Spg001980 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGTATAATTTGATTAAGATATATACCTCAATCAAGAAATTCAATATTTGATTCCTCCCACCGACATATTGTTGAACTTAAAAAATTTAACAATAATTTGATTGGAACGTTGGTAACTAAAATCTTTCTTTTATTATTGTTATAGGTAATTCTGGACCACTCCGATGTACAAGGAGCTGACGAGGACAACAGACAGAAATAGGACTGAGAGATGGACCCCAGAGGCGAGACCGACAAGTAGGACAGGCCAAGATCGAAGGGGTCGGGCTTTTGGCCCGACCCCCTGCTCGGCCTCGGCCTTAGGCCCATGGTCGGCCTCGGCCATGGGTCGAGGTCGAGTTCTTCCGACTCCGTTCGGTCCCCACCGCCTCTGGCCGCCTCGGTTTTTCCTGGTTTGTCCCGAAACGCCTCCAAAATCCTAAAAACCCTAGGAGCATGAGCGGGTATTTATACCCCTCTTCGCCACTGAAGAATGGGATCCGAACTCTAATCTGAACTCTATTCTCTATTTTCTCCTTTTGCTCTTACTTCCCTGCTTCCCATCGTTCTGCTTGCTGACTTAAGCATCGGAGATGGTGTGGCTAGCACCACACTGGTGTGCAGGTTTACTTTCTTGCAGGCCACGTCTTCCCCCCTCTCAAACAAATTTACCGTTGGTGGCACGTGAAGGTCAGGTGAGTCCCTTGACCAAATTTGACCATCAACAATTATTATTATTTTTTTAAAAGTCACCCCAAATTACTAGGGAGCATTTTGACCATAGAAGAGTGAGGATTTATTTATTGGGATAACTACATGGTTAACCTATAAATGAGGCCTATATTTCATTTTTGTCCAAAGCAACTATCTTTTTCACAAATAGCCAAAAATCCTAGAGTTTTTACATAAAAGTTGTGACTCAATTACTTTTATGCCCTCTTCCATTATTTTTATATTTAAAAAACAACAAAAATCATAAAAGGAAGTTTTTATTCCTTCTTATTCAAAATTCATAACCCATTTAATTCATTTTCCATAAAATGTCATCTTCCACAATTTTATATTTAAAAAAGAAAAAAAAATCATAAAAGGAAGTTTTTTATTCATTCCTATTCAAAATTCCAAACCCATTTAATTCATTTTCCATAATTTTCCATAGTTTTTTTTTATTATTTTTAATATCCCTTGTCAACAACCATGAAGTTTTTGTTTTGTTTTTAAATCTTTTTCATTTGCTGTCTTTTTTTTTTTCCATCAATTCAAACAAACATTTTTTGTTTTGTTTGTTATATTTTCCATTGTTAAAGATTTTTTTTTAATGAATTCTTTTATAGGTTTTCTAAGAAAAGTCTTTAATCAAATATTAAATAATTGTGTAGTTTGATTTTTTTTTATTTTATATATAATGGTTTATTTTTTCATATTGAATTACCATAATTTCATGGCGTATGTTTTACCATACATAATGGTAAATATATACTATAAACTTTTATATATATATATATACAAAATGCAACTTAATTTTATTTAATTTTCTTTTCTCTCTCTATTTTATATATGTGATGATTTTTTTTTTTCATATTTATCATCATGTTCTGATAGTTTATGTTTTACAATATATAGTGATAAATATATACTAAGTTAATTTTTCATACAAAATGGTTACTAGCATATATACCAGGTTTATGCTCGACAGTATAGAAAATCCTAGCTTGATGTTTGTTAGATAGAGAAACTCTTTCCTTTTGGAGTAGAAGCAAAATCGTGTAGAATGGTTATGGGGTTATTTCAAATAAACAAGTACCTGTATGTATGTATGTATGTATGTATATATATATATATAGGGGTATATTTAATAATATGTGGTATATATTTTGTATAAACCTTTCACACATACTGAATAAATATTTACAAGTAACACGATGGTGGTGATGCAAGAATATATTGATAATATATTTGTAAATAACTAAATATATCGAGTGTATATGATGAAATCTATAATAGATAGAATACATATTTCAATAAAAATGGAATGATATATATAAACGTAGTATATGTGTTGGATTATATTAATTTAAAATTATCATTTATGTTGTTGTGTTCGATACTATATATGACAAAAAAAAAAAACCCAATATATGTGACTACAATGGGTAAAATGAAAATTTTGTATACGTGGTATATATGAAGTTGTACATGAATGTCAAAATGAAAGTAAATGTATTAAAAAAAAAAACTTTTTTTAAAGGACATGTGTTATAAAATAATAGTCATGTTTGCCTAAAATGAAAATAAGTATTTTTAGAAGAAGTGTGAATGATAAAAGGAATGAAAACTGACCAAATAAAATTCGTAGCTAGCGAAATAAATGAAAAATCGACCGGAACAATTGCAAAACGTGAAAAATGAAGAAAAACAGAGAAATCAAAGGATGACCGACAATGTAAAATTGTTGAAAAATTGAAAATGGTTAAAATTGTGAAACAATTTAAATAATAATAAAATTACAAATTGGTAAAATTCTGCAAAGAAAATGGGAGAAAAACACTAAAACTAAATTGGAGATTAAAATAGGAGAGAACTAATTTCGAAAATCGTGGACAATCAAATTAATTAAGAAAAAATTAAATAAAATATATAAGGATTGTTTTGATAATAAATATTGATATTAGTTGTCATATAATAATTATTATATGTAATTTGGGAAAAAATGAAATGAAACAGCTTATTAATTGTGGAGAGATAAACATAAATAGGGACACAATGGTAAGAAAATTTACCTTAAATCTACCTATGAAAATTTTCAAATACTTTGACATTTATGAAAATATAATCTTAAAACCACCTTTTTTGACACAATTTATATTATATTTTTGGGCCTTAGCAAGCCTAGAAGGAAATGGGTCATTCCAATTGGATCTCTAACGTCCTCAATCCGCACTATTTCAAATTACAAAAATTATGTCATATAGTCCCTTTCATAACCTATATTTCACAAATGTTAATTTTTTTTGGGAAAAAAAAAAAGTTTAGTTTGGGTTGAGTTTTGTTTCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCATTTCTTTCTTATGATTTTACCATCATCTAATATTATACCTCTTTATTTTAATTCTCCATTTAAAATTTATTCTTTACTAATATACATATTTTCATTTAGGGCAATGAGGTGGACACAAAGAGGGCCAACGAGACAAAGGAGGGAGACGAGAGAGGAAGGTGTTTTATTTTTTTTCTTTTCTAACTAAACAATTGTGAGGTGGAAGGTTTAACCATTGACATTGGGATGATAATTGGTGCATCTACTAAGCTATGTTTGGACGGATAAAAGAGGAAGATGTTTTGTTTTTTTTTATGCACGATTTGCCAACTGCAAGTGTACGGGCTAAGTTATAATATAGTGATTTGTTAGATCGAATGTCGTCCTCTGGATTGGGTTTCTAATTAAATTAATTACCACAAATACTTATGTCCAATTTTATCTAGGGAACAAACTTTAGTGAGAATGAATGGAAAACAAACACAAAGCTAAAAGTATGGAAATCAAATGATGGAAAACTCTTAGGGAGTTGATTTCACCAATTGAAATTATGAATTAATTAATGGATGATTTAACATGCTATGTTTCTTAAATCTATGAATACTTAAATCATATTTATCTCTCCCGAGCATAAATAATTCTCTCACATGCAATGAATTCAATATCCCTATCTAAACTCATTAACATGCAAGGCCTTAAGTCTAATCCCTTTTAACGATTTCTAAGATTATCTTAAATCTCCCGATCTTAAGACTATCCTAGTTATGCATAACGAGATCTAAGCTAAACCCCCTCTTCCGAGCAAGATTTAGACAAAACATCATTCAATTCATGGCCAATAAATTGAAAGCATTAAGGAAAGTCTATGCATAAATGAAAGCATAACATACATCCATAATCAATCCATTACGCCCAAAGGGCTACATCAATCCCTAAGATAATAAACTTAGCTACTCATACACGGCGTTACGATATAAACTAAGTCTGAAACAACCGTTAAAACCATTAAAGTAAAGAGAGATAGGAGATTAAACACTACGGTCGCCGAAAACTGCACGTCCCCGTCACGAGCTCCCAGGAACCTAGCCTTGAATCTCGCTCCTCTAACTTGCTTCAGCTCCCACAGAAGGTCTTTAGTCGAGTTTAGGCTAAAATTGCATCCCCAGAAGTCCCCCTTGGCCAGCCCTATTCGCATAGTATTTATAGGAAATCTGTCGACAGCGTCGAGACGCTATAGGCAGCGTCGCGACGCTGTCCCATTACCGCGCATTCTGTTTAAGGGAAAATCGAGAGCGTCGAGATGCTATTGTCACAGCGTCTCGACGTTGTGACCTTCTGCCGCCGAAATCAATTAAGGAAACTACTAGCGTCGAGACACCCAGAGAGTAGCGTCTCGACACTAGCTCTCAGACTTGTCTTCTTTTAAAAGTCTCCCACTTGATTCTTTTTTGTTCCTTTAGTCTCTTTTCGTGTCCCAATCACTCGATTAACTTCATTTTCTCGATTTAGCTCTAATAATTGATTCCTACAAATAAAACATTAAAATGCATAAATTTGGCCAATTTAATATCAAAGACTAACTAAAATAGATAGGGAAAAATAGCTTGCTCCGCTCGCTATCATTTTTCTTTTCTAATAAAACAATTGTGAGGTGAAAGATTTAACCATTGACCTTGAAATGATAATTGGTGCATCCACTAAGTTAGGTTCGAATTGACAAAAGAATAAGATGTTGATGTGACAATATGTGTAATTTTTAATATTTTATTTAGCTACATAAATATGATGATAATAAGGACATTTTTTTTCATTAATATTGATATTTTAAAAAAAAAATTATTAAAATATAGTGGTTTTGAAACTTATTATATTAATATTGTTGTTTTAATTCCTGATAGCATGTCTTCTCTTGAAGAGACGACATGTACCACGTGACAGGCGATCTTC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ATGGCATCTTCTGGTATGGGTCCAGTTGGAAAACCCAGTAGTGGTGTTGCATTATTTGCTGATAAACTTCCGGAGGAGATTAATGAAATGAAGATCAGAGATGAGAAGGTTGAAAAGGAGATGGAAGCGACAGTGGTTGATGGAAATGGTACAGAAACTGGACATATAATTGTAACTACCATTGGTGGTCGAAATGGTCAACCCAAACAGGTGAACATTCTAAAACTTGCTGCTTTTGAAATTCCCTCAACGATAAGTTACATGGCAGAGCGTACAGTTGGGCAGGGATCCTTCGGTATTGTATTTCAGGCTAAGTGCCTTGAGACTGGAGAAACTGTTGCTATCAAGAAGGTTCTTCAGGATAAGAGATATAAGAACCGTGAGTTGCAAACAATGCGCCTTCTTGATCATCCTAATGTTGTTTCTCTCAAACACTGCTTTTTTTCCACAACGGAAAAGGATGAGCTTTATCTTAATCTGGTGCTTGAGTATGTACCTGAGACAGTTTACCGGGTAATAAAGCACTACACAAAGGCAAATCAGCGGATGCCTCTCATATATGTCAAGCTTTATGCCTATCAGGTGGTTATCTATACTGTTTCTAAGATTTGTAGAGCTCTAGCCTACATTCATGGAGGAATAGGAGTATGCCATAGGGATATTAAGCCGCAGAATCTACTGGTCAATCCCCATACTCATCAGGTCAAGCTATGCGATTTTGGAAGTGCAAAAGTTCTGGTGAAAGGCGAGCCAAATATATCATATATTTGTTCTCGTTATTATCGAGCACCTGAACTAATATTTGGGGCCACTGAATACACTACCGCAATTGATATATGGTCTGCAGGCTGCGTTCTTGCCGAGTTACTTCTTGGACAGCCTCTCTTTCCTGGTGAGAGTGGCGTGGATCAGCTTGTTGAGATAATCAAGGTACTTGGAACTCCTACCCGTGAAGAAATCAAGTGTATGAACCCAAATTATACGGAGTTTAAATTCCCACAAATCAAGGCTCATCCCTGGCACAAGATATTTCACAAGCGCATGCCCCCGGAAGCAGTGGATCTTGTCTCAAGACTCCTCCAGTATTCTCCAAACCTTAGATGCACTGCTTTAGAGGCCTGTGTCCATCCCTTCTTTGATGAACTTCGGGATCCCAATACTCGTCTTCCAAATGGGCGCCCCCTGCCTCCTCTCTTCAACTTCAAACCCCAAGAGCTGAAAGGTGCAACTTTGGAGCTCCTCTCTAAACTCATTCCGGAACATGCTCGGAAGCAGTGTCCTTTCCTTGATTTTTAG MASSGMGPVGKPSSGVALFADKLPEEINEMKIRDEKVEKEMEATVVDGNGTETGHIIVTTIGGRNGQPKQVNILKLAAFEIPSTISYMAERTVGQGSFGIVFQAKCLETGETVAIKKVLQDKRYKNRELQTMRLLDHPNVVSLKHCFFSTTEKDELYLNLVLEYVPETVYRVIKHYTKANQRMPLIYVKLYAYQVVIYTVSKICRALAYIHGGIGVCHRDIKPQNLLVNPHTHQVKLCDFGSAKVLVKGEPNISYICSRYYRAPELIFGATEYTTAIDIWSAGCVLAELLLGQPLFPGESGVDQLVEIIKVLGTPTREEIKCMNPNYTEFKFPQIKAHPWHKIFHKRMPPEAVDLVSRLLQYSPNLRCTALEACVHPFFDELRDPNTRLPNGRPLPPLFNFKPQELKGATLELLSKLIPEHARKQCPFLDF Homology
BLAST of Spg001980 vs. NCBI nr
Match: XP_038903828.1 (shaggy-related protein kinase epsilon [Benincasa hispida] >XP_038903829.1 shaggy-related protein kinase epsilon [Benincasa hispida] >XP_038903830.1 shaggy-related protein kinase epsilon [Benincasa hispida] >XP_038903831.1 shaggy-related protein kinase epsilon [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 3.8e-232 Identity = 404/431 (93.74%), Postives = 406/431 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. NCBI nr
Match: XP_008443540.1 (PREDICTED: shaggy-related protein kinase epsilon [Cucumis melo] >KAA0053654.1 shaggy-related protein kinase epsilon [Cucumis melo var. makuwa] >TYK00825.1 shaggy-related protein kinase epsilon [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 3.8e-232 Identity = 404/431 (93.74%), Postives = 406/431 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. NCBI nr
Match: XP_022152169.1 (shaggy-related protein kinase epsilon [Momordica charantia] >XP_022152170.1 shaggy-related protein kinase epsilon [Momordica charantia] >XP_022152171.1 shaggy-related protein kinase epsilon [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 8.5e-232 Identity = 405/431 (93.97%), Postives = 407/431 (94.43%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. NCBI nr
Match: XP_022928202.1 (shaggy-related protein kinase epsilon [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 813.1 bits (2099), Expect = 1.1e-231 Identity = 403/431 (93.50%), Postives = 405/431 (93.97%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. NCBI nr
Match: XP_004141099.2 (shaggy-related protein kinase epsilon [Cucumis sativus] >KGN59685.1 hypothetical protein Csa_002367 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 812.4 bits (2097), Expect = 1.9e-231 Identity = 403/431 (93.50%), Postives = 405/431 (93.97%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VZD5 (Shaggy-related protein kinase epsilon OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASK5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 737.3 bits (1902), Expect = 1.0e-211 Identity = 370/432 (85.65%), Postives = 384/432 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P43288 (Shaggy-related protein kinase alpha OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASK1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 719.5 bits (1856), Expect = 2.2e-206 Identity = 360/429 (83.92%), Postives = 377/429 (87.88%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P43289 (Shaggy-related protein kinase gamma OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASK3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 712.2 bits (1837), Expect = 3.5e-204 Identity = 354/431 (82.13%), Postives = 379/431 (87.94%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q40518 (Shaggy-related protein kinase NtK-1 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=NTK-1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 708.4 bits (1827), Expect = 5.1e-203 Identity = 356/431 (82.60%), Postives = 374/431 (86.77%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P51139 (Glycogen synthase kinase-3 homolog MsK-3 OS=Medicago sativa OX=3879 GN=MSK-3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 705.7 bits (1820), Expect = 3.3e-202 Identity = 355/431 (82.37%), Postives = 376/431 (87.24%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UEK5 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1545G00260 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 1.8e-232 Identity = 404/431 (93.74%), Postives = 406/431 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B917 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487105 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 1.8e-232 Identity = 404/431 (93.74%), Postives = 406/431 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DD64 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019956 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 4.1e-232 Identity = 405/431 (93.97%), Postives = 407/431 (94.43%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EJ87 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435100 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 813.1 bits (2099), Expect = 5.4e-232 Identity = 403/431 (93.50%), Postives = 405/431 (93.97%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LCE4 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G838640 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 812.4 bits (2097), Expect = 9.2e-232 Identity = 403/431 (93.50%), Postives = 405/431 (93.97%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. TAIR 10
Match: AT5G14640.1 (shaggy-like kinase 13 ) HSP 1 Score: 737.3 bits (1902), Expect = 7.2e-213 Identity = 370/432 (85.65%), Postives = 384/432 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. TAIR 10
Match: AT5G26751.1 (shaggy-related kinase 11 ) HSP 1 Score: 719.5 bits (1856), Expect = 1.6e-207 Identity = 360/429 (83.92%), Postives = 377/429 (87.88%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. TAIR 10
Match: AT3G05840.2 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 712.2 bits (1837), Expect = 2.5e-205 Identity = 354/431 (82.13%), Postives = 379/431 (87.94%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. TAIR 10
Match: AT3G05840.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 712.2 bits (1837), Expect = 2.5e-205 Identity = 354/431 (82.13%), Postives = 379/431 (87.94%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001980 vs. TAIR 10
Match: AT4G00720.1 (shaggy-like protein kinase 32 ) HSP 1 Score: 643.3 bits (1658), Expect = 1.4e-184 Identity = 312/407 (76.66%), Postives = 345/407 (84.77%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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