Sed0024176 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0024176
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG10: 32732674 .. 32736679 (+)
RNA-Seq ExpressionSed0024176
SyntenySed0024176
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TTTTATTAAATTTAAAAAAAATGAATGGAATTCTATGGATTAGTTGAAAACACATATGGGTTATTATTATTAAAATAGATATATTTTAAAGGAGGATTTCTTTTAAAAGAAAAAAAAGGAAAAAGAAAAAGTAAAAAAATTATATATATCCCTCTTTCCCTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCCCTCAACCCAAACCCTAGCCTCCATTCCAACCCCGCCGTTGTTCGACGTCGATCGCCGCCAGCCGTCAACTACCCACAACCACTTGTGCGCCCCGTCGTGCTCAGACCCACCTGTGCGCACGCTGACAGCCCCTGTGCAGACGCACGTTGTAATGACCCAGAATTTTGGAAAAAAAAGAGCTATTAAAAGATAATAATAATAATAATAAAGATTACCTTCTCCTTTTATTTAAGGAAAAGTAAAAGGTTGGGGTTTTAAGGCTATTTGGAAAAAAAAACCCATGTGGGAAGTTAGATAACATTTAAATAGATGATAAAAAAGAGGTTTTGTAAAATAATAAAAAAAAAACAAAAACTCATTTTATTTTCTTTTTTTCCCTTTTCTTTTTCTCTTCTTCTTTTTCTTCCCCTCCATCTTCAAACCCTAGATCTACCTTCCCCTGCTGCGCCACCGCCTCCGCCTGCACCCCGACCGCCGTCGACTCGTCGCCTAGTCGCAACCACCGCCGTTCATGCCAGCTCAGCATGTTTAGAGCGCCGCGCCAAGACGATCTCGTCTCTCCTTGCGCGCGCGCACAACGCGAAGGCGCAATTCAGCGCCGGTCACACCCACGAAAGCCCCGTTGTGCCACCTTAGCACAGCTCCCACGCGCGCTCTCGTCCCCTGACTCAGCCAACCGCATTGCTCCGCCCAGCAGCGCGCGATACATGCCCCTGTTCAGCGCCCTAGTCGCGTGTTTCCTCGCCTAACCTTGTACCTGCGCGACGCTGCCTCATCTCGGTCACACTCTGCATGCTCGTCCCTACAACAGCCTTGTTGTTCGACGCCAACAAGCAATCGTGCTCTGATTCGCACGCGTTTATGTTCATGGGTTTCGCTCCTCTGTGTTCATTATGTTCAGATCTTGGGTAAAGTTGTTAGCTCGATGTTATTCATGTTGTCGATTAATCGTTTGGGCTTGATTGTATGTAATGATGAGTATTTTGTTTGGGTCGGTTACGAAGTGTTGTTCTTGTTGGATTTTGAAACTTGTGTATGGTAGGTTCGACTTGGGTTTGGTGCTTCACCAAGCATTGGTCAGCCGTGCTCGAGTTTTTGTTTGGTAATGGTTTTTTCTCTACTCTCATGGTTAATTTTCATTGTTGCTTGGGTAAAGTTTTCTAATTAAGAATAATGGATAGGTCGTTTCAACTGAGTTTTGGTGGATTTTCTAACTACCGCTCAAGGAGCACTTTTAATTGATTGTTTAGTAAGATTCAATTTCAGGTAAGGACTCTCTACCCGGATTGTGTGGACCCTGCACAGGGCGAAACTCATTGTGTTGTTTCATGCATTTCTAGATATGGATGTGGCCTGGTATTGTTTTGGTTGGCTCTGAATTGTTGGTTATGGATTGTTGCTAGTATGTAGGTGATGTGTATGTCTGTTGGGTTGTCCTTCTGTGTGCCTTGACCTCGGGATTAAGGGGTCCCGGGGTGTCACTTTTTCATGTGTGTTTCTCTTGTATTTTTATGTTTTGTATTTCGGGATTATGGGGTCTCGGGGTTCCAAACTTGTATGTGTTCTTTAAATTATATTTCTTGTGAACATGCTAGGATTATGGGGTCTTAGCATGTTATTTGTTCTGTTATTAGTTCTTGGTTCTCTGAGTATGTGTTTGAGTTGGTGATGATGTGTGTGGTATGTAGCTAGTCCCGATCATGTAGAGAATAGTATCCTGTTAGGATGACTGAATGAGAATAATCAAGCAGGTTTGGTGATCTGTTGGGACTGAGTTGTTGGAAGTTGATAGGTTGTTGTGGTTCGAGTTCTCGCTTGTTGGAAGTTGTTGGAATTGTTATGTATCTTCTTTTCAGGTAAGGATTCTCTACCCGGGTTGTGTGGACCCTGCACAGGGCGAAAATTATCGTGCTGCAATATGTAATATTTTCAAATATGGATGTGGGATGATGATGCATTGTTGATTATGAATTATTGCTGACATGTGTGGTGTTTAGTGTATGTCAGGTTGTTACTTGTTTGTTCTGTACACTTTGTGCTTCAGGATTATGGGGTCCCGAGGTACTTTTTCTGTATGTTTTATTTGTCTTACTTATAACTATATGTGTGCTTTGGGATTACGGGATCCCGAGGTGACACTGTGTATGTAATTTCTATAATTATGATTCGTGTGAAGCATGCTAGGATTATGAGGTCTTATCATATTGTTGTTCTTATGGTCGTTCTATGGTTTTTTTGGTGTGTGTGTGAGCGAGTGATGATGTGTTTACTTTGTGTACACTATTAATCCTTCAAGTTTTTTTTTAAAAAAAATTTTCCTCTACATATATCGCTTAAGTTTTTTTTAATTTTTTCCTCTACATATATTGCTTCAGGCATCTCCCTCTTGATCGTGCATCGATTGATGATTGATTGTAATCTTTTGTAACTTAGCTTCAGTTTATTAACTTAACATTTTTAATGATTCTTGTTTGTGGACATCCTTCTCTTATAAAATTAACTTCATGTATCTTTGAGGTTGGTTTAAAATTTTTCATTTTTTTTCTACACTAACTCAATGTATGTGTGTTATAACAGTTCACTCCATATTTTCTTTCCATTTTGTAGTGTTGTTTTCTATATTTAACTCTGGTAACTCTTAACTCTTAAGTACATTGATATTGTTTTCCTCTAACAATTTTTTTTAAAGCCCTAATGTCTTTCTTTTCATATCTGTTGATTCTAATCCGTGTGTTGATTTATTTTCATGTTACCTTTACCAATTGCTTAGTGCTTTGTTTTACTTTATAATTTCTTCTTATTGATTTTTGTGTTGGTTGAAACTGTAGCTCAATTTGGCGTAATTTTTCTTCTTTTTGCTATGAGGTTGTTTTCATCAAGTAAGGTTAGTCATGTACAACTTTATTTGCAATAAGTTGTACGTTGAGTCTATTTTTGGAAACTTGGGAAATATGTGTGGCTAACATATTAGGAAGAGTACGATATAGCTATTGTTTATTAAGTTTATTTTTACAAGTACATCTCTCCAAATCTTGTGAACTAAATATTTAACTAATTTCTTTTTATAGTGAGAGAAATGGTATCGGTGGTACCAATTCTTTCGAGTGGATAATGATCATGGAGGTAGAGTTTTACTTTTGTTTTTACGCCTTTCTTTATATCATGTTTTTTTTTAATTATAATCACTTTCCTCAATCAAGTATCGCTTGGTTGAATTATATTTATGTCTCTTTTGCTAAATTATGTTTTTATCAATTTGAGAGAGTATTTAGGAAGATAGAGTAGTAAACTTGGAATTGATAGTTGGTAATTGGTTTGTACTATTAGAATTTGCTAGGTACCAATTGCACTTACATGATTGGAAAGGTAGAGAAGTTGCAACTCTATTCAATGTTTTTGTTCAACATCGTGAAGGTAAGAGATTAGATCTTAATGAGATTTTCATTTGTTTTTTTTTTTTCAGTTTCATTCTTCTCATATTTTCTCACACCACTAAGATAAGGTTATGGGAACCTGAGATCTTGAAGGGAGCACACCTTCAAATCCTAATTCACTACCATTTATATTTTTTCTTCATTTCTCTTAGAAATTTTTGCCACTCCTATAGTGACAATTTGAAGAATTTTTTTTTGTTTGCTTTGCATTTTTATTAAGGTACGTTTAAAATCTCTTAAAAAGTTTCTTATTTGATTTGTCTTTGCATTTTTAGGAATCGTTTGGGTATCCAACTCGTGGCAATCTTCTAAAGTTGAACTTGAGATAATTTGATCTCTTACGTGACTTATGTGAATCTTGTTATTTGCTTTTACTAGCT

mRNA sequence

TTTTATTAAATTTAAAAAAAATGAATGGAATTCTATGGATTAGTTGAAAACACATATGGGTTATTATTATTAAAATAGATATATTTTAAAGGAGGATTTCTTTTAAAAGAAAAAAAAGGAAAAAGAAAAAGTAAAAAAATTATATATATCCCTCTTTCCCTTTCTTCTTCTTCTTTTTCTTCTTCTTCTTCCCTCAACCCAAACCCTAGCCTCCATTCCAACCCCGCCGTTGTTCGACGTCGATCGCCGCCAGCCGTCAACTACCCACAACCACTTGTGCGCCCCGTCGTGCTCAGACCCACCTGTGCGCACGCTGACAGCCCCTGTGCAGACGCACGTTGTAATGACCCAGAATTTTGGAAAAAAAAGAGCTATTAAAAGATAATAATAATAATAATAAAGATTACCTTCTCCTTTTATTTAAGGAAAAGTAAAAGGTTGGGGTTTTAAGGCTATTTGGAAAAAAAAACCCATGTGGGAAGTTAGATAACATTTAAATAGATGATAAAAAAGAGGTTTTGTAAAATAATAAAAAAAAAACAAAAACTCATTTTATTTTCTTTTTTTCCCTTTTCTTTTTCTCTTCTTCTTTTTCTTCCCCTCCATCTTCAAACCCTAGATCTACCTTCCCCTGCTGCGCCACCGCCTCCGCCTGCACCCCGACCGCCGTCGACTCGTCGCCTAGTCGCAACCACCGCCGTTCATGCCAGCTCAGCATGTTTAGAGCGCCGCGCCAAGACGATCTCGTCTCTCCTTGCGCGCGCGCACAACGCGAAGGCGCAATTCAGCGCCGGTCACACCCACGAAAGCCCCGTTGTGCCACCTTAGCACAGCTCCCACGCGCGCTCTCGTCCCCTGACTCAGCCAACCGCATTGCTCCGCCCAGCAGCGCGCGATACATGCCCCTGTTCAGCGCCCTAGTCGCGTGTTTCCTCGCCTAACCTTGTACCTGCGCGACGCTGCCTCATCTCGGTCACACTCTGCATGCTCGTCCCTACAACAGCCTTGTTGTTCGACGCCAACAAGCAATCGTGCTCTGATTCGCACGCGTTTATGTTCATGGGTTTCGCTCCTCTGTGTTCATTATGTTCAGATCTTGGGTAAAGTTGTTAGCTCGATGTTATTCATGTTGTCGATTAATCGTTTGGGCTTGATTGTATGTAATGATGAGTATTTTGTTTGGGTCGGTTACGAAGTGTTGTTCTTGTTGGATTTTGAAACTTGTGTATGGTAGGTTCGACTTGGGTTTGGTGCTTCACCAAGCATTGGTCAGCCGTGCTCGAGTTTTTGTTTGGTCGTTTCAACTGAGTTTTGGTGGATTTTCTAACTACCGCTCAAGGAGCACTTTTAATTGATTGTTTAGTAAGATTCAATTTCAGGTAAGGACTCTCTACCCGGATTGTGTGGACCCTGCACAGGGCGAAACTCATTGTGTTGTTTCATGCATTTCTAGATATGGATGTGGCCTGGTATTGTTTTGGTTGGCTCTGAATTGTTGGTTATGGATTGTTGCTAGTATGTAGGTGATGTGTATGTCTGTTGGGTTGTCCTTCTGTGTGCCTTGACCTCGGGATTAAGGGGTCCCGGGGTGTCACTTTTTCATGTGTGTTTCTCTTGTATTTTTATGTTTTGTATTTCGGGATTATGGGGTCTCGGGGTTCCAAACTTGTATGTGTTCTTTAAATTATATTTCTTGTGAACATGCTAGGATTATGGGGTCTTAGCATGTTATTTGTTCTGTTATTAGTTCTTGGTTCTCTGAGTATGTGTTTGAGTTGGTGATGATGTGTGTGGTATGTAGCTAGTCCCGATCATGTAGAGAATAGTATCCTGTTAGGATGACTGAATGAGAATAATCAAGCAGGTTTGGTGATCTGTTGGGACTGAGTTGTTGGAAGTTGATAGGTTGTTGTGGTTCGAGTTCTCGCTTGTTGGAAGTTGTTGGAATTGTTATGTATCTTCTTTTCAGGTAAGGATTCTCTACCCGGGTTGTGTGGACCCTGCACAGGGCGAAAATTATCGTGCTGCAATATGTAATATTTTCAAATATGGATGTGGGATGATGATGCATTGTTGATTATGAATTATTGCTGACATGTGTGGTGTTTAGTGTATGTCAGGTTGTTACTTGTTTGTTCTGTACACTTTGTGCTTCAGGATTATGGGGTCCCGAGCTCAATTTGGCGTAATTTTTCTTCTTTTTGCTATGAGGTTGTTTTCATCAAGTAAGTGAGAGAAATGGTATCGGTGGTACCAATTCTTTCGAGTGGATAATGATCATGGAGGTAGAGTTTTACTTTTGTTTTTACGCCTTTCTTTATATCATGTTTTTTTTTAATTATAATCACTTTCCTCAATCAAGTATCGCTTGGTTGAATTATATTTATGTCTCTTTTGCTAAATTATGTTTTTATCAATTTGAGAGAGTATTTAGGAAGATAGAGTAGTAAACTTGGAATTGATAGTTGGTAATTGGTTTGTACTATTAGAATTTGCTAGGTACCAATTGCACTTACATGATTGGAAAGGTAGAGAAGTTGCAACTCTATTCAATGTTTTTGTTCAACATCGTGAAGGAATCGTTTGGGTATCCAACTCGTGGCAATCTTCTAAAGTTGAACTTGAGATAATTTGATCTCTTACGTGACTTATGTGAATCTTGTTATTTGCTTTTACTAGCT

Coding sequence (CDS)

ATGATAAAAAAGAGGTTTTGTAAAATAATAAAAAAAAAACAAAAACTCATTTTATTTTCTTTTTTTCCCTTTTCTTTTTCTCTTCTTCTTTTTCTTCCCCTCCATCTTCAAACCCTAGATCTACCTTCCCCTGCTGCGCCACCGCCTCCGCCTGCACCCCGACCGCCGTCGACTCGTCGCCTAGTCGCAACCACCGCCGTTCATGCCAGCTCAGCATGTTTAGAGCGCCGCGCCAAGACGATCTCGTCTCTCCTTGCGCGCGCGCACAACGCGAAGGCGCAATTCAGCGCCGGTCACACCCACGAAAGCCCCGTTGTGCCACCTTAG

Protein sequence

MIKKRFCKIIKKKQKLILFSFFPFSFSLLLFLPLHLQTLDLPSPAAPPPPPAPRPPSTRRLVATTAVHASSACLERRAKTISSLLARAHNAKAQFSAGHTHESPVVPP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Sed0024176 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Sed0024176 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Sed0024176 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Sed0024176 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0024176.1Sed0024176.1mRNA