Sed0024025 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGATTGAGACTAAACTTTATGTCAATACTACCTTTGTTATTATCGTTTGCATATATTGCTAAAGCCCAATACACAGCTGGTGCAGTATTTGATATCACTAAATCTGGCGCCAAACCTAATGATGATGTTACTACGGTTAGTATCTACTAGTTTGTTAACCCCTTTAATTTATATATAAATAAATACATTTATTTGAAGTAGAATTCAATTTATAGGCTTTAGCAACCGCATGGAAGGAAGCATGTGCATCAACCACTCCAAGTAAAGTGTTGATTCCAAAAGGAGTTTACAAATTAAAAGAATCCGAGCTCAAAGGCCCTTGCAAGAGTTCTATTGAGCTTCAAATTGAAGGGACATTACAAGCTCCCTCAAACCCGGAAGGAGAAGGATGGGTCACTTTGGAAAATATCGACAAATTGACTTTGTCGGGCACTGGGATTCTTGATGGTCAAGGAGAATCGGGGTGGGCAAAGAATGATTGTCACAAAAAGAAGGAATGTACCAAGCTTCCCATGGTAAATGCTCTAGATACAAGAGATTTTTGTGCTTATCCTTATGGTACAAAATTTAATTTCATAATCTCAATTAGCATGTACATTTTAACACTTACTTTTTTTTTTTTTTGCAGAATTTGAGATTTAATTTCATCAACAATTCAATTGTGAAGGACATAACTTCATTGGATAGTAAAAATTTCCATATCAATCTTTTGGGTTGCAAAAATCTTACTTTTGATCACTTGACAATTACTGCACTAGAGAATAGCCCCAATACTGATGGAATTCATATTGGACATTCGGAGCAGATTAATATTATGAATACACAAATTGCAACCGGAGATGATTGTGTGTCTGTAGGGTATACTAACAAACAAATAACTATTAGTAATGTCACTTGTGGACCAGGACATGGAATTGCCATCGGAAGCTTGGGCAAATACAAGACTGAAGAAACTGTGGAAGGAGTTACCGTGAAAAATTGCAAATTAATCAGTACTACGAATGGTGTCCGAATTAAATCATGGCGGATTCAAATAAATCGATACCCAGTCTCTCGACTTGCATTTTGAAGATATTGAAATGGTTAATGTTAGCAATCCTGTCATTATAGACCAAGAATATTGTCCATGGAATCAATGCAACCGAAAGGTATATATGTTGAAATTATGACACATTCATTTCTAACTTATTATTAGCTCTAACTGCTATTAAAAAACCTCAAATTATAAGCTTTATATTTTATGTCTAAATTTTTATTTTTATTTCTATCATGTTTAGGTTCCATCAAAAATTAAAATCAGCAAAGTTAGCTTCAAGAATATTAAAGGTACTTCTGCAACTCCAGTAGCAGTCAAATTTGTTTGTAGCAAGAGTCTTCCATGTGAAGATGTAGAAATTGCTGATATTGATCTCACTTACGACGGAAAAGAAGGACCGATTGTTTCTGAATGTGCAAATGTCAAACCCATCGTTTCTGGAAAGCAAAACCCTCCCATATGTGCTAAGCCTGCTCCTGCTGACGCTTCATCAACGTACTAATCTTTTTACAATGGCATAATTTCTTAATGAGCGACGATTTAAAGTTTCAATTTTTATTTCAAGAAAAATAATTAATTATGTAACATTTCTTTCTAATTAACTACAAAATTTAAGATTGTTGTTCCCTTTAATAAATGGTGTAACGACCCAAGATTTTAGAGCTTATTATATAGTTCGACTGCCATATTTGTAATCTTGGAATGTAATGTAAGAAAACCCAAGGAAATATATTATAATTAAAGAAGAATCTTTAGATTTGAAGTCTCAAAATAAATCATTGTGTAAACTGCTTAAAATAATAGTGAGCAATCATATAAAATATGATTTTGCAGAATAAGGAAAATGAATCTAAGAAATTCAAATATAAACAAAGCCAATAAAATAAAATAATCGATGACATGGTAAATTAGAGTATTTTGGCTAATTTAGTGTTATAGTTTCTTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTTTTTATAATGGTTTAAGGTGTTAGTTTTGACTAGGTTGTCTGTTTTGGGCCTGGTTTTGTTATTTGAGGCTCGAGATTCAGTTGAACTTTTAATAGTCTAGTTTGTGAATTTGGCCTATGTAAGGAGCCCTTACCCTTATCGGTCTGTGGATTATCACATGTGTATATGTTGTTGCCTATGATTGTTTGTTGTGCATTGTTGATTCCTATTCAAGTATAATTACAAGTTAGCATATGTACTGCATCAGCCTTTGCGTCATTGTTGATATCTCGATATGATTGAATATTGTAGATGCATGTTTGGCCGAGATGTTCCAAGCTGAGCTAGCCTAGCTTTCTCTTATTGTTATTGTTGCGTGTCATACCAAGATTTTCCACGGTTAACTAGCACACACTGCGCTCATTCCATTGGGGACCAGATGATCCAGCATCCCAAGGAGGACCTGAGAGATGACTGTTGTTCCAAAAGGAACTTGTATGTTGTCGCAAAGGGAACCATATCTTGTTTGCGGTTCCAAAACGAAACTTATGATTTATAGCACGTGCTGATGCCCGGTATAGATGTCATCCGAGTTACGGGTATCAGATAGAGGTGATGATAAGGTTGTAAGGCGATGAGCGATCCCATTCGCAGTTAGTGATAGAGGATGGTTGGTCGACTGGAGCACTCTACCTACCAAAGTTCTCATGACAGTATCCTAGGTGTCTTGCCATTGTTTTTGGATTGCCTGGGTGATATCCTAATTCGAACGGTACTTGTACTGTTGTGTGACTCTTGAGGGCCACAAAGTTGCCTGCTCGCCGAGGACATTCTACTTGATATAGGTAGCCCAGTTTTCCAAGTGAGTTATAGGATTCTAGAGGGTATTTCGATCCTTGGCACATGTCGTGGGACGGTTCGCTGGAGCATGGGTCTGAGTACCCTTTGATGTAAATGTTTTATTAAAATATTATGGCTTATATTGTATTATATTATATGCTCTAGTGCATGTATACATGTTGTACCTCGAGTAGTGGATTCTTATTGAGTGTCAAAACTCACCCATTTCCATGTTGATTTTGTTGGCTTTTTGGCCATCTAAAATTAATTAATGAATGGATTAATGTTTTGATGATACAAACTTAATATTTATTTGCTAAAAAATTTAGTGTCGTAAAGTTGTCTTTTTGTAGAGGTTGGAATAACAATTCAATTGCATTTTGAATTACTCAAATCAAAGTTGAGATGAAAAAGTTACAGCCTAAACAAGTTTAAATGGTAAATCGCGACGTGATGAGTTTGCAAAATTGGCCAATCCAAGAGTGAAGTCTTGAATGTTTGACACTTGCGACTTTTTGTGTTTTAACAAAAAGTCAAAAGTAAAAGAAAAGGAAAAATGAAGATATACACTATTATATTATTATTTGAGCATGCGTCAACTTTTTTTTTAAAATGAAAAGAAATTTATATCTTCTTATATTTCTTTTATATGTTTGTCTAAATACTAACTTTTTGAATATTATAGTGTTATTATTCATTGTATCTAATGGTAACTTTCTCGATATCTTCTTTTATTTTCGCAATTAATTTATTGTTATATTTTATAATTTTTTTAGATGTTTATTTTGATTGTTTTAATTTTATCTTGACATATTCTATACCAATCTTAATATCGAATTAAAGAGGGTGCTTGAAGTTGGTGTTTGGAAATTTGCTATTTATTTTGCATCGTATTCTCTGTTAAATTTATTCCTTAGTAAAAAGTATATTAATTTGTTTAATTAGACCCACATTAGGAAAAAGTTTTATAAGAATGAAAGAAATCTTATACACTCGCTTGGGGTTGCCATACTTATACAATAGATTTTCTCACGGGTGCTTGGAACAAGATATATACCAAGGCTATTGATGTGACTATTACAAACGTTACAGAGTCTAGATATCATTCTAGCATAACTATTTTAATTATTGATGTTGTACGATCTTTGATATATTTTATGGCTTTAAGGATCCTCTTAAATACTTATTAAATGAATTATTTTTACCGTTTTAAGTTGCCATTTGGGAAATTTTACCGTAGATTTACATGCACGTGTAGTAAATTTCAAGATTTTAGCCCTTTGGAAATTTTGGGTTTCTATATGTGGACTATATATCCAAATATACTTAGATCTCATTTAATTAATAGTATCCTACTGTGTTTAGATTATTTTAGCCTTGATTTAGTCAATATTATCCTACTCTGCTTGTGTTATTTTACACTAGATTTACATGCACGTATAGTAAATTTTCGAATTTTAGTCCTTTGAAAATTTTGGGTCTATGGAAATTATGGACTGTCAAAATAATATTTAAACCTCATTTAATTAATATTATTCTAATTAGCATTATAATACAAATTATTTTCATGTAGTTGAACATTAATTCTATCTTGACGGCTTCCATCAAACTCTTCCTATTTGATAATAATTTTTATCATCCATGTTTTGCTTAATTACTCCATTTCAAAATATTAAAATTTCTTTTTGATCATATCTTTACGAATTAATTTTATTTATTGATAAACCAAACCCAACATAAAAAATTAATTTTCTTAGGAAATAAACTTCAAATGTTTTTAATATGTTTTCTTTCTACTAGCCTTTTTTTTTTTCGGGTTTAACAAAACTTTAAACAAACAACTTTGTTACACCTCTTAAAAGTATATATTTATGGTAAAGCTCAAAGTCATTTATAGCAACTACTTTTTAATGATTCATTGACTTTCAAATAAATGGCCTAATAGAAACCTCCTTCCATAGTGTGATATTCTATATTTTTATTTTGTTTTATTAAAAAATAAAAAGTATACATTTTTATAAGAAAAAGTAGTTATATATGCCTTTTATTTTTAGTAAAATAAAAAAGTATATATGTTATATATGTATGTGTTTTTTGTAAGAAAAATAAAACTATATAAATATAAAAACAAAAAACAATACTACATTAATAAGGATTTATGATATTGTATT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Match: KAA0045594.1 (exopolygalacturonase-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 324.7 bits (831), Expect = 7.3e-85 Identity = 177/320 (55.31%), Postives = 204/320 (63.75%), Query Frame = 0
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Match: XP_008449696.2 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: exopolygalacturonase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 323.9 bits (829), Expect = 1.2e-84 Identity = 176/321 (54.83%), Postives = 205/321 (63.86%), Query Frame = 0
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Match: TYJ96129.1 (Exopolygalacturonase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 323.6 bits (828), Expect = 1.6e-84 Identity = 176/321 (54.83%), Postives = 205/321 (63.86%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q40312 (Polygalacturonase OS=Medicago sativa OX=3879 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 259.6 bits (662), Expect = 3.8e-68 Identity = 118/179 (65.92%), Postives = 143/179 (79.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P35337 (Polygalacturonase OS=Brassica napus OX=3708 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 232.6 bits (592), Expect = 4.9e-60 Identity = 102/181 (56.35%), Postives = 137/181 (75.69%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P24548 (Exopolygalacturonase (Fragment) OS=Oenothera organensis OX=3945 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 229.6 bits (584), Expect = 4.2e-59 Identity = 102/179 (56.98%), Postives = 138/179 (77.09%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39766 (Polygalacturonase OS=Gossypium barbadense OX=3634 GN=G9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 226.9 bits (577), Expect = 2.7e-58 Identity = 98/175 (56.00%), Postives = 134/175 (76.57%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39786 (Polygalacturonase OS=Gossypium hirsutum OX=3635 GN=G9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 226.5 bits (576), Expect = 3.5e-58 Identity = 98/175 (56.00%), Postives = 134/175 (76.57%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K6J6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G037450 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 337.0 bits (863), Expect = 6.8e-89 Identity = 171/254 (67.32%), Postives = 205/254 (80.71%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LX75 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G066500 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 328.9 bits (842), Expect = 1.9e-86 Identity = 168/261 (64.37%), Postives = 187/261 (71.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DYI3 (Exopolygalacturonase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold303G00050 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 328.2 bits (840), Expect = 3.2e-86 Identity = 178/320 (55.62%), Postives = 206/320 (64.38%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TRZ0 (Exopolygalacturonase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold280G00600 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 327.8 bits (839), Expect = 4.2e-86 Identity = 178/320 (55.62%), Postives = 205/320 (64.06%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TR51 (Exopolygalacturonase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold243G00990 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 324.7 bits (831), Expect = 3.5e-85 Identity = 177/320 (55.31%), Postives = 204/320 (63.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. TAIR 10
Match: AT3G07840.1 (Pectin lyase-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 2.9e-63 Identity = 106/195 (54.36%), Postives = 147/195 (75.38%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. TAIR 10
Match: AT3G07820.1 (Pectin lyase-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 5.4e-62 Identity = 105/195 (53.85%), Postives = 147/195 (75.38%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. TAIR 10
Match: AT3G07830.1 (Pectin lyase-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 231.1 bits (588), Expect = 1.0e-60 Identity = 102/195 (52.31%), Postives = 146/195 (74.87%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. TAIR 10
Match: AT5G48140.1 (Pectin lyase-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 230.7 bits (587), Expect = 1.3e-60 Identity = 104/195 (53.33%), Postives = 143/195 (73.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024025 vs. TAIR 10
Match: AT4G18180.1 (Pectin lyase-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 197.2 bits (500), Expect = 1.6e-50 Identity = 90/175 (51.43%), Postives = 128/175 (73.14%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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