
Spg012473 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCCCCACTCACATTGTAAATTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAGTCACTTTGCAAATATAAATATACAAGTGAAAGTGCTTTGTATTGCATAGGAACACCCATCTACAAGAAGGTTCCTATCAATATACCAATCGGTGTAGGAATGATGTGGATGAACAGTTTGACCTTGCCGCAACATTTCCCCTTCGCATCGACCTTCTCGCAGCCTACTAATGATTCATCACCTATGTCCATCAAGAAGCTTCAAAATGGCTTCCACTTCAAAACTCAAACCAGCCCTGGGATGGCTCATAGCCCCACGATTGAGCCTCTAACTAACGGCGCAATAGCGTCCGATAAACTAATTTGCAGCCGACCACAAAGCAACAATGGAGCCCCACTCCTCAAAATCCCACCGCCGACCACCGCCCCATCGACGCTGGGCCACTACCTAGCCCGGCGGCTGGTTCAGATCGGTGTCTCTGATATCTTTTCGGTTCCGGGGGATTCCAATCTTGTGCTGCTCGATTACTTTGTGGCAGAGCAAGGGCTGAAGTTTGTGGGGTGTTGTAGCGAGCTCAATGCCGGCTATGCGGCCGATGGCTACGCCAGGCGCCGAGGCGTTGGAGCCTGCGCCGTGACGTTCACTGTTGGTGGACTCAGCCTCATCAACGCCATTGCCGGCGCTTACTCTGAGGATCTTCCGGTGATTTGCATCGTGGGTGGACCAAACTCGAATTATTATGGGAGTAAGAAGATTCTCCACCATACCATTGGCTTGCCGGATTTCAGTCAAGAACTTCGGTGCTTTCAAAATGTCACGTGTCATCAGGCCATTATTGATAATTTGGAAGATGCACAATGGAAGATTGATACAGCAATATCAAAGTGTTTGGAAGAGAGCAAACCAGTTTACATTAGTATTTCTTGCAATTTGGTCGCCATTCCTCATCCTTCTTTCTCCATCCAACCACTCATTCCACTCTCTCTTTCTCCCAAGTAATTTCTCATTTCAAGCCCCAACACAATAAATTCAAAGAGATATATATTTAAGATTTTAAAAATCCTTATTCTCTCTGTTGAATGATTTCACAGGCAAACTAACCAAATGGGTCTGGAGATGGCAGTGGAGAAGGCAGCTCAGCTTCTAAACAACGCCGTAAAACCAGTCATGGTCGGCGGGAAGAAGCTGCGACCCGCCAAAGCACAGGCGGCGTTTGTCGAGCTAGCCGACGCTTGTGGCTACGTCGTCGCCGTCACGCCGGCGGCGAAGGGTATGTTCCCGGAGAACCACCCACATTTCATCGGAACGTACTGGGGAACAATCAGCACCCCCTTCTGCGGCGAGACGGTGGAAGTAGCCGACGCTTCAATCTTCGTCGGAGCCACTTTAGACGAATTTGAAACCGTCAGCTTCTCGCTTGCGTACAGAAAGAACAAGGCGATTATGGTAGAACCAGATCGCGTTGTGTTTCCGAATGGGCCGAGTTTTGGGCCGATTATAATGAAGGATTTTCTTCGGGCGTTGGCTAAGCGGCTAAAGCCCAATCCAACGGCTTACGAGAATTATCGCCGGATTTATATTCCGGAGTCGGGTCCAGTCCAATCGGAGCCGGGTGAGGCCTTGCGGGTTAACGTTCTTTTCAAACATATCCAGAAAATGTTATCGAGTAATATGACTGTGATATCTGAGGCAGGCGACTCTTGGTTTCAATGTCAAAAACTAAACCTACCTAAATCATGCAGGTAAAAACTTTCTTTTTAAGTCTACAAAACTAACAATTTTCTTTATTTAGTTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAATTAAATGTGTTTACAATAAAGCATTTATTTGAAAATGTGTTTGCTTGGGTAGATACAAATTATTTTGAGTATAATATGAAATGACGTTGATGATAAATGTAGATATGAGATACAATTGCTATACGCATCTATTGGATGGTCTTTGGGTGCAACTCTAGGATACGCGCAGGCTGCACCAGAAGAGCGAGTGGTTCTTTGCATTGGTGATGGGAGTTTTCAGGTCAATTTTTGTTTTGATAAATTTAAATTATATTTCTTATTTGTTATAAGTTAAAAGTATTGTTTTAATGTTTTATTCTAGGATAAACATAAAAATATATTATTTCAGAGCTAAGTTTAAAATTTGCAATAACTTGAATATTTAAAATAGAATTCGAATCCATTTAGTTATTTGCCAATTTTTTAAATTTCAAATAAATAGTATGATTTTTGTGGTAGATGACCGTACAAGATGTGTCTACAATGCTAAGGTTGGGGCAAAAGAACATAATATTTTTGATAAACAATGGCGGATACACTATTGAAGTAGAAATTCATGATGGCCCTTACAATGTTATCAAGAATTGGGATTACACTGCCATCGTCAATGCTATGCAAAATCGTGATGGCAATTGTTGGACCACCAAGGTGAAATCTCTCTAAACTTTGTACTTCTATTTTCATACACACTATTAGATTATCTCTAGAAGAAAACAATCTCTATACATGGTAGTCACTTTACCAAAATATCATTATTGTAATTTTTTTTCTAATGACAATTGCTCGATATAATTCATCGAAGTGCATTAGTGAGTTAACAGAGAAAAAGTGAAGCTTTATGTATTTTTTGGCACATGATTTTTAATAAATGTTTTTATTTTCATGTAGGTACGTACTGAAGAAGAGTTGGTGAATGCAATTGAGATAGCAACCGGAGATCGAAATGATTGTTTGTGCTTCATAGAAGTTATTGTTCATAGGGATGATACTAGTAAAGAGTTACTTGAATTTGGAAGCAAGTTTGTTGCTATTGGTAGTCTTCCTCCAAGAAATTTATGATTTTTTTTTCTTTTTTTAAATATATGAAATTTTATGAATGTTGACAATGTGTAGTATTATCTAATATTTTCAATCAAGTGCCATGAATTACGTCTTTTTTTTTTTCTATAAAAAAAATGAAGAAGTAAAACAAAACGAAACAAAATAGTTTAGGATAAAATGGTCCAAACACTTAGGATTCCTTGCTTCACTGGTTCGGAATCTTAAAGTTGGAATGTCAAACTTGTGGTTCAGTTGGGAGTTTAGGCCGTCTCGGTCTATCGGTCTAAGAAAGTTGTGTTTGGGGCATATGTTTAGGAAGTTTAGGTTTAAGAAGTCCATATTTGGAGTTCAAGTTAAAAAACTTGTGTTTTGGATGCGGATCTTAGACATCTTGTGAAATATTTAATTGTATTCAATCAATGGGTTAGATCTAAGAAGCACAGACACGGGACACGGACACGACAGGACACAGCGATACGTCAATTTCTAAAAAACTAAGATATGGATAAGTGGAGGATACGTCGTTTTTTTTTTAATTTTTTTTTAGTATATATATAAATTTAACATCAAAATACTAAAATTACACCACTAATTAAAAAGCCTGAATTCTTTAAGGCTTTAAGTTTAAGTTAAGAGATTAAATAAATATATATATATATATATATTAGGGAACAAACAGATACACTTGTTGTGGTCTGCTCGAAAAATGCATTTAAAAAAAAGAAAATAACCGAATAACTTTAAGAAAAAAAACTTGCTGGTTGTGGTGGTTGTCTCTCGAAAATGGAATGGCTGACGGACAACTTATTCAGCTGGAACTGCCGACAGCTTCTAAAGCTAGGGGCAGCGGTGGCGAAGACGGCCGGTGACGGTGCCGACGAAGATGGCTGAGCGGTGAGTGTGCGAGTGCGATGTAGGAGGGAAGGCAAATCGAATGAGAAGAAGAAGGCTGCTGTTTTTGAAAGGAAATATAGGGTTTGTTTATTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAAACTAAAGCCCAGACTTTTGGGCTTTAAACTTGGGCCCAGAAGTTCAATTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGAGAAAAATAGCTAGATTTAATAGATGGATTTTGAAAAATGGCTAAAAAAGTTTAGAAATTAAATAACTGGCTAATGTGATTTTAATTAATTACTTCCTAATTAAACTAGACAAAATTGCCCCTAACAACCCGTCTAAAAAGTCTATAACGTTTAGGAGAGAGAAATACAAACTAAAAAGCTGGAAATTTATTAGAAAGAATGAGAAATATATATTTGCAACAACCTAACAACCTAATTTGAATCCTAACAACCTAACTTGAATCCTATGGAAACTCTAGCATCTTTTGAATATTGAAGAATTAGTTTCTGAAGGATGGAAGGAAGAAAAAAAGAAGAAAAAAAAAACTGATATCCCTGTGTAGATGAAACAATGATTTACAAACACAAAATGAAGAATGAATACACTCAACTACATGGGCACAAATGACAAATGGAGTAATCACAATACATCACTCAGTAGCGTAATTACAAAGAATTACACCCATGGCTGTGTAAACATTGTATAACCTTTGAACTTCCAAATTAAAACCATGGTTGTAGAAAAATCCCCTCACCAAAACGTTAATGTTCAAACGGGGTATACAAAAAATGAATTTAGAAACTTACCCGACGCATTGATGGCATGTCAAATCGAGTAAAACCTCTTATCTTTCCCATTGCATGCGTTCCACACCTCAAAACCTTACCGGTTGTGTATACCAGTATCTACATCCTGCACGTCAACAACTACACAACAATCCCTGTACATACCATTCTGAGTTAACAAACTCAAAATTTGTCTCCCCCTGCTATGAGCTTGCGACTGCCCCCGGTTGTGTATACCAGTATCTACATCCTGCACGTCAACAACTACACAACAATCCCTGTACGTACTATTCTGAAACTGGCTGACCATCCAAAAAAACATCATTATCTTCTAAAAGGACTATATTGATCGGGTTGCTTGACCAGTTCCTGAAGAGTGTTAACCGACAGATACTATTACTGTCAGACAGATTGAGGTAGTTCGCAGCACATATCTTGAGTTGAGAGAGGTTAGAATCACAAGGAACCGTCACAATTC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BLAST of Spg012473 vs. NCBI nr
Match: XP_038881465.1 (pyruvate decarboxylase 1-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1066.6 bits (2757), Expect = 8.4e-308 Identity = 522/620 (84.19%), Postives = 562/620 (90.65%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. NCBI nr
Match: XP_038881352.1 (pyruvate decarboxylase 1-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1062.0 bits (2745), Expect = 2.1e-306 Identity = 524/625 (83.84%), Postives = 561/625 (89.76%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. NCBI nr
Match: XP_004148631.3 (pyruvate decarboxylase 1 [Cucumis sativus] >KGN54392.1 hypothetical protein Csa_018074 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1057.4 bits (2733), Expect = 5.1e-305 Identity = 518/653 (79.33%), Postives = 569/653 (87.14%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. NCBI nr
Match: TYK29657.1 (pyruvate decarboxylase 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1052.4 bits (2720), Expect = 1.7e-303 Identity = 515/638 (80.72%), Postives = 557/638 (87.30%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. NCBI nr
Match: XP_008464213.1 (PREDICTED: pyruvate decarboxylase 1-like [Cucumis melo] >KAA0037741.1 pyruvate decarboxylase 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1050.4 bits (2715), Expect = 6.3e-303 Identity = 514/638 (80.56%), Postives = 557/638 (87.30%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2Y5L9 (Pyruvate decarboxylase 1 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=PDC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 817.0 bits (2109), Expect = 1.5e-235 Identity = 387/571 (67.78%), Postives = 466/571 (81.61%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DHF6 (Pyruvate decarboxylase 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PDC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 815.5 bits (2105), Expect = 4.5e-235 Identity = 387/571 (67.78%), Postives = 465/571 (81.44%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M040 (Pyruvate decarboxylase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDC4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 815.5 bits (2105), Expect = 4.5e-235 Identity = 393/581 (67.64%), Postives = 465/581 (80.03%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2XFI3 (Pyruvate decarboxylase 2 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=PDC2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 813.9 bits (2101), Expect = 1.3e-234 Identity = 388/600 (64.67%), Postives = 473/600 (78.83%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82647 (Pyruvate decarboxylase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 812.8 bits (2098), Expect = 2.9e-234 Identity = 387/561 (68.98%), Postives = 459/561 (81.82%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L1C6 (Pyruvate decarboxylase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G312250 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1057.4 bits (2733), Expect = 2.5e-305 Identity = 518/653 (79.33%), Postives = 569/653 (87.14%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E0N5 (Pyruvate decarboxylase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold669G00060 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1052.4 bits (2720), Expect = 8.0e-304 Identity = 515/638 (80.72%), Postives = 557/638 (87.30%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T827 (Pyruvate decarboxylase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold141G00370 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1050.4 bits (2715), Expect = 3.0e-303 Identity = 514/638 (80.56%), Postives = 557/638 (87.30%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CKZ0 (Pyruvate decarboxylase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502148 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1050.4 bits (2715), Expect = 3.0e-303 Identity = 514/638 (80.56%), Postives = 557/638 (87.30%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CKY9 (Pyruvate decarboxylase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502149 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1047.0 bits (2706), Expect = 3.4e-302 Identity = 517/653 (79.17%), Postives = 563/653 (86.22%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. TAIR 10
Match: AT5G01320.1 (Thiamine pyrophosphate dependent pyruvate decarboxylase family protein ) HSP 1 Score: 815.5 bits (2105), Expect = 3.2e-236 Identity = 393/581 (67.64%), Postives = 465/581 (80.03%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. TAIR 10
Match: AT4G33070.1 (Thiamine pyrophosphate dependent pyruvate decarboxylase family protein ) HSP 1 Score: 812.8 bits (2098), Expect = 2.1e-235 Identity = 387/561 (68.98%), Postives = 459/561 (81.82%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. TAIR 10
Match: AT5G54960.1 (pyruvate decarboxylase-2 ) HSP 1 Score: 802.4 bits (2071), Expect = 2.8e-232 Identity = 385/561 (68.63%), Postives = 451/561 (80.39%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. TAIR 10
Match: AT5G01330.1 (pyruvate decarboxylase-3 ) HSP 1 Score: 792.7 bits (2046), Expect = 2.2e-229 Identity = 387/587 (65.93%), Postives = 459/587 (78.19%), Query Frame = 0
BLAST of Spg012473 vs. TAIR 10
Match: AT5G17380.1 (Thiamine pyrophosphate dependent pyruvate decarboxylase family protein ) HSP 1 Score: 92.0 bits (227), Expect = 1.8e-18 Identity = 118/504 (23.41%), Postives = 211/504 (41.87%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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