Sed0001012 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTACAGAAATGAATACCTCTACACGCATTTCAAGTCTCTTCTCGCGCCAAATCTCCCGCTCCTGAAAACCCCCAAACCAAACCCTTTCTTCCTTCATTCTGGACTCGGACCTCCCATTTTCTCTTGCTTTCAACTCGCCATTGATCATCTTCGGTGCGTATTTCCCTGCTTTTCTCTGTTCTTTAATGGCGTTCATCACTTGTTGTACAGTTGTAGCTCGATTCAGCCGTTGCTGTTGTCTGTTCTTGCAGGTTTATGAACTCTTGAGCTCAATCATGGTCGTGAAGTCGCGATCGCTGCGTTCTGCTGCTAATGGAGAGCTGCATTCTCCTGTAACGCCCGAGGAGAAGCCGAAGCGCAGCGAAGTAGCTTCGCATGGCCGGAAGAATGGTAAAGCTGTTGCAGCGAAGGAGCGGACGAGTGCTCGAATCCAGGTACGGCAACTGGCCGAGAAGGAGATTCTTGTGCGCCAAAGAGTAGAGCTCCTTGATGAAGCTGACAGTCAGGGGAAAAGGAAGAAGACGAACAGTCGAGTAAGGAGTGTCGAGGATGAGGCGGTTGCTGTTGCTGTTGCGGTATCGAACTGTGGCGGCGAGGTCGAGCCGATGGGAGCGCGTGCGGTAGAAAAGAGTAGAACTGGCGTCGAAGGTGGTTCGGGTAGTATGGTTGAGAAGAGTGACCATGCCAAGGTTAAGGAGGCTCTCAGGTTGTTCAACAAGTATTATCTTCATTTTGTACAGGTTCGTCGCTTGGGAATGTCAGTTTGTTTGTAGCTATTTTAGAATCTTTTCACATTGAACTTTATAGTCGGCTAACTTTTGGTTGTTGTATGTTCATCTGATCCAAAAGGAAGAAGAGGGGAGGTGCAAAAAAGCCGAAGTTGCTCTAAAAGCTTCCAAAGGGTCAAAATCCAAAGTAAAAGCATTCTCTCATTTCTATGTTTTGGTTCATTTGTAACTGGGTCTCTTTAAAAATATTCTTCTAAGTTACACAAATCATGATATAATATGTCATCATGATTTTACATATTTATCTTATTGCTTGATATCTGTACAGAAGGCGGCTCCTGTAGAAGACACAGAAAGCAAATCTAAGCGACCACGGGCAGATTTGAAGGCCATTACTAAGGCAAGTTGTTAAGCACACATCAAGCCTCTAGAACCCTTTTTTGCTTTTGTGTTATTTATCATTATCTAGCTTTAATTGAAGATTCCATCAGAGATCTAGCATTGGCTCATTTGGGTGTATCTCTATATAACCTTTTAGTTCATTGAGCTAGATACTTTTTGACTGATTTGTTGTCTTTGCACATTTATTAATAGCCTCTCTGACTTTCTATAGGAAACTGAAAAGTATCAAACACATTATACAGGTATGGTTTTTTCCGTTGGAATTAAGAAGGATAGGAGAGGAGATGGGATAACACATTTTTTATTTTTTTAGGGGTAGGGGTTTCAATTTGCAAGGGTAGTTTTTAGATGTTCAATGAGCGTTTAGCTTGGAATAGAGACTACAACTTTATGGTGGGGGAGGTTTTTGGAATCTTCCCTTTCGTGATAGATGCTAAGAGTAGACAACCCTTGACAAGATCTTCACATTGATATGGGATTGTCCACTTTGGGCATAATCCCTGCATGCCTTTGTTTTTTGTTTCACTTGAAAGGCCTCATATGGTCATACTTATGGATATGGTTGTTAGCCTTTATATACCTGTGATTTATTCTTTAGTTACCTAATATGCAACTACACTTTGTAATTCCATCAATCCTCCCCTCGAACAAAGTTCCACATATGAGCCTCCTGACCATCATCTCTTCGAATCACACTTGAACGCACCAAAGTTCAACCTCAAATCCTTTCGAATTACACTTGAGCCCACCAGAAAGCTCACTGATCCATTTGAGTAACATTTGAGCGCACAAGCACAACAACTAAACCTTTACTGGAGCAACATTTCATAAGCACTCATGACCTGAGTACTTCCATAAGCACCCTTCATCATAACACTCATAAGGCTCAACAACAAATTCATGTTCACTATGACTTAACTATGACATATGCTATTTTGAGGCTCATATTCTTTGTCTACACGTGAATTCTACATGCATGGCTATATAAGGGGCATTAGTCTAATACCTATTGTTAAGGAAAAAAACCTTCGAAAAGATCTCCACTAAATATGCAGTTGTCCACTTGGGACAGAAGCCATCATTACTTCGTTTTTTGTTTCACCCAAGAGGTCTAATACCAATGTAGATGTGTAGAGAAAAAGTGTTTTCTTCTAAGGCAAAAAGTCTTTTTCTCACTTTGCTCACTACAGGCTCCCAACACAAAGAAGACCTTAAGGATTGACCAAGGAGAAGGTTTGAATAAGAAGTTGGGAAATTTCCCACCTCGCAACCCACCAGAGCCGCCCAGTTATCCAACTTATCTCTTAACAATTTATCCTCAGGATCATCGAATTTCCCTATTATTCTTTAAGCCCAAGATATCCTCAAAACATATTACTCAAACTAGAGAACAATTTTTTCTTCCCAAACAAACTGGAGATGATAGACATAAACTTAGATGCTCGACTTGAAATCCTTCTACCACCTATGACTCAACACCTTGCAAAATGTTAACAAGGAGGGAGAGTGGATCTCTTTGTCTGAGGCCTCTTTAGGCACTAAAGTGACTTCTTGGACTGCCATTGAACACAATAGAGTACTTAATTGAGTTAACACAACTTTGCATCCACTCCTTCCATTTGATCCCAAAGCACTTATTAGCTAGGACTTGGTTGTATGTTTATTCATAATCAATCTTAAAAACCACCCATCATGTTTTTTTTCTTATATACTCCTCGAAATCTCATTTGTAATTAGTGTTTCTCAAAGTAAGCTTGAGTTATAATAAAAAAAAATGATTTGTCTACCAACAATAAAATTCCCATTAGTATCAACAATAGTTGCACGAAACACTTCAAAATCTTCACAATAATCTTGTAGACAGTCGTCACTAGACTGATAGGTCTAAAATTCGAACCTCCCTCAAAACATCTTTATTTGAGATAAGAAAAATATACGTCTTGTTGATGGAGCTGTCAATTACCTGGTCTCATTGAGCTCATGAAACACTTCCCAAAGGTCCCCTTTATTACCTTTTGAACCATGCCGCTGCCCACCAACTACAAAACACTTTCCAAGGGTCCCCTTTAGTACCTTCCTAATTTGTGGTGAGTACCATTGCAAGTGAAAACATCCTTGTGAGTTGATAAAGAGGCTAGAATCTAAATAATAATGATACAATGGATGGGTCAATCTTCCAATTTTTTTACGCTGATGACTCTTGTGAAAAATAATACATAGTATGATGATGTAAAGTTTTTTGTGAAAAAAGAAGCTGTGCAAGAATGATAATGAATAGTTTATTATTTAATTTAATGTCCCTTCACTCATTTTGCCCTTTTCTTGTTTCTAAATTCTGTGCCAGATGTTGGAGGCAAATGAAAATTTGAACCATGAGAAACGTTTTGGCAATATTCCAGGTTGTTTTTAGCTCTTAAACTTTACCTCTTTACTGTTGTTTTGGCCTTGTGTTGTGGTGTATGGATGGTGGGAGTAGCTTTCTGGTGCACATGTGAAATTCTTAGTATTCTTCATGAACTATTCATTTTTTAGTTTTTCTTTTATAGTTTATTTTTCTTAGTGAAACCTAATCAAGTTAACCATTAATATTGCCCCCAAGGGGTGGTGCAGTGGTAAAAAACTTAGGTTTTGAAGGTGTACTCCTCTAAAGGTTCTAGGTTCGAAACTCACTTGTGACATTAATTTGTTGACATCTCTTGTGTTTTCATTCCTACAATGTCTCTTGGTGCCTGACCTAGGGACGACGTGATTACCTCGGGTATAGTAAAGCAAAACTTCGATTTCCTAATTAAAAAAAAAAAAAACTTTGCAAAGAAGGAAATATAATTGAACTTTTAGTAAATATAACTAAATGTACTCCAATTACGCTCTCGTCCTGATGCTAAATGAGGAGGATTGAGGAATGTTAGAATTATGTATATATGTATTTGTATTTATGCTTCCATAAGTTTAGGCCCAGCAGGCCCATTAGGGTTACCTTGTACTTTATAAATAGGCTTCGCCTCATCTAATGAGAGAGACGAATATTTTTTCGTAAGTAACATGGTATCAGAGCGTTAGGAAAATAATTTAGAGTTTCTGTCACTGCCTGCCGCCGCCCGCCAGATTTTTTTTTCTTTTTTCCCCGATTGTTTCTGGAACAGACGGAGCCGATCTACGCAGTGGTCAAAGAATCGTCGCCATCCGAGTAGCCACGTGGGAGCAATCGCCGCCGCAAGATATCGCCGCCGCTGCCGCTCGTTGCTGGAGCTCTGATCGAGAAATTGGTTTGGGGGGGTTTTGTTCACGCCGAGGTATACTTCAAGTCTGTCCAGATTATTTTCGGTTTTAGGCATCGTAGGGTATCCGATTTGCCGTTTAAAGCTGTTGTGGAATTATGGTTTTTTGTTGAACAGGGGTGTTCTGTGTTTTTCGTAAAATCGAGTTCTTTATAGCATGATTGGACCTAATTGAAGTAGTATGGGTGACAATAAGCATACAAGTGTGATTTCTCACTCGATGAAAATTACGAAACGCAAGTTGAATGGTTCAAACTTCCTCGATTAGAATAGAATGATTAGAAACCATTTACTCTACAATGAATTGGAGGCTCATGTGGATGGAAAACCACCTACGGATGAGATAGAAAAAAAGAGTTGGGATCGTGATGATGCGCGCCTCTATAATCAAATTACGAACTCCATGAATGATGACATTGTGGACTTGATAAGTCATCCTTCTAGTGTGAAGGAGCTTGTGAAGTTTGTGGAATTCTTGTATTCTGGGAAGGAACAGGTCACGACGACTTATGATGTGTTCTCTGCTTACTTCCATGCTGATCAGAATGGGGAATCACTTTTTAGTTATTACACTAGACATAAGCAA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BLAST of Sed0001012 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0001012 vs. NCBI nr
Match: KAG6588860.1 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1176.8 bits (3043), Expect = 0.0e+00 Identity = 590/717 (82.29%), Postives = 631/717 (88.01%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. NCBI nr
Match: XP_022928428.1 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4-like isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022928429.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4-like isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1176.0 bits (3041), Expect = 0.0e+00 Identity = 590/717 (82.29%), Postives = 631/717 (88.01%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. NCBI nr
Match: XP_022934519.1 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022934520.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022934521.1 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1175.6 bits (3040), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/720 (82.64%), Postives = 631/720 (87.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. NCBI nr
Match: XP_038882087.1 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1173.7 bits (3035), Expect = 0.0e+00 Identity = 593/726 (81.68%), Postives = 632/726 (87.05%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GZB6 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SUVH4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 729.6 bits (1882), Expect = 3.4e-209 Identity = 369/653 (56.51%), Postives = 462/653 (70.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VZ17 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SUVH6 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 353.6 bits (906), Expect = 5.1e-96 Identity = 229/587 (39.01%), Postives = 297/587 (50.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82175 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SUVH5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 346.7 bits (888), Expect = 6.2e-94 Identity = 219/581 (37.69%), Postives = 294/581 (50.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C5P4 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SUVH3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 332.0 bits (850), Expect = 1.6e-89 Identity = 201/519 (38.73%), Postives = 278/519 (53.56%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YF5 (Histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH1 OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=SUVH1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 312.0 bits (798), Expect = 1.7e-83 Identity = 189/509 (37.13%), Postives = 263/509 (51.67%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EP01 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435244 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1176.0 bits (3041), Expect = 0.0e+00 Identity = 590/717 (82.29%), Postives = 631/717 (88.01%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F7X9 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441673 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1175.6 bits (3040), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/720 (82.64%), Postives = 631/720 (87.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IZZ3 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481473 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1173.7 bits (3035), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/719 (82.75%), Postives = 631/719 (87.76%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EK99 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435244 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1170.2 bits (3026), Expect = 0.0e+00 Identity = 589/717 (82.15%), Postives = 630/717 (87.87%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D214 (histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH4 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016869 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1164.4 bits (3011), Expect = 0.0e+00 Identity = 585/718 (81.48%), Postives = 624/718 (86.91%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. TAIR 10
Match: AT5G13960.1 (SU(VAR)3-9 homolog 4 ) HSP 1 Score: 729.6 bits (1882), Expect = 2.4e-210 Identity = 369/653 (56.51%), Postives = 462/653 (70.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. TAIR 10
Match: AT2G22740.2 (SU(VAR)3-9 homolog 6 ) HSP 1 Score: 353.6 bits (906), Expect = 3.6e-97 Identity = 229/587 (39.01%), Postives = 297/587 (50.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. TAIR 10
Match: AT2G22740.1 (SU(VAR)3-9 homolog 6 ) HSP 1 Score: 353.6 bits (906), Expect = 3.6e-97 Identity = 229/587 (39.01%), Postives = 297/587 (50.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. TAIR 10
Match: AT2G35160.1 (SU(VAR)3-9 homolog 5 ) HSP 1 Score: 346.7 bits (888), Expect = 4.4e-95 Identity = 219/581 (37.69%), Postives = 294/581 (50.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0001012 vs. TAIR 10
Match: AT1G73100.1 (SU(VAR)3-9 homolog 3 ) HSP 1 Score: 332.0 bits (850), Expect = 1.1e-90 Identity = 201/519 (38.73%), Postives = 278/519 (53.56%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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