Spg011107 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview


Name	Spg011107
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Unknown protein
Location	scaffold4: 26612818 .. 26621833 (+)
RNA-Seq Expression	Spg011107
Synteny	Spg011107

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGTGGTCCTAGGCGGCGCAGATCAGCTATCTCCAGTGAGCAAACTCGCGGACAACAAGACCATTCGCGTTTCCCAACTGTTTGGACAGTGGGTCTTTAATTTCCTGGTGGATTTGAGCGTTTCTTGTAGTGGGTAAGAGTTTCTAAGTTGTTTTTGGGTTGGTTATGGTGTGTAATTAGATACCCATTGACTTTAGCTATTGTTTTTAAGGTACCCATAGCATTTGGAGGCCGATTCGTCGAATTGGAGCAAAATTAGAACCCGAACAACAAGCTTAAGGTTCTATTTTGGTGAGTTTTGGGTGTCAAATTTATCTCCAAGATTATTTGGCTCCTAGTGGTATGCTTGAAGTAATCTCCTATTGGTTTAAAAATTATTTTCGCCTTGTGTAGATTGATTAAAGGGCCTTGAAGCTAAGAAGTGATATAGTTCTATCGAGCAAATTATTTAGCTAAGGTAAGTAGCTATTTGGATTCGAAGTCTAAGTTTTGCCCTTGAACCTAATCAAGCATAATTGGTTCTTTTTGGATGCTTGGAATAGTTGAGAATGTTACGGTTAATTGTAGCATGTTGAGTTAGCCTTTACGTAAGTAGCCATTTAAATGAAAATTTCTGTGCTCTAGACTCATTGTGTGACTGTTGGAATTGATAAGTAGTCAATGGTCTAAGCCCTATGCTTTGGATTAATTTTCTTTGAGAATTTAACATGCTAGCATGAATCGAATTTGAGTCTTGAGTTTTGCATTTGAATTTAAATAAGCATGTTGAGTTTCTTTGTGAGGCATGATGTCTATATGAGGATTTTATGGTTAATTGTAGCCTGTTGAGACTGCCTTTAGTTGGATTAACGTCTTTTGGTTCACTTCAGAGCATGTTTGGTTTGGATAAGTTATGGTTTCTTTGGATGTCTGTTTATGATATTGGATGATGGGTTGAATGTTTGTTGAAGTTGTGGATGAACTGTGGATACGAGATCTGACTCACTATGGTTATAGAAGTGTGTTTTCTTGCTTCCAGGTGATAGGAAAATTTGGGATTTGCCTATATGTATGTCGTTATGCTGCCGAATTTTCGGTAGCATTGCAGTTGTTAAAGGGACTAAGCTTAGAAATATCCCTTGGAATATGAAGTGCTTAATCGGCTGGCTGATTAGTATAGACCATAGGCTCTCCATGCATGTTTTATTATGCCTTTTAGAGAACCATGTATGAATGAGAATAGAGTTAGAATAGGGACCTTAATCATGTTTTAGGGCCTTAGGTAGACTTAAAGAATCCTTATAAGTCTTATGTTAGCTAGGGTTATTTCTTTCCCCATCTCAGGACTGATGGAACCAGTTTTCTTGCACGGGATTGTGCATTCTATCATTGACTGGTAGATTCCAGTTTTCAAGCATGGGATCGTGCATTCTATCATTGACTGGTAAATTCCAGTTTTCAGGCACGAGATCGTGCATTCCATCAGTCGACTGTTAGAGTCCAATTTTCAGGCACAAGATTGTGTGCTCTATTAGTCTCAGGACGGTGTTGAGCCCAGGCACGAGATCGTGGGCCAGATGGCACTCAGGCATGTTTTCATGCACTAGATTGCTCCACCGTATTTTTATGATTCAGGGGTGTTGTGTTGGGATAGGTGTAGTTTTGCTAGAGGTTGCCAGCTAGTCTTTAGTTTACTTACCTTACTCGACTAACCCAAACAATACTCTAGTTGGCATAGGTTGGGGATAGGTAATCATCCTAGACAGAACGTTTCAGGAACCTAGTTATGGTCCAGGGTTAGAAACCCGAATGACTGTTCTAATTAGGTCCCTCTGATGTTAAGTCCCAAATTCAAGTTTTATGCTATTAGTTTCCATGTTATCAGATCTCATGTTATCAGTTTTAACTCTTAAGTGGGCTACTTACTGAGTATATTCTTATATACTCACCCATGCTACATGACTTTCATTTTCAGGTTGTACTTGATGACATTAGGTGAGTGGCGAGGGCAGTGACTTGGCTAGGCTATGGGATGCAGCTGCAAATCATGTCCATAGGAGTCTAAGATCGAGTCTCCTAGTCTCATGTTTTCAAATGTTTCAATGTTCAAATTTATGAAATTTTATAGCATGTCTTGACTATTATGATATTGTAAAATGACTTATGGTTTTGGGCCCGATTTATTAAATAAAATTTTTTTATTTAGGATCTCTTCCGCTTTAAAGTTCAATGTTTTTACGTTCTCGTGCATGTAGTAGCAAACCTTAGTATGTTTTTAATTTCTTTTTGAGTCGGGTCGTTACAAAAAAATAAACATTATATATGTTAAAATAAAAATGTTGTACAAAGACACAAGATAGTTGAACTAAAAATGAGTGAAATTAAATAAAAAAGAAGGGAGAGAGTGGGGTTGTGGTGGAATGAAGAAAGAAAGAGAGGAGAGAAAGGAAAAAAAATATAAATAATACAGAGAAAAATAATATAAAATTTTAATTAATTTAGTATTATTTTTATTTTAAAAATTGAAAAATATTTATATTTTTTTAAAAAAATGGGTGCCACATCAGCATTCCATTAATTTCTAACGGAAAAATGGATGGAGGGACTAAAGTGAAACGAAATCCAAACCTGAAGGGCTAAATTGTTGAGTTTGAAAACTCAGGGACCAAAATGAAACCTAACCAAAACCTGAGGGATCAAAAGTGTATTTTTCAATTTAATATATTTAATTAAATTTGATTTAGTTAAGATAATTAAATTAATACTATAGGTCATACGAAAATGCACATAGAAAATGAGATATTTAATGAATATTAGTTAATTAAGTTATGAAACTCCCAGTTGATCCTAGCCTCGACAAGGCCGAAGCTGACCCTAGCTTCATGAGGGAGTTTCACATGGGATATGCACTCCTTATTAAACAAAAAGTAAGGAACGAGGATATGTACTCCCTATAAAAAAAAGCTAAGCAAGATGATATGCACTTCCTATTAAACAAAAAAGCAATGAATAGGGATATGCCCTCCATATTAAACAAAAACAATGAAAGGGAATATGAGCTGGGTTTTATGCCCTAAACTCGTGGATAGTAAATGTAAACAAAGTTTATCTATTCAATAAAGATGTGATTGAGGTTTCTTTCAGAATTTCATTAACTCAAATTCAATAAACTAACATCATGGGTTATTTAGTGAGGGTTGAACAATATGTGGTCACATAAAGGGGTTCATGTTCAAGTAAGAACATAAAGGGTCTATAGTATAGGGATAAAGTTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTATAGATACAACCCACTTTGTATTTGATACAAACATATTAATCCAAGTCAATTCATGTGGAGGCATGCGAGTAGGGGTATCCTATCGATAACTCAATTTATGAGCTATATTTTATACTATTTTAATGTTAGTCTTGATAATTATTTGAAAAATTTATGAAAATTTGATTATAATTTTGTAGGAATCAAACATTTGACGGAAATTGAAGTTTTGGAAGAAAAATGATGATTTGGAAGCAATTGAAAGAGTTGAAGTGAAGAAAAGAAGAAAAAAAACCAAATCCAAGCCAACTAACTGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTGAATGTAACAAATAATATATACTTGTTCAATAAAGTTGTATTGAGGTTTATTCAGTAAAGTTATTATTGAACAATTGAATTGTACAATGGATAATCCAAATCCAATAAACTAAGAACCCCTAGCTATATAATGAATACTTGAACTTTATGTGGAAACATAAAAGTGGATCAGATTCGAGTAATAGCCAAAACGGTCTATAGTATAGGGATAGGACTTGGTACCTAATTCTGGGGACACTATGGACGCGACCCACTTTATTGATAACAGTCAATAGTTTTACATTTACTATCTACGAGTTTTAGGGCATAAAACCCAACAAACTCCCACTTGAACTAAAACTCTAGTTAGTGAGATGTACATTAGGATAAATAACCTAAAGCAATAGAAAGGTTAAATGTATAAGTACATTACATACAAATACAATAAACTAGGACATTCTCTGTTGGGTTTTATGCCTTAAAACTCGTGGATAGTAAATAAAAAAAATTAATTAATCTCAATAAAGTGTTATTTGAGTGATTTAGTAATTTGTTATTGAATGTTCGAGATTTGCATTAATTAACCCTAAGTCCAATAAACTAAGATGCAAGGTTGTTTGAATGAAACTTGGACTAGTATGTGGGGACATATGAGGATCAGTGTTCAAGTAACAACCTAAAAGGTCTATAGTATAGGGATAAGGTTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTATGTGATACGACCTGCTTTGTATTCGATACAGATGCATATATCCAAAGCATCCATGTGGGGGCTGGACCGAGTGGGGGCTGGGAACATAACACTACATGATGGAATTCACTTCTTCCCCTATTGGGGCAAGTAGATGAGTGTTCCCTTAAGGACTGATTTCGAGTCTTGAACAAGGGCGCTTGTCCTCTCCTAGCCCGAGAGGAACTACTGTTTATTGGTTGGACCATAAACAGATTGTTCATTAGAGGAATTAGTGGTACTTAAGGATCTAGAGGTAACCCTGGGGTGAAACGGTAATTTTACCCAACTGACATTACGAACACTTGTGAAGGATTGACTTACCAGTATTGGTCGATATCTGTGGACACATAAATATTCTATAGTGAGAAGAGTTCAACTGCGGGTCTTTAGTGGAGTGACCCACAGTTAACGAATGTTGACTAACTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTAGTCAAGTATCGTTGGAGCTTCTGATCTATAGGTCCATTAGGTCCACGTGCTAGCTCGTAAAGGGTTCTGAGGTTAATTAGTCTTGAAGATTAAGGGAATCTTAGTTAATTGTATAAGATGCAATTAATACAATGTATGGAGATACATTATAATATAAGTTTAATTATAGAATTAAACTTTATAATAAAATTAATTTTGGATGTGATTCAAAATTAAT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mRNA sequence

ATGGTGGTCCTAGGCGGCGCAGATCAGCTATCTCCAGTGAGCAAACTCGCGGACAACAAGACCATTCGCGTTTCCCAACTGTTTGGACAGTGGGTCTTTAATTTCCTGGTGGATTTGAGCGTTTCTTGTAGTGGCCTGTTGAGACTGCCTTTAGTTGGATTAACGTCTTTTGGTTCACTTCAGAGCATGTTTGGTTTGGATAAGTTATGGTTTCTTTGGATGTCTAAGTGTGTTTTCTTGCTTCCAGGTGATAGGAAAATTTGGGATTTGCCTATATGTATGTCGTTATGCTGCCGAATTTTCGGTAGCATTGCAGTTGTTAAAGGGACTAAGCTTAGAAATATCCCTTGGAATATGAAGTGCTTAATCGGCTGGCTGATTAGACTGATGGAACCAGTTTTCTTGCACGGGATTGTGCATTCTATCATTGACTGGCACGAGATCGTGCATTCCATCAGTCGACTGTTAGAGTCCAATTTTCAGGCACAAGATTGTGTGAGTGGCGAGGGCAGTGACTTGGCTAGGCTATGGGATGCAGCTGCAAATCATGTCCATAGGAGTCTAAGATCGATTGATCCTAGCCTCGACAAGGCCGAAGCTGACCCTAGCTTCATGAGGGAGTTTCACATGGGATATGCACTCCTTATTAAACAAAAAGGCGCTTGTCCTCTCCTAGCCCGAGAGGAACTACTGTTTATTGGTTGGACCATAAACAGATTGTTCATTAGAGGAATTAGTGCTCTTGCTCAGATGACCTCTGATGCAGACTTCCAGAGAATTCTTCAAATGGCAGCTTCCTCAAGAAGTGAATCACCTGCTTCTTTTGCACAAGGAGAAGACAACGAACCAGATTACTATCTGGATGATCCATATCTCGACTCACAATCCATCAGTGCAATTAAAGAAGAAGATTATGAGATCTTGAAGACGAAGATCATTGGGATCCCGCCCTCTCACTGGCCCGAGAGGGACTTTCTGTTTACTGGTTGGACCATAAACAAGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGAGCCAGAGGTCCTCACCGGAGCTTTGGAAACGATTCGGGGCTTAAACGAGCGAAACCGGAGCATTAAATCACCATTCTGCCCTTGGAGCCATCCCAGCGTCGAGACTCTTCAACCCAAGCGTCGGGACGCTGCGCAAATAAGGAAAAGACTTGGGCGTGAAGCTGAAGCAAGAGCGTCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGGTCCTAGGCGGCGCAGATCAGCTATCTCCAGTGAGCAAACTCGCGGACAACAAGACCATTCGCGTTTCCCAACTGTTTGGACAGTGGGTCTTTAATTTCCTGGTGGATTTGAGCGTTTCTTGTAGTGGCCTGTTGAGACTGCCTTTAGTTGGATTAACGTCTTTTGGTTCACTTCAGAGCATGTTTGGTTTGGATAAGTTATGGTTTCTTTGGATGTCTAAGTGTGTTTTCTTGCTTCCAGGTGATAGGAAAATTTGGGATTTGCCTATATGTATGTCGTTATGCTGCCGAATTTTCGGTAGCATTGCAGTTGTTAAAGGGACTAAGCTTAGAAATATCCCTTGGAATATGAAGTGCTTAATCGGCTGGCTGATTAGACTGATGGAACCAGTTTTCTTGCACGGGATTGTGCATTCTATCATTGACTGGCACGAGATCGTGCATTCCATCAGTCGACTGTTAGAGTCCAATTTTCAGGCACAAGATTGTGTGAGTGGCGAGGGCAGTGACTTGGCTAGGCTATGGGATGCAGCTGCAAATCATGTCCATAGGAGTCTAAGATCGATTGATCCTAGCCTCGACAAGGCCGAAGCTGACCCTAGCTTCATGAGGGAGTTTCACATGGGATATGCACTCCTTATTAAACAAAAAGGCGCTTGTCCTCTCCTAGCCCGAGAGGAACTACTGTTTATTGGTTGGACCATAAACAGATTGTTCATTAGAGGAATTAGTGCTCTTGCTCAGATGACCTCTGATGCAGACTTCCAGAGAATTCTTCAAATGGCAGCTTCCTCAAGAAGTGAATCACCTGCTTCTTTTGCACAAGGAGAAGACAACGAACCAGATTACTATCTGGATGATCCATATCTCGACTCACAATCCATCAGTGCAATTAAAGAAGAAGATTATGAGATCTTGAAGACGAAGATCATTGGGATCCCGCCCTCTCACTGGCCCGAGAGGGACTTTCTGTTTACTGGTTGGACCATAAACAAGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGAGCCAGAGGTCCTCACCGGAGCTTTGGAAACGATTCGGGGCTTAAACGAGCGAAACCGGAGCATTAAATCACCATTCTGCCCTTGGAGCCATCCCAGCGTCGAGACTCTTCAACCCAAGCGTCGGGACGCTGCGCAAATAAGGAAAAGACTTGGGCGTGAAGCTGAAGCAAGAGCGTCGTGA

Protein sequence

MVVLGGADQLSPVSKLADNKTIRVSQLFGQWVFNFLVDLSVSCSGLLRLPLVGLTSFGSLQSMFGLDKLWFLWMSKCVFLLPGDRKIWDLPICMSLCCRIFGSIAVVKGTKLRNIPWNMKCLIGWLIRLMEPVFLHGIVHSIIDWHEIVHSISRLLESNFQAQDCVSGEGSDLARLWDAAANHVHRSLRSIDPSLDKAEADPSFMREFHMGYALLIKQKGACPLLAREELLFIGWTINRLFIRGISALAQMTSDADFQRILQMAASSRSESPASFAQGEDNEPDYYLDDPYLDSQSISAIKEEDYEILKTKIIGIPPSHWPERDFLFTGWTINKLFIRGALVLKEPEVLTGALETIRGLNERNRSIKSPFCPWSHPSVETLQPKRRDAAQIRKRLGREAEARAS

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spg011107 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg011107 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg011107 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg011107 vs.


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InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 384..404

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spg011107.1	Spg011107.1	mRNA