTCTGAAGCTTCGATGGATTCTTGGAGCTTAAAGTCCTCTAAGTTTGAAAGAGTCTTCAGTCTTCAAGAAGTGTTCAGTGCTTGGAAACTTATAGATTTCAAAGAGTCTTCAGTCTTCCGTTAAGAGGGAATTTCTCTGAATTCTCTAAGTCTGGTTGAGAGCTCCAAAAATCTGAACCCCTGAAATGGTGGAGAGCTCCTCTATTTATAGAGTTCTCGCTGGATGGACCCTGGAGACTTTTGGGCCTAACAACTTGGGCTTGGGCTTAATTGGTTTTGGGCTCAACCATTTAGTCTTGGGTTTGACCCAAAACCATATGACCCAAACATTTAAAAAAACCCAAATTTGAACCAAATAATTATTTTTTTTTAATTAATTGGTCAAATTAAATAATTTGATCAAAATAATTTAATTTTAATTAATTGATCAAATAGAAATTTGACTCTATAAATTTATAATTGGCCAACTTTGTTTTCAAATTAAATTTGGGACACATGTCAATTTATAATTGGTCCCAAATTTAATTCATTTTAATTTCGTCATTAATTTTATGTAACGACGTGGCAATTCGTGATTGGTCAAAATTTCTCCATCAACAAATGGCCCCTTTTCGAGATTTGGGCACAAATTGTGTGGATGAATCTCGAAAAGAAATTATCTGGAATCAAAACTTATATTTTTTTTTTTCAAATTTTGACTCCATTTGATGTATCAATCAAAATATGAATAGGGTTAAAATTTTGATTGATTTTTTTTTCACACGTCTTTTATGCCAATTTAATCAAAATTCGACATTTTTTTTAAATGAAATTTTGATCTTGTTTGGCGACGAGTTGTTACTTGAATCTCAATGGAATTTTGAATTTGAGTAAAATTCAAATTCTATTCAATTGTGATATGAATTTGAAGCATAACATTTTTTTAAAAAAAAAAAAATTTGAATTTCACTCAAGTTTAATTTGGGATTGGGTTATGATTACACCCAAATTATCTCAAGATAAACTCAAATTCAAAGAGAGAATTTGGAATAAGGTTTGATTGAGGTAAATATTAAGCTCTATCCAAAAATTTGGTTAAAGGAATGAAATTTTAATATTCCCCTTTCAAATTTGATTTGGATAAGGACCTAGTTACACTGCAACTGACAGAATGACTCGTATGGAATTTTTTTGAGTTTGGCCACCCAATTCAATTTAATTCAAATTGAACCAAATTTGAAACATATCCAAATTATCTTTTGATTTAAAAAAAAAAAATGGACTAACTTGAATTTATTTTCTTCAAATTGATTTAATCCAATTTCACACTTGGATTATGATTTGAATTAGAATTCCTAATTTGATAAGGATCAAAAGATATGATTTGGTTAAGATCCCAAATAAAATTAGGATTACGGTAAAGTTCAATGCTATAAATTAAAACACTCCACAAACAAATCCTCATACTCCACCCCACTCGTGTATAGGTATTTTTTTTACCCCTTTTCTTTTGTGAATTCCCTATCCACTTGTGACAATTGAATGCAGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATGCTACGTTGGCTGTATACCCTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTCCTTCTTAATGAATATTCTTGCTTTCTTCCTTCCACTTCTTCTATTTCCTTGAGTACTCTATTTTTTTTAATCTCATGAACTTTGGACATAAACCCAACCAATTAATTGACAGTAGGAGTTTTTTTAACATTTTTTGCTGCTGCGTTGGGCTATTAAACGAAAAGATACACTGAGGTAGCGACGCTAGGATTATTCACGGCGCAGGTGATTGACGGCGGCTGGAGCGAAGGAGGGGGACGGCTGGCGTTTAACTGAGACAGAAGAGAGTGAGGAAGAGAGATCCAGTTTTTTTTTAACACAGGTCATTGCTTGTAGAAACGCGGGGCCGTTCTTCTTCGCGGCGGCAACGGCGAGGGGGAAGAGAGTTAGAGAGAGGCGATAAAGAGGTCTGTGCGGCGTTCCAAAACGAGAAGGAGAGAGAGAATGGGAGAGAGGGAGCCCGTGACTCTTTTCCCTTTTCTTTTTTTTTCACTTTTTGAAAAGAAAAAGAAACGTGCTTGCTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTATTTTCTTTAAGTTTTTTTTTAACCTTTGATTTTTTACTTTCTTAATTCGTATATATATTTTTTTGAGTTTTATTTATTTATTTTTAACGTCCTGACTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATATATATATATATATCTTTTAACTTGATTTTTTTTTTACTTTTCTTCATGCTTTTTTTCTTCAAGTTTTTTTCCATTTTTTTTAAACTTTTATTTTTATTTTTTTATTTTTACATTTTCAGGCCCTTTTTTTTTTAAATAATCTCTTTGATATATACATACGTAAACTTTAATTTATGCAATATTTGTACATATGCATATAATTTCAACATTTTTTCTTCCTTTTTTGTAGGAACAATCTTCATGATCCTTGCTTAGTCCATAAAGGTAAATTTTTTTTTTAAGTAATTGGACATTGACTAATTTCAATTTTTTTTACAAATTCAAACATCCCTTGTTTGATTTGACTTCATGATTTTTTTTTTGCCCCTTTTTTTTTTTCTTCTAAGGAAGGAAGCTTTGACTTTAGAGACTTGGAGAATATATATATATATATATATATATATATATATATACGCTTTAGACATCTTTTGCCCTCTATTCGAGAGACAAGTTTCCAAGTAATTTTTTTCTTTTTTTTTTAGCATTCATTTTTTTTTCTGAACTAACACTATATTTCCAAAATTCTCATTGCAGGAACAAAATTTCCATTCACCAAAAGGTAAATTAGGTGAACGTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTAGTGTTGTTTTTTTATTCGTAGGTACAACGTCTTTCAACATGAGTACAGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCACTGCCACCGCCTTTCAGCATGAGTACAAGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCGCCGCCACACCTTTTAACATGAGTACAGGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCCCGCCACGCCTTTCAGCATGAGTACAGGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCGCCGCCACACCCTTCAGCATGAGTACAGGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTTCCGCCGCCACGTCTTTCAGCATGAGTATAGGGACATGTTCCTGACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCGCCGTCACGTCTTTCAGCATGAGTACAGGGACATGTTCCTGACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCGCCGCCACGTCTTTCAGCATGAGTACAGGGACATGTTCCTGACATTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCAGCCGCCATGCCTTTCAGCATGAGTACAAGGACATGTGACGTCCTTGAACTCTTATTGTCATAACGTTTTTGCAACATTAGTCCTGGGAAATTTTCCTTAACGCATTATTATTATTATCATTTTTAACTTATCTTCATAAAAATTTCATTCTTTTGACTTGTGTTAACTTTCATCTCCTTAAATTTTGCAGAGTCATGGTGTGCTTTGCAGAACATATTGTCTCTGAAAAGACGTACCTCGTTCTCCTGAAAGACAACAATCAACCCATAAGAAGCAGACTCAGCTTCTTAGTAGAAGAGCCTAAGACTGGATGTCTTGCAGCCCCATGA

mRNA sequence

ATGCTTGATCTCGAGTCTGAAGCTTCGATGGATTCTTGGAGCTTAAAGTCCTCTAAGTTTGAAAGAGTCTTCAGTCTTCAAGAAGTGTTCAGTGCTTGGAAACTTATAGATTTCAAAGAGTCTTCAGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCACTGCCACCGCCTTTCAGCATGAGTACAAGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCGCCGCCACACCTTTTAACATGAGTACAGGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCCCGCCACGCCTTTCAGCATGAGTACAGGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCGCCGCCACACCCTTCAGCATGAGTACAGGGACATCCGCCATGCCTTTCAGCATGAGTACAAGGACATGTGACGTCCTTGAACTCTTATTAGTCATGGTGTGCTTTGCAGAACATATTGTCTCTGAAAAGACGTACCTCGTTCTCCTGAAAGACAACAATCAACCCATAAGAAGCAGACTCAGCTTCTTAGTAGAAGAGCCTAAGACTGGATGTCTTGCAGCCCCATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTTGATCTCGAGTCTGAAGCTTCGATGGATTCTTGGAGCTTAAAGTCCTCTAAGTTTGAAAGAGTCTTCAGTCTTCAAGAAGTGTTCAGTGCTTGGAAACTTATAGATTTCAAAGAGTCTTCAGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCACTGCCACCGCCTTTCAGCATGAGTACAAGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCGCCGCCACACCTTTTAACATGAGTACAGGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCCCGCCACGCCTTTCAGCATGAGTACAGGGACATGTTCCTTACTTTGGGACATGTTCCTTGGACTTTTGCCGCCGCCACACCCTTCAGCATGAGTACAGGGACATCCGCCATGCCTTTCAGCATGAGTACAAGGACATGTGACGTCCTTGAACTCTTATTAGTCATGGTGTGCTTTGCAGAACATATTGTCTCTGAAAAGACGTACCTCGTTCTCCTGAAAGACAACAATCAACCCATAAGAAGCAGACTCAGCTTCTTAGTAGAAGAGCCTAAGACTGGATGTCTTGCAGCCCCATGA

Protein sequence

MLDLESEASMDSWSLKSSKFERVFSLQEVFSAWKLIDFKESSGHVPWTFATATAFQHEYKDMFLTLGHVPWTFAAATPFNMSTGTCSLLWDMFLGLLPRHAFQHEYRDMFLTLGHVPWTFAAATPFSMSTGTSAMPFSMSTRTCDVLELLLVMVCFAEHIVSEKTYLVLLKDNNQPIRSRLSFLVEEPKTGCLAAP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg020012.1Spg020012.1mRNA