Sgr016857 (gene) Monk fruit (Qingpiguo) v1

Overview
NameSgr016857
Typegene
OrganismSiraitia grosvenorii (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
Descriptionagamous-like MADS-box protein AGL12
Locationtig00153010: 2080834 .. 2090191 (-)
RNA-Seq ExpressionSgr016857
SyntenySgr016857
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AACCATGCAAGGGCTTATTGAAAGGTACATGAAGCACACCAATCAGACTCAGCCACCAGACCCACCGATTGAAAACCAAGCTCTGGTACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTAAAGGGGTGGTGGAGATTCGAACGCAGACTTGAAGTTTGATTAGTTGAGCTACAAGTCGGGAAAAATAAAACCCAAATTATAATCCTTAAAGACTGTTTTAAAAGACAAAAATACACAGAAAAGCATCTTCTAAACAAGTCTATAGTCTTTTAAGTAGATTTGTTAAAGAAGTGGTAGGCTGCATCTGAATCTGGTTCTATATATATATTCTCAAGAATCCCATTAATGTGAATTCAGGCCATTGGATTATAAAATGAGAGATTGTTCAAATTTTCATCCCCATAAAATAGATTAAGTAGCATAAAAAAATCAAATAATAAAAAATTGAATTTAAAGTAATTGTAGTAGTGGTTTTTTCAGAAGCATGTTTTTGGTTTTGAATTTAGTTCATGAATTAAAAGGTGTTTTTAGAGAGTATAAAACATAAAATAAGGAAATTATTAATAAAAACCTAAAACTTTTTAACAAAAAGTTTTCAAAGAAACCTTAATTATTTAAAAAGTACATTGGTTTAGTTAATTAATGAATAGGTTTGAAAATGATCGCTGAACATTAGCTAAATATATATAATTTTGTTCTCAATTTCATCTATAATCTTTTGAAGTTTTAATTTTATTCTTTATATATTCAGTTTTTAATCATTCTTATTGTTAGAGTGAATTTTGAAATGACTTTTGAAAGTGGTGTTTTTAAGTAAAGTACTATGGAAAGAAGCACAAATTAAGTGCTTTCCTAAAAGCAATTTAATTTTTTAAATTACTTTTTACAATATAACCAAACACAATGAAGAATTTAAAAAGTATTTTTATTGGTTAAAAGTACTTTTCTCTATTTCAATGTCATTTTAAATTCATTTGCAATAAACAAAAAAATAATAATTTGTGTGAAAATCATATTTTTTAGTAAGAAGGCCCATTGTTAGCATGAAAATGTTTTTAGTGAGTTTAATAGGGATTGAAGGAATCAATTTTGAGTCACGTAACATAATATAGTTTGAGTTATGCAAAATGCGAATTTTTTTCAATTTTATAAATAGATATATCTAACTCATTAAATTAAAATATGCGTAATTTTAATTTAGTTAATAAAATTTATTTTAATATTATATTATCATCTCACTAATGAATTTTGATGTTTGATGATAAGAATTTTGATGTTTGATGATAATAAGAATGTGATTAAAATATTTAATGCATAAAACATGAAATTAAAACTCTTAAGAAAATTATAGCTGAAAATTGAAAAATGATACAAATATTAAAAATAAAATTATATATTTGGCTAAAATGTTAATTGTGAACATTGTGATCCCTAGAATTAGCAAATATTCAAAACAATTTTGGATTACAAATTAATTTACAATATTTTTTTTTCACAATTTAATTTAATTTATAATACTTGTACAATATGCTACTAGCATCAAAAGTACAATTATTTTTTTTAGTTCAATAATTGAGAGGTGGGCGATCCAACTTTTAACCTTTAGAGAGGTTACTAGATATCTTAATCAATTGAACTATGTTCGATTTAGCAGAACAATTTAATTGTTAAGATGTGGATAAGTCGTTGCAACATATGAATAAACTTATATATTGGCATGCAAGTACAATAGCCACGATTATTTTAATGAAACAAAAAGAAAAAAGATAATTATTAAGTGAAATCGTTGACATTTTATTAAAAAAATTTGGGTGGTTTTTTAAGTTCCACTTAATAACCGTTACCTATTTTTAAAAAGCAAAGAATAGTTCTCTAATGTGAAAAAAATGAAAAACCTGTTTAATAACAATTTTTTATTTTTTATTTAAAAATTATGTTTGTTCATTAATTTTTTGTTTTAGGAAAACTCAATTTTTACCCTTGAACTTAAGTGGGTAAGTCAATTTTAACCTTAAACTTTCACTTTCGTTTTAATTTAAACCATGAACTTAAATAAGTTGATACAATTAATAGTAATGCCCTCAATTAGTTAAGTTTCTATTTTTCTAAAGATTGTAGTCCTTAGATTAAATTATTTTTGTAGGTATTGGTTCTTTTAATTGTGTTGGATACTTTTATTTGGTTGGATTTGAGCATTTTATTGTTAAGTTGAACGTTTTTTATTTGCTTGATTTTTTTATTAAGTTCGAGTATTTTCGTGATTGGATTTAGGTATTTCTTTGTCATGATCTTGAGTGTTTAGTTTGTTGAATGTTGTATGATTTGTTGATCGGTTCATAGACAATATTTAAATTTAGTTTTGAGAATGTATAAATTTCAACATTTATTCAAGTTTAGGTTTAAATTGATGAAATTAAAAGTTTAAAGCTAAAAATTGACGCACTCACCTAAGTTTAGGGGTAAATTTTGAATTTTTCCCCAATTGTTTTTTATAATCTACTTTTGATGATGTTTTTCAAATTCTAGGAAAATTTTAATACTGGAGAAGAAATAATTTTCAAAAATATGTTTGGAAAAAAATTTTATTTTTAACCTTTTACTTAGCTTAGTGAGTTAATTTTTAACCTTAAATTATTTTCAATGGCACCAAATTGAATCCTAGACTTAAATAACTAGTGCAAATAATTCCTCAACAAAATCAAATTAAAAACTTGCTCTTAAACCAACCAATAAATCACACAATATTCAATCAATATGATACTTAAAATCAAGTCATAAAAATACTCAAACTTAACTACAAAAATAGCTAAATATAGCTAGAAAATTAAGCATCTAAGAAGCACTCAAACTCAATACTAAAGTGCTCAAGTCCAACTAAAATGCATCCACCACAATTAGAAAAACTGGTGCCTACATGAATAGTCTTGGCCAACCACAAAATCGTCAACAACTATCCATAAATCTTTAGAAAAATGAAAACTCAATTAATATTAGATGGTATTAATTTTACCACATATTTAAGTTTATATTTCAATTTAATAAAACCAAAATTTTAAAGTTAAATATAATTCACTCAGCCAAGTTTACAGTAACAAAGAAATTTTTTCCATCTATTTTTTATTTTATAATTTAGCTAAGATATCAAATGCATTTTAAAAAGAGTGAAAACGTAAACAAAGAATTAATAGTATTAAACTTAATTTCTAAAAATAGTTTATTATTTAAAAAAAAAGTTAGGTTATTATTTGAAAATAAAAGTTTCACACTACTTTCTAATTTATTTTTAGTAATGAAACATTTTACATACATTTAAAGAATGCATAAGTTTATGGAGAGATTGAACTTTAAATATTCTACTTTAATACCATTATTTTATTTTATTTTTTGATAAATACTTTAATATCATTATTGTTATGCATCTTGACTAAAGTTATATATATTTATGTGGCTATATCTAGGAAGCAAAGGAGGAGGTCAACAGGCTGAAACAAGAAATTGAAGTCCAAAAGGGTCTCAGGTATGACATGCATCATCTCATTGATATTGTCCATTTTAAGTTCACGTAAATTTTATTTTAAATACTATTTAAAATATTCTGTTCACACAATGTTATACCATAGTGTCAAGTTTTAATAGAGTTGTTAAGAAAACATTGTCTTCCTCTAGGATTGGAATAAAAATCTTTTCAAGTACTTGAATTGATTTTGACTCTAACTTTATTTAGATAAACAATTTAAAGTGATAAAGTTTCGAAGCTTCAATTTTACTTAATTAATTTCAATTATTCTCTCTAATGAATTATAGGTAAGAATGTCTATCTCTTAAGTGTCAAGTCAGATCTAATCTTTGATTTTAATTCCAATATCTCTATTAAAAATAAAAAAGGACTAGAAAATTTAGGTGTCTCATATGTTTTTGCTGGTCTTTCGACTCAATCAAGCCCTCTATATTGAATTACTAAGACCATGCCTAAATTTCCTTCTCTCAAGTGTTAAAATCTAAGCCTATATTCAACTCTTCTATGGCTATAAGATAAAAGAAGAGGGATTAGTTCAACAAGAACAGAATAAATCAAATTCTAAAACTAGTCCTAGAAAGCATTAATAAAATCCCTAAGGAAAGAAGAGATGAAAAGAGAAGAAAAGAATATCTTGTTGTCATCTTCAATCTCCTGAATTTTCTTCTTGTCTTTATCACGTGATTCCTTCGAATCCTTAATGTGGCAGCTGTTCCAAGCCATTGTGGTCTCTAAAGCTCTAAAATCCCCCTTCAAAACTCGTGTAGATGACTTAAATAATCCTTCAACGCTAAAAATTTTACATCCGAGTGCCTATGCACTTTTTTTAAAAAAAAAAAAATTAAACGTTTGCTTCATCATTACTTACATAGAGGGATAAAAATGTCTCAACACATCTAAATAATTAAAAAACTAGCAAAATAACTTTTTAAAATTTTTAACGTAGAAAACACAAAATCTGTGAAAGCTTAAAGGAAAATTTGATGGAATACAAGACTCATACATCAGAAGTCCAAGATTTACGAGTGGATGAATATTGAGTACTCAGCAAGTAGCCTCCCAAAAAGAGGGATGTGATAACATACGTGGGTTACAACATGAGATATAGATGACTTATAAAACATATCTTATATCATAACTTGAAATTTTAAATTTCAAGTTATAAGGGAGTAGGCTAAACCCATTCAGTGTGAGGTACACTACTTTGAGAGGGCAAAAGGTAGATTTTTGCATAAGACAAAACTCCAACTAATGATAATAGTGAGGTCAGTCAGTAAAGTCTTGCACTAAAAAATTGCTATTATATATGAACATGAAATGAGGTCTAAAGATGTGCTACCATATGTGTTCGTCAACCTCATGAATATAAATCTGGTGAAGTACTACAATATATACTCATCTACCTTATAAATTTCTGCAATAGACTCAATTAACTGTTGTAATAGTGTTTTATTATAGCAAATACGACTTCAATATTTTTGAAGTTTCAAAGGTGAATAATTTTTTTAATGTATATGCAGAAATGCATTTGGAGGAGGACCTGAAGGAATGACATTGGATGAGCTCGATATGTTTGAGAAGCAACTTGAGATTTGGATTTGTCAAGTGCGTTCTTCAAAGGTATACTTCCCAAAACACAAATATACACACTGTGCACTCTCATTTGTTCTATATGATAACTTTGAGATTAAAAGTGAGTTTGGAATGACTTTTGAAATTGTAGTAAAAAGTCTTTTGACTGTTTTTCAAAACTGCTTATAGAAAAATTGTTTTTACTCAAAATTACATTTTTTCAAAAGTCATTTCAAAATCACCTTAACATGTATTTAATATGAAATTAATTAGTTTCAATTATTTGGCCTTGATGATACAGATGAAGTTTATGTGTCAAGAGATTGAAGCACTGAAGAACCAGGTTGGATTTTAACCTCTTAATTATAAGATAAAATTTAAGTTAAATTATACTTTTAGACTATGTCTCTGTCTATTTAGTTGTTAAGTTTCTAAGTCTTATGATTTAAACTATAAGATTTCAAAAATTGGTTTAAATGGTATATGTTGTTAGTTTTTCATTAGCTAAAGTTAAAAGCGGATTGAATATTTTTTTATTAATTTTATAACATCAACTATATTGATGTGTCATTAAGAAAAATTAATTTTTGTTGTTAGCTATGTGGAAAAAGAAATTAGTTTTCTATTTACATATAAAATTATATTTTCAATGTTAGTTTATTGTAAAATTCATTAAAATATTCCATCAACCGTCCATTATTTTAGCTAACAGAAAACTAACTGTCTGAACCATTTAGCCCCTTAAAAAAACTTAAGGTATAAATCGTAAAATTCAAATACTTGTTGGGAATTTTAGGTTTTTTTAATCAGATTTAAATTTCCCTTCCACACAACACAGCGATACACAAAGTAAAACGAACAAAATAAAGGATAGAAAGTTACATCGTAGTTCATACTAGTTTGCCCTAAACTCAGGACTACATAGTCCACTGCATTTGCAGGTTCCACTAATATTGCTGAAGATTTAACGGGGATTCACATAATCTCATGAGTGTTTCTCTCTAAAAAAAATACTTTCAAACACTCTAAACAAAAGGCCCAATTGTCACTCCCTTTTTCTTTCTATTTGCCACAATCTGAAGGATACATAAATGAATGAGAAAACTGCTCCTTAAATAGAGAATCCCTAAGGTTGTGCTAGTTGTACGCACCAGCACCTTGAGTTACAAACGAGTGCCTCGGCACTCCAGATATTATCTTTTGCTTCGGGTTCAACACCTCGATGTTGTGGGTAGCACCTAGGCACTAGGTGCCCTCTTCTTGGGCTCCATGCTTTGCAACATATTACAATATGCTACAACATTTGTTGTAGTATTGTTGCAGCATTACGTCATGTTGCATCTTCTCTTAACTTTCATTTGTGCTTCGAACGGGCCTTCCAACAAGTCTTAAACTGAGTCTCTTGATGATTTGACTCCAAAAATCCTAACAATCTCCCACTTGTAGATTAATAATCGATCTTCGCCGCCTGTTATAATTGTCTTCACCTCCCATTTCAACTACAGTTCTTGATCTGCTTGGCAAACTCTAAGACTTCACCTACAAATTTATCCAACTTGCAAACATTTGTTACCATCTATAACAGTTATACATACTTGTCCAAGGTTGGGTCAACTACATGGACTTTCTTCCAGATAAAAAAAGACACCGCCCATGTACTCTCACTCTAGTTAAGTCGTGAGATTCAACACCTCTTTTCTGAATTCAAGCCTTTTGCCAAATTTGAGACATTATCTCTCACATCAGCATCTACTTTGGTATTTCTCTTGGATGCATACATTCGCCTGGACAACTTCACCAATTTTCTTAATTGTCTGACAATTGGGACTACCAACTGACAACCTTCAAAACTTTGCATTCGACTCCCAAACGGTTACTTCTTCTGGATTGATGGATTCTAATATAACTTGGTTGTCTATGATGCTAGCTCTTTCCTACCTCCTGAGGAATCATCTGCAGCTTTTGAAATTTGCTTCCATCATCTAATCTTCCCTTTGGCAACATTCAACTTCATCACCTACGAGGGTAGAATGCCTGTGGCCACTAGCGACTAACTTAGATCCTTGAGTGAGTTTCCACTGGCCACCACCAAACTCACTTTGATAGCCACCATCGTCGAGTTTACCTGTTGAGATAAGGTACCAGGAACGTACTTGACATCTCGCGGCATTAACTCATAACCTATGTTAGTTCTCAAACAAATGTCTCCAATTCCAACTATCTTGGAGATTCTCTCATTTCTCATTCTCACTTGGCCATGGTTGCCTATAGTGAAGGATGTGAACAAACCAATATTTGAAGATACATATATACATGCTACACAATCAACTACCTAATCTGATGGATGGTTTTCAATCCTTTTTTTGTCCTCTACACAAACAAAGGCGTCGTCCAAGATTACATTTGCTTCTACCTTTTTCTTTAGGTCCTCCTTCAATTTTTTACATCGACACATATAGTGACCCTTCTTGTGGCAGTAATAGCATCTAAGGTCATTCCTCCTGTTCCACTTGCCAATTTTATGTTGTCTGTCTTCAAACCCATTGTTGTCTCTTCCCTTTTGAGCAATCAATGCTGAGTCTGATATAGATTCTTTACTACCATCCTTCCTACAAAGTTTTTCAATAATTGTTGCATAACAGATCTCGGAGAATTTTAACTCTCTTTCTCCCAGAGAATTGGATATGGTTGTCTTCATAGTTTCCCAACTATTAGGTAAAAACTTTAACAAAATAATGGTGTTGACGTCATCACTAAAGTAGTCTTTACTAAACTCAGTTGATTGATTAAATTAATTACTTAATTTATATGGGAGTTAATTGATGAAACTTCATCCATCTTAATATTAAAGAACTTTGTGATGAGCAATACCTTGTTGCTAGCAGAGAGCTTTTCATGCCTATTCGACAACTCTTCTATCAGTCCTACTGTAGTTGTCTCGTTTGCCACAAGACTGGCCACATTATTTAACAATGGCAACTTGATGATAGCTACTGTGTGTTTGTCAATATTCTCCCAATCTTCATCTTTCATTCTCTCTAGCCGTTTCTTCAATGTGTTGTGGACTCTTTTGCAGGTTAGATAACCTTTAATTTGCATCTTCCAGTTTTCAAAATCTTGTCCATCAAACTTTTAACTTCTTCAATGCTCAATGGCGTTCTTGACCCCATGATTCTAAAACCAGAAGCTCTAATATCAATTGTTGGGAATTTTGGACTTTTCGAATCAAACCTAAATTCCCCTTCCATATAACACAAGAGCGATACACAAAGTAAAACGAACAATTAAAAGAAACAAGATACATAATAGAAAGTTACACCAAAGATTATATTGGTTCGTCCCAAACTCGAGACTACGTCCAGTCTTTTGTAACTGTATGTTCCACTAATATTGATGAATATTACAATGGAGATTCATACAATCTCATGAGTGTTTCCCTCTATTTTTCTCTCTGAAAAATACTCTCAAACACTTTGAATAAGAGGTCTAGTCATCACTCCCTTTTCTCTCTATTTGCCACACTCTGAAGGATACAAATGAATGATTAAATTTCTTAGTATTTAGAGAACCCCTAAGGTTTTGCTAGTAATATACACCACTGCCTTTACATTGTAAATGAGTACCTCGACGCTCCAGATATTGTCTTCTACTTCAGGTAGCGCCTAGGCACCCAAAAATGGTGCCTAGGCGCCTTCTTCTTGGGCTCCATGCTTTGCAGTGTGCTACAGTATGCTACAACATTGTTGTACATTGTAGCAGCATTACATCATGATGCCTCTTCTCTTAACTTTTATATGTGCTTCGAATGAGCCTTCCAAAAAGTATCAAACTGAGTCGTATTGATGATTAGGCTTCACAAATCCAGACAATACTTAGGGACCAAATAGATACGAAAGTAAAATCTCAAGAACCCAAAAGTATAACTTACTCTAAATTTTAATTTTGTCATCAACTATTGATTTTGATCCCTATGGCATTATTCAATACCGAACAAATCAAATAGTTGATTATGAATCAGTTTGAAACAAAAAGGAAAAAGAAGAAAAAGAGTTTTGAGTAGATGAAATTGGAACGTGCCAATATATTTAGTTCAAGTACCAAAGTACAGAACGACTTTATATTTTAGTCGATATGATACAAAAGTTAAACTTGTTTTTCATCTTTAATTATTGTGCTTGAATAATAATATTAATCAAATCTAAATTTTCTTTTTCTGTTTGAAAGGAATTAATACTGAAAGCTGCCAATAAGTATCTTCATGATAAG

mRNA sequence

AACCATGCAAGGGCTTATTGAAAGGTACATGAAGCACACCAATCAGACTCAGCCACCAGACCCACCGATTGAAAACCAAGCTCTGGAAGCAAAGGAGGAGGTCAACAGGCTGAAACAAGAAATTGAAGTCCAAAAGGGTCTCAGAAATGCATTTGGAGGAGGACCTGAAGGAATGACATTGGATGAGCTCGATATGTTTGAGAAGCAACTTGAGATTTGGATTTGTCAAGTGCGTTCTTCAAAGATGAAGTTTATGTGTCAAGAGATTGAAGCACTGAAGAACCAGGAATTAATACTGAAAGCTGCCAATAAGTATCTTCATGATAAG

Coding sequence (CDS)

AACCATGCAAGGGCTTATTGAAAGGTACATGAAGCACACCAATCAGACTCAGCCACCAGACCCACCGATTGAAAACCAAGCTCTGGAAGCAAAGGAGGAGGTCAACAGGCTGAAACAAGAAATTGAAGTCCAAAAGGGTCTCAGAAATGCATTTGGAGGAGGACCTGAAGGAATGACATTGGATGAGCTCGATATGTTTGAGAAGCAACTTGAGATTTGGATTTGTCAAGTGCGTTCTTCAAAGATGAAGTTTATGTGTCAAGAGATTGAAGCACTGAAGAACCAGGAATTAATACTGAAAGCTGCCAATAAGTATCTTCATGATAAG

Protein sequence

TMQGLIERYMKHTNQTQPPDPPIENQALEAKEEVNRLKQEIEVQKGLRNAFGGGPEGMTLDELDMFEKQLEIWICQVRSSKMKFMCQEIEALKNQELILKAANKYLHDK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022149997.13.9e-4889.91agamous-like MADS-box protein AGL12 isoform X1 [Momordica charantia][more]
XP_038891170.11.7e-4385.59agamous-like MADS-box protein AGL12 [Benincasa hispida][more]
XP_022925494.11.1e-4283.78agamous-like MADS-box protein AGL12 [Cucurbita moschata] >XP_023536341.1 agamous... [more]
KAG6592380.12.4e-4282.88Agamous-like MADS-box protein AGL12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. soro... [more]
XP_022973991.11.2e-4182.88agamous-like MADS-box protein AGL12 [Cucurbita maxima][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Q388412.7e-2046.77Agamous-like MADS-box protein AGL12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL12 PE=... [more]
Q2QW556.9e-1643.12MADS-box transcription factor 33 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MAD... [more]
A2YQK94.5e-1545.05MADS-box transcription factor 26 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MADS2... [more]
Q0J8G84.5e-1545.05MADS-box transcription factor 26 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MAD... [more]
O646452.2e-0631.19MADS-box protein SOC1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SOC1 PE=1 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1D9I41.9e-4889.91agamous-like MADS-box protein AGL12 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN... [more]
A0A6J1ECC15.3e-4383.78agamous-like MADS-box protein AGL12 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC11143278... [more]
A0A6J1IA695.8e-4282.88agamous-like MADS-box protein AGL12 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472603 ... [more]
A0A0A0KW777.6e-4282.88Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G650620 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1D8981.7e-4191.58agamous-like MADS-box protein AGL12 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G71692.11.9e-2146.77AGAMOUS-like 12 [more]
AT2G45660.11.6e-0731.19AGAMOUS-like 20 [more]
AT2G03710.11.9e-0526.61K-box region and MADS-box transcription factor family protein [more]
AT2G03710.21.9e-0526.61K-box region and MADS-box transcription factor family protein [more]
AT2G03710.31.9e-0526.61K-box region and MADS-box transcription factor family protein [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Monk fruit (Qingpiguo) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 27..47
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR48019SERUM RESPONSE FACTOR HOMOLOGcoord: 1..109
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR48019:SF45AGAMOUS-LIKE MADS-BOX PROTEIN AGL12coord: 1..109
IPR002487Transcription factor, K-boxPFAMPF01486K-boxcoord: 26..109
e-value: 1.7E-18
score: 66.6
IPR002487Transcription factor, K-boxPROSITEPS51297K_BOXcoord: 27..109
score: 9.058371

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sgr016857.1Sgr016857.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
biological_process GO:0006355 regulation of transcription, DNA-templated
cellular_component GO:0005634 nucleus
molecular_function GO:0000981 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
molecular_function GO:0046983 protein dimerization activity
molecular_function GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
molecular_function GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity