Spg012532 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGACCGTTGATCAATCAACCCGTCAGGCAAAGATGAAGGACAACAAAAAAAGCATCTCAAAATTCGTAAAAGTGCTTTTCAAGCTTGCCATTGCCATCATCTTGAATGCGAAGTTCGTCGACTTTCATACATTCTAATAAATCTGATGTGATTCTGAATTTGGCTGTGTCCTTGCTCGACGACCCTTTATTCCAAAGGCTCGAATTTATAGTAACCAAAGGAAAGCTAGGCTCGCTGCGGTATATCTAGCCTCCCGCCAAAAGGAAGGAAGGAAAGAGAAAAAGTTTCCGAAACCCCCTACAGACCACAGCTGTATTTGACAAAAATGGACGGAAGAATAGTGTCAAAAGCAAAATTCTTTCGATAGGGACGTCGGGAAAAAGCAATACGCAAAGACCCTTGTTACTGTTACTGTATTGTACTGTTCATAATGAGGGAAAAAAGTTGCAGTTCTTCCCACAATTTCAGTGCGTTTCCAAGCCCTGCACTCCCAAATTACTGGGAAATCAATGTCATGAACCAAAGGGGTTGGAGCTCCGAGCGAATACCTCAGCCTAATAGCAACACACGCCGGAGGAATGCCTCTGTCGCCGCCTTGACGCCCTTTTACGGCAGGACACTGCCCTCCAAATGGGAGGACGCCGAGCGATGGATTAGTAGCCCTGTTATGGGCAACGGCTTCAGCAGGAGTTTGCAGTCTCACCTACAGAGAAGACCCAAGTCCAAGAGTGGCCCTATTGGGTCGCCTGGAGTTTCTAATTACTCCAATTATTCACCCGCAATTCCAACTCCCGAGAATGGGGCTTTCGCCACTTCCAAATTAGGCTCTGCTCTTTCCACTGGAGTGTTGGTGGCTGATGGGGTTTCTATCTGCTATGGCGGTAGCATCGATAGGGGACAATCTTATCCAGAGTGTACCATTCAACGATTAGCCTCTGCTCCCAGATGGTCAGATATACTGAACGAATCGCCACTGCCCAGCTCTCAAGGTATCTCTTTATTCTTCTCCCTTTGTTTTCCGGGTAGTCTTGAAGTAGTCTGTTTAACTTGGGCTGAGATGAAGTTTGTTGTCTTTAGTATTAAATGATACTCAGGTTGGATGCTGGTATTAATTGTTGATGTCAAGTACTGCAAAGTTTCTATGCGACAGTGATTGAGTGTAAAATCAAGTCTCTCTTACTTTCACATCCGTTTAAATCATAATAATGTTAGATTGTTTGGTTGGGATTAAGTTGTCTCTTCATGTTCATTCTTGAAGAGTTGAATATTGGAGATCCATTTTGTTGAGACATTGAAGATAGTTTGATTACACCTTGTTTTTGAGTTGGAGATTGGTGGTTTTTAAGATGTTCTTTGTGGCATTTGAATCATATCTACAGATGAAAAGTATGGTGGTTCCGATGAGGCAATGGATTCAGGCGTTGTTTCACAACGAAATGTGGCTACCCAAATGAGCCCTGAAGATTTCACACCTTCATCTCCTCAGGGGAATGGTTCACTTTCCCCTTCATCTCCTTCAACACACCAATCTATGGTTGGAAAGGAGAGCGACCATTGTTCTAAACAAGAAGTGAGAGATGTTGAGGTAGACAAGAGAGCCACGGTGATACAGAGATTCAAAGGGAATAAACTCAGATTGACCAAAGAAGACTTTCCACACCCTGGAAACTCGGATGAAAATGCTACGGAGGCTGCAGCTTCAACTTTGGATATTGCAGAGGCAGCTATTCAGGTTTCCAAGTAAGTATTATTTTCGTCGTTCTTTCAGTGGTGGAGTTGATTTTAGAGAAAAATTTGTGTTTCACTCTTGTTCTTGTTTGAATGAATAAAATTTAATTTTGAAGTTTTAATTTCATTGAACTGATCTTGGACTTAAATAAATGGTAAAATGAATACTCTTTATTAAATGATTTAGTTCTACTTTTGTGAGTGCTAGTTTTGTAATCGTGTAGGACGTTTATTTTGCTTGCTTTGAGTGCTTTGGTGTTGTTTGAGGCTAATTTTAGCCGTTTGATTCCAAGACTCAGGTTGATTGTTTTTATGGTTGGATTTAGGCATTTTAACTGGGTTTTAGTTGTTGTATTGGTTGGACTTTAAGTGATTTATTGGTTAGTTTTTTAGAGGAAAATATTGATTTCACTAATCATTCAAGTTCAAGATTCAATTCAATAGAACTAAAGCTTTACATTTAACTCACTCCACTACGTACATGAATAAAAGAACGAACTTTTTCTTTACAAGGTTTAAACTTCCAGCATTGCTTGATCTTGGATCTCCGATCTCTTTTAGATTGATATTTATCTACATACCTAAAAGATTTTACGCATCCCATGTCTGGTATAATTGATTAGCTATTATACATCCTTGGCTCAGAATGCCTGGTTTTCATAGGAAATAATTTTGTCTTTGTCCACTCTTATTTGAAAAGTTTTGGAATCTGTAGTACATATCAAGATATTGTCATGACCTGGAATTGTCAACAATCTCTTGACAATGTCAAAGAAGTTTCTGCTAACTTGAAATGTAATGTTTAGGTTGCAGAGAGAAGAAGCCAAGATAACAGCATGGGAGAATTTGCAGAAGGCAAAAGCTGAAGCTGCGATACGCAAACTCGAGGTTAGGGCCGCTTTTAGCATCAAAATCTGCAACTTTCACTCTGTTTTATTGGGAAAAATAGAGAGAAAACATAGAAAAATCCTAGAATAGTATGGTCCTGGTTAAAGGTTAAAGCAGCTTCGTTTATTTGTGGATTTCTTTTCCCCAACATTTCATTCGAATTCAAAAAAATACAGTCATTTATGTTGGTCCTGGTCAAATTAGAATAGCAATGTACTCGAACTAGAAGAAGCTATGTGGTTCACTGACGATGAAGCTTGTTGATTCAGATGAAACTTGAAAAGGCAAGATCATCATCAATGGATAAGATATTGAAGAAGCTGAGGAAGGCACAGATGAAAGCACACAAAATGAGGAACTCGTCTCCAGGCGATCGAAACCAGAGAATTCGCAACACTAACAACTTTCTCCCGTTCCACAAGCACGTGTGGATCGGTTCCCTCAAGCGTTGGTTCATCTGCCATGCTTCCTGATTTCACAAGGTAGCATCTAGTAGTTTCGTCGTCTGTCTTAGAAATTTACACTAGCTTAGCTTGATTGGTTCTGTATCATCCAGGATCTTGCACTGTAGAATTGTTGTAGAATAAGAAATTATAGCTGGCTTATGGTTTTTGAGCAGGACATGTTGTGAATTGCCACCCAATGTGATATCAGGTTTAATTGACAGTTCATATGTAGGTAGAAAAGGCTGAAAGAGAGTTGTGTCCAGCACTGTCTGAGACAGTTCATATGTTTTCTTTTTACTAATATATATAGGAGGGGAAGGGATCTTTAATCTAAGAATTTTAGAAGTCAGTGCTCAAACCAGAGTAGCCACAGTTATTAGAAATGTTGTAAGATGATGAATCGTTTGATAAGATTAGAAAGATTAGTTACGCAAAGTAATTCCATCACTCACACAGATTAAGAGAGTGGTTGATAATTAAACTTTGCAAATCAAAAGAATTGGGCAAACAATTCCAATGGACAAGATATGAGAATTTTTGCATTGGATCATACTGCTTTAAAGGCCTATATCTCTGGTCGGATACAGACCTCGTGGTCTTCAGCTTTTCCCTTTTAATTTCTAAACCCCACTTCACCAGAACAGGAATTGAGTTTCATTGTACTTTGTAAAAACTTTTTACTAGTATTTTCTCGCAAAAGATATTTATCGAAATCATATTAAATTAAAATATAGGGACTAAATTAATACAAATTTGAAAGTATAGGAACAAATTTGATTTTTAATCTATATTTAAAATTAAGAGAATTGATTTGATTATTCTTTTTTAATAATATGTGGGGAGAGGGATTCGATCCACATACCTTGTGGTTATCAGTACAAGGTTATGTCAGTTGAGTTAAGTTCTTGTTTGCAGATTGATTTGATTATTAAAGTACTTCTGGTTCATTATTTTAATAATAAGTTTTTTACTTATTCGAATAAATCTGACCCCAATATCATATCATTGGATTGGATTTTATTTTAATTCACATTAATTAATAAGATGGACAAATCTAGAAACTCGACTATCATACAACAGATCTTTTATCAACTCAACCCATCAAAGATTATTCTTGGATTTTTTCTTTTTTTTACCGAACACATCTTTAAATTTGTTCATTGTACATGGAAACATAATTGCAACTTCTTTAGCTCGATATATTCAGTTGGGCTCGATATAGGTTGAAGATAAGCTTTACTTTCCTTTTATGTGTATAAATATATCCCATAATTTTCCAAAGAACAAAACTTGGTTGCATATGGGTATGTAGGGATCTTCCTGCATATCCCATTAAAATCTTGACAACTAAGAAAGAGGAAGAGAGGAAATGAGAACTTTTTTTTTTATCTCTCCTAATTGTCACCATTTTAATGGTGGTATGTAGGAAAATCTACCTATATGTAGGAAGTTTTTTTCTCAAATATTGCTTCATTTATTGCTTACTAGGGGTGAGCAAAAAAATCCGAAAAACGAGCTGATCGATCGAAACCGACCGAACCGACGTCGGTCGGTCGGTTTTCTAATATTTTCGATCGGGGTCGGTTTTACACCAAGGAAAACCGACCTTTCGGTCGGTCGGCCCGCCTAAAATGGCGAAAACCGACCGAAAGAAAAAAAAATATTACGCAGATGCGATCTGCGAGGCACTGCCTGCACCTTGGGAAGACCATCAACCGATGGTCTTCCCAAGGATTTGAAATTATATATTTTTTTTGTTTTTTTATTTTTTACTTTTTTTTCATCTCTTTCTCTTGTTTCTCTCTCATTTTTTTCTCATTCTTTCTTCATCTTCTCTAAATTCTTCTTCTCTTTGGGGCTGTTTGTGGCGCTGAATTGGTTATAATATCTTGTGCTTATAATAATCTGGTGATTATAATAGTCTGGGGGTTA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MREKSCSSSHNFSAFPSPALPNYWEINVMNQRGWSSERIPQPNSNTRRRNASVAALTPFYGRTLPSKWEDAERWISSPVMGNGFSRSLQSHLQRRPKSKSGPIGSPGVSNYSNYSPAIPTPENGAFATSKLGSALSTGVLVADGVSICYGGSIDRGQSYPECTIQRLASAPRWSDILNESPLPSSQDEKYGGSDEAMDSGVVSQRNVATQMSPEDFTPSSPQGNGSLSPSSPSTHQSMVGKESDHCSKQEVRDVEVDKRATVIQRFKGNKLRLTKEDFPHPGNSDENATEAAASTLDIAEAAIQVSKTFILLALSALVLFEANFSRLIPRLRLQREEAKITAWENLQKAKAEAAIRKLEMKLEKARSSSMDKILKKLRKAQMKAHKMRNSSPGDRNQRIRNTNNFLPFHKHVWIGSLKRWFICHAS Homology
BLAST of Spg012532 vs. NCBI nr
Match: XP_038883869.1 (uncharacterized protein LOC120074722 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 699.1 bits (1803), Expect = 2.3e-197 Identity = 362/426 (84.98%), Postives = 380/426 (89.20%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. NCBI nr
Match: KAG7027057.1 (Remorin 4.1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 691.0 bits (1782), Expect = 6.3e-195 Identity = 363/426 (85.21%), Postives = 376/426 (88.26%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. NCBI nr
Match: KAG6595034.1 (Remorin 4.1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 689.9 bits (1779), Expect = 1.4e-194 Identity = 362/426 (84.98%), Postives = 376/426 (88.26%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. NCBI nr
Match: XP_023518932.1 (uncharacterized protein LOC111782305 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 689.1 bits (1777), Expect = 2.4e-194 Identity = 363/426 (85.21%), Postives = 375/426 (88.03%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. NCBI nr
Match: XP_022962881.1 (uncharacterized protein LOC111463248 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 688.3 bits (1775), Expect = 4.1e-194 Identity = 363/426 (85.21%), Postives = 375/426 (88.03%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KX88 (uncharacterized protein LOC111497187 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497187 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 688.3 bits (1775), Expect = 2.0e-194 Identity = 363/426 (85.21%), Postives = 375/426 (88.03%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HEJ0 (uncharacterized protein LOC111463248 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463248 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 688.3 bits (1775), Expect = 2.0e-194 Identity = 363/426 (85.21%), Postives = 375/426 (88.03%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BT18 (uncharacterized protein LOC111005291 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005291 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 677.2 bits (1746), Expect = 4.6e-191 Identity = 358/429 (83.45%), Postives = 375/429 (87.41%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KLC7 (Remorin_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G490900 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 668.3 bits (1723), Expect = 2.1e-188 Identity = 354/427 (82.90%), Postives = 374/427 (87.59%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B0Q2 (uncharacterized protein LOC103484775 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484775 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 664.1 bits (1712), Expect = 4.0e-187 Identity = 350/427 (81.97%), Postives = 372/427 (87.12%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. TAIR 10
Match: AT4G36970.1 (Remorin family protein ) HSP 1 Score: 192.6 bits (488), Expect = 6.5e-49 Identity = 168/428 (39.25%), Postives = 225/428 (52.57%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. TAIR 10
Match: AT1G45207.2 (Remorin family protein ) HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 1.4e-43 Identity = 146/395 (36.96%), Postives = 204/395 (51.65%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. TAIR 10
Match: AT2G02170.1 (Remorin family protein ) HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 4.7e-07 Identity = 89/362 (24.59%), Postives = 155/362 (42.82%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. TAIR 10
Match: AT2G02170.2 (Remorin family protein ) HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 4.7e-07 Identity = 89/362 (24.59%), Postives = 155/362 (42.82%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012532 vs. TAIR 10
Match: AT1G53860.1 (Remorin family protein ) HSP 1 Score: 43.5 bits (101), Expect = 4.9e-04 Identity = 59/218 (27.06%), Postives = 104/218 (47.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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