Sed0000399 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGCACATCTCTGAAAACAACACTTGTGATCTGTTTGATTTCAGGGAAAATTAGCTAAGAAAGTGGAATTTGTGGAAAAAAAGAGGGGAAAATGGGTGGTAATTTCCTTTTTTCGGAACCCAATTGGATAAAGCGCTGAATTAGAAGTGGCGTTGGCTTGTCCATTTCCAGTCTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCCATTGTTCATACGAGCATTGGTTCTACAACTTTCCATTCATACTGAATACATTGCATTTCTGATGATTTTGTACAGAATCGGCGGCCATTGATGCACAGCTTCTTCATAATCTTCCTTTGATTGACGCTTCAATTTCTCAAGCTCTCAGGATCTTGTTTATTTTCTAGGTATCGCTCTTTTCTGTAATCTTTGTTCTGTTTTGTTATCTGGGTTGTTGTTATTTTGCTGCATAATTTTTGGGTTTTATCTGATTTGTTGTGTTTTGGGGGTTTTTAGAGAGTTAGCTGCTGTAAGCTATGGACTCTGCAATTCAGGCTTCACCTTCTTCTGCTTCGTCTTCTGCATTTCGTAGTCCATGTCTCACTTCTGCTTCTCAGAACTGCAAATTTCCGTTGTAAGCTCGTTTTCGTGATTATGAAGTCTGAATTGGATGGTTTTGTTTGTGTTTCATGTGCGTTTATCTATCTTTTTTGTGAAATATGTTAGTTGTTTAAACCCTTGGATACTTCAAAATCGCTTCTTTAAAGTGAAATCTCTAGTTTTCCACCATGGTTATGCGAGCTTTAATTTTGGTGCTAGCAGCTTCTTAGGGAGCTGCGGACTTATTTACTTTGCAGTTTCACATTTTGCACATGTAATCTGGGGCTATTGGAGTTACCATTCCTTGTCTTTGGTTAACATAGAAGGCCTGTGATCTCGGTAGTCGGTTCATAAGTGGAGCATGAATGCCATAGAAGGTTTTTGGATGTGGAATCGTAGAGTGATTATTTCGGGTGATTAGAAATTTGAGTTTTAGAAATAGCTCGTTTGGATGTGGTTATTTGTAGAGGAGTTGCAGTGAATAACTTGTTTGAATGGTGGTTTTTGTAGAGGGGTTGCAGATAATAGCTTGTTTGGATGTAGTTAAAAACAAGTGATTACTTTGAGGGATTAGAAATGAGTGCTTAGAAGTAAGTGATTATTTTGAATGATTACAATAGCTTGTTTGGATATAATTTTTTAAGAGGAGTTGTAAAAGCTCATTTGTAATAGCTAGTTAACTACATCAAACAAACACCCCCATAGTGAACTGGTCAGATTTCCGGCCATCCTACATATCAAACGTAGGACCCCGGCCTGAGATTTCAATCTTCTCAGTAATGGGCAAGGATGGGCATACACGATTTGGTTACAGGTTAGAATTAGGGCAATGAAGTAGCTCGACTGAGAAGAAATGTAGATGGGTTCATAGGGAAGGTGATCCTTGAGTTGAGTATCCTCAGTTCCAAAATTGCGTCTGATGCTTTTCTCTCACTCATTGTTCCTTATACTTTAAGATCTAGGGAATTTGTAGTCCCCACAGTGAGTTACTTCTTAAGGCAAATAGAATGAAAACCTTCCATCTGAAATTATATCATCTGTATATCCTTGCCTGGGGAGGGGCGAATAGGACTAGAATATAGAGTTGAGAATCCACGCGACCGATTGGTGTTCGTTACCCCCTCCCTCTGTTTCCTTAGAAAGACCAAGTTGGAAATAGTTTACGCAAAGAAGAAAGTGCACGAACTTCTCAAAGGTTGGGGTGTTTGTTGTGGTCTTCTTTCCTTTGACTGTGCTAGTGTTATTGACTGGAAGTGTCTTACTTGTCTGTGTGAGGTATGATGGTGTTGCTAATATTGCTGGGTGCAGTCATAATAGCTGTTACAGATAACAAAGTATTCCTCCGAGGAACCTCAGATCCAATTTCAAAGACACTTTAACTTTTGTTGGGTTCCTGCCAATTGTTTAGCAACTTCAGTTTTCTGACACATTAAGAGTTGTTGTTACGGTACAGAACTTAATAAACTCGATCACTTCCTACTTTTCAACAGTTTGCTCCCTGTTCTCTTTAAATGGTTTGTTGGCAGTTTATGTATTCCAATGCATGATTAATGTATGATTTTCACAAATCTTTTGTCTAGTGTATTCTGATAGAACTTCCAAATAATACAATGCCGAGGTTCATGCCTTATTTTAAATATATTTTTACTTATTTTTCTCCATCGACACAGCCTTTGTATTTATGCTGTTTTGTTATATTTGGGCTATAACTTGTTACGATAGCATGGCAGTGATAATTTGCATATCTTTTCCTGCACAGGCCAACTTCCAGAGTAACGGCTTCCTCTAAAAGAATTCATCGTGGCTTCAGGCTCCATATGGATGCTTGTCCTAATTACAACATTTCAAAAAGTCATGTGGTTTCCAAATACTCTTCAGAATGGCCTGAATCACAATCAATATTCTCTAAGCAATCACTCAACAAGTATTTTCTGCCTCTGAGAGCATTGGTAGCTTCAAACAGGCAAGATATTTCAGCTGCACCTTTAACTGGAGATGACAAGGTTGGAGTATTGTTGCTGAACCTTGGAGGTCCAGAGACTCTGGATGATGTGCAGCCTTTCTTGTTTAACCTCTTTGCTGACCCGGTATCATTCCCAACAATCCATTTCACTTTTTAGTTTGAAGTTTTGATTATTCACTCTTATTTATTAGGAGAGAAGCTTTAAGAAGTTTGCTTTATCTTTTTGTTGTTCATAAATTTATTATTTTTTTTGGATAAGAGTTGTTCATAAATTTATTAGATGGGGTGAAACTTTACATATTATTCTTCACTCTTTCGAACTTCTTTCTGTCCCAAGCGCTTTTGTTCAAAGATGATAGTTTAGTTTGATCTTAATAATGGTGACTTTTTTTCTAGTTAAAAAAAAGACACGGTATCTGTTTAATAAAATTTTGGTAGTTTAGTTTGATCGTAAATGATTGGCCATCTGAACTTTTTTTGAAACGTAACTTAGCATATTTCTTAGAAAGGCTTTTTGTAAATCAATTGACTTGTTGTAACTTTTCATCATATTAATGAAAGTTTTTGTTTCCTATATAAAAAAAAAAACTGTGTTGTTTTGACGCTAGCACAAAGAGCTATACAGTGGAATAAATTTATTTACTTAATTTGCATGGATTTTGCCTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTATTATAACTTCTATGCTTGATCTAAAATTGGATTTAATCATTTTTATGTATCATTGGTTTCTTCTAAAAATAAGTTTTTTCTAAAATTGGATATTTTCATTTTTATCTATCATTTTTTCGAATACTTGATAAAATTTGCCATAATGTTGGTAGTTGAACTGTACATATTTGAATAGGCACAAAACCCTCTGATAGCCTAGGAAGCACGGACACTTCTATTTTGACAAAGTATCTGTGTCGTACTCGTGTCCGACACCGATACTTCTGGACACTCGTTGGACACGTGTCCGACACTCAAAATTCAGTGTCCTCTTTTATTATTATTATTTTCAATTTCGGACACTTAACGGACACACCATGGACACTTCATGGACACCTCAATTAAGACTTATTTGTTTCCAACAATGGATGACATGACAACGGGAAGTGTTGGTGGAGGCCGTTGATGACGATGTCTATCGAAGATAGATGGACTAAGATGGAAAAAGGAAAGAAAGAGAGAAAATAGAATGTAGGGAAGGAAAATGAGATGAAAACTAAAATATTTATAAATTATTATGGGTAGGCTTATAACTAGCTAAAATATTTGGATTTCATCTTTTAATAGTATATTATAAAAAATAATAATAAATCACGTATCCTCGACGTATCCGTATCCTGCATTTTTAAATAATGGCGTTTCTACGTATTCGTGTCGTGTCGTATCCGTATCTCGTGTCCGTGTCCATGCTTCTTAGCTGATAGCTGTACATATTTTTATCTTGTACATGGGTTAACAGTTTTATAGTACTTAATTATTGGGACTATGATATTTTTTCTCACATAATACAATTGAAATTGTGAAACCTCATATTTTTAATAGGATATAATACGATTGCCACGGTTGTTCCGTTTCCTCCAAAGACCATTGGCACAGTTTATCTCAGTTCTAAGATCGCCCAAGAGTAGAGAAGGCTATGCCTCAATTGGTGGTGGTTCTCCTTTGCGAAAGATAACTGATGCACAGGCAAGAAATTCTTCTTCTTCTTCTCTTACTTTTATTATTTTTATTTTTTTGTACCGTGTGTCTGAGCCTGTATTCACTACTATTGTTGTTAAACGATCGAGGTTACAGAGAAATACTGAGAATATTGTCTGCATTTTTTTTGCTATCCTTGAATGTTCAAGCCTGTCCGCATTTTCGCTCACTTGTTCAATGCATATTTTGTGTGTAAATACGAGATGCAACGCTTGAAGATATGTTTCTTTTTGTTTATGCATGTATTATCTTTTTGGGGTCAGGCATAAATGTGTTTAGCAGAAATTTTTCATAAATATTACGCCTCATTTCTTTTTCCTTTTAATAATTAATAATTTTATGTTTGTGAGCAGTGTTGAGTGTACATATGTATGTGTGTGGGGGAATCAAATGTCTAGCCTCTAGCTTGACAATACAAGCATTATGCTAGCTAAATTATGCTCATTTTGGCATGAACAGTAATCTCTTGACAAGAGTAGTGCCTTTGTTTTGAATTCAGGGTACAGTACAACTTATAAAATAAATCCTATTCAAGCAACGCACTAACATTGGTTTCAATTCTCTGCTAGAAACTGTCTTTTATACTGCTTGTTTTTGGTGCCATATGATCACACTATTTTGTAGCTATGATTTATCCACCCTCATTCACAGTGGCGTAGTTTTTTGTGATGTTTTGAATTTGATAGGACTACACGATTATTCATTTTATCAATGAAGTATCCTTTCTTGTCAAAAAAAGAAAAAAAAATCCCGTTCAAGTAAGGTTGTTAGATA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MDSAIQASPSSASSSAFRSPCLTSASQNCKFPLPTSRVTASSKRIHRGFRLHMDACPNYNISKSHVVSKYSSEWPESQSIFSKQSLNKYFLPLRALVASNRQDISAAPLTGDDKVGVLLLNLGGPETLDDVQPFLFNLFADPDIIRLPRLFRFLQRPLAQFISVLRSPKSREGYASIGGGSPLRKITDAQAEELKKALWQKDVPAEVYVGMRYWHPFTEEAIEQIKKDKITKLVVLPLYPQFSISTSGSSLRLLEGIFREDEYLVNMQHTVIPSWYQREGYIKAMADLIEKELKRFDIPEQVMVFFSAHGVPLAYVEEAGDPYKAEMEECVDLIMEELEKRRITNSYTLAYQSRVGPVEWLKPYTDDTIIELGQKGVKSLLAVPISFVSEHIETLEEIDVEYKELALNSGIEKWGRVPALGCEPTFITDLADAVIESLPYVGAMAVSNLEARQPLVPLGSVEELLAAYDSQRRQLPPPVTMWEWGWTKSAETWNGRAAMLAVLVLLVLEVTTGEGFLHQLGIFPLFHQ Homology
BLAST of Sed0000399 vs. NCBI nr
Match: XP_022947333.1 (ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita moschata] >XP_022947334.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita moschata] >XP_022947335.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1018.5 bits (2632), Expect = 2.1e-293 Identity = 509/528 (96.40%), Postives = 517/528 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. NCBI nr
Match: KAG6605357.1 (Ferrochelatase-2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1016.9 bits (2628), Expect = 6.2e-293 Identity = 508/528 (96.21%), Postives = 516/528 (97.73%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. NCBI nr
Match: XP_023007154.1 (ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita maxima] >XP_023007155.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita maxima] >XP_023007156.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1012.3 bits (2616), Expect = 1.5e-291 Identity = 506/528 (95.83%), Postives = 515/528 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. NCBI nr
Match: XP_023533357.1 (ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023533358.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023533359.1 ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1011.1 bits (2613), Expect = 3.4e-291 Identity = 506/528 (95.83%), Postives = 515/528 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. NCBI nr
Match: KAG7035317.1 (Ferrochelatase-2, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1008.1 bits (2605), Expect = 2.9e-290 Identity = 508/540 (94.07%), Postives = 516/540 (95.56%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DIV0 (Ferrochelatase-2, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0361200 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 772.3 bits (1993), Expect = 3.5e-222 Identity = 380/419 (90.69%), Postives = 402/419 (95.94%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2Y3Q5 (Ferrochelatase-2, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=HEMH PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 772.3 bits (1993), Expect = 3.5e-222 Identity = 380/419 (90.69%), Postives = 402/419 (95.94%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O04921 (Ferrochelatase-2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 751.1 bits (1938), Expect = 8.3e-216 Identity = 386/511 (75.54%), Postives = 429/511 (83.95%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P42045 (Ferrochelatase-2, chloroplastic OS=Hordeum vulgare OX=4513 GN=HEMH PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 528.5 bits (1360), Expect = 8.8e-149 Identity = 252/339 (74.34%), Postives = 296/339 (87.32%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69TB1 (Ferrochelatase-1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os09g0297000 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 2.0e-148 Identity = 251/339 (74.04%), Postives = 296/339 (87.32%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G6H7 (Ferrochelatase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451226 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1018.5 bits (2632), Expect = 1.0e-293 Identity = 509/528 (96.40%), Postives = 517/528 (97.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L275 (Ferrochelatase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499733 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1012.3 bits (2616), Expect = 7.4e-292 Identity = 506/528 (95.83%), Postives = 515/528 (97.54%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D7G7 (Ferrochelatase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018063 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 983.4 bits (2541), Expect = 3.7e-283 Identity = 492/528 (93.18%), Postives = 506/528 (95.83%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E153 (Ferrochelatase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496275 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 977.6 bits (2526), Expect = 2.0e-281 Identity = 493/528 (93.37%), Postives = 508/528 (96.21%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2U9 (Ferrochelatase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496275 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 977.6 bits (2526), Expect = 2.0e-281 Identity = 493/528 (93.37%), Postives = 508/528 (96.21%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. TAIR 10
Match: AT2G30390.1 (ferrochelatase 2 ) HSP 1 Score: 751.1 bits (1938), Expect = 5.9e-217 Identity = 386/511 (75.54%), Postives = 429/511 (83.95%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. TAIR 10
Match: AT2G30390.2 (ferrochelatase 2 ) HSP 1 Score: 743.0 bits (1917), Expect = 1.6e-214 Identity = 386/521 (74.09%), Postives = 429/521 (82.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. TAIR 10
Match: AT5G26030.1 (ferrochelatase 1 ) HSP 1 Score: 515.4 bits (1326), Expect = 5.5e-146 Identity = 241/340 (70.88%), Postives = 297/340 (87.35%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000399 vs. TAIR 10
Match: AT5G26030.2 (ferrochelatase 1 ) HSP 1 Score: 515.4 bits (1326), Expect = 5.5e-146 Identity = 241/340 (70.88%), Postives = 297/340 (87.35%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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