
Spg003344 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGAACTCCACGCGAGGCGAGCAAAGGTGCAATCGGGTGAGCGCCTATTTGAAGACGCTCGCCCCAGCTACCTACGAGGCGCAGTACATGTTGGGCGCCTCGCCTCTCGCCATAGGCGCTCGCCCGGCATCGCCTCAACAACATTGGTTTGGATACCTAACACACATCTTGTGGCAATGCCATTTTCTTGTCTGTTTAATTTGTGCCTGTTTACGATACTCCCAGATTTGTCATTTCCCATCGTCTTGTTCCTCCTAGGCTCGAGCTTCTTCACCTTTTATCCAAATTCAGCAAAGGAGAACAGTCACTAATGTTTGTGAACAAAATGTGCATTAGAAAGAACAACAATAGCTGTCATTTTTGGATGGACAAACCAACAAATTCAGAAGAAATTTAGTGGGCAGTTTTAAAGCTTGGAATTTATTAAAGTGAGTTCCTAAAAACCAAACGAATTGAAATGCAGATCAATTTTCAAGAGAAAGCAATCTATCTATCTAAAGTTGAAATGAAAGCTGCACTTCACCTTCATGTTATGAAATTTTGCCCTAAACCCACCCCTATTTCCTTAACCTGTTTGGCAAAAAATTTTCCAAACATGCCCCAATTTTAAACCCACGAATTGATCCACTCAAATTTATCCCACGTGACATTTGACGTGCAATCTTTACATTGTACCTAGTGTGCCACATAAGCACTTAATTAATATAGTTCGACGGAGTTAACGACAAGGACCAATTAGATACAAAATTGATATCAACGATCTATCAGACACTTTTCAAAGTTCAGGGGTCTATTAGACACAACTTTGAAAGTTCATGGACTAAACTTGTAATTTAACCTTATATATATATATATTAAAAATGAAACTAGAGACCAATGCCTCCCTTCCTAAAGGGGAACAAAACACTATCATTCTAGGTTTATCGAAGAGGACTTCTAATATATATATATATATATATTCAACAAGAAATGAATCTTTTCATTGATCTAATGCAAAGAGACTAATGCTCAAAAGATACAAACTCCGAAATAGGGTGAAAAATAAAAACAAAAGGAACAATTACAAAGGGAAAATAAAAGCATGCCAATTAAGATAAATGTCATGAAGTGAGAAAGCACTAAAAGTCTTGGAAAGAGCATGCCATGAAGATGCTTTTAAACATGTTGAATCCAAATGGTCTGATCAAGGAAGAAGTTTATCTTCAAAAAATCACAAAATTAGGGATTTCTTGTGCAACCACTTGCGGAAGAGAATTTCATGCAACTAGTACATATATTACTAGGACATGAGTAGGGCCAAACAAATAAGAAGAATTTGATAGAGCAAGTTCCATTCCTCTACAATCCAAAGATAGATTGGGTTTTATACATATGCGAGGAAGTCAATAAAAAAGGTGGAAAAATACTCCTATGAGAGGTAGGCCTGGTCATGGTTTTATTATGAAGTTGAAAGATCTTAAAGTGAGACTTTGCTCTTGGAATAAAGAGGTTTTTGGTTGCATCACCACAAAAAGAAACCAGCTTCTGACTGAGATTTCCATCATTGATAGTAGGGAGGAAACAAGACCTTTATCCCCAACCCAAATCTCACTTCGCAGATCTATGAAAGCTGAAATCTTAAACCTTGCACCCCTTGAAGAACAAAAATGGAAACAAAAGTGTAAAAAAAGATGGATCGAAGAGGGTGACTCCAATACCAGCTTTTTCCACCGTATTCTGGCTTCCAAAAAAAGGAAAAACACTATCAATGAAGTCCTATCTTCACATGGCCAAAGCCTTCTCAATGAAAACGAGATTGTTTCAGAGTTCATAGCTTTTTTCCAAGCGTTGTATAAGGGAAAAGATAACTTGGCAGCCTTCCCAATTGGCATAGATTGAAGCTCTATCCATCATCAGTCGGCTGTGGAGCTAGAAAAAGACTTTATAGAGATCGAAGTTTGGAATGCGGTCAAGCTTCTTGGCACCGATAAATCGTCGGGTCCCGACGGTTTTTACATCCGAATTCTTCAAAAAAATGTTGGAACATCCTTAAAGAAGACATCATGAGAGTGTTCCAAGATTTTTTTAAGAATGGTATCGTCAATGCCAGCCTTAACGAGACATACATCTGCCTCATTCCAAAGAAGATTGATGCCAAATCAGTGGCTGACTACCGACCAATTAGTCTCACTACATGTCTCTATAAAATTATTGCTTGAGAGTTGAGTCTTATCAAAAAGGTTAAAAAAGGTCTTACCTTGCACTATTATAGAATACCAAGCTACCTTTGTGGAAAATAGGCAAATCCTTGATGCATCCTTTATTGCAAACAAGATTATTGATGAGTGGAACCGAAAGAAGAAAAAGGGTATGGTCATTAAACTTGATATTGAAAAAGCCTTTGACAAGGTAGATTGGAATTTCCTCGATCACATCCTTCTTGCCAAAGGATTTGTAAACAAATGGAAAATTGAAAATTTTTTCAATTGATTCCATTACCTTGAAGTTTATGATTAGTCATAATTTGAGAGGAGGAATCGTGATGTTGAGAGGGGTTTTCAAAATTGATATTTCCTAACCATTGTTTTATCATTTGTAACTTTTGAATGGTTGAAAAGATGGAAGAAGGAACAATTTTTTTTTGACCACTGAAACCCACGACTCAAGCTGCTTCTGTAAGAGACCCATGAACGACGAAGGAAGACAAGCGGCAAACAAACGAACAATCGACGACAGACGAATGGCAGATGTGCAACGGTGAATAAACAAACCCGATCCATTGCTGCGAAAGGACGAGTGGATGTGAGGTGCTCGTCGGTGAATGCCCTTGTGGAAGAAAAAAACGCGAATGCCCTGGTGGAAGAAATGCGAATGTCGATGTGCTCGTCGGTGAGTGCATCGTTGGTGTGACCTTGTTGGTGGTGTATTGTCGTAGATGTGTTGTCAGAAGAATAGCTTGCCAGTGAGATTAGAGTTTTTGACGGCTAGAGTTTATTTTAGGGTTTTGCTTTGACACCATGTGGTTTAGGGAAAAAGAATCTATTTTCTTATTTTCAAATTACAGGAAGATATATTACAAGGCAAAATACAAAAAAGGAAAGAAGTAAAATTAGAACAATATCTAATCTAAATAAAGGATGAAATAAAAATAGAATGAAATAAATCTAGAAAGATGAAGATCTAAATTGAATTACAACACTCTGAACTCAAACTCAAGAAAGCAAGCTAAATTTTTTTTTATTTATTGACAATGTAGTTCATCTCTCCCCCCCTTACTGACCATACCTCCCTTGTATATTTAACTCTAACAAATTCTTTTTATAGCGTTGGTTCTTGTACCAACGCGAGAGCTATGCATGCAGGTCTATGAAACTCTACAGAAACTAATACATCGTTATCATTGGATTGTTCCTGGTTACATAACGGGTGGTGAAAGTCGGTCAAAGGAGAAAGCCAGGTTGCGAAAAGGTAGGATATTTCTTGTTTTAATTATGGAATTACCATTTCATTGATGCAAGGTATAGCTTTGTTCTGTGACAATGATGTGTATGCTGGTCTGTTGGGGTTTTTTTGAAAAAAGTAAAAATAAAAACAATTTTATTTTATTTGTTAATTTATAAATAAGTTTTTAGCCTAACGCCCTCATAGCTATAAGTGTTAGTCATTGGATGTCGATTATTAGGGGTTATTGACTAAACTGAGCCAAATTGGAAGGATTTTTTGGTTAGTCGGTTTGTAGTTTGGCTCTTTTTTATAAACTGTGAGTTTTGGTTTGGGGTTCAAAAATCGAACGGGGCAACTTTCTTTTTTCTTTTCATTTTATTTACACTATATATTATTATTATTATTATCTTTCCAAAACTATTTATATTTTATTAGCATTCTAGGGGTCGTTAGTTAATGTTTATGTTTATTGTTTCTTGTTCCTAGTCTTTTTAGGCATACAAGCATTTTGGTAACTGTTATTGTTTCTTATTCCTCATTTTTAAGAAAAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATATCTGTGAGTGTCTGGGCCAGGTTGCACACACCTCGACTAATCTCATATAACAACTGTCTAACCCTACTACATTTGGTTGCTAGGAAACACATACCTAGGATTTAATATCGTACATGTTTCCAACAACCAAATGTAGTAGGGTTAGACAGTCGTATTCAAATTTTTGGAAACAACAAAATCAAATTTTTTTGTTTCTTGTTCTTTTTTTCCTTTTTTTTTTTTCAAGAAACATAAATGAAGCTATGTTTAAAAGATAATATTTTTTGTATTTCATTGGGTGGAGGAGAATTGAATTTATACAAGGAGCTCTCATCAAATATGCAAAAAAATTGCTATCAATCTAATCCTCTGTTTGGAACTAAGAAAGTTCAAAAAATGATTTTAAATCCTGTGATTTGAAATTCGAGAAATGATTTTAAATTATGTCTCTTTTGAATTTGGAAGATTTAAAATATATTTAAAATTTTGTGTTTGGATGGTAACAAGATAAGAAAAGAAAATGCAAAATTTACTAATATAGGCTTTTAATTTTGAGTTATTAATAGAAAATTTAAATATGATAAGATTAAATAAGTAATTTACCTTTCAATTCTATGAAATCCTGCAAAATTTGATAGTCTTAGTCAAAAAATTTTGTACGTAAAAACACAAAATTTCAAATCATTGAAAGTCTCACTTAAGGGAGCCACAAGGTTTTTCCCGTTGGAAGATTATACCTCGAAGATTTCATCAAACCTTTCTCTTTTATTGGTAGTTTTTTGTTTCAATGTGAGGCCAGTTTCACATGAAGTTTTCTTGAAACTTCTTTAGGACGGGGAAGAAGCAAGTTTTCATTAATGTCAACTATCCAAATTGCCACAACTGCTCCGCTTGAGAGAACTGTGTGGAGGAATTACTAGAGATGGTTGCCGGGGGGATTACATACATGGACAAAAATTAAGAGAACCATTTTCACTTATGAAACTTTTAAATTTTATTTTTG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BLAST of Spg003344 vs. NCBI nr
Match: BBN69274.1 (TatD related DNase [Prunus dulcis]) HSP 1 Score: 188.7 bits (478), Expect = 2.1e-43 Identity = 121/359 (33.70%), Postives = 169/359 (47.08%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. NCBI nr
Match: KAA0039950.1 (LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK24553.1 LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 4.9e-40 Identity = 99/337 (29.38%), Postives = 151/337 (44.81%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. NCBI nr
Match: KAA0044556.1 (LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 6.5e-40 Identity = 104/346 (30.06%), Postives = 158/346 (45.66%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. NCBI nr
Match: KAA0041397.1 (LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 176.8 bits (447), Expect = 8.4e-40 Identity = 104/346 (30.06%), Postives = 158/346 (45.66%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. NCBI nr
Match: RVW53692.1 (putative ribonuclease H protein [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 3.2e-39 Identity = 104/301 (34.55%), Postives = 150/301 (49.83%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XJN0 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RH17 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 3.1e-21 Identity = 59/95 (62.11%), Postives = 66/95 (69.47%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DLB9 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase 17 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=RH17 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 100.1 bits (248), Expect = 1.3e-19 Identity = 47/73 (64.38%), Postives = 64/73 (87.67%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0C2F6 (Putative ribonuclease H protein At1g65750 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g65750 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 1.7e-14 Identity = 82/331 (24.77%), Postives = 127/331 (38.37%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4WV71 (ATP-dependent RNA helicase dbp7 OS=Neosartorya fumigata (strain ATCC MYA-4609 / Af293 / CBS 101355 / FGSC A1100) OX=330879 GN=dbp7 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.3e-06 Identity = 33/87 (37.93%), Postives = 55/87 (63.22%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A1DE84 (ATP-dependent RNA helicase dbp7 OS=Neosartorya fischeri (strain ATCC 1020 / DSM 3700 / CBS 544.65 / FGSC A1164 / JCM 1740 / NRRL 181 / WB 181) OX=331117 GN=dbp7 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.3e-06 Identity = 33/87 (37.93%), Postives = 55/87 (63.22%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5H2XQW2 (TatD related DNase OS=Prunus dulcis OX=3755 GN=Prudu_862S001100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 188.7 bits (478), Expect = 1.0e-43 Identity = 121/359 (33.70%), Postives = 169/359 (47.08%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy TrEMBL
Match: M5WJ76 (Reverse transcriptase domain-containing protein (Fragment) OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_ppa015871mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 181.8 bits (460), Expect = 1.3e-41 Identity = 118/345 (34.20%), Postives = 165/345 (47.83%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T9I7 (LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold266G00980 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 2.4e-40 Identity = 99/337 (29.38%), Postives = 151/337 (44.81%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy TrEMBL
Match: M5XV38 (zf-RVT domain-containing protein OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_ppa019854mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 2.4e-40 Identity = 118/357 (33.05%), Postives = 166/357 (46.50%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TR15 (LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold46G003050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 3.1e-40 Identity = 104/346 (30.06%), Postives = 158/346 (45.66%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. TAIR 10
Match: AT2G40700.1 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 2.2e-22 Identity = 59/95 (62.11%), Postives = 66/95 (69.47%), Query Frame = 0
BLAST of Spg003344 vs. TAIR 10
Match: AT4G29090.1 (Ribonuclease H-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 51.2 bits (121), Expect = 5.0e-06 Identity = 58/226 (25.66%), Postives = 88/226 (38.94%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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