Sed0024936 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGACTTCATGGCGGCAGCTCAAGGCCATGCTCCGCAAGAACTGCCTCCTCAAAATCCGCCACCCGTTCATCACCGCCGCAGAGGTTCCTCTCTCTCTCTCTCTGTTCATCCTTTTTCACTTTTTCTTTCGCTTTACGTTCCTGTTCGCCTTCATCGCAATCTGCACGCTAGGGTTTTCCTGTTCACTCTTGTTCTCATTCTTCAATCCGCTGCTGTATCGTCTAATTTCCGGCGAGTTTGGTGATTCTTATCGATATTGAGTAAATGCGTACTGGAATGTGCTATTTTAGAAGCTGTGTTAGTTTTCGCTTCTTTGCTCCTTTTTCGCTGCGGTTATCGTCGAAGTTTCCGTGTTTGTATCGTCAAATTTCTGGAGAATTTGTTGTTTCTTATTGCTATTGAGTAAATGTGTACTGGAATGTGATGTATTAGAAGTTGTGTGAATTTCAGCTTCTTTTCTCCTTTTCACTGTGGATATCATCCAATTATCCATTGCTGTATCGTTAGATTTCTGGAGAATTTTCTGTTTCTTGTTGCTATTGAGTAAATGTGTACTGGAATATGCTATTTTAGAAGCTGTGTGAATTTCAGCTTCTTTTCTCTTTTTCACTGCGGATATCATCCATGTATCCGTTGCTCTATCGTCAAATTTCTGGAGAATTTGTTGTTTCTTATGGGTGTGTTTGTTTTTAGTAGAAAAGAGCGGAGTGGAGTGAGGTGGAAGAGAATGAAGTTGTTAATAGTAGTTTGGAGCGGTTAACTACTCGTTTGAAGATTGAAGTTAATAGTAGTAGAGTAATTAACTACTTGTTTGAATATTGAGGTTAATAGTGGTTGAGTGATAAATTAGATGTGAAGTTTAATAAAATTTAATGTGAGATTTGATAATGGGGTTAAAGAATGGTTAAAAATAGTTAAGAGTGCTTGTTTACTACAAAAAACAAACACGAGGTTTATGAAGAGTGGTTATTAACCACCCCTCATGTCCAAAAAACAAACATACCTATTGAGTAAATGTGTACTGCAATATGCTATATTAGAAGCTATGTTACTTTTCGCTACTTTGCTTTTTTTTCACTGCGGATATCATCCATGTATCCGTTGCTGTATTATCAAATTTCTGGAGAATTTGTTGTTTCTTATTGCGTTTGTGTAAATGTGCACTGGAATATGCAATTTAGTTGGAGTGTGACTTTTTTATTGAGTTTTTTTTTTGTTTACTTTCATTTTTCTGTTTCTGTTTTGTTCTGGAAGTGAAGAGTGAAGGAATAAATGTTATTTCTGTTTTTTTTGGTAGATTTTACTTCCGACTGTGGTGATGTTGTTACTGATAGCTGTAAGGACGCAAGTTGATAACACAGTTCATCCTCCGCAACCGTGAGTTTTATAAGATTACTAATAGTTTCAACATTTTATTTCTATCTGCCTTCTATAAAAAGTATTTAACGATCATCGGCAAAATCTCCAGCCAGAATCCTTCTGCCTTATGGGTGACCTGTTATTCTTGATATTTTTTTGTTCGCTTCAGTTCTATATTACAGTATATGTTCGAGGAACGTGTTCTTGCTTTCATGAATTTCATGCTTCTCTTTCAAAATGCTTTTACGGTTATTGATAGTGTGTAATTAAATGTAGATGGGAAGTTCTCTCTGTAATTAGCTTCTGTAGTTTTGATTGGGGATGCTCTCTTATTATGTAATATTCCTGAGTGGATAACTTTTCAGACTAAATTTTCAATTGTCAATAGAGAGTTCTTAGATGGAGTTGGAAAAAGAGAAGTTGATATTTGTTTGTTGTGGTTTTATTTGGAATAAAAGGAGGCTTTATTTTTTTTATGCATATAATTTGCTTAAGCAGCCTAGCCCGTTATCTGGAGCCTAGAGTTTTTTTCTTTCCAATTTTGAATGCATATTCGGGCTTGAATAGTTGTATTACGCTATTACTATAACTGGTCAATCAAAGGAGTAATAAGTGGAATGAATTGGCTCCCATGATTTGAGCTTGTTTGATACATTTACTCCCTTTTAGTCCCAACGCATGATGATTTTATCTTTTTTTTATATTTTTTTTGTCAGGCATATACAAAAAAAAATGTTTGTAGAAATTGGCAAAGGTATATCCCCGAGTTTCCAGGAAGTTCTGGAGTCATTAAGGAAAAATGGAGAATATCTGGCTTTTGCACCGGATACAGTTGAGACAAAGACCATGCTACGTTTGATGTCAATACAATTTCCTCTTTTAGAGGTACATAACGGCACCTATCTCTTAATCTAATTCTATTAGTAAAAAAGAAAAAAGAATTAAAGTAGGACTCCAGCTCACTCGGGTGGTATTTTTTTGTTTGACTATTTAGTAAATGTTTCTATCCCTGTGTCCGCATTTGGGATACACCTAAACTATGTTGTAATGAAAAATATGTATTATAGATCCTTTCTGAAAGCACAATTAAGAATAAATGATCCCTGCTTTATTTTTGAGTTTGTAAATAATGCACCAAGTGAAAGATAACAGGTTAATTAATCTTGTTCCGTTGGAAGTTTGAATCCAATCTAAAAAGTAATACCTATCGACTAACAACTTGTATTCCCTAGTTGTCTCCTACAATATTTATTTTCATTACGCCTTTGGAAATCACTCCCCATGATTTGCGGAGGTCTGAATGTTCTTCTTGTCGTTCTTTTCTTAATTTTTTGTAATCATTAGATAGCATGGGGGGTTCCACCTCAAAAAACTAATTGGCAATGACATGAGTAGCCCACATTTCCAACTTCTATTCCGTAGTTGTGTCCTATTTTCATTACGCTCTTGCAAATCACTCCCCATGATTTGTGGAGTTCTGAATGTTCTTGTCGTTCTTTTTGAAATTTTTTTTTGTAGTCAGTAGTATGGGAGCTCCACCTCAAAATTAATTGGCAATGACATGAGTAGCCCACATTTCGTTTATAAGAGTTATGAGGTCTTCTCATATTTCCAATGTGTGATCCTCAACATGCTCCTCAAGATGGTGCCTTTTTGATTTCACCAATATTTGATCAGATCTCAATTTCAATTTTATTGCACCGAATACCTGTTTGAGTTTAATGGGCTATGATACCATGTTGGATAGCATGTCATTTTATCTCAATTTTTTTTTTATTTTCTCATGTTCTCGAGCAATTACTTTCTTTGCCGATAAGCTTCTTTGTTGTTTAAGTCTGTTAATTATTTTCGTTGTCTTTGTTTTTGTTAATCTTTGAAAGTTTTGTTCTATTATTTGCTTTCCAGTTTTTGGTAGTGGCTTTCTTTCTGTTTTTTTTTATTCTTTCATCCTTAGAGTTTGTATTTTTGAGCAGTAGTTTCTTTTCATTTATGAATGAAAATATATTTTAAAACTCTGGTGAAACAATTGTTTTTTACCAATTGGTAAGAAGTGCAATGTTTCCTATTGAATGGGTAAAAAACACAAATTATGCTTCCTTTTTAAAGGACGAGTCATTTCGTTATATCAATGAGTTTTTCTTTTTTGACACCACGTTATATCAATGAGTTAAATCTGGTTTATTTTATCTAAGCAAAATGTGCACCACCTCGTACTGACAGGTAGTTACTAGGGTCTACAAAGATGAACAGGAGCTGGAAACCTACATTCGGTCTGATCTGTATGGAAACTGCAATGAAGTTAAGTAAGTATTTGAACATTTATATATTCATTTGGTTTGGTTAGGAACTAAGAAACAAGAAGCAAAATGAGACAATTTTAACTTCTTATATCTGACAAATATAGAAGAAAATTATTCTTACACTTCTAAATTAAGTTTATGGTCTTGGTTAAATTTATTCATAAAAATGTATAATTTCAAGCAATTGAAACTTTGCCAATAAAATGAAGTTAGGCCCTTGGATTACTCATTAGCGACTGTTGTAGCTTAGTCACCAAACTACTCATCTTGTCCAGTGGTCCAACAAAATTTTCCTTTGTTCAACAAAATTTTCGTTTACTCAAATATTATGTAAGTGGGAAGCAATGAAAGCACAAAAGAAGGAGAAGGAAGCTAAGATTGCTGGAATTTTCCCTATGGATCTCGCCAAAATTCTCTACATTGTTGGAATCCATCCTGTCAATAGTTTCCAAGGGGTGGCGCAGTGGTCGAGGTTTGGGTTTTGAAGGTGTGCTCTCCTCAAAGTCCTAGGTGCGGGACTCATCCGTGACATTAATTTGTAACACCTCCCTTCTCTCCATTTCTTCGATGTCTCCTAGTGCCTGGTTTAGGAACGGGCGTGGTTACCCAGGGTATGCTAGAGCGAAACTCCATTTCTTTAGTTAAAAAAAGAATTCTGTCAAAGGTGACCTGCATCGATACTTTTGGTGTGTAAGGCTTCTTTGGGAGAAGGTGTCCTGCACCTGATATTGTTGTGAAGGCTTCTTCAGTTTGTGGAAGCATCCTACACTCTTCTTTTCCACCATTATCAACCTCATTTTTGCTCCTCACACCACATCAACGAAATGGAAGTTAAAAGTTGCAATATTCAAGGATCATTCTACACCATATGGCAAGAAGACGACTTCTTTTTATTGGAAGACTCAGAATTAGAAAAGTCAACCCTCCTTTCTGAACCCCTTTTGAAATGGCTAGAATCTTCACTTGTTGAAATGCTCTGGCCGCCCATCCAATCTTATTTTTGTCAAGGATATCGTGATGGTTTTGGATCAATATGCATTGGTAAACTCTGCTCCTTCATAGGCTCTTTATTTCATTGTGTTGTTTGGCCAAGAAAGGGAGGAAGATACTTCATTCATGTTGTGTAAAATGAGAGGAATAATACTCTATATTTTATTCAATGCAATGAAGGTCTCTTATATAGAGAAAACCTAGATATACAAATAAGGTAAAAGTACAAGTATGAATTAAAAATTTTACAATCACTATTATGCACACCCGAAGGACATAATTGTATATATAAGAAAATTTTCATCATCCTCTTGACGCTCCCCATGACTAGTACTTGACTA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MATSWRQLKAMLRKNCLLKIRHPFITAAEILLPTVVMLLLIAVRTQVDNTVHPPQPHIQKKMFVEIGKGISPSFQEVLESLRKNGEYLAFAPDTVETKTMLRLMSIQFPLLEVVTRVYKDEQELETYIRSDLYGNCNEVKNSNCSNPKIKGAVVFHEQGPKLFDYSIRLNHTWAFSGFPNVRSIMDMNGPYLNDLELGATNVPTMQYSVSGFLTIQQVMDSFIIFASQEMESNILHLRRKNTSSNSSSNPSLPNLPWTQFSPSNIRIVPFPTREYVDDEFQSIVKRVMGVLYLLGFLYPVSRLISYYAFEKEEKIKEGLYMMGLKDGIFHLSWFISYAVQFAISAGIITFCTMHNLFKYSDKTVVFIYFFSFGLSAIMFSFLISTFFKRAKTAVAVGTLSFLGAYFPYYTVNDETVSVIMKAIASLLSPTAFALGSINFADYERARVGLRWSNLWRASSGVNFLACLLMILFDTLLYCAIGLYMDKILSRENVFGSSWGCFLRKFFSRKRSVSEHDTPIDFKIADATSVENAQASRKGTFDPVVEAISLDMKQQETDGRCIQIRNLHKVYDTKMGKYCAVDSLQLTLYENQILALLGHNGAGKSTTISMLVGLLPPTGGDALVLGKNIITEMKEIRKELGVCPQNDILFPELTVREHLEIYATLKGVKEDILERTVVDMVDEVGLADKINTLVNALSGGMKRKLSLAIALIGDSKVIVLDEPTSGMDPYSMRLTRQLIKKIKKGRIILLTTHSMDEADELGDRIAIMANGSLKCCGSSLFLKRQYGVGYTLTLVKSAPTVSVAADIIYRHIPSAVCVSEVGTEISFKLPISSASSFESMFREIENYMGRSVSNSEMNCSSDTSNGDDHLGIESYGISVTTLEEVFLRVSGCDFDVAHSEQEEGPLLASSVVSNISVHESQQLGKSEKSGFFAVAVRRACGLIFSTCFSIINFLSIHCCGCDILWRSKFWQHSKALFIKRAISARRDRRTVVFQLLIPVVFLFVGLLFLKLKPHPDQQSVTLTTSEFNPELISGGGGGPIPFDLHWPISKQVAHYIEGGWIQNYKPSAYKFPDAEIALSNAIEAAGETLGPILLSMSEYLMSSFNGSYQSRYGAIVMDDQNGDGSLGYTVLHNCSCQHSAPTFINLVNAAILRLATGDQNMTIQTRNHPLPMAKSQRLQRHDLDAFAAAIIVNMALCFIPASFAVSLVKERETKAKQQQMISGVSMLSYWTSTYIWDIISFLVPTCLALILFYIFGMDQFIGKGRFLATAILFLEYGMAIASSTYCLTFFFLDHTVAQNVVLSVHFFTGLILMVISFIMGLIKTTAKTNSFLKNFFRISPGFCFADGLASLALLRQGIKDKTSDRVYDWNVTGASICYLGVQSVCYFLLTLGLESLPLHKLTPIAVKQWWINCWRRNLANAQIETSSPSLEPLLTPSPEYFTPHFDLDADVTAERNRVLSGSTDNAIICLRNLRKVYPGETYLHKKVAVDSLTFSVQEGECFGFLGTNGAGKTTTLSMLTGEESPSEGTAFIFGKDMRSDPKVARCHIGYCPQFDALLEFLTAKEHLELYARIKGVPKWKINDVVREKLMDFDLLKHANKPSYSLSGGNKRKLSVAIAMIGEPPVVILDEPSTGMDPIAKRFMWDVISRISTRQGKTAVILTTHSMNEAQALCTRIGIMVGGRLRCIGSSQHLKTRFGNHLELEVKPHEIRPEDLFNLCQNIRERFFDFPSHPRSLMNDIEVCMGATDPITPENQSVKEISLSRQMLIMIGRWLGNEERIKTLVSSLSTAPGVFGEQLTELFFREGSIPLPIFSEWWLATEKFSEINSFIVSSFPGATLHSCNGLSMKYQLPYGEDGLSLADAFGHLERNRKKLGISEYSLSQSTLETIFNHFASNP Homology
BLAST of Sed0024936 vs. NCBI nr
Match: XP_022967690.1 (ABC transporter A family member 1 [Cucurbita maxima] >XP_022967692.1 ABC transporter A family member 1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 3354.3 bits (8696), Expect = 0.0e+00 Identity = 1691/1905 (88.77%), Postives = 1776/1905 (93.23%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. NCBI nr
Match: XP_022928622.1 (ABC transporter A family member 1 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 3353.1 bits (8693), Expect = 0.0e+00 Identity = 1690/1905 (88.71%), Postives = 1778/1905 (93.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. NCBI nr
Match: KAG6603210.1 (ABC transporter A family member 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 3350.5 bits (8686), Expect = 0.0e+00 Identity = 1692/1905 (88.82%), Postives = 1776/1905 (93.23%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. NCBI nr
Match: XP_023543867.1 (ABC transporter A family member 1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 3339.7 bits (8658), Expect = 0.0e+00 Identity = 1685/1905 (88.45%), Postives = 1774/1905 (93.12%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. NCBI nr
Match: XP_038881444.1 (ABC transporter A family member 1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 3330.0 bits (8633), Expect = 0.0e+00 Identity = 1681/1905 (88.24%), Postives = 1769/1905 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84M24 (ABC transporter A family member 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCA1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 2581.2 bits (6689), Expect = 0.0e+00 Identity = 1310/1905 (68.77%), Postives = 1562/1905 (81.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q99758 (Phospholipid-transporting ATPase ABCA3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCA3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 728.0 bits (1878), Expect = 2.7e-208 Identity = 593/1960 (30.26%), Postives = 877/1960 (44.74%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P41233 (Phospholipid-transporting ATPase ABCA1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Abca1 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 716.5 bits (1848), Expect = 8.2e-205 Identity = 554/1726 (32.10%), Postives = 834/1726 (48.32%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O95477 (Phospholipid-transporting ATPase ABCA1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ABCA1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 710.7 bits (1833), Expect = 4.5e-203 Identity = 547/1718 (31.84%), Postives = 827/1718 (48.14%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8R420 (Phospholipid-transporting ATPase ABCA3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Abca3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 704.9 bits (1818), Expect = 2.5e-201 Identity = 554/1775 (31.21%), Postives = 846/1775 (47.66%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HV62 (ABC transporter A family member 1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467144 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 3354.3 bits (8696), Expect = 0.0e+00 Identity = 1691/1905 (88.77%), Postives = 1776/1905 (93.23%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EKF6 (ABC transporter A family member 1 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435475 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 3353.1 bits (8693), Expect = 0.0e+00 Identity = 1690/1905 (88.71%), Postives = 1778/1905 (93.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DFF4 (ABC transporter A family member 1 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019999 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 3299.2 bits (8553), Expect = 0.0e+00 Identity = 1675/1905 (87.93%), Postives = 1761/1905 (92.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EPK6 (ABC transporter A family member 1 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435475 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 3291.9 bits (8534), Expect = 0.0e+00 Identity = 1657/1869 (88.66%), Postives = 1743/1869 (93.26%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CCN6 (ABC transporter A family member 1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499508 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 3289.6 bits (8528), Expect = 0.0e+00 Identity = 1661/1904 (87.24%), Postives = 1753/1904 (92.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. TAIR 10
Match: AT2G41700.1 (ATP-binding cassette A1 ) HSP 1 Score: 2581.2 bits (6689), Expect = 0.0e+00 Identity = 1310/1905 (68.77%), Postives = 1562/1905 (81.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. TAIR 10
Match: AT2G41700.2 (ATP-binding cassette A1 ) HSP 1 Score: 2317.7 bits (6005), Expect = 0.0e+00 Identity = 1224/1920 (63.75%), Postives = 1457/1920 (75.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. TAIR 10
Match: AT3G47730.1 (ATP-binding cassette A2 ) HSP 1 Score: 255.0 bits (650), Expect = 4.8e-67 Identity = 217/697 (31.13%), Postives = 331/697 (47.49%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. TAIR 10
Match: AT5G61730.1 (ABC2 homolog 11 ) HSP 1 Score: 245.7 bits (626), Expect = 2.9e-64 Identity = 195/643 (30.33%), Postives = 305/643 (47.43%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024936 vs. TAIR 10
Match: AT5G61700.1 (ABC2 homolog 16 ) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 8.7e-61 Identity = 130/284 (45.77%), Postives = 172/284 (60.56%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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