Sed0008490 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0008490
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG13: 2188402 .. 2191605 (+)
RNA-Seq ExpressionSed0008490
SyntenySed0008490
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTGACGTCGGAGGCTTTCACCAGATCTGGAGATGTCGCCGCTGCGGGAAGGAGTAAACCGCCAAAGCCTAGACTGGTTGCGCCGCCGTTCTCGGCGGAGAATGACAGGTCGGCGGTGGCGCTGCCACCGGAGAGTCGCTGAAAGGGGGATTGCGGCGGTTCACGCGAGAGAGGGAGGGAAGAAAAGAGAGAATGAGATTGTAAATGAGTAAATGCGAAAGTTTACTTCCTTTTATACAGTCTAATATTAAGAAGAAATTAATCTCAATATATATATATATATATATATATATATATATTAATAAGAAATTAAATGATAATATTTTATATGAAACAAATTAAATGATATCTTTGAACTTAAAAAACAAAAAAAAAAAAAGATTAGATGATATCTTTTATACTTCTATTTAAGGAATTACTTTCCTGCAGTTAAATGATAATCTTTTCTTGAAACAAATTAAATGATATCTTTCAACTTAAGAAAAATTAAATGATGTCTCTTATACTTCTATTTAAGGAAATACTTTCCTGCAGTTAAATGATAAATTTTTCTTGAAACAAATTAAATGATATATTTCAACTTAAAAAAAAGATATCATTTTTATATTTCTATTTAAGAAAATACTCTCCGTCCGTTAAATGATTAAGAGTGTGTTTGGGCTCGTTTATGTAAACAGTCAAATTGGTTATAATAACTCTATTAACATTTAACCACCATTTATCATAAAATCGTTACCTAAACTTATGTGTCCGTTTACCTAAATTTATGTGTCTCGTTTATCTAAATTTACGTGTTCGTTTATCTATACCTTATATATATATTGTTACATAATCAGCTCATCAAACACTATTTATCATATTCCATGTTATAATAACTTGCCGCTCAAACAACATTTATAATAACTCAGTGTTTATCATAACCTTCCGTCTATAATAACAAAATCGGTGCTCCAAACTCACCCTAAAGATTTTAATTGAAGGAAATATTAAAGATTTTTAATTGATTGATTTTAATTTAAATAAAATTTCATTGATTTTATTTGTCAAAATAAATAGTTTTTTTTAAATCATCAAAATAAATGTTAATATATCATATTTTCAACTCAACCATTAAAAATTTAAAATTTAAAAACATAACATTACAATAAAGTTAATATTATAAAAAAGCATGTATAGTGTCACATTTTATTTATTAATTTTTTTTTTACAAAAGAGTAATAGTTTAACAATATCAAAGTACACATGCAACGACAAACAACAGTAAAAAGATAATTTATCATCAACAACACATTTTATATCTTGTGTTGTATTTGCAGTAGATTTTTTTAAAATTTAAAACAATTCATCAATAACACATTAATTTCTATCACTCAAATTGGACTTAATATTGATTTCTATCACTAATAATAAACTCAAGCAGTGATAGAATGAATATATTATTGATTGAATTCTATGTGGTAAAACTCAATTTGAATTTTTTTGTTACAAATGAATTAGTTTTGATTTTGTGCTATAAATATAAATATGTTGTATTTTTTTGTTATACATGCAAAATCTTCTAATAACAATGAACAGAAAAAATTAAAATAACTTATTTAAACATTTTAACTTAAGAGATGAATATTATTTTGAATTATAAAACATATTGATTTTTTTAATTTTTAATTTACCATTAACTATTTAAAAATAAACAATATTGTATAGATAAAAGAAAGAAAATAAATAAAAACGTAACACAAAAAAAAAAGATTTTAAAATTGTATACATATATATTTTTTTACTTTACTATAGTTATTTTTGTTGATTAATTAAAAGTAATTATTCATCAGATAAAATAAGAAAAAGTTGTGTACTTTTTTTTTTGAAAACAGAAAAGTCGTGTACTTAATTGAGAAAATAGAAAAAAAAATGAATTATTATTATTATTATTTTAAAAAAGGCCATCCTGCAGGTAAGTATACCTCTCCTATTTATAAAAACGTGGCCGACTTTGATTGGATAAACCATGTCATCGGAGTTCATCCGAAAAAGTGAAATGGAACCCTAACATCGAATTCCAAATTGGTTCTGCATCAGCTTTTCACCACTCTGCAAATTATCTTGTTCATCTCATCGTCATCGATTTCCGATTGGATCGGCGTCAAGATCTAGCCGGCCATTGATATCCATAGTCGCCGTTCAATCAGGTAAGTCTTTCTTTATGAAACCAACTTTTTCTGTGGATGTTTGTGGATTTGCTCGATCATTTGGTTTTGTTAGATCATGTTGCAAAAACATTGCACGGCTGTCGTCGATAAAGAACAAATTGTCAGGGCTGGGAAAATTTGGTGGAAATTGCATTGTCCGGCTGTGTTGTCGAGTTACAGAGATGATATTGATGAACTAAACATGGTTCATAGGGAATTAATTCAATTTTTTGAACCTTAGAAAGAGTAATCTCAGTCGAAATTGCATGTGTTTATCTTGTGGGTAAGATAAAACAGCGTCTATTTTGTTTGATTTTATAATTTTCGGTGCTTTTGGCCTTTCGGGTGGGAATTGGGACCTGGGAAATTTTTGGCATTATGTAAATGGAGCTATCCGGGTTGCCGAATTGGGTGCTTATCTAATTCGTGCAGCTTTCTAGATTTTATAGCTCAACTCGACTCAGACATTGTGGTTGGTTTATCCTCAACTTTGGAAAATTCGATAGCGTAGAGAGATCTGAATATCGCTGAGTTAATTCTAATTTTCTCTTTGAGAAACCCTTAAAACATCATATAATGAACATTTTTCCTTTAGCTATGAGAATCTTTTGCGAAACAATGCATAAATATGTACATGATATGGGAGATGCAGAAGTTGAAACTGTACTTATCTTCATTTATCAAGAAAGAGATTACTCAAAGAGTCATCAAATCTTGTAATTAAGTATAAAATGAACTCCACTTTAGTTTTTAGACATAGATGTCCATGAGAAACCAGAAAATGAACTTTTCAATAGAAGATTTTCATCACTGAAAATTACCCTATTTTCCCCCGCTAAGATGGGAAATCTTGGATTGCTTGGACAAGGAAAATCCTTACATCCATGAAAGTGTTTTTTATGCATTACTTCTTAATGTAAATGTCTTTGATATGGATAATCAATATACTATATTTTATCATCACTATATTGTTTTATTTGGCTGACATTTCTAATTCTCAAACGACAGTGCAGTAG

mRNA sequence

ATGCTGACGTCGGAGGCTTTCACCAGATCTGGAGATGTCGCCGCTGCGGGAAGGAGTAAACCGCCAAAGCCTAGACTGGTTGCGCCGCCGTTCTCGGCGGAGAATGACAGCTTTTCACCACTCTGCAAATTATCTTGTTCATCTCATCGTCATCGATTTCCGATTGGATCGGCGTCAAGATCTAGCCGGCCATTGATATCCATAGTCGCCGTTCAATCAGTGCAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCTGACGTCGGAGGCTTTCACCAGATCTGGAGATGTCGCCGCTGCGGGAAGGAGTAAACCGCCAAAGCCTAGACTGGTTGCGCCGCCGTTCTCGGCGGAGAATGACAGCTTTTCACCACTCTGCAAATTATCTTGTTCATCTCATCGTCATCGATTTCCGATTGGATCGGCGTCAAGATCTAGCCGGCCATTGATATCCATAGTCGCCGTTCAATCAGTGCAGTAG

Protein sequence

MLTSEAFTRSGDVAAAGRSKPPKPRLVAPPFSAENDSFSPLCKLSCSSHRHRFPIGSASRSSRPLISIVAVQSVQ
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..34

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0008490.1Sed0008490.1mRNA