Pay0015738 (gene) Melon (Payzawat) v1

Overview
NamePay0015738
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionProtein LUTEIN DEFICIENT 5
Locationchr02: 10982861 .. 11002472 (+)
RNA-Seq ExpressionPay0015738
SyntenyPay0015738
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexonpolypeptide
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mRNA sequence

ATGAACATTGATCAAGGCATGATGAACTTCAACCCTCCCAACTACCATGATTCCTCTTCACAAACTTTGTTCCCGTGTGAAGCAGGAATTGGGAATTTGATGAGTGAGGATAATGCATCCAATGCTAATTGCTATCAGTTTGCAGTAGTAACCAATCAGTTGGGTTCTGATTATTTCCCTTTGGCTGTCCCTCCAACTACTCCCACTTTTGTTCATATGTCCAATGCCCAGGAAACTATGGGCGGTGAGAATAGCCAATATCCACCGGGCTTCTTTCAAACACATTCCAAAGATCAATGGTATCCTCTCAAGAAGCAGAATAACATTCAACACCCCTCCTCAACTCCATTTGGGACAGAAGAAATACAATTTGGACTATTGAACCAAGGATCATCAAACGGCACCTTCTACCCAAGTGGTCTTTCAAACACCCAATTTCCTCAGCCAAGATTGAATCTGCAAGATGAGCTGCCATCATCCTCAAATCTTCACCTCCCAAGGAATTGGATCTCTGAAGACAATGTCTTAAGCAATGCGACCACACCTCCAACTTCAAGATCATCAGCAGAAAGTAGAAATACAGTTTATGACCCAACATATGAATCTATGGGATTGCCGATAGATCCTCATTTACGCATGTTCCTTGCAAGGCGCGATCCAACAGGTATCGGCACAAGAAAGGTCACATCTTGGAAAACTATCCAACTCGCCCACCCTACCTTCCAGCCACTCACTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAACATTGATCAAGGCATGATGAACTTCAACCCTCCCAACTACCATGATTCCTCTTCACAAACTTTGTTCCCGTGTGAAGCAGGAATTGGGAATTTGATGAGTGAGGATAATGCATCCAATGCTAATTGCTATCAGTTTGCAGTAGTAACCAATCAGTTGGGTTCTGATTATTTCCCTTTGGCTGTCCCTCCAACTACTCCCACTTTTGTTCATATGTCCAATGCCCAGGAAACTATGGGCGGTGAGAATAGCCAATATCCACCGGGCTTCTTTCAAACACATTCCAAAGATCAATGGTATCCTCTCAAGAAGCAGAATAACATTCAACACCCCTCCTCAACTCCATTTGGGACAGAAGAAATACAATTTGGACTATTGAACCAAGGATCATCAAACGGCACCTTCTACCCAAGTGGTCTTTCAAACACCCAATTTCCTCAGCCAAGATTGAATCTGCAAGATGAGCTGCCATCATCCTCAAATCTTCACCTCCCAAGGAATTGGATCTCTGAAGACAATGTCTTAAGCAATGCGACCACACCTCCAACTTCAAGATCATCAGCAGAAAGTAGAAATACAGTTTATGACCCAACATATGAATCTATGGGATTGCCGATAGATCCTCATTTACGCATGTTCCTTGCAAGGCGCGATCCAACAGGTATCGGCACAAGAAAGGTCACATCTTGGAAAACTATCCAACTCGCCCACCCTACCTTCCAGCCACTCACTTAA

Protein sequence

MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFPLAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTEEIQFGLLNQGSSNGTFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNATTPPTSRSSAESRNTVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTGIGTRKVTSWKTIQLAHPTFQPLT
Homology
[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B887 (uncharacterized protein LOC103487245 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487245 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 505.8 bits (1301), Expect = 1.0e-139
Identity = 242/245 (98.78%), Postives = 242/245 (98.78%), Query Frame = 0 

Query: 1   MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60
           MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP
Sbjct: 1   MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60

Query: 61  LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE 120
           LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE
Sbjct: 61  LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE 120

Query: 121 EIQFGLLNQGSSNGTFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 180
           EIQFGLLNQGSSNG FYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT
Sbjct: 121 EIQFGLLNQGSSNGAFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 180

Query: 181 TPPTSRSSAESRNTVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTGIGTRKVTSWKTIQLAHPT 240
           TPPTSRSSAESRN VYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTGI TRKVTSWKTIQLAHPT
Sbjct: 181 TPPTSRSSAESRNAVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTGISTRKVTSWKTIQLAHPT 240

Query: 241 FQPLT 246
           FQPLT
Sbjct: 241 FQPLT 245

[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B8P4 (uncharacterized protein LOC103487245 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487245 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 460.3 bits (1183), Expect = 5.0e-126
Identity = 220/222 (99.10%), Postives = 220/222 (99.10%), Query Frame = 0 

Query: 1   MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60
           MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP
Sbjct: 1   MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60

Query: 61  LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE 120
           LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE
Sbjct: 61  LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE 120

Query: 121 EIQFGLLNQGSSNGTFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 180
           EIQFGLLNQGSSNG FYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT
Sbjct: 121 EIQFGLLNQGSSNGAFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 180

Query: 181 TPPTSRSSAESRNTVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTG 223
           TPPTSRSSAESRN VYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTG
Sbjct: 181 TPPTSRSSAESRNAVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTG 222

[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T4L0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold270G001680 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 1.5e-37
Identity = 77/78 (98.72%), Postives = 78/78 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60
          MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP
Sbjct: 13 MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 72

Query: 61 LAVPPTTPTFVHMSNAQE 79
          LAVPPTTPTFVHMSNAQ+
Sbjct: 73 LAVPPTTPTFVHMSNAQD 90

[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D8K2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold811G00650 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 1.5e-37
Identity = 77/78 (98.72%), Postives = 78/78 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60
          MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP
Sbjct: 13 MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 72

Query: 61 LAVPPTTPTFVHMSNAQE 79
          LAVPPTTPTFVHMSNAQ+
Sbjct: 73 LAVPPTTPTFVHMSNAQD 90

[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M393 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G660700 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 150.2 bits (378), Expect = 1.1e-32
Identity = 69/80 (86.25%), Postives = 70/80 (87.50%), Query Frame = 0 

Query: 1   MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60
           MN DQGMMNFNPPNYHDSSSQ  FPCEAGIGNLMSEDNA N NCYQFAVVTN LGSDYFP
Sbjct: 48  MNFDQGMMNFNPPNYHDSSSQISFPCEAGIGNLMSEDNAYNTNCYQFAVVTNHLGSDYFP 107

Query: 61  LAVPPTTPTFVHMSNAQETM 81
           LAVPPTTPTF H SN Q T+
Sbjct: 108 LAVPPTTPTFAHTSNVQVTL 127

[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. NCBI nr
Match: XP_008443727.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487245 isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 505.8 bits (1301), Expect = 2.2e-139
Identity = 242/245 (98.78%), Postives = 242/245 (98.78%), Query Frame = 0 

Query: 1   MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60
           MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP
Sbjct: 1   MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60

Query: 61  LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE 120
           LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE
Sbjct: 61  LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE 120

Query: 121 EIQFGLLNQGSSNGTFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 180
           EIQFGLLNQGSSNG FYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT
Sbjct: 121 EIQFGLLNQGSSNGAFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 180

Query: 181 TPPTSRSSAESRNTVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTGIGTRKVTSWKTIQLAHPT 240
           TPPTSRSSAESRN VYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTGI TRKVTSWKTIQLAHPT
Sbjct: 181 TPPTSRSSAESRNAVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTGISTRKVTSWKTIQLAHPT 240

Query: 241 FQPLT 246
           FQPLT
Sbjct: 241 FQPLT 245

[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. NCBI nr
Match: XP_008443728.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487245 isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 460.3 bits (1183), Expect = 1.0e-125
Identity = 220/222 (99.10%), Postives = 220/222 (99.10%), Query Frame = 0 

Query: 1   MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60
           MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP
Sbjct: 1   MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60

Query: 61  LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE 120
           LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE
Sbjct: 61  LAVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTE 120

Query: 121 EIQFGLLNQGSSNGTFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 180
           EIQFGLLNQGSSNG FYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT
Sbjct: 121 EIQFGLLNQGSSNGAFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 180

Query: 181 TPPTSRSSAESRNTVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTG 223
           TPPTSRSSAESRN VYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTG
Sbjct: 181 TPPTSRSSAESRNAVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTG 222

[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. NCBI nr
Match: KAG6590081.1 (hypothetical protein SDJN03_15504, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 2.4e-66
Identity = 144/221 (65.16%), Postives = 160/221 (72.40%), Query Frame = 0 

Query: 18  SSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASN----------------ANCYQFAVVTNQLGSDYFPL 77
           S++  L   EAG G+LMSEDNA N                 N YQFA     +GS++FPL
Sbjct: 56  STTLVLPSSEAGRGSLMSEDNAYNNGGQQAGLGVGSSYWGINGYQFA--ATNMGSEHFPL 115

Query: 78  AVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTEE 137
           AV  TTPT +H+SNAQE MGG N+QYP  F QT S +QWYPL K +  Q PSS PF +EE
Sbjct: 116 AVAATTPTAIHLSNAQEGMGGGNNQYPSEFLQTPSSEQWYPLNKIDVQQQPSSNPFRSEE 175

Query: 138 IQF-GLLNQGSSNGTFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 197
           IQF GLLNQG SNGTFY +GLS  QFPQ RLNLQD LPS SNLHL RNWISE N LSNAT
Sbjct: 176 IQFQGLLNQGPSNGTFYSNGLSTIQFPQTRLNLQDGLPSPSNLHLSRNWISEGNGLSNAT 235

Query: 198 TPPTSRSSAESRNTVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPT 222
           TPPTSR S ++RN VYDPTYESMGLP+DPHLRMFLARRDPT
Sbjct: 236 TPPTSR-SPQNRNAVYDPTYESMGLPVDPHLRMFLARRDPT 273

[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. NCBI nr
Match: KAG7023746.1 (hypothetical protein SDJN02_14772, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 259.6 bits (662), Expect = 2.7e-65
Identity = 144/232 (62.07%), Postives = 160/232 (68.97%), Query Frame = 0 

Query: 18  SSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASN----------------ANCYQFAVVTNQLGSDYFPL 77
           S++  L   EAG G+LMSEDNA N                 N YQFA     +GS++FPL
Sbjct: 54  STTLVLPSSEAGRGSLMSEDNAYNNGGQQAGLGAGSSYWGINGYQFA--ATNMGSEHFPL 113

Query: 78  AVPPTTPTFVHMSNAQETMGGENSQYPPGFFQTHSKDQWYPLKKQNNIQHPSSTPFGTEE 137
           AV  TTPT +H+SNAQE MGG N+QYP  F QT S +QWYPL K +  Q PSS PF +EE
Sbjct: 114 AVAATTPTAIHLSNAQEGMGGGNNQYPSEFLQTPSSEQWYPLNKIDVQQQPSSNPFRSEE 173

Query: 138 IQF-GLLNQGSSNGTFYPSGLSNTQFPQPRLNLQDELPSSSNLHLPRNWISEDNVLSNAT 197
           IQF GLLNQG SNGTFY +GLS  QFPQ RLNLQD LPS SNLHL RNWISE N LSNAT
Sbjct: 174 IQFQGLLNQGPSNGTFYSNGLSTIQFPQTRLNLQDGLPSPSNLHLSRNWISEGNGLSNAT 233

Query: 198 TPPTS----------RSSAESRNTVYDPTYESMGLPIDPHLRMFLARRDPTG 223
           TPPTS            S ++RN VYDPTYESMGLP+DPHLRMFLARRDPTG
Sbjct: 234 TPPTSSLNLIKLKFRNRSPQNRNAVYDPTYESMGLPVDPHLRMFLARRDPTG 283

[Close]
BLAST of Pay0015738 vs. NCBI nr
Match: KAA0038300.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold270G001680 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 166.4 bits (420), Expect = 3.1e-37
Identity = 77/78 (98.72%), Postives = 78/78 (100.00%), Query Frame = 0 

Query: 1  MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 60
          MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP
Sbjct: 13 MNIDQGMMNFNPPNYHDSSSQTLFPCEAGIGNLMSEDNASNANCYQFAVVTNQLGSDYFP 72

Query: 61 LAVPPTTPTFVHMSNAQE 79
          LAVPPTTPTFVHMSNAQ+
Sbjct: 73 LAVPPTTPTFVHMSNAQD 90

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Pay0015738 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Pay0015738 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A1S3B8871.0e-13998.78uncharacterized protein LOC103487245 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10... [more]
A0A1S3B8P45.0e-12699.10uncharacterized protein LOC103487245 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10... [more]
A0A5A7T4L01.5e-3798.72Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold... [more]
A0A5D3D8K21.5e-3798.72Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold... [more]
A0A0A0M3931.1e-3286.25Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G660700 PE=4 SV=1[more]
BLAST of Pay0015738 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_008443727.12.2e-13998.78PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487245 isoform X1 [Cucumis melo][more]
XP_008443728.11.0e-12599.10PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487245 isoform X2 [Cucumis melo][more]
KAG6590081.12.4e-6665.16hypothetical protein SDJN03_15504, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
KAG7023746.12.7e-6562.07hypothetical protein SDJN02_14772, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
KAA0038300.13.1e-3798.72hypothetical protein E6C27_scaffold270G001680 [Cucumis melo var. makuwa][more]
BLAST of Pay0015738 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Pay0015738.1Pay0015738.1mRNA