Pay0012918 (gene) Melon (Payzawat) v1

Overview
NamePay0012918
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr11: 20152261 .. 20155704 (+)
RNA-Seq ExpressionPay0012918
SyntenyPay0012918
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSexonpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGGACAAAGGAGAAGATGGGGATTGAGGCTGAACGACAACCGTGAGTTTGAACTTTGAAGAGAGAATGAAAAGAAAACCTAAAAATCTGTCTTTTATTAAAAAAAAAACAATATATATATATATATATATATATATATATATATTAATTCAGGTTGGGTTAGGTTAACCCGAATTTTTCAACCCCTAACCCGAGACCCAACCCAACAAAAAAAATTTAAAATTTTTCAACCCAACCCAACCCATGTAATATGGGTTGGGTAACCCAGGTTCTCGGGTTGATCGGGTTATTCTTAAACCTCTAGAATCCAAGTCTTGAACAAGGGATCCCGCCCTCTCATTGGCTCGAGAGGAATTCAGTTTATAGGTTGGATCTTAAATTAAATGTTCAATAGTGGATCAGTGGGACTTAAGGAACAAGAAATAGTCTCGAGTGCAAAATGATATTTTGACCCAACCAAGGTTACAATCAACCTATGAGGGATTAACTTACTAATCATGGTTATATCAGATGGACACAAATATATCTATAGTGAACAGAGTGCAACTACGAAACTTTAATGGAATGACCCGTTAGTTAACAATGTTGATTAACTATGTCTAAAAGAGTTTAGTAGTTAATCTCAGATCATTGTAGCCCATGATCTATAGGTCCATTAGGTTACCCTGCTAGCTTATATGAAATTAACTTAGAACAATATGTTGGAATAATTGAAATTAATCGAATTAGGTAGAGAGAGAAAAACCGACGAAATATGTGATATAGCTGTCAGTTATAGAGCCTTATAGTTTAAATGTGATTTAAATATTAAAAATATAAATATGCATCTGAATTTTGGCTTTATATTCAAATGTGATTTAAATATCAGAAAAATGAATAGGAATTCATGCTCGGGAGGTCGAAATTAGTCAAGACGTACAAAATGGTAAAAAGTTAAAATGTCAACTTTTGACTTGAAAAAGTCAAAGTTTGACTTTGACTTTAATGGTCAAATGACCAAAATGTCCTTGGACTAAGTTAGTGGACAAATTCTTTGTTGGATAATCCCACTAGCTCTTAGTGGAATAGGTGGCTACATGAGATATAAACACCTAGCCCACTAAGTTCCACTAATTGTTAGTGGATTATTAGATGTTAAGATTTAATAAACTAATTACATGCAATTTTGCATGTAATTAGTCTATAAATAGGGTATTTTTCATATTGAAGAATTTTTTTTGCCAATTTTGTAATTTTGAATTACAAAATAAACCATTTTTTTCTCTAAATTCTCAACCTAATTCCTCCTCAATTTCCATCTCTTTCTCAAATTCCTTCACTTAACGGGTCCCACAACCCAGTTCTATGTCCGAAGAATAGTGGATCAACACTAGTGGTGGTATTGATTCATGATCGTGAGAAGTTTTAGAGAAATTGAAAAAAGCTTCAAAGGTAAGAATTTATTTTAACCCAAATTAGTGTAATTAGGGTAGTCTTAAGCATATTAATCACTAAAGTGTTTAGTTGCATATAGAGTAATTTTTTCATTCATGTTTTCCGTTGCGTCTGTAAGCTTTCCATCATGTGGTATCAGAGCATGCTAAATATTACTCATTTGCATACGGTGGGTATTTCAATTTATTAGATAAATTGTTGTGGTTTGGTATAAAATTGATATATTATGGTTTTGGCTTAAATTAGGTTTAAATTTGTAATAATTATTGTAATTAGCCCGGTTTGTGGCTTATTTTTATTTTTGCAAAAGGCCTATAATTTTATTGGAGTCATTAGAGTTGAAATTAGGCTGTAATTGCTTCAACCAGGAGAGAGAAAAGCTGGACAGTTTAAAAAGTTGAAGACAAACTCAAATTTCCTTCTATTGACCCAAAACCGAACCCAAAAATCCATCACATAGCTTCTGACCAGGTTCCTCCAGCACGCGTCACGTGTCTCCTCAAATTCGGCCAGCCTGCATGCGTGCGCTCCGAGCTGCATTTGCCTACCTGCGTCTGGCTCTCATCACACGAAGCCCACCGTCTCGGCCCAATTCTCATGCATGCTAGGTCCAAGCCTGCGATCCTCGTCCAGTTTTCACTCACCCGCGTGTCAACTTGGTCTCAACCCGAGCCTCGTTTCGTCTGGCTCTTTTCGCGCAAGTCAGGTCTAAGCTTCGCGTGAGGCCCACTTCATCTGAAGGCCCTACTCGTGTCCTCCTACTCTCTCCGACTCTTGTTTGACCCGATACATGGTAACCTGCGTGCTTGACCTGATAGTTTGGGTCGGTTCAAGCCCAATGGTTGGTTTTTGGGCCGGTTCAAGGGATTTTCAAGTGGGTTCAAGCAGTTTTGATGGTTTTCCAGTCGGTAAAAGTTGTTCGGGAGCGATTTATGTACTCCACCAAATTATTACTGTAATAATTTAGTTTTTAGCTTAATTTAGGAGTCAAAATTAGCCCATTTTAGGGTGTTTTAATTAATTATGCATTTGATGTATGTTTTAATTAATGTTTAATTGTATGTGCATATAGCAATAGAGATTTAAAATCCCACCACAGGTTAACATTTTCTTGCATTGAAAGTATGTTATAATGGTTATAATGCATAGTATGCATGTTAATTAATTAAGATGATTAATTAATTGTTTAATTAATTAAATTAATTTTGATTAAATATGATTTAATGAAATTAATTAATTAATGATTTATTTATTTAATTAAATATGATTTAATTAAAAGATAAATAAATAAAAAAATCATATTAATTAATTTGTTTCTATAATGGTTATATATTGTTAGATAAATGTTATAGGTTTGTCTATGTTTTTTTTATAAGTGTTATAAAATGAATTAGACGTTTAAAATTTATAACAAAGATAAGATGCAAGCTCACCTAGGTTAAACATATCTTCCAAATTTCTTAGAATTAGGTCGTTGTAAAACTGGTTACAAGAGGCTCGCCTGACTCGATCTTGTCAACAAGTAAGACAAGATGACTAAGGTTAGATGTTCTTAAGTTAACGGTTTACGAAACACTTGTTACCTGGAGATCGTAATCAGTTCTTGAGCCTAGTTAACCTAGTTTTATGAGCATGCATGAGATGTGAGGTAATAAAATTGGTTTATCACCTGGACCTCTCCGTTAGGAGTCTTATTCCACTTAAAGAAGCCGAGTCCTTCTCAAATTCTTCTCAATATTCTTTGATCCTTAGCCCTTGGGAAAGAGATCCCGCAAAATGTCCAACCTTAGCATTTTCAGCCACTTCCACTTTCACCTTCAAAGATGGCCCCGTGGGAGTGGGGGATTTCGTTCTCATGCAAAGGCCTCTCTCCATACTAATTCTTGAAATCCGAGGAGTTGCAAGCTACCTTTCTGATTCAAGAGATCATGAAACCGGAACAAGGAGAGAAAGGACGATTGATTCAAGAGGGTTGCTCGAGCTCTTTTTCCGAAGCTTCATAGTATAG

mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGGGGACAAAGGAGAAGATGGGGATTGAGGCTGAACGACAACCCCCTTGGGAAAGAGATCCCGCAAAATGTCCAACCTTAGCATTTTCAGCCACTTCCACTTTCACCTTCAAAGATGGCCCCGTGGGAGTGGGGGATTTCGTTCTCATGCAAAGGCCTCTCTCCATACTAATTCTTGAAATCCGAGGAGTTGCAAGCTACCTTTCTGATTCAAGAGATCATGAAACCGGAACAAGGAGAGAAAGGACGATTGATTCAAGAGGGTTGCTCGAGCTCTTTTTCCGAAGCTTCATAGTATAG

Protein sequence

MGTKEKMGIEAERQPPWERDPAKCPTLAFSATSTFTFKDGPVGVGDFVLMQRPLSILILEIRGVASYLSDSRDHETGTRRERTIDSRGLLELFFRSFIV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..19
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..23

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Pay0012918.1Pay0012918.1mRNA