Spg013236 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview


Name	Spg013236
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Unknown protein
Location	scaffold1: 19093138 .. 19103130 (+)
RNA-Seq Expression	Spg013236
Synteny	Spg013236

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

TTCAATGACGGACGTTTAAAAAAGGCGCGGTATGTTGGGTTAAAATTTTCGTGAAGCCTATAACGTCGGGCATAGCTAACAAGCCGACCTATGCTATGTTTTCTCTCTCCCCAAAAAAAAACCCACGTTCCCCTTCTTTGGTCTCTCTCACAGAGGACACTTACTTCTTTCTTCCCCTCATCTTTCGATTTTTTCCCCTCATCGGCATGAATTTCTTCCTCTCACCGGCGGCGCGACTTTCTTTCCTTCACCAGCGTGGTTTGTTTGGCTCATCTTTTCTTCTTCTCCGGTGCATTTTTCTTCTTTTGTGGCGCGGTTTGCTTCCTCTGTCACCATCGGCAGCTATTTTCGTGCAACATCGCCATTCTTTTTTCTTCTTGTTCGTTGCTGGTGGGTTTTCTCATTTTTCCTCTGTTGTTTCTTTAATTTTATATACAAATGTGAGAAAGAACCTCAGATGTTCTTTTTGGGGTTTTCCCTATCTCTGTGATTTATATTCCAAGATTTAAATCCAAGGTTTGAGATTCGATCATGGTGTTTCTATTTGTGGGTTTTGAGTTCTCAAGCTAAAATTTGTGTTCTAATTTTTAATTTGGTAAGTTCCTCAATGTTTTCTTGTTTGACCATTTCTAACACATGGAGAGGTTGTTGGTAGTGGCTTCGATTGCTTCACTGACGGAGAAGATAATGATGGCAGAAGCGAGATGATGAGAGCTCAAATGTGGCCATTGTGAGGTAGGAGAAGAGAGGTTTTTTTCTTTTCTTTTTGTACCCACTGTCCTCCATTTTCCAGTTTTTTTGTTAGTTGGTGAGGGGTTTTTTTCCTTTTCTTTTTTAAACTTCTATTTTTGTAGCTAAGAAACATATGTTCTGGTTGAGTGTTCTATTTTGTTGTGTATCTTTTCATAATGTTAAGTGAATATTAGTATTATGAAATTGGTAGAATTTTGAGGGTCCAATGAAGTTCAATGTTTCGGGGTTTTACATTGCTGTCAATTTTGTGCTTGCTTTTGCCGCTGGATATACTACATATCTAAGGTTGTTGTGTTATTTGGAGACAATTTTGAATCTATATGAATGCAATTTCCTAGGACTGGATTATTGAAAATATAGTTCGTCGTTTAAGAGGATTAAAAGCATAAATTATGCAATTCTTAAGTTAAATACCCTTCATGGGATGTTGGATTTTCTGTAGTTTGAACTTAGCTGGCCTTGGAGGCTTTGCTTGAGAGGTTTTAGACTCCATTAAACATCTGGGTATTGATTATGATGACAATTATCTATTTCTTCATTCATTTATGGCATCTTATTGATTTAGTAAAGCTTAACCTTGTTGTCCCTCAAATAAAAGCTAACATCCTTTTATCTTTTTTATTTTCTTTTTCAACATGGCCTTATAGATTTCTTCTTGCTTTTGCCCTTGTCAATATATATAAACTTTTAATATCATTCCCTTGGTGGAATACTTAAGGAATTTTCTTTTCATTCATTAGTTTGCCTCATGTCTAGACCTTAATTATTCAAGAACACTTGGTGGAATACTACATATAATGTGTAAAGTATGCTGAACTTTTTGTTACCTTCTAATAGTGCTTGGTGATTGGGCGTTTGAGAAACAAATGTTGGAGAAACTGATGTGGATTTATGCATTTATGCTTGTTGGAGCACATCATCCAGGTTGAGCACCAAATTTGCTTTTATGATGATTTGAGTTTTTAAGCACATGTACAAATGTTAGTATGCTTTTGTGGTGATTTGAGTTTTTTGTCCATCTGCTTGCTTTTATATTAATATAAAAGACTTTTCATGTTCTATATTGGTTATAATTTATAAAGATATGCAGGATGATTGTCCTTCTTTTTCTATTCTTTTTATATTCTTTTCTTTTTTTTTTTCAGATCTAGCATTTTCATTATGTACTGTGTTTTCCTATTCCAATTTCACAGAGAATTTCCTATTGAAGAAAATTCTATGATTAGAGTTGTCGTGCTTTAATTTTGTTGACATTGCATGAATTTTCACATATTTTCTAATGTGAGCCTTTCCTTTTTGGTTCAATTGTTATTCAATTGTAGTGTTTATCCCTTTGTGCTATTTTTTGTAGGTATTAAGAACTGGAAAACAATCCAAATGTGGAGTATATTACTAGAGGTAACGTATGGATGATTGAATATATTTGTGTTATTATGGTTTTGGCACATTTGTGAATTTAATGTGTGCTTTTTAAGTGCAGGTGGTGCACAAAACTCAATTGAATGTTCATTGTTCTGCTCCTGTGCTATTAAGGTCTCAATTCTTTGTTGGGGGGAAATAATTTTGTTATCTGTATTTGTTGTAGGACTTGTGTTAAACAATGTAAAAAAAATAAGATGCATTGATCAACAATGAGGAATAAGATGTGTTGATCTTAATAATCTCACCTTGCGATTTCTGATGAAATTTGTTAGCAACTATTTTAAAGTGTTCCAGAACTCCTACCAATAAACAACCTACGGACTATCAAACAACTGATTCTAAACATGTGTTGAAACGACCAAGACCATTTCGATTATCTAAGGAGGTATTGCTTAACTTCTTCTTCTTTCTTTTTCATTTGCAAAGATATTTTCTAAATTATTTATCTCACATCACCATAGGAGCATAGTTGCAGAGAGGTTTTTGGATGGATAAGTAAAATAAGACAGTTGTTTCCTCTTGAAAGGTCATCATGTTGGATGCTTTTTAGATTTAGTCCCAGCACAAGAATCTTGAATTCATAAAAAATCTATGCCTTTACGGAATTCCATTTTGTCTTTGTTTCTATTGTTTAACCATATAGCTAGTGGAGCCATTACCTTACAATCTGAGTTTCAGTAATAGGAGTAAAGCCCACCATTTTAAATATGGGAAATTATTGATTTGGTGAAGGTGAATCAAATCAATGTTGTGATTGAATGGATCTCAGATTTGACCGTCATCTGCCGAATTTCTAGTTCTTGAATTGACTGATGGGCTACTCTTGGGTTGTTATATTGAGTTGGTATGTTGTGTTATTAAACTAGCCAAGATTTCGGTCCTTGTTTATCCATTTGATTAAGGGTAGTGGTCTGATGAAGATGAATTTTTTGATCCATTTCCCCTAACTTTTGCTTTTGCTTTAGTCATTTTGTGAAAAAGTTAAGCATTTTTTCTTTGTCTACTTCAGTAAGACATCATCCAATGAGTGTTGATATCATCTGTGATTTGTAAGGTTGATTCAAACTTCATTTGCCATCTTATTCTTTGTTTATAACCCCTGCTTTTGGATTGGCTAGCTTTATATTGGTATCATTTGGATTCTTTTGTTCATATTGGCTCCCTTTACTTTATTTAATTTCACTTATTGATGTTAATTGTTTACTTTCTTCACGAGAATTTTTATGATTGTAAAAGATTTCACGGGAAATTCAGATTTTTTTTTAATGATTTGTGTTATCAATCTTCAAACACATAAAAAAAACTCTCAAACACTACTACAAATTAGCCATATAACGACGGTCATGAATAAAAGATGCGGATATTTAATGACGGACGGAAAAAAAACGCGTGAAAATTGGAGAGAATGAAAGATTAAAGCGTCCGACGTTATTTCTTCGTTACATTTTCACTGACTAACTCCTTTTTCTCTTTAGGTTTTCTCTCCTCCCTTACTGTGGGTCTAAGTTATCCTTCATCGTCATCGTCGATCTATTATTCGTTGGTTGCCGCCGTCCACCATTTGTGAGTTCTGAAGTGTTAGTCGCCATGGTAGGTGTTGTTCGTGGGTTCTCGAGTGGTAGTCTTTGTTTTCCGTTGTTAGCCATGATGGGAGCTGCCATTCATCTTCGAAGTTGTGGGTACTAGATATGAGTTTTGTTGTCATCTCATTGATGGCCAAATGGTGCTTTGCCTCGAGTGTAAAAAATGGAAACCTTTATTTCTTATCTCTTTGTTGGCTTCCCAAATAACCTGCTCTCATTGTTCTCGCAAATTTCAGGTGAGAGATGTCTGGCTGATCATGGACAGGAATTCTAGATGGTCAAAAGGAGTTGGGTATGTGGTCTGGATGAGCAATTTTTATATTGTATGCTTGTGATCTTGTTAATATGGTTATTAACTTAGTAGTTTTCAAGTATCAAATTTAACTGTATTTTTAAATGAACTAGCAATGCAAAAATGATGAGGGATGATGGGAATACTATGCAGTCATGTTTAATCAATTCATGTTGCTTGTCCAAGGTAGATAACATTAACCTGAGGTTTCCTTTGTTGTTTTCCCCATCGTACTCCTAATTTTGCTCCTCTATGTTTTTGTGCAGATAAGAAATCGTCCTAACTCCTATGACTCTGTTATCTTTGGTCTTGGTTTTAGATTCATTTCTTTCTATTATGAATTTTTTTGGTTCAAATTAACTAGACAATGAACATGCTTGATCGTGTATCATCTACTCTCATTGTTTCTTGTCCTTGGAAAGAATGTAGAAAGGCTCTGGCTTGGGTTTGTTTGAGTCTATTATCCAAATAATAAAAATTAAGAGAAAGTTGGTCTTCTGTGACATCTTGACTTCCCCATAGTACTTGCCATCTAATGATTTTCAATAATGATTTTTTTCTTGGTGATTAACTTATGTACGCAAATATGCTGATTGAAAATATTAGAAAGGGTGATGAATAGTCACCATACGATCTCCCTCCCTCCTCTAGTCTAAGCTGATTGAGAATATTAGAAAGGGTGATGAATGTAGTGTGTTTTTCTTGTTTAACAGGTTTAAAAATTTTTGGGTTAGTCATATGTATGTCGTTATGTTGTCGAAATTTCTAGAGCAACCGGTTAGAATGCAGATAGATGCTATAGTAATGTAACCTAGAGCATTACAGGTTCTCTGAAGGGGTTAAACTTGATATCTTGAAGTTTGTTATCTTTTGGAGTTTATTGGGTTTTCTAACAATTTTTTCCGATACTCATCGAGATTGGTTTTTTTTTTGTGTGTATTTTATTGTTAACTAAATTTTTTTTTATTAGGTTCTTCGAGTTGTTGGACATATGTTTGTTATGTGAGTTCTTGTTTTGGCATTGTATCAAACCTAATTACAATTTGTTTTTCTTAGGTTCTTCAAGTTTGATGAAAGAGCAAGATTATGGTGACAAGAATGAAAGTGGCATGTACGAGAATTTTTGTTTTTTGGTGTAGGTGTAGACTTTTAATCATAGGTGTTGAGTAATTTTGAGGCTTTTAAGTGTAAGTGTTTGTAATTTTATTCATATATCAAACTTATATGAATAAAACTTGTATGAACAAATTTGGTTCATTGGCTTATTGGAATGAAATTTGACAAATATTTGATTTCTATACAATTTTGCACATTTAAGATTAAAATTACTTTATTTACAGGTTGACAAATGAAGAAAAAATTGTTGGTATGCCACTGGGCAGCCAAATTTTTTTTTTTTATAATGAACAAAATGATGACGGGCAATGCCTGTCATTAAAAAGGATATTTAATGACGGACATTTAATGACGGACACCTTTAATGACGGACATTTTGTTGGAAAATACCCTTTCAATGACGGAATTTTTATGACGTACACCTTTTAATGACGGGCATTGTCCGTCATTAAAAATGTCCTCGGTTGGAAAATACCCTTTAATGACAGACTTTTGATGACGGGCGGATTTTAATGACGGGCATTGCCCGTCATGAAAAACGTCTGTCATTGTACCTTGTTATGACGGACAGCTTTTGATGACGAGCATTGCCCGTCATTAAAAGTCGCCCGTCATAACAAGTTACGACGACACTAGTATAGACGACGGACGCTGCCCGTCATGAAAAGTCTGTAATGACGGGCAATGCCCGTCATTAAAAGTGATTTTTGTAGTAGTGAGATTAATCAATTATGGAATTGATTGGTTATGGAATTGATTGATTATGGAAAAGATTAAATCAGTTATGGAAATAATTGATTTTAAATGAATATTTTATTCATGACCTTTCTCCTATAAATAGAACACTAACCCTAGGGTTTAGGCACCACAACATATGGCCACCATAAGGCCCTCTCATATTCTCTCAACTCAAGAACTCTAGGGAGAATTTTCTCTCTAGAGTTTTTCCCATTCAAGATTAGGTAGTCCCACAACTACGTTTCTAATCTCAGAGTTATAGCGGGGAAGATCAAATGGTGGTGTTCTTCGTTGTTGCAGAGCAATCAAGAATCATTCTTGAAGTATTCAGAGTCGTCAACGACGGTATGTTTGCCTCTCCCCTTTAGATTTAGATCTAATAATTTTTGTATGCTTAACCTTAAGTTTGTATAGAATTTGTTCTATGTTTTTTGCCAATGTAATAGTATTTTTGGATAAACAAAATTAACTACGAATCGGTCCCAATTACGCTTCCGCTTTATCGGAACTAGGGAATTCCAAATCCTTTCAAGAAGCACATAAAACTGTGGGCAAAGCCGGCGAGAAAGCTCATATCTCAGATCTGGACGGGGAGACCTCCCTACTCCCTCATTTGTTCTATTAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAAGTGGGAGAAGAGAGAAGAAAAAGAAAGAAAAAAAATAGAGCCGCCGACTGGCGCCGGTCGCCGGTCGCCGGAGTTAAGGAAGAAAGATGGTGGTTGAGAGGAAGATGATGATAGTTGGGTTGAGAAGAAGAAGAAAAGAGGGAAAAAAGAAGAGGGAAAATGAAAAATTAAAAAAAAAATATATTTTTTACTTATTTTATTATTATTTTATTTTTAAAATTTAAAAAATAAATTTTTAATAAAAAAAATAGGTGCCACGTCAGCAAACCATTAGTTTTTAACGAAAAAATGGATGGAGGGACCAAAATGCTACTAAATGCAAACCTCAGGGACTAAAATGTTGAGTTTGAAACCTCAGGGACCAAAACGAAACCTAAACCAAACCTCAGGGACCAAAAGTGTATTTTTCCCTTTTAAATATTATATGGATAAATTAAAATCCATAAAAGAAAACATATTCCACAGTTTGAATTTACCATAGATAGGAGTCATAATTTATTTTAAATAAAAAGGATTTTTTATATATTATTTTAAAATAATTATAAAAAGCAAAAATCAATAAATAAAAATGAAATTGAAAGGAAATAAAATTAATCATGCATGCCAATGGGCCAAGACCCCAAATTCAAGTAAAAATATTAAAGGGATAAATACACATATAGTCCAAATTGGGGGGCCTATTATCAAGTCTGTACAACTTCACTATATTTTAGAAAAATAGACTTTGGGCCTCCATTTATTACATAAAAGTCGACCCAATTTTACCTTATTGCCCTAAAAAACATTCCCAAGTTTTACGCACAAAAAATGAGAGGGAAAATATCATTACATGGTAACCGAACGGTTGCATTTATTTCGAATAAGAAAATATACCATTACCGATATTCACGCTCGACAAAAGAGGAAAAAAAACGCATCTTCGATTTCGCACTCCACTATCTCTCGCCGGAGGAAAAAAACTGCAGCGAAATTTCTTGGTTTTTCTCGAGCGTTTCAGACATTCGACGGCGGCAAAAAAAAGCGTGATCGACGACAGAGAAGTACAAGTAAGTTGGATATCACTTAGTTTCTTCCATATTTCCTTTAGTTTCTTCCATTTAACTACGGGTTTATATGGATTGATTTCGGTAGGGCTTTTTCATAGGGCTTTTTCTTCAAAAAATAAGAAACCGAAACGAATAACCTTAGAAAAATTTTAAACGGCCGAATGAACGAAAAATACTTTGATTTTTTCACTGTTTAAGATTTTTTAGACATATTGAAGTTATTTCAATGTTGAAGTTTGAGTTAAATTGACAATGTGTAAATGTATTTTTGAGATTTTACATGATTTGCATGACTCTGTTTTTTGGGATTAATTCGACGGTATGACTAGCAATTTTTAGAAAAGCACAAATACGACTTGGATAGATATATAATAAACTGTCCGTTGAAAAAAATATATCATTTATGAGTTTGTTCCCAATTATGTGTGCACTATATCCTGTTGAATATCAATAATATATAATAGGTTATGGGTAGAGTTAAAAAAGCAGCAAACAATGATAATAGAAGGAGAAGCCAAAGAATAATTGGTAGAAGTAGCGGATTGCGTACAAGGAAACAGAATGAAAATGACGTTATCGATATAGATTCCGAGGTATGTAATGAACATGTTAAAATGCACTATATACTATATTAGGAATAAACTTACGTATTAATGCACTATATACAGGAAGAAGTTGATAGATCAGCCAACGTCGGGATGCCAACAAAGTCATCGTTCTTCAATCGGTTGTTTGGCGACATGGCTTCCGAGATTCGTCCTCCAACACGAAAAAAGGATGAAGATGATGATAAACAAGAAGAACCTATTCCAATCAAGATTGTAGACCCATTTGCTCATTTAGCAAACAGTCAATTAGTTCCATATGGTTATTGCTTTGGGGAAAACACAAGGAACACCGCTCAAGAGGTATAACAAATTAATTCGACATTGTTGTATGTTTCAAACACTAATATGAAAATAATTGAAGGGAGAACGTGAGGAGGAATCGATACAACCGGAGAAAGAGGTTTTCGATCATGAGGCCGTAGATGAACATGACAAAGAAAATCAAGAGGTATATTAGCAATATACATCATTGGCACATAAAAAAATAATATATATGTATATATATATTATATGCGGATATCTGAATGGGATTTTGGAAAATTGTTGCAACAGGATATAGATGGGGAAGACAATAACTTGGATGACCAGGAAGTTTGCGATCTTCACGTTGCAACATAAGAAGATAAACATTGTAAAAACGGAGGGAAAAATTCAATAGAGAAAAATGAAGAGGTATATTCGATATAGAACTAAAAATAATATGAGAATGAATTTTTTTTCCAACAGCATAAGAGATAGATAGATGTATATTAACCAACAACGACAAATACACAGGGAAAACTGGATGATAAGCATGACGAAGACAGAAACGTCAGTGGGGAAATTCAAATGGTATAATACATTCAATTTGCATAGATATATGATAGTTTATATACATATAAATGTATAAATGGGTATATATATGTATGATATCATGTATATATGTGTACATATGAATGTATGGTAAATGATAAAATCGAACCAGGGGATTCATTCCGAGGATAAAAATGTAACTCGTGATGCGGGGAGTGTGGATCTTGAAGAAAAAGAATGAGGTGAATATATAAGATAACATGAATTATATATTAAATAAGTATATTGCTTTTGATTTCTGTAAATAAGTATATGTAAAATGCCAATAAGCATATATGGATTTAATGATTGCAGGGGAATGTTATTGGCCTGGACGATACGACAGCTAGAGAAGAAGTTGGGAGGAGCAAAAGAAAAAGGACGGTAGAAGTTGCTAAGGTATATTTGAAATATAATTGAATAATATTTATATCAATGAACATATAATAATGTTTTAATGTTTATATTTACAGAAATCAAAAGCGAAGAAAATCACAGAGGCATCATCCTCTAGAAGAGTAAGAAATTAATATGATTTTGTATAGTTAATTTGAACACACGATATTTTACTTCAGCAACAATGATCGAGGTTGCATTATTTTTCAGATTACAAGGAATTCGAGTTGTGCGAAAAACAAACAGACGGTCAAAGGAAAAAAAAAAACAGATATTCGAAAAAATAACAAGAGAAAGGTATAATAACTTACACGAAAGAAAACATCATTGTTTTTTCAAATATGCTGATTCATGTATTTTTGTTGTTTCAAATAGATGGAACGGAAGAGTGAAACTGCAAAAAAGGTGATCAAGATGGAACGATTTTCCAGAGGATCAGTATTTGGAAGTAACAGAGAATATTTGTATGAG

mRNA sequence

ATGTTTTCTCTCTCCCCAAAAAAAAACCCACGTTCCCCTTCTTTGGTCTCTCTCACAGAGGACACTTACTTCTTTCTTCCCCTCATCTTTCGATTTTTTCCCCTCATCGGCATGAATTTCTTCCTCTCACCGGCGGCGCGACTTTCTTTCCTTCACCAGCGTGGTTTGTTTGGCTCATCTTTTCTTCTTCTCCGGTGCATTTTTCTTCTTTTGTGGCGCGGTTTGCTTCCTCTGTCACCATCGGCAGCTATTTTCGTGCAACATCGCCATTCTTTTTTCTTCTTGTTCGTTGCTGTGCTTGGTGATTGGGCGTTTGAGAAACAAATGTTGGAGAAACTGATGTGGATTTATGCATTTATGCTTGTTGGAGCACATCATCCAGGTATTAAGAACTGGAAAACAATCCAAATGTGGAGTATATTACTAGAGGTGGTGCACAAAACTCAATTGAATGTTCATTGTTCTGCTCCTGTGCTATTAAGGTTTTCTCTCCTCCCTTACTGTGGGTCTAAGTTATCCTTCATCGTCATCGTCGATCTATTATTCGTTGGTTGCCGCCGTCCACCATTTGTGAGTTCTGAAGTGTTAGTCGCCATGGTGAGAGATGTCTGGCTGATCATGGACAGGAATTCTAGATGGTCAAAAGGAGTTGGGTATGTGGTCTGGATGAGCAATTTTTATATTATAAGAAATCGTCCTAACTCCTATGACTCTAGCAATCAAGAATCATTCTTGAAGTATTCAGAGTCGTCAACGACGGTTATGGGTAGAGTTAAAAAAGCAGCAAACAATGATAATAGAAGGAGAAGCCAAAGAATAATTGGTAGAAGTAGCGGATTGCGTACAAGGAAACAGAATGAAAATGACGTTATCGATATAGATTCCGAGGAAGAAGTTGATAGATCAGCCAACGTCGGGATGCCAACAAAGTCATCGTTCTTCAATCGGTTGTTTGGCGACATGGCTTCCGAGATTCGTCCTCCAACACGAAAAAAGGATGAAGATGATGATAAACAAGAAGAACCTATTCCAATCAAGATTGTAGACCCATTTGCTCATTTAGCAAACAGTCAATTAGTTCCATATGGTTATTGCTTTGGGGAAAACACAAGGAACACCGCTCAAGAGGGGAATGTTATTGGCCTGGACGATACGACAGCTAGAGAAGAAGTTGGGAGGAGCAAAAGAAAAAGGACGGTAGAAGTTGCTAAGATGGAACGGAAGAGTGAAACTGCAAAAAAGGTGATCAAGATGGAACGATTTTCCAGAGGATCAGTATTTGGAAGTAACAGAGAATATTTGTATGAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTTTCTCTCTCCCCAAAAAAAAACCCACGTTCCCCTTCTTTGGTCTCTCTCACAGAGGACACTTACTTCTTTCTTCCCCTCATCTTTCGATTTTTTCCCCTCATCGGCATGAATTTCTTCCTCTCACCGGCGGCGCGACTTTCTTTCCTTCACCAGCGTGGTTTGTTTGGCTCATCTTTTCTTCTTCTCCGGTGCATTTTTCTTCTTTTGTGGCGCGGTTTGCTTCCTCTGTCACCATCGGCAGCTATTTTCGTGCAACATCGCCATTCTTTTTTCTTCTTGTTCGTTGCTGTGCTTGGTGATTGGGCGTTTGAGAAACAAATGTTGGAGAAACTGATGTGGATTTATGCATTTATGCTTGTTGGAGCACATCATCCAGGTATTAAGAACTGGAAAACAATCCAAATGTGGAGTATATTACTAGAGGTGGTGCACAAAACTCAATTGAATGTTCATTGTTCTGCTCCTGTGCTATTAAGGTTTTCTCTCCTCCCTTACTGTGGGTCTAAGTTATCCTTCATCGTCATCGTCGATCTATTATTCGTTGGTTGCCGCCGTCCACCATTTGTGAGTTCTGAAGTGTTAGTCGCCATGGTGAGAGATGTCTGGCTGATCATGGACAGGAATTCTAGATGGTCAAAAGGAGTTGGGTATGTGGTCTGGATGAGCAATTTTTATATTATAAGAAATCGTCCTAACTCCTATGACTCTAGCAATCAAGAATCATTCTTGAAGTATTCAGAGTCGTCAACGACGGTTATGGGTAGAGTTAAAAAAGCAGCAAACAATGATAATAGAAGGAGAAGCCAAAGAATAATTGGTAGAAGTAGCGGATTGCGTACAAGGAAACAGAATGAAAATGACGTTATCGATATAGATTCCGAGGAAGAAGTTGATAGATCAGCCAACGTCGGGATGCCAACAAAGTCATCGTTCTTCAATCGGTTGTTTGGCGACATGGCTTCCGAGATTCGTCCTCCAACACGAAAAAAGGATGAAGATGATGATAAACAAGAAGAACCTATTCCAATCAAGATTGTAGACCCATTTGCTCATTTAGCAAACAGTCAATTAGTTCCATATGGTTATTGCTTTGGGGAAAACACAAGGAACACCGCTCAAGAGGGGAATGTTATTGGCCTGGACGATACGACAGCTAGAGAAGAAGTTGGGAGGAGCAAAAGAAAAAGGACGGTAGAAGTTGCTAAGATGGAACGGAAGAGTGAAACTGCAAAAAAGGTGATCAAGATGGAACGATTTTCCAGAGGATCAGTATTTGGAAGTAACAGAGAATATTTGTATGAG

Protein sequence

MFSLSPKKNPRSPSLVSLTEDTYFFLPLIFRFFPLIGMNFFLSPAARLSFLHQRGLFGSSFLLLRCIFLLLWRGLLPLSPSAAIFVQHRHSFFFLFVAVLGDWAFEKQMLEKLMWIYAFMLVGAHHPGIKNWKTIQMWSILLEVVHKTQLNVHCSAPVLLRFSLLPYCGSKLSFIVIVDLLFVGCRRPPFVSSEVLVAMVRDVWLIMDRNSRWSKGVGYVVWMSNFYIIRNRPNSYDSSNQESFLKYSESSTTVMGRVKKAANNDNRRRSQRIIGRSSGLRTRKQNENDVIDIDSEEEVDRSANVGMPTKSSFFNRLFGDMASEIRPPTRKKDEDDDKQEEPIPIKIVDPFAHLANSQLVPYGYCFGENTRNTAQEGNVIGLDDTTAREEVGRSKRKRTVEVAKMERKSETAKKVIKMERFSRGSVFGSNREYLYE

Homology

[Close]

BLAST of Spg013236 vs. TAIR 10
Match: AT1G16080.1 (unknown protein; LOCATED IN: apoplast, chloroplast stroma, chloroplast, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; Has 81 Blast hits to 81 proteins in 28 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 62; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 49.7 bits (117), Expect = 7.0e-06
Identity = 23/30 (76.67%), Postives = 25/30 (83.33%), Query Frame = 0


Query: 99  VLGDWAFEKQMLEKLMWIYAFMLVGAHHPG 129
           VL   AF+KQMLEKL+WI AFMLVGA HPG
Sbjct: 190 VLDKEAFQKQMLEKLIWICAFMLVGARHPG 219

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spg013236 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg013236 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg013236 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg013236 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G16080.1	7.0e-06	76.67	unknown protein; LOCATED IN: apoplast, chloroplast stroma, chloroplast, chloropl...	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 265..285

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spg013236.1	Spg013236.1	mRNA