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Sed0022371 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGCCGGCGGTTGTGGCGGAAAGGCTAAACCAAGCGGTGCAGCAACAGTTGAACCTGGAGGCCGTGAAGACTCGAGCCATTACTCTATTCAAAGCCATCTCACGGATCCTCGAAGATTTCGATGCCTATGGTCGCACCAATACCACGCCTAAATGGTCTGGTCTGCGCTATTCTACTTTGCACTCATTTGTGTTTGTTTTCTATTTTCTCCTAATCTGGCCAACCAATTCTACACCCCAGGCAAGACATATTGGGGCAATATTCTATGGTGAATCTCGAGCTTTTCAACATTGTCGACGAAATTAAGAAAGTTTCCAAGGCTTTCGTTGTACATCCAAAGAATGTTAATGCCGAGAATTCTTCAAGTATGGGCCGGCATCCCTTCCCTTCCTAGTGTTTCGTTTGGTATTATACAAATCTGAGCGATGAATCCCCTGCTAAACTTAATTTCCCCTAACTCATGAAAAATTCTTCCTCTCACTATTCTTTAATTCTTCTTCATTTCTTTTTTAATCATCTTAAAACCAGTCTGCTAATTATTGCCTAACTCCCTCAATTAGTATTCAAGAGAAAGGAAAATGGTACAATCATTTAGGCCCATTTGATAACCATTTGGGTTTTAACATTTATGCTTATTTTTACTAAGTTTCCTACAAAATGCTCCATCTTTCCTAGAGAGTCGGTGGATGCTAACCAAATTTCAAAAACAAAAACGAGCTTTTGAAGCTATTTTTTTTTGTTCCCAAATTTTAGTTTGGTTTGTTTTCTTAAAACATAAGTAAGTTGTAAATATTAAGTAAGAATAAATCTATGTTAAGGTAATTGTTCTAAACTTAAATTTCAAAAACGAAAAACTAGAAATGGTTATCAAACAAAGCTTTATTTAATTCTAAAATTTTGATTAGCTGCAATTTTTTCTTCTTTTTTGTGAGCATAGTACTTCCAGTTATGTTGTCCTCAAAATTATTGCCTGAGATGGAGATAGATGACAATTCCAAACGAGAGCAATTGCTTCTTGGGATGCAGAACATGCCAATATCTACACAGATTGAGAAATCAAAGGTAACAGAAATTTGTTAAATTACTACAGGTTGTACGATTCTTTCCTCGAGTTCTACAAAAATTCATTCAATAGCTTACTTTCTTAGTATCCGGTATTTAGGTTTATCTTTTTTACAGACTAGAATAGAAATGATTGGAGCAGCCTGTGAAAGTGCTGAAAAATTATTAGCTGAGACTCGAAAAGCATATTGTTTTGGAATGCGTCAAGGGCCCGCGGTAGCTCCAACTTTGGATAAGGCTCAAGCTGCAAAAATTCAGGAGCAAGAGAATTTGCTCCGAGCTGCTGTTAACTTTGGGGAAGGTAACACTTCATTACTTTTATAGCCATGGATTAATGTCTAGTTTATGTATTGTTAGTAGTCTATTGGTCATTCCTTGTAAGTCGTAAGTCCACTAATGAGTAATGATTGAGCTATTTAGTAAAAATAATATTATGTTTAAACTTCTTGCCAATTTATCTCATATATGTTATTTTTAACAAGAACTAACACTTACATATCGAAAGGAATTTACAAATTACAAGACTATTGTTCAACATGGGTTGACCTAGGTGGTTAAATAAAAGCCTTGAAAATCATGATGTACTCAGTGTTTTAAAAAGCGCAAGGCGCACTAAGGCGCAAAGACCCTCTGGAGCCTGAGGCGCAAGGCGCACCTTAAGGCGATGGCTTTTTTACTTAAGGCGCACTATATTAAAAATAAAAAAAGATATATATATATATGTGGTTTATATGCCCAATAAAAGGAGTTTCATAGCAATAAAAGGTTCAAATTCAAACATATATGATATAATAATATATAAATAACTGAAGTCAAATTTCAATACATGATGCTTCAAGATTCAAAACAACCTAAAAGATGCAATCAAAACTACAAAAGTAAAAGCATAAGAATCTAAAGTCCTAAAGATCAAAATTCTCATCTTCATCATCACTAAATATCTCATCACCCTCGATCTCTACATCATTAGATTTATAAGCACTTGCATCTTCTTCTTCATCAGTGTCGGTATCCAAATCATGCAAAGCTAGTGGTATAGGTGCGGGTCGTGCTCGTGGTGGACATGAGACTCGAGATCGTGATATTGGTTGTGTGGATGACGAACAAGGTGCTTTATCCTTGTTTTTCGACGTGGCTCTAGAATAATAAGCAGGTTCTTTTGAACCAGATGCTCTTGAAACATCACCCCATGTTAGTGCGTCATCATCGTCGTTAAATACAAGATCTCTATCATCGTCGATGATCGTCATCCAATCTTCCCACCAACCACTCGTTACTCTCATCAATATCCTTTAGAGAGATGGGGTCCGCAACGTCTTTAATATTAAATCGACGCTTCAATGTTCTCGTTGTATTTTATGAACACCAAATCATTGAGACGACGTTGATCAAGTCTATTCCTCCTTTTGCTATGAAGTCGCATAATTAAAGAACCATGACAATTCAATATTTTAAACCTTAAACAAGTTACTCTAGGAGTGGTGAATTTAATTAACTATCTAACCTGTTAAAAAACACTCCAATTGCGCTCGCATCCAGAAGAACTACAGGTAAGACCTAAAACTCTTATTGCGAACTTTTGCAAGTTGGGACTTGATTTGCCAAAATCATCCCACCATTCCACTTTGTAGATTAAGATTAAAAATGATGTTAATAGCTTTCTAACCATAAAATACTTGTATTCAAGTTTAGAATTTACACGAGATCTTTTGTTTCTTTGTCTAATAGCCAGCGAGGTTCCAAACGATTCTTCACTTCTCTTATATAGGCTGAGTTCTTCAAGAATTTTATCTTGCATTTCTATGGAAGGAGTCATTCTTTCCAAACAAGAATGAAACCCCTTTGAAATTTCTACACTACTTTCAATCTTAGGATCGAGTAATAAAATTCTGATTTAGAAAAATTCCAGCTGCATGTAAGGGTCAATGCAACTGATGATCCCATCTCTTATCAATGATGGCAAATACTTCTTCATATTTGTCTTTGTTACTGAAACTCTTTTCTATGGTTTCCTTAGCCCTATCCATTGCTTCATAAATATATCCCATGGCCGGCTTTTTTTCGTTATCGACCAACCGGAGAACTTTAACTAGAGGACATGAGACTTTAAGAGCAAATGTGATAGTGTTCCAAAAGCTTGCCATCAAGATTGTTTGAACAACTCTTTTCCCCTGTTGTTCTTTACTCCATTTGCTAATTTTCCAATCTTCTGATGTAAACATCGTCCTCAAATTAAGTTTAACCCTACGTAAACTCGAAAATGTAATACAAGCTGTTGCAAAGCGAGTCTTGGCCGGTCTTATCAACTCTTGTCCATTAGTGTATCGCCTCATCATGTTCAACAACCCAGGACGACCATAAATAAAATTGCTAACCTCTATTGCTCTTTTTAGTGTTATTCGGATATTCGAGATCTTGAAGATATCTTCCAACATCAAATCCAAGCAATGAGCAGCACATGGTGACCAAAACAAGTGCGGTCGTTTTGCTTCTAATAATCTCCCTAATAGATAATAAACAAAGCACATGTTTATAAAATTGAAAAATATTAAATATATTAATCAACTTTCAAGAAGAGAAGAGTACGTTAGTCAAATTCTTACCTGCCATCACATTTGCAGAGGCACTGTCTGTAACAACTTGTATTACATATTCTTCTCCTATCTGTTCAACAAAATCATCTAACAATTGAAACATTTTCAGCCCATCCTTGACACACGAAGATGCATCAATGGATTCAACGAACATTGTTCCTTTAGGACTATTAACTAAAAAGTTTAGCAAAGTCCTATTTCTTCGATCTGTCCATCCATCCGTCATGATGGTACATCCAACTTTCTTCCATTCTTCCTTATGATCTTTCATCAAATCATTTGTTATTTTCAACTCCTTTTTCAAGCATGGAACTCGTAATTCATGATATGTAGGCGGCTTCAATCCAGACCAAATTGGCCTATTGCTTCAATCATAGGTCCTAAACTACTACTATTACAAGCATTGAATGGTATTCCGTAATCATAAAACCATCTAGCAATTTTTGGATGGCTTTCTCCTCATTTCCTTGTTGTAAGCGGCATTTAATGTTGTTTGCTTTCCTTTTTCATCCTTTTGAATCACAATTTTTGGTTTTGAGCAAAAAAGAATCCATCGGACCCTTTTGTTTCACCTTCTTTACGGCGGTTGAATTTGTTGATGACGCCGACGATCTCTTGTTTCCGTAAGAACAATAAATACTATCTTCATCTTCTTCATCTTCTTCTTCTTCAAGTGTATAATCGCTTTCAGGAATGATCAAATTTTTTTGTTCTTTCAACTCCTTTCTATTTGACATATATGCTTGAAGTTCTTTCTTTACATGTTCTGGGCATTTTCTACATGCCGTTACATTTCTATGACCCCCGACTAGGTGTTGTTTCATTCTATACACTCCTCCTTTTGTTACTTTATCACAAAAACTACATATGAAAGTATTTAGGTCTTCGGGCTTTACCAAATGAGAATAATTCCAAGCTGGATCTTTTCTCTGATTTCGTTCCTCAGCCATAATACAAAATCTGACTAGAAATATAAAATCAGCCACAAACCTCACATTTTCATTACTGATTAAATAAAACTTATGGGTACACATCTTGCTCAAGAATGTATGGGTATACTAAGAACATTAACATTCTTGCTCAAGAATGTATAATAACATTAGCTTATGCTTTGAAATTGTAGGAACAGGAATGGAAAATGTCTTCACATGGAATCAACACTCAATGAGCAAAGAAAAAGAGGAAAACAAACATTTTGAACTTGTTTTCAACAATCCAACATTCCAACCTCAACCTAAATGAAAGAAAAAAAAAATCATATAATCAACTAGTATAATCAACTAGCTTCACTATTACTTA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ATGGAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGCCGGCGGTTGTGGCGGAAAGGCTAAACCAAGCGGTGCAGCAACAGTTGAACCTGGAGGCCGTGAAGACTCGAGCCATTACTCTATTCAAAGCCATCTCACGGATCCTCGAAGATTTCGATGCCTATGGTCGCACCAATACCACGCCTAAATGGCAAGACATATTGGGGCAATATTCTATGGTGAATCTCGAGCTTTTCAACATTGTCGACGAAATTAAGAAAGTTTCCAAGGCTTTCGTTGTACATCCAAAGAATGTTAATGCCGAGAATTCTTCAATACTTCCAGTTATGTTGTCCTCAAAATTATTGCCTGAGATGGAGATAGATGACAATTCCAAACGAGAGCAATTGCTTCTTGGGATGCAGAACATGCCAATATCTACACAGATTGAGAAATCAAAGACTAGAATAGAAATGATTGGAGCAGCCTGTGAAAGTGCTGAAAAATTATTAGCTGAGACTCGAAAAGCATATTGTTTTGGAATGCGTCAAGGGCCCGCGGTAGCTCCAACTTTGGATAAGGCTCAAGCTGCAAAAATTCAGGAGCAAGAGAATTTGCTCCGAGCTGCTGTTAACTTTGGGGAAGGATTAAGATTACCTGGTGACCACCGACAGATTACACCAACACTTCCAATGCATTTGGTAGATGTGCTAAATGTAGGTGATGGAGTTCAAAGTTGTAATGAAATATCCGGTATGTATGCGAGGAATACTCTAACGTCAAATAATATTAGTGGTCAAGGATCATTGCTACAGCAACCTCCTGGATCACAACTTGTTGGAAGATCAGCTGCTTCACCTTCTGGTGCTACAAGTGCTACATCCTTTGATAACACAACATCGCCACTGCCGTATGCTAACTCTCCAAGATCTAGTGCGAATATTATGAACATACCTTCTCCTCAACAGCAGATCCAACAACAGCAACAACAGCAACAACAACAGCAGCAACAGCTTCAGGTTCAACAAAGGCAAAAGTTGATGCAACTACCTCAGCATCAGCAACTTCTTGCCCAACAGTTGAGGCAGTCGTCTATGCAAGGAATAGGACAGATTCATGGACAACATCAGATGCAGTTTACACAGCCACTAGCTCACCAGCAATATCAGGGAAGGCAGATGTCTGCTGGAATTCAACATGGCATTAGTCAAAGCCAACTTAGCCAAGGAAATCAAATGGCTCGTCAATTGAGCCAGTTTTCTGGTGCTGCGAACAGTGGTTTGTTTAATGCTGCGCAGACTACACAAAATTCTCAAATGGTCAGATATCTCCATCTTATATTTTGTTAAGCTTTAGCGTTCTTGTTTTTTTCTTTCTTAGATGTAGTTGGACTGATGTTGCTATCTATCTAGTGCATGGCATTAAGTAATCATATGATTAAATGAGAAAATGTTGCTATGAAAGGGGGTTTGGCCCAATTTGAGGGGCCCAAAATGTTGCGGGGTCTACTCGGTTTGAATAGGTGGGTCATGTAAGGGTGGTCAGTCAGCACTATTGAAACTGCTGTGGGTATTTTGTTACTGTCTCCTTGCTTGTAGTTCCATTTCATTTCAGTTTTTTAATCCAAAGGTTACTTCTAGCTTGTTTTATTCTTGTGTTCTTGGTAATTTCTCAGTATATTATTTAAGTTTAGTATGGAAACCCCTTCGGATCACTATGAGAAGCATAGCGGGTGTTGCTCAAATCCAGTGGCTTGCAATGTTTTTTCCTGTCAGTGACTTGGGTCCATGGATTCTAACGACAGAGCCAAAGTAATAATAATCTTTATTGAAGAAAGGTTCAATGCTATCAAAGATGGCTGAGGATGTTGTTGATGGCAGATGAATGGTGGTTGATAACAATCTGACTGATTGTGGTGACCTGTGACCATTATGGGAACTTCCATCGTAACTAACCTTGATGCAATTTTCTTAACCACTTCACAAAACCCTTCACAAGTGTTTCCAAATATGCCAAATATGTCAGCTACAAT ATGGAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGGCTCAGCCGGCGGTTGTGGCGGAAAGGCTAAACCAAGCGGTGCAGCAACAGTTGAACCTGGAGGCCGTGAAGACTCGAGCCATTACTCTATTCAAAGCCATCTCACGGATCCTCGAAGATTTCGATGCCTATGGTCGCACCAATACCACGCCTAAATGGCAAGACATATTGGGGCAATATTCTATGGTGAATCTCGAGCTTTTCAACATTGTCGACGAAATTAAGAAAGTTTCCAAGGCTTTCGTTGTACATCCAAAGAATGTTAATGCCGAGAATTCTTCAATACTTCCAGTTATGTTGTCCTCAAAATTATTGCCTGAGATGGAGATAGATGACAATTCCAAACGAGAGCAATTGCTTCTTGGGATGCAGAACATGCCAATATCTACACAGATTGAGAAATCAAAGACTAGAATAGAAATGATTGGAGCAGCCTGTGAAAGTGCTGAAAAATTATTAGCTGAGACTCGAAAAGCATATTGTTTTGGAATGCGTCAAGGGCCCGCGGTAGCTCCAACTTTGGATAAGGCTCAAGCTGCAAAAATTCAGGAGCAAGAGAATTTGCTCCGAGCTGCTGTTAACTTTGGGGAAGGATTAAGATTACCTGGTGACCACCGACAGATTACACCAACACTTCCAATGCATTTGGTAGATGTGCTAAATGTAGGTGATGGAGTTCAAAGTTGTAATGAAATATCCGGTATGTATGCGAGGAATACTCTAACGTCAAATAATATTAGTGGTCAAGGATCATTGCTACAGCAACCTCCTGGATCACAACTTGTTGGAAGATCAGCTGCTTCACCTTCTGGTGCTACAAGTGCTACATCCTTTGATAACACAACATCGCCACTGCCGTATGCTAACTCTCCAAGATCTAGTGCGAATATTATGAACATACCTTCTCCTCAACAGCAGATCCAACAACAGCAACAACAGCAACAACAACAGCAGCAACAGCTTCAGGTTCAACAAAGGCAAAAGTTGATGCAACTACCTCAGCATCAGCAACTTCTTGCCCAACAGTTGAGGCAGTCGTCTATGCAAGGAATAGGACAGATTCATGGACAACATCAGATGCAGTTTACACAGCCACTAGCTCACCAGCAATATCAGGGAAGGCAGATGTCTGCTGGAATTCAACATGGCATTAGTCAAAGCCAACTTAGCCAAGGAAATCAAATGGCTCGTCAATTGAGCCAGTTTTCTGGTGCTGCGAACAGTGGTTTGTTTAATGCTGCGCAGACTACACAAAATTCTCAAATGGTCAGATATCTCCATCTTATATTTTGTTAA MEAQAQAQAQAQAQPAVVAERLNQAVQQQLNLEAVKTRAITLFKAISRILEDFDAYGRTNTTPKWQDILGQYSMVNLELFNIVDEIKKVSKAFVVHPKNVNAENSSILPVMLSSKLLPEMEIDDNSKREQLLLGMQNMPISTQIEKSKTRIEMIGAACESAEKLLAETRKAYCFGMRQGPAVAPTLDKAQAAKIQEQENLLRAAVNFGEGLRLPGDHRQITPTLPMHLVDVLNVGDGVQSCNEISGMYARNTLTSNNISGQGSLLQQPPGSQLVGRSAASPSGATSATSFDNTTSPLPYANSPRSSANIMNIPSPQQQIQQQQQQQQQQQQQLQVQQRQKLMQLPQHQQLLAQQLRQSSMQGIGQIHGQHQMQFTQPLAHQQYQGRQMSAGIQHGISQSQLSQGNQMARQLSQFSGAANSGLFNAAQTTQNSQMVRYLHLIFC Homology
BLAST of Sed0022371 vs. NCBI nr
Match: XP_038874270.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X6 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 1.1e-194 Identity = 380/437 (86.96%), Postives = 402/437 (91.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. NCBI nr
Match: XP_038906890.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038906961.1 mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 690.3 bits (1780), Expect = 1.1e-194 Identity = 380/437 (86.96%), Postives = 402/437 (91.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. NCBI nr
Match: XP_022956012.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 688.7 bits (1776), Expect = 3.2e-194 Identity = 389/438 (88.81%), Postives = 407/438 (92.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. NCBI nr
Match: XP_038907034.1 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 683.7 bits (1763), Expect = 1.0e-192 Identity = 379/437 (86.73%), Postives = 401/437 (91.76%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. NCBI nr
Match: KAG6581760.1 (Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 682.9 bits (1761), Expect = 1.8e-192 Identity = 389/442 (88.01%), Postives = 407/442 (92.08%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4V3C1 (Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MED8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 443.7 bits (1140), Expect = 2.4e-123 Identity = 280/461 (60.74%), Postives = 338/461 (73.32%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GV67 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457835 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 688.7 bits (1776), Expect = 1.6e-194 Identity = 389/438 (88.81%), Postives = 407/438 (92.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GVL6 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457835 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 682.2 bits (1759), Expect = 1.5e-192 Identity = 388/438 (88.58%), Postives = 406/438 (92.69%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IZN9 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 678.7 bits (1750), Expect = 1.6e-191 Identity = 386/440 (87.73%), Postives = 405/440 (92.05%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IWU9 (mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479910 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 672.2 bits (1733), Expect = 1.5e-189 Identity = 385/440 (87.50%), Postives = 404/440 (91.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VLA2 (Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold238G001760 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 654.4 bits (1687), Expect = 3.3e-184 Identity = 369/441 (83.67%), Postives = 394/441 (89.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0022371 vs. TAIR 10
Match: AT2G03070.1 (mediator subunit 8 ) HSP 1 Score: 443.7 bits (1140), Expect = 1.7e-124 Identity = 280/461 (60.74%), Postives = 338/461 (73.32%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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