Sgr014967 (gene) Monk fruit (Qingpiguo) v1

Overview


Name	Sgr014967
Type	gene
Organism	Siraitia grosvenorii (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
Description	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like
Location	tig00002486: 602357 .. 636761 (-)
RNA-Seq Expression	Sgr014967
Synteny	Sgr014967

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

GGTTCAGGAGGGCAAGCCGATGGTCGGTTTGAGACAGGAGGATTGGCGAGAAATGAATTATACAGTGGAAGAAGGATGGAGGCTCTTTAGCCGTGAAGCGTCCTATGCAGGACTGAAAATGAGAATGAGTGGTCGAGACAGAGGAGGATTGGCAAGAACTGAAGAATTCTCCCTTGGAATAAGGAAGTTTGTAGACGGTGTCAGAGATCAATGGCCAATTGACTATGAACAGATCCCATGTAAAGTCTTGATGCTTTGCTATGATAAAGATTGTAAGGAGTTCAGGTCCCAGTGCATGGAACTTGTTCTTGTGGAAGATTTATTCTCAGCTCATCTCTCTATTGGAGAAAGGACTAGACACTGGATCAATTTATTCTCTCTTTTCAACATACATCACGAAAAGGCTCTCAGATACGTTTTGTTGCAAAAACAGAGGTTACAAAATGAGTTGCGAAGTTATTTGGCTCTACGAGAAAAGGACAAGGTATGTTGCCTATCTTCTCTTCTAAATTCTGTAGTCAGGAACTCAAGAAGGAAACCATTCCCAGATTCCATCACTGTGGTTTCTTAG

Coding sequence (CDS)

GGTTCAGGAGGGCAAGCCGATGGTCGGTTTGAGACAGGAGGATTGGCGAGAAATGAATTATACAGTGGAAGAAGGATGGAGGCTCTTTAGCCGTGAAGCGTCCTATGCAGGACTGAAAATGAGAATGAGTGGTCGAGACAGAGGAGGATTGGCAAGAACTGAAGAATTCTCCCTTGGAATAAGGAAGTTTGTAGACGGTGTCAGAGATCAATGGCCAATTGACTATGAACAGATCCCATGTAAAGTCTTGATGCTTTGCTATGATAAAGATTGTAAGGAGTTCAGGTCCCAGTGCATGGAACTTGTTCTTGTGGAAGATTTATTCTCAGCTCATCTCTCTATTGGAGAAAGGACTAGACACTGGATCAATTTATTCTCTCTTTTCAACATACATCACGAAAAGGCTCTCAGATACGTTTTGTTGCAAAAACAGAGGTTACAAAATGAGTTGCGAAGTTATTTGGCTCTACGAGAAAAGGACAAGGTATGTTGCCTATCTTCTCTTCTAAATTCTGTAGTCAGGAACTCAAGAAGGAAACCATTCCCAGATTCCATCACTGTGGTTTCTTAG

Protein sequence

VQEGKPMVGLRQEDWREMNYTVEEGWRLFSREASYAGLKMRMSGRDRGGLARTEEFSLGIRKFVDGVRDQWPIDYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHEKALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDKVCCLSSLLNSVVRNSRRKPFPDSITVVS

Homology

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. NCBI nr
Match: XP_022937151.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022937153.1 sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 [Cucurbita moschata] >KAG7024760.1 Sister chromatid cohesion protein PDS5-like A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 5.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. NCBI nr
Match: XP_023536017.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X5 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023536018.1 sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X5 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 5.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. NCBI nr
Match: XP_022937155.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X3 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 5.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. NCBI nr
Match: XP_023536012.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023536013.1 sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 5.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. NCBI nr
Match: XP_022976679.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X3 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 5.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IK50 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477004 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 2.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IHJ2 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477004 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 2.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IMW1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477004 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 2.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IGF7 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477004 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 2.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F9K0 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443537 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 2.9e-36
Identity = 77/88 (87.50%), Postives = 83/88 (94.32%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           D+EQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLF A LS+ ERTRHWI+LFSLFNIHHE
Sbjct: 437 DFEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFPADLSVEERTRHWIHLFSLFNIHHE 496

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDK 162
           KAL Y+LLQKQRLQNELR+YL LR+KDK
Sbjct: 497 KALGYILLQKQRLQNELRTYLGLRKKDK 524

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. TAIR 10
Match: AT1G77600.1 (ARM repeat superfamily protein )

HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 2.6e-21
Identity = 49/89 (55.06%), Postives = 65/89 (73.03%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           ++EQIPCK+L+LC +K+C+EFRSQ +ELVL +DLF   L + ER RHW+  F++ N  H 
Sbjct: 460 NFEQIPCKILLLCCEKNCEEFRSQNLELVLSDDLFPRLLPVEERMRHWVQCFAIMNHIHL 519

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDKV 163
           K+L  +L QK+RLQNELR  L L  K KV
Sbjct: 520 KSLNSILSQKRRLQNELRHCLTLWRKAKV 548

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. TAIR 10
Match: AT1G77600.2 (ARM repeat superfamily protein )

HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 2.6e-21
Identity = 49/89 (55.06%), Postives = 65/89 (73.03%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           ++EQIPCK+L+LC +K+C+EFRSQ +ELVL +DLF   L + ER RHW+  F++ N  H 
Sbjct: 460 NFEQIPCKILLLCCEKNCEEFRSQNLELVLSDDLFPRLLPVEERMRHWVQCFAIMNHIHL 519

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDKV 163
           K+L  +L QK+RLQNELR  L L  K KV
Sbjct: 520 KSLNSILSQKRRLQNELRHCLTLWRKAKV 548

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. TAIR 10
Match: AT1G77600.3 (ARM repeat superfamily protein )

HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 2.6e-21
Identity = 49/89 (55.06%), Postives = 65/89 (73.03%), Query Frame = 0


Query: 74  DYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHLSIGERTRHWINLFSLFNIHHE 133
           ++EQIPCK+L+LC +K+C+EFRSQ +ELVL +DLF   L + ER RHW+  F++ N  H 
Sbjct: 460 NFEQIPCKILLLCCEKNCEEFRSQNLELVLSDDLFPRLLPVEERMRHWVQCFAIMNHIHL 519

Query: 134 KALRYVLLQKQRLQNELRSYLALREKDKV 163
           K+L  +L QK+RLQNELR  L L  K KV
Sbjct: 520 KSLNSILSQKRRLQNELRHCLTLWRKAKV 548

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. TAIR 10
Match: AT5G47690.1 (binding )

HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 1.3e-12
Identity = 39/106 (36.79%), Postives = 61/106 (57.55%), Query Frame = 0


Query: 53  TEEFSLGIRKFVDGVRDQWPIDYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHL 112
           TE F +   +  DG  D    D+  IP K+L   YDKD   FRS  +E +L   LF +  
Sbjct: 408 TELFRVYCLRCADGKVDTG--DFNWIPGKILRCLYDKD---FRSDTIEYILCSSLFPSDF 467

Query: 113 SIGERTRHWINLFSLFNIHHEKALRYVLLQKQRLQNELRSYLALRE 159
           S+ ++ +HWI +FS F+    KA   +L Q+QR+Q E++ YL++++
Sbjct: 468 SVRDKVKHWIQIFSGFDKVETKAFEKILEQRQRIQQEMQRYLSIKQ 508

[Close]

BLAST of Sgr014967 vs. TAIR 10
Match: AT5G47690.2 (binding )

HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 1.3e-12
Identity = 39/106 (36.79%), Postives = 61/106 (57.55%), Query Frame = 0


Query: 53  TEEFSLGIRKFVDGVRDQWPIDYEQIPCKVLMLCYDKDCKEFRSQCMELVLVEDLFSAHL 112
           TE F +   +  DG  D    D+  IP K+L   YDKD   FRS  +E +L   LF +  
Sbjct: 408 TELFRVYCLRCADGKVDTG--DFNWIPGKILRCLYDKD---FRSDTIEYILCSSLFPSDF 467

Query: 113 SIGERTRHWINLFSLFNIHHEKALRYVLLQKQRLQNELRSYLALRE 159
           S+ ++ +HWI +FS F+    KA   +L Q+QR+Q E++ YL++++
Sbjct: 468 SVRDKVKHWIQIFSGFDKVETKAFEKILEQRQRIQQEMQRYLSIKQ 508

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Sgr014967 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022937151.1	5.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 [Cucurbita mosc...	[more]
XP_023536017.1	5.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X5 [Cucurbita pepo...	[more]
XP_022937155.1	5.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X3 [Cucurbita mosc...	[more]
XP_023536012.1	5.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X2 [Cucurbita pepo...	[more]
XP_022976679.1	5.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X3 [Cucurbita maxi...	[more]

BLAST of Sgr014967 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Sgr014967 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1IK50	2.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X4 OS=Cucurbita ma...	[more]
A0A6J1IHJ2	2.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X2 OS=Cucurbita ma...	[more]
A0A6J1IMW1	2.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 OS=Cucurbita ma...	[more]
A0A6J1IGF7	2.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X5 OS=Cucurbita ma...	[more]
A0A6J1F9K0	2.9e-36	87.50	sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 OS=Cucurbita mo...	[more]

BLAST of Sgr014967 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G77600.1	2.6e-21	55.06	ARM repeat superfamily protein	[more]
AT1G77600.2	2.6e-21	55.06	ARM repeat superfamily protein	[more]
AT1G77600.3	2.6e-21	55.06	ARM repeat superfamily protein	[more]
AT5G47690.1	1.3e-12	36.79	binding	[more]
AT5G47690.2	1.3e-12	36.79	binding	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Monk fruit (Qingpiguo) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PANTHER	PTHR12663:SF0	PRECOCIOUS DISSOCIATION OF SISTERS 5, ISOFORM A	coord: 74..164
IPR039776	Sister chromatid cohesion protein Pds5	PANTHER	PTHR12663	ANDROGEN INDUCED INHIBITOR OF PROLIFERATION AS3 / PDS5-RELATED	coord: 74..164

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Sgr014967.1	Sgr014967.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0007064	mitotic sister chromatid cohesion
cellular_component	GO:0005634	nucleus