Spg001888 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg001888
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold10: 1278388 .. 1283006 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg001888
SyntenySpg001888
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GATGACTACTTCCCGTCGGCAGAAAAGTTTTGTTTTGTTTTTCTTCTTCTTCACACCACCTCCGTCGTTCTCTCAGTTTTTTTTGTTAACATTTTCCTCTTCTTCCATTTCCTTCCTTTCTTCTTCACTTTCCCATTTTCCTTCCACCTTTCCCTTTCGTCGGAGCCGTTGGATAAGAATGTCCCTGTCGAGCTCGTGGCCGCGAGTTGCTCGAGCGAGTTCGTGAGGAGAAGGGGAGGCGATGTTCCAGATTTGAGCTGCTCCAATGAGTTTGACGACGACGTTCTAGATCTGAGCTACTCCAGCGAGCTCGACGACAACATTCCAGATATGAGGAGAAGGGAAAAGGCTTCACCGGCGTTCAGATCTGACGAGTCCCATGCTTGTTGGGGTCCCGAATCTCGGTCGCGAACTTCCCCCACAACCACCGGCTTACCCCCTATAATCTCGACTGCGAACTTCTCTCAGGGACCGTTTGGTACAAGGTTTTTTGAGATGAGAATGGACAAGGGTTTCTAATACCCTTGTTTGTTTCAAGATTTCTGTGGTGGGTTCAGGAAATAACGCATTCCCAGGCATCATTTATGCCCATAAGCAAGGGCTTTCTATGCCCTTGCAAAAGCATTGGTTTTCTCTTTTCCCATCTCTTCTTTTTTATTTTTATATGCAATTTTATTTTGAATATAGTTAATTAATTAAATAATGGATACTAAATTAAAAATAATATAATAAATTATTTAATTAGATTAAATAATAATTTGTCAAGAATTTCAATTTTTTTTAAACAAATACTTTTTTTAGGACTTTTAAACAAATACTTAGTCCAAGTTTATTAAAGGGATGTAATTCCATATTTACTAAAATTATAATTAATTAGTTAATATTATCGAAAATATATTTAATTATTGAATTAAAATCATTTAAATGATTTAGTATAAAAATTCATTTTTCAATAATTATAATTAATTACTTATCGATTATTTATAATCAATTAATTACTTTTTTGGATTTCATTATAATAAACAAATAATCATATTATTATTAAATATTTATCTAATTAATTTTTATGGATACAATATATTAAATTATTGTAGTTAAAGATATTTATTAAAAAATTAGTTAAATAATTTTAATTTGTTAAAGTAACATAGTTTATCCCATTAAATTTATTTCATGATTATTATTTCATTAATTTTTATTAATAGTTTGAATTAATTTTGGTTATTTTATTGATTAATTTATTAAAATTACATAAAGTTTACCTGATTAATTCTAAAAAATAAATACAAACATAATTTGTTCTCATAAAATCCTGATGAGATTTCCATGCACAACCAAACACAGTTATCTTTGATTCCCAGCAATCTTATTCCCAGGCATCATGTATTCTCAGGTATATATAAAACCTTAAACCAAACGGGCCCTCAAAGTGGGGGTTTTAGAGAGACAGAGAATGAGGGGTTTTGGAGGGAACAAAACAGAGAAAGAGAAAGAGGAAAGTGAGGTTGAAGAAGAGGAGAAAGGATAAAGGAAGGAGAAAAGAAGTGAGTTTCATCTCCTCTATTTTTTGACAAGTTTTTGTGGCATGAGTTTTTAAGTTCCTTGAGGTTCCAACAATTCCAGTGTTTCCGGCGAGAAAGAAGAAGAAAGGAAGAATAAGAAAAAAAGAAATGAGGAAGAAGAAAAGGGAAAGAGAAAAAAAAGAAAAAAAAAAAAATGTTGGCGGCCGACGACAACAATGGGGGTGGTGATGGTGGTTAAGAAGAAGGAGAAGGTAAGGAAAATGGAAGGGAAAATGAAATTTAAAAAAAAAAATTAAAATTTTATTATTATTTTGTTTTTAAAAATTAAAAAATATAATTTGTTTAATAAAAAAATGGTGCCACGTCTGCAAACTGTTGATTTAACGAAATCCAAACCTCAAGTGGATGGAGGAACCAAAATGAAACCTAGCCCAAACTTCAGGGACCAAAAATGTATTTCCCCCTTTTTCATTTATCCTAGTTGTCAATATTCCCTAAATTTCGGTATGTGGCCAAGTATTTTTCTTTTTTTAAACTTTCAATTTTATGTTTGATAGATCTTTGTCATATTAGACATTTTTTAAATTTAATCAATTTGTTTAGACGTAAAAGTGAATTTTGGGTCTAAAACGTAATTCTGTTAGACACAAAATTGAAAGTTTAGAGATCTGTTAAATAAAAATAATAAAAATAAAAGAAACAAAATTTATAGATGTGAAATTTATTGGATAAAAAATTAGATTTTTTTTTTTTTTGAGTAATAACGGAGAGATTGTATTAAAATGATAGAATTTCCCTAGGGGACACAAAGAAGTCCTACTCAACATGAGCAAGCCTTACTATCCATTCTGGATAGTTTGAATACCACAATTGTGGTATAAAAAATGAGAACTCAAAACATATTAGATGCTTTTTAATGTTTAAGTACCTATTTTATTAGACATTAACGTGACGTGAAAGTTTATGATTTAAACTTATTTAAACCAAAAAAGAGGGATTTGAAAAGAAAAAAAGAAAAAAAAACATTTGCTATTAGGGATTGGGAACACTCAATAATTATTTTCCTTCTCATTTTAATTGGTTTCAAAATAAAACTACTTCACATTAATATATTCGTATAAATATCCAATAATCTTTATTCAATATTCATAAATTTGAGAAAAATACTCTTAAGGTTTTTCAGCCCAATTTGATAATTATTTGGTGGTTGGTTTTTTAAAATTAGGATTGTTTTCGTCCAATTTTCTTACCATAATTTCCATGGTTGTTAAGGACACATTTGAGTTCCTAGTCAAATTTAAAAAAAAAAAAAGATTGAAAACTATTTTTTTTTAATCTTAAAAAAATTAGCTTGGTTTTTTAAACATGAAAGAAGGTAGATACAAAATAGGGAAAATACACTTTTAGTCCATGAAGTTTGGATTAGGTTTCATTTTGGTTCTTGAGTTTTCAAATTCAACAATTTAGCCCATGAGGTTTGGTTTTAGTTTCATTTTGGTCCCTCCATCCAATTTTCCGTTAATAATTAATGGATTGCTAACGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTATTAAAAATATTATTTTTTAAGTTTTTTTTTTGGGAAAAAATCATTTTTAACCCTAAACTTTGGGGGTTGTATCAATTTTAACCCTGAACTTTCAATTTCATCAAATTGAACCCTAAACTTACCAAGTTGTATCATTTTTAACCCTGAACTTTTAATTTCATCAAACTGAACCTCAAACTTATCATATCGTATCGATTTTAACCCCAAACTTGCATAAGTGTTATAATGTATACCTTCGTTTGAACCACCGTACGTAATTGATTATTTCTTCATTTTTTTTCTTAATTCACATTGCACCTGAATTAGTTTCTTGAAAATAAAATAATGGCGAAACTTGATTTTATATGACTTTTTCTTGTTGTTGAGAATTTTGTGAGAGCTTTTTTGCTGCTATCTAAGATTACGAAAGCAAATAAACTTTTGAGGTTTTTTATCTTTAAATATTTGCTAGTTTTTTTGTTGTTGCTAAGAACTTTGTGTGATTATTTTTATTCTTTTACTGTTTTTTTTTTTCTTACTAATTAGAATACTGTACAAATGTAGGAAACAAAAATAAAGAAATTTCGAGTTTTTTATTTCTCATATTTGTTGGATTTTTCTTGTTGCCAATAACTTAGTGATTTTTTTTTTTTTGGATAATAATGAGAAGAATGGTATGAGATATTTGATTTCTTTTGATAAAGAGTTTTTCCAATAATGTTTTTACAAAATACTAACTCAGGTGCAATGTGAATAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATTTTCAATTACATGTTTTAATAGCAATTCAAATGAAAAGTTGACTAAAGGTTTACATTGCAACATTTATGCAAGTTTGAGGTTCAAATTGATACAATTTGTTAAGTTTAGGGTTCAAATTGATGAAATTGAAAGTTTAGGGTTAAAATTGATACAACATGCTAAGTTTAGGGGTCAAAATTGATTTTTTCCCTTTTTTTTTTTTTAAATATAAATATAATAAAATAATAAAAATATTGTTATTTTATAATTTTCTTTTCCCCTGTCTTTCTTTTTCTTCTCCACCCAACTCCTCCTTCTTCAACACCCAACTCAGACGGTTGCTGCTTCTTCAACACTGGCTGGCAGTGGCCGACGGCCGACCTCTGTTGGCGATTTTTTTTTTCATGTCTTCCTTTCTTCTATTTTCTTTTCATATCTTCATTTTCTTTCTTTCTTCCACGGACATCCCCGCTGCACCCTCGCCGTCATTCCCCTTTTCTTCTTCATTCTCGTTTCATTTTTTTTCCTACAGACCTAGAACTCCGCGGCGTTCCAACGAGTTCAACGTCTGGCGGCACTCCAGCTCCAACGGCGTTTCAGATCTGGCGATGACGACGAAGAAGAAAACACCCTCGCACCAGTCATTTCTCCTCCCCTTTTCTTCTTCAGTGATTTCTCTGTGACTGGACGAGGAAAGGTCAAATCTGAAATGCTGGATAAAGAAGGGTCAGACCGAAGGGGATTTCAGACCGTCGTCGTCGTCAGATCTGAAAGGCCGCTGGAGCTGGAGCGCCGCTAG

mRNA sequence

GATGACTACTTCCCGTCGGCAGAAAAGTTTTGTTTTGTTTTTCTTCTTCTTCACACCACCTCCGTCGTTCTCTCAGTTTTTTTTGTTAACATTTTCCTCTTCTTCCATTTCCTTCCTTTCTTCTTCACTTTCCCATTTTCCTTCCACCTTTCCCTTTCGTCGGAGCCGTTGGATAAGAATGTCCCTGTCGAGCTCGTGGCCGCGAGTTGCTCGAGCGAGTTCGTGAGGAGAAGGGGAGGCGATGTTCCAGATTTGAGCTGCTCCAATGAGTTTGACGACGACGTTCTAGATCTGAGCTACTCCAGCGAGCTCGACGACAACATTCCAGATATGAGGAGAAGGGAAAAGGCTTCACCGGCGTTCAGATCTGACGAGTCCCATGCTTGTTGGGGTCCCGAATCTCGGTCGCGAACTTCCCCCACAACCACCGGCTTACCCCCTATAATCTCGACTGCGAACTTCTCTCAGGGACCGTTTGGAAATAACGCATTCCCAGGCATCATTTATGCCCATAAGCAAGGGCTTTCTATGCCCTTGCAAAAGCATTGA

Coding sequence (CDS)

GATGACTACTTCCCGTCGGCAGAAAAGTTTTGTTTTGTTTTTCTTCTTCTTCACACCACCTCCGTCGTTCTCTCAGTTTTTTTTGTTAACATTTTCCTCTTCTTCCATTTCCTTCCTTTCTTCTTCACTTTCCCATTTTCCTTCCACCTTTCCCTTTCGTCGGAGCCGTTGGATAAGAATGTCCCTGTCGAGCTCGTGGCCGCGAGTTGCTCGAGCGAGTTCGTGAGGAGAAGGGGAGGCGATGTTCCAGATTTGAGCTGCTCCAATGAGTTTGACGACGACGTTCTAGATCTGAGCTACTCCAGCGAGCTCGACGACAACATTCCAGATATGAGGAGAAGGGAAAAGGCTTCACCGGCGTTCAGATCTGACGAGTCCCATGCTTGTTGGGGTCCCGAATCTCGGTCGCGAACTTCCCCCACAACCACCGGCTTACCCCCTATAATCTCGACTGCGAACTTCTCTCAGGGACCGTTTGGAAATAACGCATTCCCAGGCATCATTTATGCCCATAAGCAAGGGCTTTCTATGCCCTTGCAAAAGCATTGA

Protein sequence

DDYFPSAEKFCFVFLLLHTTSVVLSVFFVNIFLFFHFLPFFFTFPFSFHLSLSSEPLDKNVPVELVAASCSSEFVRRRGGDVPDLSCSNEFDDDVLDLSYSSELDDNIPDMRRREKASPAFRSDESHACWGPESRSRTSPTTTGLPPIISTANFSQGPFGNNAFPGIIYAHKQGLSMPLQKH
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 116..145

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg001888.1Spg001888.1mRNA