Pay0009380 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCGACACTGCGATCGACCAAGTGGTTAGTAAACTTACATCCCTTCTAATAAATTTTGAGCGATTTTTGGTTGGAGTATCATAGAAGCAATTTCATTGGAATTGAGATCAATCACGGCCGTGTTTCAAGTGGTACGAAACGTGAGGATATTGGTATCAGCTACAAGACCTTTCAAAAGTGAAGATTATGAATTTATTTTCGTTGAACGATGAAATGGAAGTTAAGCTGCGTAGTGTCAGCTTAGTACAAACTTGAATTCAATTAAATATTGGAGTGGATAGTAATGTATTATTATATATTTTCTCATGCTTCTTTATGCACTGCAGAATCAATCTTACGATGACGCCAACAAGACCCAGAAGAATGTTTTTGACTTGGAATCATTTGTTGGGGACTTGACTGTCGAGGAAGACGCTTGCAGGTAGGTCCATAGTTCATGTTTCTTATTCTTGTATGAAGCATTCACAATATTTCTTTTTCAGCCATCCTAACCTTGATGATGGCCAGAATTGCAGAGCGGGCTAAGATTGACATTACTTAAGAAAGACTATCATGATCTTATTTTGTTATTATATTTATTACCTTCTACCATTGAATTACCAAATTTCATTGTAGTATTAATTTGTCCCGTTTTACAGTGACGACATTTCATTGGAAGGACTGCAGCAAGAACTCGAAGAATGTAAAGATGATGATGTAAGTTATTTCTAACTTCCGTGTAAAATTTGAATGATTGAAACGAGAGCTTTAGCTTCACAATCATTATCAGTATGTCTTACATCACGTGTTAGTATCTTTCTCCCCAATCAGTTTTTTATTTTCAAATATCATATGTTATTGTACATTTAGACTCCTTGATTTAATTGTAGTTTATAAATGTGCTAATTTTTTAAGCAAGAAGCAACTTCTCATTGATGTAATAAAAAAGATTAAATGTTTAGGAAATGCAAACTCTTACAAGGAGAGAAAGAAAAGTTATATTCAGCAAACACAACCAAAAAGAGATGAACTTTCAAAACAACTTTGACCTCCAAGCCTCTTTCAACTATTGAGAAAACAAAAGCTACAACAAACTATTGAAGAAACCCGAAAAAACAACCACCGGCCAATGAAAGACCAACAAAGAGCAAACTGAAAACTCTTGAACTATGCAGAAACTAAAAACCCTATGAAAGTTATGAACCAACACCAAAAACCTTAAAAAGTAACCTTCTCCTAATGGTCTAAAAGCTTCCAACAGGAGAAAATTCAGCTTAATGAAAGCTTGTTTTTCATGAAAATTAAGACGATTTTCATTTTTCTTTTCTGTAGGCATCAAATAGATAATCTTTGACCAGCATGTTCAATCACTTGTTGTTATTGTACTTTGATCCCAAAAAAAATCTGATCAATTAGTCAAATATTGAAGATGTGTACTCTATATCTGGTTTCAGTATAATTGTCATGATTGTTAAAGGAAAATTAGGGTTTATAAATTATTTAATATTTTCCATTATTATTTTCCTTTTCTTTTGTTATTTTCCATTTATGAATTTTCCTTTATGTAGTTTCTTTGAGTTCTATATATTTTCCTATGTAAAACATCATTATGTACTATGAATTATTATGATTTATTTAATAATATAGAAATTTCATATGGTATCAGAACTTTAGAGTTTTATATTATTAAAATTTAGCCGCCACTGCTGCCCTCTAGCCTTGTTCAGCCTCTACCTCCGTCGATTTGACTAACCATTGACAACGGTAGATCCACGTGTAGATTCGCCGTTCTCCGGTGCCAACTCTACCCAACTCGCCGTACGAACTGCAGCAAAATCGAGCATTCTTGTTCAAACCAACGCTCTTTTCCAAAGTGTTTTCCATTTTTTGTCCAGATTGGTGCGTCTTTGACCCATCTGTCGTCCGTTTCATATCAGCTCACCATCACTCGAATCCATATCCACCATCCAGATCTGTCTCCATGGGTTTCTCCAATATGCTGCCGAGTTTGCTCCAGATCTGTCTCCATGGGTTTCTCCAATATGCTGCCGAGTTTGCTCCAGATCTGTCTCGGGGAGTTCACACCTCCATTCGACATCATGGGTTTCATTCTCTATTTGTGTTTGCACAACTGTCTCCAAATTTTATTTGAGTAAAAGCCATTTATCCATGGAAAATTCATGCTTTTCTCAACCAATTTGGTTTGTTTAGTTAGCTCGATTGGTTCAATTTGGTTTAGTCTTGGTTCACCGGTTTGGTCTACTTTTGGTTGGTTCAATCATTGAGTCCGGTTTAGTTAGTCCAATTGTTATGTTTTATTTTATGTATCTATTTCATTTTCAAATCAGTCGTTCATGGGTCTTGTTATATCATTTTTGAAAAGGAGACAAGTTTCTATATTATTAATAAACTCAAAGTACAAGAGAGTTATACAATGAGACTAATAGAGAAGCCTAGAAATGGGGGAGAAAGAGAGAGGATCAGTAGGTGCACCCGGACATTTCAACTAGGTTGACACCCCAATAACACCATCATCATATCCAAAATACAAGAACAATACTAAGGTCATGAAAAAACCAAAGTAAACACCCAAAATAACAATATAATCTACCTACGTAAGACTGAAGCCAAGTTGAAAAGTAAGAACTTAACAGTAGAAATACATATTAAAGCCCCTCAGAACTACAAAAGCACCAATTTTGAACTAGCAATCGGGGGAAACTGCTTTGTATCTCTTCAGATGAAGGTAGTCCAATTGGGGCAGATATCTTGTATGGAGTAATCTTTGTGGGTTTCTAATTCTATCCTAGATCTACTGATTTGATTTAGATGTTTTCTTAGCAAACTCAAGTTCGTGAATCTAGTACCTTGAGTTTGAGGGAGGATGTTAAAGTAAAATTAGGGTTTATGAATTATTAGTATTCTCCATTATTATTTTCCTTTTTTGGTATTTTCCATTTATGAATTTTGCTTTAGTGGTTTCTTTGAGGTCATATATTTTTCTATGTAAAACATCATTATGTACTCTGAATTATTATGATTTATTCAATAATATAGAAATTTCACAATAATGACTATTTTGGAAGTTTGCATCATTTACTATGATATATTTACGCTGTTGTCTCTATATTTTGAAAGGCTGAAAGAGTTCCTCTTTTTTTTACTTTTTATTTTTATTTTTAAATTATCATTATCATAATTTTATTTTTTAAATTCTTTGTTAATCAGGTTGTTACAAACATACTTTCTAAAGGTGTAAAACTAAGGGAGTACACAAAGGGAGTTGAAAACAATTTGCGGCAGGTTGAGCTGGATTCCATACAGGTTTGTCAACATTTCTTAATCTTTTGAGTACAAGTGGCGGGAGGATTTGAACCTCAAACCTCGAACCTCTTGGTTTTGAGTCTATACAGGTGCTAGTTGAGCTAAGCTCTTGGCATTAACATTTCTTAATCTTTTATGTTTCCAATTCTATGTCTGAATATTTTAAACTGTTGTGATTTGGTTTTTTTCTAAAGTGAATTTATTATTCTGCCTTGCCTGTGATCGAGCAATGTTATAGTTGTAGACGTCAAACTGTACTCTGTATGGTGCTGCGAGAGCGTTTTGGCTATTACTTTCTTTTGCTCTCATTAATATTTTAATTTTCAGACAACTTTAAAGATTTACGATGGTATGTTGGGTGTAGTTGATGTGGTCAATTAGGACAAGGTGGATGCTAAGCATAATTTGATTTGTTGGTTGGTTTAGAATTCCATGATCTATGTTTGTTTTCCTGCCTCAAGATGGTACTGTTGGTTATTTAATTGTAATTGTTCTCTTATTATGATTAGCAGCACTTGCAGAGATCTGTTTTAATCTTCGTTGCATGCAAGTGGGGATATTTTTATTTTCCATTAGATTGCTGGTAAGAAATGATGAGGGTGCTAACAGGGTGTCAATTTAGTTGAGATGTTTGGGTGTGCTTCGGTCTTTCTTTATTGCTCTTTGTTTAACTTTCTTGTACTTTGAGCATCAGTCTCTGATGTAGTAGGAATAGGGTACAGTCAAATCCTTAATATATTAGGATTAGGATTAGTTTCTTTGGTTTATTAGGATTAAGATTAGTTTCTTCTATTAATTAAGATCGTGATAAGTTTGCTTTTTAATTATAAATAGAGTAATTGTCTTCATTTATTCACAACTTTTAAACATTAATGAAATTCTCTCATTCGATATAAAATCGATTTGGTAGTGGAGCAGTCGTTCGAGCCAACGTTGACTACCACCGGTGAAAGACTGGAAACTCTTTGTGATGCCGATCACAAGAGGAGCTTTGTGAGTTGTGCTCGTTGCCAAATAACACACATCTAACAGGGGAACCCTTAAAATTAAAGAAAAAAAAAACAAAGATTTATCAGAATTTTGCAAGAATGGAATTTTATAGAACTACAATTTGGGACAGATATTGTTGTAGTAACAATCAAGAAAAACTGAGAAATATGCAAGAAAATTCAAGAATCGGTCCTACAACAATTATGATGAAGAAGCTTACCAAGAACACCCCATTTGTACATCAATCGTAAAGTTTTTGAAGAAATGAAGAAGGAAATCTAGAAAATTTGATAAAGGATTTTCTTTTGATCCTCAACAACGCATTATTGCACTCCGCTCTTCATCACGACTCCAATCAGTCTGGGTCACAGACTCCACAAGCACCAAACCTGGGTTCAAGCTACGTAGACAAAGTGAAGACCACCTGGAATAAACCATACTCTTTTTTGATGCTGGAAAACATAGCATGGTTAAGGGTTCAAAAAACCTTAGCCATCACTCAATTGATAGATTAACACAGAACTTCGAAAAACTTCCTCCCTACTCCGGCCACTCATCTGTGGAAAATTACTGGTTCAGAAACCAAATTGTGCAGGTTCCTACCAGCAACCATTAAAGAACGCCATAAGAGGAAGTTTTTTTTCTAAACTTCGGTGATTTTGATTCACTTGAAGCCCCACTGTCGGTTAAACAAGATT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MADTAIDQVNQSYDDANKTQKNVFDLESFVGDLTVEEDACSDDISLEGLQQELEECKDDDVVTNILSKGVKLREYTKGVENNLRQVELDSIQEYIKESDNLVSLHEQIRDCDNILSQMETLLSGFQAEIGSISADIKVLQEKSMDMGLKLKNRKVAESKLAKFVEEIIVPPRMIDIIVDGEVNDEYLRTLEILSKKLVVAEVDPMIKNSKALKDVQPELEKLRQKAVSKVYDFLVQKLHALRKPKTNIQILQQSVLLKYKYVISFLKDHSKEVYSEVRTAYIDTMNKVLSAHFRAYIQALEKLQLDIATSSDLIGVEARSSGLFLRGREPLKNRSAVFALGDRIKILKEVDEPALIPHIAEASSIKYPYEVLFRSLHKLLMDTATSEYNFCDDFFGEESMFYDIFAGPFAVIDEHFSSILPNSYDAIGLMLMILIIHQHQLIMSRRRIPCLDSYLDKVNIALWPRFKMVFDMHLSSLRNANVKTLWEDDVHPHYVMRRYAEFTASLIHLNVEYGDGQLDLNLERLRMAIDDLLIKLAKTFSKAKSQTVFLINNYDMTISVLKEAGPEGGKILVHFENLLKSNTALFEELLAEHFSQLIKFVKTRGSEDLSSNPDRPITVAEVEPLVKDFASRWKAAIELMHKDVITSFSNFLCGMEILRAALTQLLLYYTRLSDCIKRIELFKVEGIRTKSKK Homology
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94KD3 (Vacuolar protein sorting-associated protein 52 A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS52 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1091.6 bits (2822), Expect = 0.0e+00 Identity = 552/681 (81.06%), Postives = 620/681 (91.04%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FVV6 (Vacuolar protein sorting-associated protein 52 B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=P2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1024.6 bits (2648), Expect = 5.1e-298 Identity = 517/674 (76.71%), Postives = 594/674 (88.13%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8C754 (Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Vps52 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 406.0 bits (1042), Expect = 8.6e-112 Identity = 236/663 (35.60%), Postives = 395/663 (59.58%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O55166 (Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Vps52 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 405.6 bits (1041), Expect = 1.1e-111 Identity = 235/662 (35.50%), Postives = 392/662 (59.21%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8N1B4 (Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=VPS52 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 404.8 bits (1039), Expect = 1.9e-111 Identity = 233/662 (35.20%), Postives = 393/662 (59.37%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3M6 (vacuolar protein sorting-associated protein 52 A OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485406 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1302.0 bits (3368), Expect = 0.0e+00 Identity = 679/680 (99.85%), Postives = 679/680 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C5H3 (Vacuolar protein sorting-associated protein 52 A OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold453G00980 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1298.1 bits (3358), Expect = 0.0e+00 Identity = 677/680 (99.56%), Postives = 678/680 (99.71%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T4H6 (Vacuolar protein sorting-associated protein 52 A OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold86G001140 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1293.5 bits (3346), Expect = 0.0e+00 Identity = 677/681 (99.41%), Postives = 678/681 (99.56%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LSV2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G402000 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1287.7 bits (3331), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/680 (98.68%), Postives = 676/680 (99.41%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DHR6 (vacuolar protein sorting-associated protein 52 A OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020176 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1269.6 bits (3284), Expect = 0.0e+00 Identity = 657/680 (96.62%), Postives = 674/680 (99.12%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. NCBI nr
Match: XP_008441201.1 (PREDICTED: vacuolar protein sorting-associated protein 52 A [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1302.0 bits (3368), Expect = 0.0e+00 Identity = 679/680 (99.85%), Postives = 679/680 (99.85%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. NCBI nr
Match: TYK06625.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 52 A [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1298.1 bits (3358), Expect = 0.0e+00 Identity = 677/680 (99.56%), Postives = 678/680 (99.71%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. NCBI nr
Match: KAA0037026.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 52 A [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1293.5 bits (3346), Expect = 0.0e+00 Identity = 677/681 (99.41%), Postives = 678/681 (99.56%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. NCBI nr
Match: XP_011649893.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 52 A [Cucumis sativus] >KGN63091.1 hypothetical protein Csa_022639 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1287.7 bits (3331), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/680 (98.68%), Postives = 676/680 (99.41%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. NCBI nr
Match: XP_038884385.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 52 A isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1286.2 bits (3327), Expect = 0.0e+00 Identity = 669/680 (98.38%), Postives = 676/680 (99.41%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. TAIR 10
Match: AT1G71270.1 (Vps52 / Sac2 family ) HSP 1 Score: 1091.6 bits (2822), Expect = 0.0e+00 Identity = 552/681 (81.06%), Postives = 620/681 (91.04%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. TAIR 10
Match: AT1G71300.1 (Vps52 / Sac2 family ) HSP 1 Score: 1012.7 bits (2617), Expect = 1.4e-295 Identity = 517/694 (74.50%), Postives = 594/694 (85.59%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0009380 vs. TAIR 10
Match: AT1G47560.1 (exocyst complex component sec3B ) HSP 1 Score: 46.6 bits (109), Expect = 9.4e-05 Identity = 64/303 (21.12%), Postives = 131/303 (43.23%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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