Sed0018047 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATATTAGACACAAACTTAGAGAAGATGAGAGAAAAGAAGGTATATTGTGGTTTGTTGGTGAGACATAGCATTTATGCAGTGATGTTCATACTCTCCAAAGCTGCATTTGATGGTGGAATGAACAGCTTTGTATTTGTTTTCTATAGACAAGCCATAGCCACCCTCTTCTTGTTTCCTATAGCTTTCTATTTTGAATGGTAACTTTGTTTCTTTTTTAATTCATTAAACCTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTAATTTCATATGGCCAATAATTCTCATTAAAATTTTCTGTTTGTTTCTCAGGAAAACTGCTCCACCCCTCTCATTCCTCACCTTTTGCAAGATCTTTCTGCTTTCTTTGATTGGGTATGTTTTTTTCTTTTTTTCAACTTTTTTAGTTTTCCAACCTTTCATTGTTTCTGTGCATATTTTACAGTTTCAATGGAGGAGACACATATATACCTTCTTTGGCGATTTAATATGAATAATTAGTAGTTTATGCGATAAGTATATTAATCTTGTTTAAACATGAAGTATATAATGATTTATTCAAACTAGCCAACAAAAGCAATAGTTCAACAACATTAATGTACACCTACGCATCAAGAGATCATGGATTCAACCACTCATCATGTTATTAAACCGGAAATTTTTTTTTTTTTATTCAAACTATTACTAGTATGTAATATTTTAGTCTTCATTACTAGAGCTCATCGAAATCATCAAAACGAGGTTGATCAGCCACACCAACCTTTGGTCAGCATCAGATTTGGTTCTGCAAAACCAAAACTTTGAATCAAATTGGTCAAAATATTTGTGGTTTTGCCATTTGCCCACAATAAACTTTGTGGCTGCTCAACACCACGGCCTTTATAAGAAATGATTACGTTTTAAGAGTTTAAAATAGTGAAATAAGAAATTGTTCGATTGAAAATTGCCCAAAAAAACTAGTCATAGGTTCTTCTCTCTCAAATTTATTGAAGAGATGAAATATAACTAAGGTATATCTTTTTTATCAGAGGTTAAATGGATCACGAGAGGAAGAATTAGGCAAAAAATTAATATATTTTTTCTTGTTTTTAATTTTTATATTTTCACTTTTTCAATATATATGAAATATTTTTTTCATTATTAATTGAGATGGAACCATATAATGTCTAATATGACATAAGAATTTAAAGTGGATATTTGATCTCTAATTTCGTATTCAATTCAAGCAAATAAAGTTTTAAGATCATCAAATCTTTAACTTTAGCTCCACAGTAAAATTTTAAGATCATCAGATGTTATATATATATATATTTCCTTTTTGTTTTTAATTTCTATCTTTTGACTTATTCTTTTCTATTCCTCACCATTACTTATATTTTAAAGTTTAGAGATCAATTCGTGATTCCAAAATAAATGGTAAGAAAAAGAAACATATTTATGCTTAATAGAATCAATTTTGAATAGAACAAAAAAAGTACTTAAAAGACGTTTTAAGCATTAGATATAAATAAGAACATTTATTGAACAATATGAAGAAAAAAAAATCAAAAAAAAAAAAATCGAGTAGAACATATTCGAAACAAACCCTTTATTACAATTACGTACGAAAGTTGTTGTGTTGGCAGGATGAGCATATGTCTAAATATGAATGGGGTTGCCCTTATATATACATCCCCAACTTTAGCTGCAGCAACCACCAATTGTATTCCTGTCATTACCTTCCTTTTTGCTCTTCTATTCAGGTACACTAAAGGTTTATTATTATTGTTTTTTTCATATATTCGTAAGTGTTCGGGTCAGCTTGTGTGCAACTCGACTATTCTTATAAAACATATTGTCTAATTCTACAATATTTAAATGTCAAAGAAACTTGTAAGAAATTAAATTTTAAATAAATAGTCATTCTAAGTTGAACTGATCATAACTTTTTAGTTTCTTAGCCTTTAAGCTCTTATAATCCAGTCTAATGTATATTCTTAAATCGTAAAAAGTGTTAAATAGATCTATAAATTTTCAATACTATGTCTAATATGTTATTTAAGTTAAGAAAGATAATTTTATAGCAGTCCTCTAATTAAACATTCAATTTTGTGTTTATATTATACTAATGGAGTTTCAATTTTATGTCTAAAGTTTTCTTTGTTGACGATGTATTTTTTAAATTGTAAAATCTATTAAATACAAAACCATATAAGAGGATAGAAAATCCTAATTTAACATCTTTGGTTCTAATCCACAACTCACAGCCAAAACCTTCAAACCGCAATAAGCCAAGAGACAGCTTTCTCTCTCGAACTTCTAAATGGATGCAACAAAATTATTACAAGTTAATAAAGTTGACAATTTTTTTCAGGACAGAATCTTTGGTTTTCAAAGTATCTTTAATAATAAAATTACTTTTTTTTTTTAGAATAATAATAAAATTACTTTATTAAAGAAGCTTTTGCCATCTAAAGATTATAACTCTGTTATTCTTATTTAACATCGAAAAAACCTTTTGTAACTGTTAACTACAAATAGACTTTGTTTCAAAAAAAAACTACAAATAGACTTTTGTTTATAACTTTTTATTTATCAATAAAAGTTGTGTTTCCTAAAAAAAAAAGTAGCTTTTATAAATATTTTAGATTCTCTTTGGTAAATTGTCATCTTAGTTGAAATAAAAGGGGATTTTAAGTCATTTTCGACGTTTCATCAATAGTGTATAAATTAAGGGGCTGTTTGGATTAGGATTGGTAGGAATGACTAGAATGAGTAATTAGAATAAAGAGTTATTTTGAGTGATTAAAATTTGAAATTTGTGCCACAACTTGTTTGGATGAAGTTTATTTTGTAGAAGACTTACAAACAATAATTCGTTTGGATGAAGATTTTAGAGGTGGAGTTATATGTTGAGTGGTTTAAAAATAAAAGATTGTTTTAATTGATTTGAAATGAGTGGTTGTTTTAAGTGATTACAATAGTTCGTTTGGATGAATTTTTTTGAAAAGTAATTATAATAACTCATTAGTAATAGCTCGTTGAAAATCGCACACCAAACAAGCCCCAAGAAGTTTTGCATTTAATTCGTTTCACTTTTTTTTTTTTTTAATTATAGAAATGAAAACTAATTATACTTTATGATTTTCTTTTCGAAGTGGAGGGGAAAAGATATATTATTTTCCATCAGCATCATTAGTCACATATATTTTATTTTATATATTGGCAACATGAAATATGGTATAAAGTGTAGTTTATTTTATTTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTTCTTATACAAGTTGATATTGGTAGGGTTCAAATTTGAAATAATAATTTATATGTGAAATAAATTAATAATTATTTGGCAGGGTGGAGGGTTTGAAATTAAAGTCAAAAACAGGAATAGCAAAGGTTGGAGGAATAGTGATTTGTATGGGTGGTGTAATGATTTTGGCATTCTACATTGGCCCTCAACTCACAATCTTCAAGAATCATCACATTATTGCAACTCACAATAATCAACATAATCAACATGTTGCTTCATCCAAAACTTGGGTAAAGGGTACCTTCCTCATGCTGACATCAAATATCTTTTGGGGTTTATCACTTGTATTTCAGGTACCTTATTATTATTATGTATGTTTTTTAAAATTCTCTAGTTACAAATTTCTTTAAGAATCATCACATTATTGTTTTTTTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTTGAAAACAGAACTTTGTGTTCAAAAGTTATCCTTCAACACTTTTATTCACTAGTCTTCAATGCCTTGCAAGTTCATTTCAATCCTTTATTGTTGCTGTTGCATTGGAGAGAAATTTTGAAGAATGGAAATTGGGTTGGAATGTTAGACTTCTTGCAGTGGCATATTGTGTAAGATTTTCCAAACTCTATAATTTCTTTCTTTTTTTTCTTTCTAATTTGCATTGTTATCTATCTTCCTAGCTACTTCCAATTAAAAGTAGTGATACTAAAAATAAAATATGAATGAGAATAACAATTTGGTGTAGGGAATAGTGGCAACTGGAGTTACATATTCTCTTCAAACATGGATTATTAAGAAGAAAGGACCAGTTTTTCTTGCCATGTCAACTCCAATTATTCTTGTCATTACAACTCTTTCTTCTGCTATTTTTCTTGGTGAAAGTATCACCCTTGGAAGGTAACTAATTAAAAGCCCTTTTATATATTAATATATCATAATAATAAAATTTCTAATTATATTGTTTCTATGTTGTTTGTAGTTGTTTAGGAGGGCTATTATTGATTGGAGGTCTCTATAGTGTGCTATGGGCAAAGAGTAAAGAGCAAAAAGCCAATGAAGAACTAAAAGAAGTTGACAAAAAATGCAGTTTGCCCATAAGGAAAAATGACACAACTGAAAATGATAATCTACCATAAATGTATGAATAATATTAATTAGTTTTCAGTAATCCATTTCTTTCAAATTTGGTGGTTTTTGTTTAAATAATACCAAAATAGAATTACTTTATCGAATGTCACATGGGTATTTTCTTCTTGCCATATATTTTCTATTTTTTCGTTTGATAGATAATCCTTCCATACGTGTATTTAAAAGCAATCTAGATTATCATTATTGTCATGAGTTCAATCCCGAAAATCGATATTTGACTTTCATTTATTTGAGAGGAGAACTTCTAAAATAATTGACCCTCGTGGAAGCACTTTATAAGACATCCACTCACATTAGCAAAAGGAGCAATACAAAATTGAGGCAAATTCCACAATCAAAATGATGAAGGAATTCATTCTATATATATATATATATATATATTATACTCATATTAATTTGACGAAGTCATATTGTCTACATGGAAAGAAAATTAGGAAAGAGAGTGAAAAACTTGATGAAAAACCAACGACATGATATATATGTTGGGAATAAACACTATTCTAATAGGATCAATTATTCACTCTCTTGTATTATTAATGAAAAATCAGCAAGCATATAATATGGTAGAAATATCAAGCACAACTCAACGATTTTTAACGTGGA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ATGAGAGAAAAGAAGGTATATTGTGGTTTGTTGGTGAGACATAGCATTTATGCAGTGATGTTCATACTCTCCAAAGCTGCATTTGATGGTGGAATGAACAGCTTTGTATTTGTTTTCTATAGACAAGCCATAGCCACCCTCTTCTTGTTTCCTATAGCTTTCTATTTTGAATGGAAAACTGCTCCACCCCTCTCATTCCTCACCTTTTGCAAGATCTTTCTGCTTTCTTTGATTGGGATGAGCATATGTCTAAATATGAATGGGGTTGCCCTTATATATACATCCCCAACTTTAGCTGCAGCAACCACCAATTGTATTCCTGTCATTACCTTCCTTTTTGCTCTTCTATTCAGGGTGGAGGGTTTGAAATTAAAGTCAAAAACAGGAATAGCAAAGGTTGGAGGAATAGTGATTTGTATGGGTGGTGTAATGATTTTGGCATTCTACATTGGCCCTCAACTCACAATCTTCAAGAATCATCACATTATTGCAACTCACAATAATCAACATAATCAACATGTTGCTTCATCCAAAACTTGGGTAAAGGGTACCTTCCTCATGCTGACATCAAATATCTTTTGGGGTTTATCACTTGTATTTCAGAACTTTGTGTTCAAAAGTTATCCTTCAACACTTTTATTCACTAGTCTTCAATGCCTTGCAAGTTCATTTCAATCCTTTATTGTTGCTGTTGCATTGGAGAGAAATTTTGAAGAATGGAAATTGGGTTGGAATGTTAGACTTCTTGCAGTGGCATATTGTGGAATAGTGGCAACTGGAGTTACATATTCTCTTCAAACATGGATTATTAAGAAGAAAGGACCAGTTTTTCTTGCCATGTCAACTCCAATTATTCTTGTCATTACAACTCTTTCTTCTGCTATTTTTCTTGGTGAAAGTATCACCCTTGGAAGTTGTTTAGGAGGGCTATTATTGATTGGAGGTCTCTATAGTGTGCTATGGGCAAAGAGTAAAGAGCAAAAAGCCAATGAAGAACTAAAAGAAGTTGACAAAGATCAAAAAGTCAATGAAGAACTAAAAGAAGTTGACAAAGAATGCAGTTTGCCTATAAGAGAAAATGAGGCAACTGAAAATGATAATCTACCATCTTCCTTGAGTAAAAATGTATGA MREKKVYCGLLVRHSIYAVMFILSKAAFDGGMNSFVFVFYRQAIATLFLFPIAFYFEWKTAPPLSFLTFCKIFLLSLIGMSICLNMNGVALIYTSPTLAAATTNCIPVITFLFALLFRVEGLKLKSKTGIAKVGGIVICMGGVMILAFYIGPQLTIFKNHHIIATHNNQHNQHVASSKTWVKGTFLMLTSNIFWGLSLVFQNFVFKSYPSTLLFTSLQCLASSFQSFIVAVALERNFEEWKLGWNVRLLAVAYCGIVATGVTYSLQTWIIKKKGPVFLAMSTPIILVITTLSSAIFLGESITLGSCLGGLLLIGGLYSVLWAKSKEQKANEELKEVDKDQKVNEELKEVDKECSLPIRENEATENDNLPSSLSKNV Homology
BLAST of Sed0018047 vs. NCBI nr
Match: XP_022927986.1 (WAT1-related protein At5g64700-like isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 516.9 bits (1330), Expect = 1.4e-142 Identity = 268/364 (73.63%), Postives = 307/364 (84.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. NCBI nr
Match: XP_022927987.1 (WAT1-related protein At5g64700-like isoform X3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 2.7e-141 Identity = 265/364 (72.80%), Postives = 306/364 (84.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. NCBI nr
Match: XP_022927989.1 (WAT1-related protein At5g64700-like isoform X4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 512.3 bits (1318), Expect = 3.5e-141 Identity = 266/362 (73.48%), Postives = 304/362 (83.98%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. NCBI nr
Match: XP_022927985.1 (WAT1-related protein At5g64700-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 6.0e-141 Identity = 265/364 (72.80%), Postives = 307/364 (84.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. NCBI nr
Match: XP_023512364.1 (WAT1-related protein At5g64700-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 8.7e-140 Identity = 261/358 (72.91%), Postives = 303/358 (84.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FGG3 (WAT1-related protein At5g64700 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g64700 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 361.7 bits (927), Expect = 1.0e-98 Identity = 197/347 (56.77%), Postives = 252/347 (72.62%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NMB7 (WAT1-related protein At1g43650 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g43650 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 253.4 bits (646), Expect = 3.9e-66 Identity = 158/349 (45.27%), Postives = 215/349 (61.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FL41 (WAT1-related protein At5g07050 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g07050 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 213.0 bits (541), Expect = 5.8e-54 Identity = 129/353 (36.54%), Postives = 209/353 (59.21%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HZQ7 (WAT1-related protein At1g21890 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g21890 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 194.1 bits (492), Expect = 2.8e-48 Identity = 121/356 (33.99%), Postives = 190/356 (53.37%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LPF1 (WAT1-related protein At1g44800 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g44800 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 186.0 bits (471), Expect = 7.6e-46 Identity = 110/328 (33.54%), Postives = 183/328 (55.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EJ08 (WAT1-related protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434891 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 516.9 bits (1330), Expect = 7.0e-143 Identity = 268/364 (73.63%), Postives = 307/364 (84.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIN9 (WAT1-related protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434891 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 1.3e-141 Identity = 265/364 (72.80%), Postives = 306/364 (84.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EJJ5 (WAT1-related protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434891 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 512.3 bits (1318), Expect = 1.7e-141 Identity = 266/362 (73.48%), Postives = 304/362 (83.98%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EQE0 (WAT1-related protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434891 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 511.5 bits (1316), Expect = 2.9e-141 Identity = 265/364 (72.80%), Postives = 307/364 (84.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DPX5 (WAT1-related protein OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022003 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 499.2 bits (1284), Expect = 1.5e-137 Identity = 266/376 (70.74%), Postives = 304/376 (80.85%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. TAIR 10
Match: AT5G64700.1 (nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein ) HSP 1 Score: 361.7 bits (927), Expect = 7.2e-100 Identity = 197/347 (56.77%), Postives = 252/347 (72.62%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. TAIR 10
Match: AT1G43650.1 (nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein ) HSP 1 Score: 253.4 bits (646), Expect = 2.8e-67 Identity = 158/349 (45.27%), Postives = 215/349 (61.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. TAIR 10
Match: AT5G07050.1 (nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein ) HSP 1 Score: 213.0 bits (541), Expect = 4.1e-55 Identity = 129/353 (36.54%), Postives = 209/353 (59.21%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. TAIR 10
Match: AT1G21890.1 (nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein ) HSP 1 Score: 194.1 bits (492), Expect = 2.0e-49 Identity = 121/356 (33.99%), Postives = 190/356 (53.37%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0018047 vs. TAIR 10
Match: AT1G44800.1 (nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein ) HSP 1 Score: 186.0 bits (471), Expect = 5.4e-47 Identity = 110/328 (33.54%), Postives = 183/328 (55.79%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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