Sed0008871 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATAAATTGGAACAAACCCAAAATATTTTGAAAAATAAGCCGCTGGACAAAATGCGTTAATTTGTGTAATGAAACCTCTCGCAGCGTTTGCAGTTGCTTCAAGTACTCTCTAGTCTCTACACTTTGCTTTTCAACGAAGTTGCGAGAATTTTCCAGAACCAGAATGAGATCCAACATCGTTACTGAGGTAAACTTTTAATTTCCATTTTTTTTTCTAATGCAAGCTTTAATTTGGCCTGATTTTGTTCCGGGTTTTGAAATTCCGTTCAGGAATTTTGGCTCATAGAATCGAGCTAACTCTCATCGAAGTCTGTTTCGTTGCTACGAAATTCCGTTCTTGTGCGTTTAGTTGTTAGTTTTTCTTTGAATCCGAGCGTAATTAGCAGAGAGGTTCTTGAAAAATTGAGTAAATCGAGTTAGTTTGATTTGATAATTGGCGGATACAGTCCCAAGATTACGCATAAAGTGTCGATTTGATGCCTAGAGAGATCCACCCCCAAAGGGGCTTGTTCTTATTTTCAGCTAGCTGGTCCATATAATTATTTCAATTTATTAGCTTAGCTAACTCTCGTAGAGTGACCTAGTGGTCAAGAGAGCCTCGAGGAATTCAGAAGTGATGAATTCAATCCATGATCATCACCTATTTAGGAGTATGGGTTTCCTTAACAGCCAAATGTTGTAGGATCAAGGCGGTATTCTCTTGCGATATTTGTCGACGTGCGCACAAGCTGTCCCGTCACGAATATAAAAGAAAAATATTAGCTCAGTTATACCCATGATAATGTGAAGAGAAAAAATCTAGATAGCTCATGCCAATGTCTTGTGACTTAGAGCTGTCTTAGTTGACAAATGCAAAGTACACAAATTTCCTCCCTCATGGATCAAACCTTTGTTCTAATGAGTGAAATTTGAACCGGTACAGGCGTACAACCACCTGATACGAACCTGGGATCTTTGAAAGTTTACTCAAGGCGAACCAAGAAGTGACGGATCCCTTTTTTATTGCTTTATTAAATATAATTATGTTTTGTTATTTAAGTTGTATTGGGCTTTTGGGCTTGAATAGGGCTATTTACTAAATTAGGTTAAATCCTAGGTTTACTATAAATAGGATATGTTAGGCCTCTAGCAATTCATTCATTCAGTTGTCGTTTATGTACTTTGGCTCTTTGAGAGATTCTCTCGAGAGATTTATCGTAGTTTATAAAATATTTCGGTAGTTCGTATCATTTTGGTATCAGAGCCATTTGCCAATCTGGGAATGGTGAGTACTAAGATGGAGAATAGGATGCAAGATTGTGAGGAAAACGGGGTCGAGATGCTAAAAAACAGAAAGAGTTTGAGGCTCAGTTGGCGGCTATAGGGAGCCGGATGGACCAGGAATTGGGACAAATGAATCTCAACATACAGAAGCTTTTAGAGCGCAAGCCGGAACTGTCGAATCCCGAACCAATTGTCGCGGATAAAGGGAAGGGGGTGGCGGCAGAACCGGAAGGGGAGAGCGGGGAGCAGGCGTCGGCGGTGGAGGAGTTGAGTGGGGTGGTCGGACCGGCGGGGTTGGGGGCCGGGCCGGGCGTATGGGAGAGGGCGCGGCGCGAAGGGCGCAGTGGGCGCGGCCGGGCCGCGGCTTGAGAGGAGCGAGCGAGCGGCGTGGGCGGCGCGAAGGAGATCGGGCCTGGGGATGCGGCCGAGGGAGCTGGGGCGGATCGGGCGCGGGTGAGCGGGAATGGGGCGTGGGAGCAGGCGCGGGTGAGCGGGGCTGTGGGCGTGGGTGCGGGTGAGTGGGGCGCGGGCACGCGCGCAGTGCAGCGAGTGGGGGGGGCCCGGCGGGGTGAACGGGGCATGGGCGCGGGTCCGGGCAGGGGCGATCGTGGTGCGGGGCGGGTCGATGGGTCCGAGCCGGTTCGGGTCAGCCGGGGTGGACCGGAGGGAAAATTTTTCGTGGCTTGACCGATGGGGACAATTATATGGGTTCGGAATTCGAGCGAAGGGGAGATGGCCGGTTTGATGGCAGGGGGAATGTTTTTTCGGAGGAGAGGAAGGTGCGCACCGGCTATGAAAGGCCGATTGCGCATGACGGTTGGAACGAGCAGGAGGATTGGAGGGATAGGCAAGAGCGTGGTGACCGAGGGGGATCAGGTGTAGTCAGACGGGATGGACCAACTGTTGATAGACGGTTACGAAAATTAGAAATGCCAGTGTTTAAAGGTCTTATTGATGAGGACCCGGACGGGTGGCTCTGCCGAGTGGAAAGGTACTTCTGGGTTAATCGGTTGACGGGACATGAAAGGGTCGATGCAGCAGCCTTGTGTATGGAAGGGGAGGCATTGGAATGGCTACAATATGAAGAGGACCGAGCTCCGATTGCCTCGTGGGAGGAGTTTCGAGAATTGCTATTGCATCGTTTCCAACCAACGATCAATGACAATAAATATGCCAATTTGATGAGTCTACAACAGGTGGGAACAGTCAAGGAGTATCGTCGGTTGTTTGAAAAATATGCAAAGGGTATGCGCGATATCAGTGCGAGTGCCTTGGAAGGAAAATGGGAAAGTGGTCTAAAGGCAGAAATACGAAGTGAGATGAGAAAACTTCGACCAGTGGGAATCCAGGATAAGAAATTTATGGCACAAGTAATTGAAGATGACCTGGCTTTTCGAAATCAAGCAAGAGGAGTGAGCACGACGTCAATGGTTAAACCAAGCTTGGGTTCAGGTACTATGAATACAAGAGTAGCAGGAAGTACGAACCTAAAAACGATCACGCCCACCTCAAACTATGCCAACCGATCAACACCGTCGAACAACCCCACCCCCACCATCCCGTATAAACGCTTAACAGATAGTGAGATTCGCATACGTAAAGACAAGGGGCTATGTTTTCGGTGTGACGAGAAGTTCGTTCCGGGGCACCGGTGTAAGAAAAAGGAGCTGCAAGCTCTGGAGATTCTTGTCGTACGTGATTCAATAGACAAACTGGAAAATGAAGAAAACGATGACTCCCAAGAATGTGTATTCGAAGATGAACTTGTTGAGGAAATGGTGGATACACCGAACATGGCAGCCCTTTCATTGCACTCAATGGCAGGACTGAGCTCTCCAAAAACACTTAAGGTTACAGGCTCGATACGGGGACACGAAGTAGTAGTATTAATCGATAGTGGGGCTACGCATAACTTCATATCCGATGACATGGTTGCTAAATTGAAATTACCGGTAGAGCCGTCCGATGATTATGGCATTATGTTGGGTACTGGGGACTCGTGAGAAGCTCTTTGGCATCCTGTAAGAATGTGGAACTTCAGTTGGCCAAATTGAGAATAGTGAATGATTTCTTGCCCTTACCTTTGGGTAGTGCGGATGTGATTTTGGGCATTGTGTGGCTAGCAACGTTGGGAAAAATTGAATTTGACTATCGCGCACTTAAAATGAAATTCAAAAGCCGGGTCGAGGCGAGTTGAATTGCAGGGCGAGCCACGGCTGGTCAAGGCCCAGGTTTCATTAAAATCTATGATGAAATCCTTACGTCCCGAGGATCAGGGGCTCCTGGTCGAGCTAAATATGATTGAGACATCGATACCGTCTCGTGAACAGTCCGGAACTCTACCTGACTTGTCTCAGGTACCCACAAAACTACACTCTGTACTTCGTTTATACTCACCGGTTTTTGAATCATTGACAGGTCTTCCCCTGCAACGTAATTGCGACCATGCTATTGCCGGGCAAGGAATCCGTAAATGTACGTCCGTATAGGTACCCACAGTATCAGAAGAACGAGATTGAAAAATTAGTGGGAGAAATGTTGTTGGCAGGTATTATCTGGCCTAGCACGAGCCCGTTTTCAAGCCTAGTTTTATTGGTTAAAAAGAAAGATGGGAGTTGGCGTTTCTGCGTCGACTATCGCGCCCTGAATCAAGCAACAGTGCCCGATAAGTATTCGATACCGTTGGTTGATGAATTGTTAGATGAGTTGCATGGGGCGACAGTGATTTCGAAAATTGATCTTAAGGCGGGTTACCATCAAATCCGTGTTAAGCCGGCCGATGTACAAAAAACAGCTTTTAGAACTCATGAGGGCCACTATGAATTTGTAGTCATGCCTTTCGGATTACGCAATGCTCCTGCGACATTTCAATCAGTTATGAATGAGATTTTGCGACCGTTCCTACGCCGGTTTGTGCTAGTATTTTTTGATGACATCCTGATCTACAGTGTGACCATCGATGAACATAAGGAGCACTTAGTCAGAATTTTTGAAGTGTTACAAACCCATGCCCTGGTAGCCAATGCCAAGAAATGTCAGTTTGGACTGCGCAAGATTGAGTATTTGGGGCATTTTATATCTCACAAGGCGTGGTACGCGCGATCCGAGAAAATTGCGGCCATGGTACGTTGGCCAAGCCCTAAAAACATTAAAGACTTACAAGGATTTCTTGGGTTGACAGGTTACTACCGTCGTTTTGTGGCAAATTATGGGTCGATGGCTTTTCCACTGACTCAGCCCTTAAAAAAGGGAAAGTTTGAATGGGGTCCAACAGTGGAGGATTGTTTTCAGAGACTTAAGCATGCGATGAGTAGTGTGCCAGTATTACGATTGCCAGACTTTGATCAGTTGTTTGTTGTGGAGACTGATGCTTCCGGTATTGGCGTGGGTGCAGTCTTGATGCAACAGGGGCAACCGTTGGCTAGAGATGTCCACGGGGCGGGGCGGGGCCGGGGAATGGCTTCCCCGGCCCCGTCCCTGCCATAAAATTCAATCCCCGTCCCCGGAAAAATCCTCGGTTTTTTTTTCGGGGATCGGGTTCCCCGCGGGGATTTTTTACAATTTTTTTTTCTTTTTTCATTTTTTAAAATATTTTTTGGATAAAAAATTCAAAAAATTAGATTTAAAAAAAAAATATATCTATAAGTTTCAATTATAATGTTAATTATCAAAGAAAATATTCATATGTATAGAAAATATCATCAACAAAGATATATTTATTTGAAAATTAAA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Match: XP_038882733.1 (rhomboid-like protein 15 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 688.3 bits (1775), Expect = 3.8e-194 Identity = 355/396 (89.65%), Postives = 373/396 (94.19%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. NCBI nr
Match: XP_004147524.1 (rhomboid-like protein 15 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 687.2 bits (1772), Expect = 8.5e-194 Identity = 352/397 (88.66%), Postives = 375/397 (94.46%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. NCBI nr
Match: XP_016899587.1 (PREDICTED: rhomboid-like protein 15 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 684.9 bits (1766), Expect = 4.2e-193 Identity = 354/405 (87.41%), Postives = 377/405 (93.09%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. NCBI nr
Match: KAG6603502.1 (Rhomboid-like protein 15, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 681.8 bits (1758), Expect = 3.6e-192 Identity = 349/396 (88.13%), Postives = 369/396 (93.18%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LB17 (Rhomboid-like protein 15 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RBL15 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 518.5 bits (1334), Expect = 6.8e-146 Identity = 261/403 (64.76%), Postives = 330/403 (81.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8TEB9 (Rhomboid-related protein 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RHBDD1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 69.7 bits (169), Expect = 8.4e-11 Identity = 51/165 (30.91%), Postives = 78/165 (47.27%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RXW0 (Rhomboid-like protein 14, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RBL14 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 68.9 bits (167), Expect = 1.4e-10 Identity = 53/160 (33.12%), Postives = 88/160 (55.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BHC7 (Rhomboid-related protein 4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Rhbdd1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 68.9 bits (167), Expect = 1.4e-10 Identity = 51/165 (30.91%), Postives = 79/165 (47.88%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RBS4 (Rhomboid-related protein 4 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=RHBDD1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 1.6e-09 Identity = 51/177 (28.81%), Postives = 78/177 (44.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B586 (rhomboid-like protein 15 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485963 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 692.2 bits (1785), Expect = 1.3e-195 Identity = 354/397 (89.17%), Postives = 377/397 (94.96%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KYQ9 (UBA domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G194270 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 687.2 bits (1772), Expect = 4.1e-194 Identity = 352/397 (88.66%), Postives = 375/397 (94.46%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUC3 (rhomboid-like protein 15 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485963 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 684.9 bits (1766), Expect = 2.0e-193 Identity = 354/405 (87.41%), Postives = 377/405 (93.09%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GFT1 (rhomboid-like protein 15 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453791 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 681.8 bits (1758), Expect = 1.7e-192 Identity = 349/396 (88.13%), Postives = 370/396 (93.43%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DSL3 (rhomboid-like protein 15 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023134 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 677.6 bits (1747), Expect = 3.2e-191 Identity = 352/407 (86.49%), Postives = 370/407 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. TAIR 10
Match: AT3G58460.1 (RHOMBOID-like protein 15 ) HSP 1 Score: 518.5 bits (1334), Expect = 4.8e-147 Identity = 261/403 (64.76%), Postives = 330/403 (81.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. TAIR 10
Match: AT3G58460.2 (RHOMBOID-like protein 15 ) HSP 1 Score: 504.6 bits (1298), Expect = 7.2e-143 Identity = 254/395 (64.30%), Postives = 323/395 (81.77%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. TAIR 10
Match: AT3G17611.1 (RHOMBOID-like protein 14 ) HSP 1 Score: 68.9 bits (167), Expect = 1.0e-11 Identity = 53/160 (33.12%), Postives = 88/160 (55.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. TAIR 10
Match: AT3G59520.1 (RHOMBOID-like protein 13 ) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 4.0e-08 Identity = 55/193 (28.50%), Postives = 105/193 (54.40%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0008871 vs. TAIR 10
Match: AT3G17611.2 (RHOMBOID-like protein 14 ) HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 9.8e-07 Identity = 43/126 (34.13%), Postives = 69/126 (54.76%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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