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Sed0016766 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGTTCGTTCTTCGTTCTTCGTTTCTTGACCTTTCTACTGCAAATTGAAATCCAGCACATGTTATGTAATTTTTTTAGTTACATGTGAAATTAAGGGTAAGATTTTTTATTCTATTGTTTTCTGAGAATTTTCCTGATGTTTTGAACAGTGATTTTGGTTGTGTTTTTGGGCTTGAATCCTTCTGTTTATGGCAGCATGTAGATTGTTGTGTTTAGGGGTATTGATTTTGTAGTCAAAGCTGATAAAAACTTGCGTGTGGCTCGGATCTGTTCGATCTCAGCTATTTTGGTTAATTTCTCGTTACAATTTTAGGTTATTATGTGTGAATTTTCGTTTGGTTTGAGTTGAATGATTTGTTAGGACATTCCTGTGTTTAGAGCTGTACAAAAAACCCCAAACCCGAGCAAACCAGAATGGTTTGGTTTGGGTTGGGTTAAGTTATGATATTATAGTTTTTGTTGGGTTGAGTCGGTTCTTGGATTGGCTAATTTTTATCTTGTTCAATCCAACCAACCGGAACTAAGAATATTATCTACATATTACGCGTGTATGTAAGATAAATTAATAAGATAGATTCTTAAGCATAATTGTAAGTCTTCTAAAAAAAGAATATGTATTAATTAATAAGATAGGTAATAAGTTGAAGTATAGTATCATGAATCTTTTAGACAAATTTCAAATTTAGGAGCCTATGAGTTAAATCTTAGAGTGAAAAAATGGAAGTAGCACAACCGAAAATCCAACCCAACCCAACTCAAAAATTTAGAGTTGGATTGGGTTGGGTTGCGTTAATGCATAGGATTGGATGGGTCGGAGAATTGACCATCCCGAAAAGTTGGGTTGGTCCAAAATATTCATCCAACCCTACCCAACTGATACCATATACACCCCTATCTTTCTTAGGTGTTGAAATTTTCATTAATTATTGGATTATTGAGCACATAGCTGAAGATTTGTTGTAGATTAGCACATAGCTGAAGAATTGGCCGGGACATTCACAGATATTAAAAAAAAAACAATTTTCTTAGTTTCTTTCATTATTTTTTAAAATCAATATTTTTTACATCAAGTTTAATTATGCTGATTCTTGCAGTTTTGAGAAAATTTCAGCCATAAGAACCTTCAAATTTTTTTGCTTCTCCTCATTTTATGTGTTCTACATATGATCAATTTGTATGCACATGGTAGAACTTATGTTTCAAGCTTGAGAAAAGAGTTGAGCGCCTGCTTTTTATTTATTATCCAAAAAAGTTAGGAGTTGACCATCTTAATCTTGATTGGAAGAAGTCTAGTTTGCAGAATAAGTGGCTGCCTTTTGGCTCAAAAGAACTAAATATGTACACGTTTTGTTGTCAAGTGATATGTTTATTTATTTTTTTAATTGCTTGAAGGTATCTGCAATTTTGTAGTTGGGAAATTTATTTGAATGTTATGGATGCATTATTATGTCTTATTGGGAAACCAGTATTTGTTATTTGATACCCATCTGACATGGGAATTTTTTTCTAACTTGGAATTTCTATGGTTTCTAAATTTATAGCTTTATTTTTGTTCATCTTTTCCGCTATGTTGCTTTCCAGTGTGGCTGTTTGCTTCTTGACACTTCCTGGTATGTTCCAATTCTCTGAGTAAAGTTCTCGTGCACACACCATAAACACTGAGTAAACATGAGAAATTGAGCACAACCAATATGGTTTTGGCTGAAGTCCTTCAAATTGAAAAATAAAGTAGGATTTGACCACTTATTCTTAACTTTTCTCCCCAAGTGTTTGTTCACATAATTTGTCGAATATTTATGATTTTTCAACATTTACTCATTTTTTAAACATATTTTCATTTTCCAGGGTTTTACCAGTTTCTCACATGACTATCTTTACAAGTCTGTTGATGTATATAGCTTTGGATATTTAATACACTTTTAGATTTGAAGTTGCATTAGAATTAGTCTAGTCAGTAAAAATGAAAGACAAGATCCCAAAGGTATTGGGTAGCCATAGAGTTGGATTTTCGTTTAAAAGAAAGCGAGCAGCAGCTGCAACACCGTTTGGTGCTCATTCAATACAACCTTTTTGTATGGCACACCAGTTGCCTACCACGACTTCATTGAATACCGTGGGTAAAAGACGGAAGCTAGGTGGAATTAGTAGCATGCTTGCAAACTCTGAAACTCGTTCTAGACCCTTGTACAGTGGTTACTCAAATTTTATGAAAAGTGGGGTACCAAAACAAATAATGTTGTACGACAATGATGAGTGGATTAATTTCCCCCCTGGTCTCCTTGATTTGGCTGGGGAAGATCTGCAGGTAAAGAAAGCATCTGTGGAAATTAAGTTTAATGGACAGCACTGCATTCTAGACTTTCTGCACATGTTCTTTTTGGACTTAAATACAGAGTTGCGGCAACCTCTTGGATGGATTGATGAAGCCGGCAGCTGCTTCTTCCCCGAGATTTATGGTGCAGACAAAAGTGAATGCTGTCATTCTAATAATTTTGGAAATACAGAACCACAGGTTGAAGAAGGGCATGGATCTGATGTAATCAAGTTGCAGTTGGAAATTGAATTAAGTGGACTTAACCAGTCGTGTTTGAAGGTATGTAGTGGGGAGTCGAATGATTATATCAAGCTGTCCCAAATGGACGAAAAACCTGCTTATGGCTGTGATATTGAAGAAGTTGAAGATAGTTGTGGTGTAATACCTACTGGAAAAGCGTATGAAGATGTTCCAAAACTTAAAGAGTTGAATGTAAACCTCAACTCTGAAATTCAACTTGTGAACGGAGAATTGGATACAAGAACAGTGGAAAAAATATTTCGTGATGGAATGATGAGCTCTAATGGCAGTTTAGAGATACTTAATATAAAACGTTGCATTGACTCTTCAATGCAATTTCAATCAGAGCTTTTCCATAAACAAATGGAAATGACCAAACTTTACCGAGGGGATGCGAATGTTCGTCTTGCTTGGCTTGCTGTTTCTGAAGCAGAATTATCTAGCATGTTGAAGTATGGGGTCGGGGTTACTGGAGTTTCTTCAATCAAATCCATGTATGGCACTGGTGTTCACCTCACAGCCGTCAATTGCCCGAATGTCAGGTGGTTAGATTTCTTCCGAACAAAAGTTTTCTTTTTTTTAATCGGTTTTTAATTGACTTTAAACTCATAATATGTTGGTTACACGAGTCATACTGGCAGCTAACTAGCATAACTAAACTATCCATCCACTAAAGAAACTAACTATTGACTGGCAACTGCCAACAATACTACCTCTGCTTCAATTTGCCACCAAACTATAGGAAGCTTGTTATTTGCCACCAAGTGAAAAGTTGTTCATTTGGTGCATGATATTAAGGCAAAGCTGAAGCTGAAGCACGCTAGAAGTTGGATGTGCATGTTCCGGAAGATTTTTTAGCCTTTTTGTTTCTTGTTTCTCAAATAAACAGGATACAAGAGTTTGTCCACGGGGCAAGGCGGGGCTGGGGAATGGCTTCCCCGTCCCCGGGAAAATTCCCGTTTTTTTTCTTGGGTATCGGGGCCCTGCTGGGTTTTTTTCAATTTTTCTTTTTTTTAACATTTTTTTTATATATTTTTGGACAATACATTTAAATAATTAGATTTTCTTAGAAAATATTTATAAATTTCAACTATAATGTTAATTATTAAAGAAAAATACTCGTATGCATAGATAATTTCATCAACAAATATGTTTTTATTTGAAAATGAAGGGGGTAAAGTATAGAAAAAAAGAAGAAAAGAAAGTAAACGATGCGGGGATCCGGGACGGGGAATATTCCCAGTCCCCGTCCCCGATTAGCCCACGGGGAATTTTCAACCTCCGTCCCCGGCCCCGTTCCCCGCCTAATCGAGGATTCTCAGCCCCATTAGGGGTGATTCCCCGCGGAAAAAATGGACATCTCTAATTCTTACTCTGTTACCACTTTTTGGATTTTCATTTTATCGTTAATAGAAATAATTCTTTGTTTCCCATGAATATGTTTTTTTTAAAAAAAAATTTCGCTCATATCTAACACTACTATTTTATGTGCTCCTAAGTTTTTCGCTACTTGAAGCTACATTGCAATTCTATAATGGTTCCAGTTCCTTCAATTATTTGGGTATATGTTATGTTTTGGAGTGCTTTGACATTTTTACATAAAGTGATTTCTAGTCAATCATCTGGGAGATGTTTTGAGTGATTTCTGTCTGTCTGATTAATTGTCGTTTTATTTTTATGAATGGCCATTACTTCAGGTTCCAAAATTAATAATCTTTTTCATTCTATTTTGTCTTAAAATTTTGAGATTTTTTTGTTTTGTTTTCCTCTCTCTAACCTTGTTATCTCTAATTTTTTTCCACCCTCTCCCAACTATTTTTGTCCCTAATTTTTTCGTGATGACATTGTAAGTTTTTTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTTAAACATGAAACAACCTTTTTCTAACTTTATATCTTCCTCCAATTCTTTTTCTTAGTCTCTAATGTCTCTCTAAGATTTTTGTCCTTTCAAACTTGTCTGTCTTTCTAAAATATATTTCATCTCCCCTAAATTTGATTCTAATTTTTTCCACCCTTCTATAACTGTTCTCTCTCCAAAATTTGTCCTTTCATAAACCTTTTAATTGCCCTAAAGTATGGTATCACAGGATTCACACTCCCAACTTCATTTCTCTATAAGAGTTTTTGCGCTTGCAAATTTTCTATTTCTCCAAACTTTTTTCTCTTTGTAAAATTTTTAACATAAACTCTTTTCTTAGCTAAGTTGATTTTTAGGTGTTTTATTTTCAGTGTTCTATTAGAGATTATAGGGAGATGTTCAAGAAGTTCTTCCTTCATCCGTTGCTTTGATGGAATTGGTGGTTAATGTGGCAAGTTGAAACGTGTGCTTTGTTGTGGGGTCTTTAGGGAAAGAGGAACAATAGAGCCTATGGAAAGGAAGGGGAAACCCTAACTC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BLAST of Sed0016766 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0016766 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0016766 vs. NCBI nr
Match: XP_023540443.1 (inactive poly [ADP-ribose] polymerase RCD1-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 914.8 bits (2363), Expect = 3.7e-262 Identity = 453/590 (76.78%), Postives = 508/590 (86.10%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016766 vs. NCBI nr
Match: KAG6596717.1 (Inactive poly [ADP-ribose] polymerase RCD1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 911.4 bits (2354), Expect = 4.1e-261 Identity = 451/590 (76.44%), Postives = 506/590 (85.76%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016766 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0016766 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Sed0016766 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Sed0016766 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Sed0016766 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Sed0016766 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Sed0016766 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Sed0016766 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Sed0016766 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Sed0016766 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Sed0016766 vs. TAIR 10
Match: AT1G32230.1 (WWE protein-protein interaction domain protein family ) HSP 1 Score: 364.8 bits (935), Expect = 1.3e-100 Identity = 239/596 (40.10%), Postives = 333/596 (55.87%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016766 vs. TAIR 10
Match: AT1G32230.2 (WWE protein-protein interaction domain protein family ) HSP 1 Score: 362.8 bits (930), Expect = 5.1e-100 Identity = 238/596 (39.93%), Postives = 333/596 (55.87%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016766 vs. TAIR 10
Match: AT1G32230.3 (WWE protein-protein interaction domain protein family ) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 2.5e-99 Identity = 237/592 (40.03%), Postives = 331/592 (55.91%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016766 vs. TAIR 10
Match: AT2G35510.1 (similar to RCD one 1 ) HSP 1 Score: 335.9 bits (860), Expect = 6.6e-92 Identity = 211/584 (36.13%), Postives = 327/584 (55.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016766 vs. TAIR 10
Match: AT1G23550.1 (similar to RCD one 2 ) HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 4.2e-30 Identity = 82/259 (31.66%), Postives = 125/259 (48.26%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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