Pay0002947 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTTGATACCTTGGAGTGCGACAGACGATGGTTGGTTCAAATATTCTACTTTTATCCACAAGTAAGCTCCCTTGCACTGTCTCGAAATGGAACTCTCCCTTGTTGGTAATGGTTATCACCGCCATGTCCTCCGGACTCGGTTGCCCACACCTTCTTCTGTAATGGCTTCTGCGTCGCATGCTGTCCCTAGCCTCCAGAACAATCAATCTAATTCTGTCGCAATTCTCCCTAAAGAGCCTCAATTCCTCCCCGGCTCTTCAAATTCTAAACTCTTCAATGGCGCCCAGAAGCGCCACTCCAAATCATACCTTGAGAGACAGTCCGCTATTGCTCAAGTTAAAGATTGCTCCGAGTTGGCTCCGGCTCTTGCCAGGTTCTTCTTCTCTTACCTTTTTGGCATGTGTTTTTGGATTTTGAGCTGTGGGAAATCACTTGCTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTGTTAGAAAGGTTTCTTTTTCAATGTTAGTTAATTATCGATTTTGGTAAAGAACTATATGTAGTTGGAGGGCAGCGAGAGAATTCTAATCCCGTGTGCTTACAAGATTACTGCTCGGGTCTTATTGAATCGATTGAAACAGGTTCTTCAATCTACCATTGCTTTAAATCAGCTTGCTTTTGTTGAAAATAGACAGATTCTGGATGCATCCTTATGGCTAACGAATTGGTGGATGATTGGTTTCATGAAACCAAGAAAGGTGTGATTATTAAACTTGATCTTGAAAAGCTTTTGGTACGGTCAATTAGGACTTTTTAGATGCAATTCTTTGGGCTAAAGGCTTTGGAAGGGTTTGGCGTAAGTGGATTCATGAATGTGTCTCTAGTGCAAATTTTTCCATTATTATTAATGGTAGACCTCGTGGTGAAATAATCCCTACTTGCGACATTAGACGAGGTGATCCTCTTTCTTCTTTTCTTTTTATGTTGGTTGCCGATTGCTTAAGTCATCTGTTGGATCATAATCTATCTAAAAATTTGATAGCCACTAACCCCATTGGTGCTTGGAGTTTTATCCTGAATTACTTGCAATTTGCTGATGACACTTTGCTTTTCTCCACTGCTGACCGCGTTGTCCTTACATGCTTGTTTGAGGTTATTCATGTCTTTGAACAAGCTTCTGGTTTATCAATTAATCTCTCTAAAAGTGAGCTCCTTTGGATTTATATCTTTGATGATGATTTGGATTGGATGGTGACTGTTTTTGGGTGTAAGAAGGGACAATGGCCAACTTCTTATCTTGGCCTTCCCCTTGGTAGCAACTCTAAATCAATGATTTTCTGGCAACCAATTATTGAGAAGTTCCAACAAAAACTCTATAATTGGAAGTATGACTATAGGGTGGTCGTCGTACACTTATTCATGCCCGACTTATTCATGCTACTCTGTCAAGCTTGCCTACTTATTACCTCTCTTTTTTTTCCTAGTTGCCCGATTCTTGCGATAATTAATTGAATTTGGACCAGAAACCCTGGATCTTCCATAGATGATCTATTTTTCTTTTGAGAGGCCAGGAAATTTTCACTCGTGAGTGAGACTGAATATGGAAATAATTGTCCACTAATGAAAAATTGCCGAAATACCTAACCCTCTACCAAGGGCGACCCCTACTGTAGCTCTGGGGCGTGCGTTTTTTGAGGAAGTGAGCATTGGTGCAAAATTTTCGTCATCGTATATATTCTGTCTCTTTAACTGAGGGAAGTAGATCTGAAGGAATTTTTGTAAGATGAGCCAAGATGACACTCTGTGTGTCGTCAGTCTTCATCTGATGGCTAAAACTACTATTTATCCATTCTTTTGTGTTTCTCGACCCAAATAAATATAGAAAAGATCATGACATCGGTTTCCGCTACCAAACAAATTAATCTATATAGCAAAAAGGCTCGTACAAAGTTGCCCACCGTAAGGATCTACCAAAGATCGGCCATAATCAACTATGACCTTGTTGATAGTGCTTCGTGTTCCAAGCGTATGAATCAGGTAGTAAGCAATGAATAAAGATACGGGCATGAATAGAGTGTACGGACGACGCGACCCTAGAGTCATACTTCCATTATAAGTTTTTGTTGGGAATCTCTCAATAATTGGTTTGCCAGAAAAATGCATTGATTTAGAGTTTCTACCAGGGAAAGGCCCAAAGATAAGAAGTTGGCCATTGTCCCTTCTTACACCCAAAAACAGTCACCATCCAATCCAAATCATCATCAAAGATATAAATCCAAAGGAGCTCACTTTTAGAGAGATTAATTGATAAACCAGAAGCTTGTTCAAAGACATGAATAACCTCAAACAAACATGTAAGGGAACGCGGTTCAATAGTAGTGGGAGAAAAAAGCAAAGGTTCTATGATCTCTTTTTTTCGAGAATTTAGCGACTTAGGCTAATATTGATTGCTAGGTAATTTATCAACACTCCTATAGTCAGCTAGTTATTGCTCCGGTCTTATGTGTTGCTTGTCTTCTCTTGAATATCCTAACCATGCATATTTTAGAGTTTAGGTGTCTGAATATGATACCACGCGTAGAGTGAGACTTTTGCTGATAGTCATGAGACTCGGAACTCTATGGCACCCTTATACGACGTAATTTATACTGATCAAGCAGAAATCAGGTATATGACGCAAGTGAAATGGATTCATTGCCTCGTCTACTATTATTTTGTCCTGCTAAGGTGAGTGATTTCATATTGAGTGCTCTCTAGATTCCCAACCTGGAGAATGGGGGACTTTACTTACCGACTCTTCATCATAAATAAATATCTATATTTATTGTGAAATCTATGATTGATGACTTGATAGGTGTTCTCGAACCTTTTTAAAGGGATTTTTATTCAATCACTTGGATAGATCACTTCCTAAAGAAAATTAAAATTTTTCTTTTGAAGCTTAGTCATAAATCTATAAACACTACCGATCGTCTTCAACGTCGTATGCCTTATATGTCTCTTTCTCCTTCTTGGTGTATTATTTGTTGTGCTAATGTTGGATCCCATGTTCATCTTTTTATTCATTGTCCTTTTGCTTGGGAATTTTGGGATCGCATTTTGAGGCTTTTGGTTGGTCTACTACTTTGTCCACCGACATTTCAAACATCCTCAACTCTCTTATGCTGGGTCACCCGTTTATTGGTTGCAAGAAGATTATTTGGCTGGGTGTTCTTCGGGCTTTCTTTTGGACTTTATGGGGCGAGCTTAATAGGCGTCTTTTTCAAGACTCGTTTTCATCTTTTAGTTCTTTTTTTGACATGGGTCCACAAGTTTTTGTTGGTGCAAATTTGGGCACCCTTTTAAGAACTTTAGCTTATCGGTCTTAGTTGCCAATTGGCACTCTTTTTGTAAATCACCTTTAGGTGCTTAGGGTTTCCCTTTATTTCATTTTATCAATGAAATGTTTGTCTCTTGTCAAAAAAAACAATGGATGGAAGATGTTATGCGTTAGCAAGGATTTGGACCTTGATTCGAATTTTGTATTCAGCACCTAATGGCTCTGACATTCCCTACATTCTTGCAATATGACAACGTTATCCTTGTTTCAAATTGTTTCTAAGTGGGAAGACTATCCCCACATACTCACATACCAATACTGGGACCTTTTAACATCCTTGATTCTCACTTACATGCTTATTGACGAGAATTACTTCAAGCTAAAGATGCTTAACTTTGAAGTTTTTATGATTGAGTTAAAAAAAAAATGAAAATGTACCTTGTTGGTATATGGTGAATTCGTGGGGCCCGAAGATTTGTTGGAATTGAGCTCAGAAACAACATATTTGACCTCTTTCTTGGTGAAGGTGGTTTCTAGAAGTGATGCTTGTTGTGTGGAGATGGGTAGCCAATTTGAGATTTTCTGGAGAGAGTGGCTGCTCTGTTTTTTTGTTTGTTTGTCTTTTTTGTGTGTGTATAGATCAGTTAACGTTGCCCTCATATGGCCATTTTGTCTTACATTTTTGTTACCTCCTTAGCAACCAAAGAAAGAAGCTATTCCTTCAAAAGTGTTTCTTTGTAGTTTATGGGAAACCAACATATCCCCTGATTACTCTGTGCTGTTGATAGTGATAATTTCTGCAATAAGCTGGTGTTTCTGGGTGATATTGCAGCTAAAGGTCTCACAGTTCCACTCTTTAAGAATAGCTTTTGAAACCTTTAAGTTTTTGCATCAATCCATGTCCTGGTCAAGCGCAAATAGGGGTATCTTCACCAATGGTCCACTATAGGAGAAAGGGAATGCTGTTGCAATGACATATTCTCAAATTAAAAAAGGGGGTGTAATCCTAAGATACACGTGTGACCAATGGAGAGAAGCAACAGCTAGTGATAAGAGGTTGGTCTTTCAAGCCTTCAAACAGTGGCCATTAAATTTATCTAACACCTTTTTAATTGTTAAGAATCGATTAATCAACATAAGCCTCAGAGAGTCATGAAAATAAAACCAATTGTAGAGGTTGTTTTGGAGGGGGATATCAATAAGAACAATAAGTTCCCCCCCCCTTTTTCCATTGGGAAAAAAAACCAATTAAAAAGGTGCTATTACTTCCTCGTGTTTAAATTCCCAGTTAGAAGTTTGAGAAGACCATCGTGCCATATTGGAATCTCCTCCCAATAATCAATAATCAACACAAAGATGAGACAAAACTTCCGGTTCCTTTAGAAAATAAGACTTAATGGGTAAAGAAGTCTCAGGGATTCTTGTGAACCAAAATTCAAATGGATCTAGATCGCGATTCCTCCCTTGAATACATTGCTCCATAATAGGGGCTTCATAAAGTTAGAGCTTTGGAGGTGGAGGTTTGAGATTGGTAGGGATGATGGGTACGTAGAGAAGAAGGAAGGGAGGTTAGGGGTGGGGATGGGGGAAAGATGAAGCTTAAGGACTGGAAACTGGGTCATAGATGTCGATGTTGAGAAGATGGATGGAGATTTAATCTTGGGTGTTGGATTTGAGAAAGTAGGGACTGTTGTGGGGGTTAATGGTAATTTTA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ATGGAACTCTCCCTTGTTGGTAATGGTTATCACCGCCATGTCCTCCGGACTCGGTTGCCCACACCTTCTTCTGTAATGGCTTCTGCGTCGCATGCTGTCCCTAGCCTCCAGAACAATCAATCTAATTCTGTCGCAATTCTCCCTAAAGAGCCTCAATTCCTCCCCGGCTCTTCAAATTCTAAACTCTTCAATGGCGCCCAGAAGCGCCACTCCAAATCATACCTTGAGAGACAGTCCGCTATTGCTCAAGTTAAAGATTGCTCCGAGTTGGCTCCGGCTCTTGCCAGATATGGTGGACTACTAAAACCGCAAGATTTGAATGTTATACTGCGGCATTTTGGGATGTTAAATAGGTGGAAGGATCTATCTCAGCTGTTTGAGTGGATGCAGGAGACTGGAAAGACCAATGTTTCTTCTTACAGCAGTTACATAAAGTTCATGGGGAGAGGTCTCAATCCTTTGAAGGCACTAGAAGTATACAATAATATTCAAGAAGTATCAATAAAGAATAGTATTTTTATTTGTAATTCTATCCTCAATTGTCTGGTGAGAAATGGCAAGTTTGATACCAGTGTTAAGCTGTTTCATCAAATGAAGAATGATGGTTTATGTCCAGATACAGTTACATATAGCACGATGCTTACCGGTTGCATCAGGGTTAAACATGGTTATGCTAAAGCAATGGAGCTTCTTAAGGAGCTGCAAGACAATGGACTATGCATGGATTGTGTATTGTATGGGACATTGATAGCTATTTGTGCTTCACATAATAGATTGGAAGATGCAAAGAGCTTCTTCAACCAGATGAGAGCTGAAGGTCATTCACCAAATATGTTCCATTATGGCTCTCTACTCAATGCTTATTCAATCAATGGAGATTATAAAAAGGCTGATGAGCTGATTGAGGATATGAAATTGACCGGGTTAGTACCAAATAAGGTGATTTTAACGACGTTGCTGAAGGTTTATGTTAGGGGAAGTTTGTTTGAGAAATCAAGGAAATTGTTATCAGAATTGGAATCCCTTGGCTATGGTGAAAATGAGGTATCAGGTTCTGTATTAGAAAAGCAAAGCAGTTTGAATGAAATGGAAAGCAAAAAACTAGATCTGGTAATGTTTTCTCTCTTTAATGGGTATGCTCACAGCATCATGATATCAGCTTTTTGCCGAAGTGGGCTTCTAGAAGAGGCAAAGTTGTTGGCTAAAGATTTTGAAGCCACATATGACAGATATGACATTGTAATATTGAATACAATGCTCTGTGCCTACTGCAGAGCAGGGGAAATGGAGAGTGTAATGCAAATGCTTAGGAAAATGGATGACTTAGCAATCAGTCCAGATTATACTACCTTCCATATCTTAATCAAATATTTCTTTAAGGAGAAACTATATCTACTTTGTTATAGGACATTGGAGGACATGCATCGTAAAGGCCACCAACCAGAGGAGGAGCTTTGTTCATCTTTAATATCATCTCTTGGGAACATACGGGCTTATTCGGAAGCATTTTCCGTTTACAATATATTGAAATATAGTAAAAGAACAATGTGCAAGGCACTCCATGAGAAGATTTTGCACATTCTAATTGCAGGTCGACTTCTCAAAGATGCTTACGTCATTGTCAAGGCAATCCATGGTTCTGGATACAAGATTGATCAGGATTTGTTTATGATTGCTACATCACGCTACATTGAGCTACCTGAAAAGAAGGATTTATTTATTCAATTGCTACAGTGGATGCCTGGTCAGGGTTATGTTGTTGACTCATCAACAAGAAACCTTATCTTAAAGAATGCACATTTATTTGGTCGCCAGCTTATTGCAGAGATCCTATCAAAGCATAGTCTATTGTCAAAATCCACAAAATCTCGTGAGAACACCTTTCGTTTAAAATAA MELSLVGNGYHRHVLRTRLPTPSSVMASASHAVPSLQNNQSNSVAILPKEPQFLPGSSNSKLFNGAQKRHSKSYLERQSAIAQVKDCSELAPALARYGGLLKPQDLNVILRHFGMLNRWKDLSQLFEWMQETGKTNVSSYSSYIKFMGRGLNPLKALEVYNNIQEVSIKNSIFICNSILNCLVRNGKFDTSVKLFHQMKNDGLCPDTVTYSTMLTGCIRVKHGYAKAMELLKELQDNGLCMDCVLYGTLIAICASHNRLEDAKSFFNQMRAEGHSPNMFHYGSLLNAYSINGDYKKADELIEDMKLTGLVPNKVILTTLLKVYVRGSLFEKSRKLLSELESLGYGENEVSGSVLEKQSSLNEMESKKLDLVMFSLFNGYAHSIMISAFCRSGLLEEAKLLAKDFEATYDRYDIVILNTMLCAYCRAGEMESVMQMLRKMDDLAISPDYTTFHILIKYFFKEKLYLLCYRTLEDMHRKGHQPEEELCSSLISSLGNIRAYSEAFSVYNILKYSKRTMCKALHEKILHILIAGRLLKDAYVIVKAIHGSGYKIDQDLFMIATSRYIELPEKKDLFIQLLQWMPGQGYVVDSSTRNLILKNAHLFGRQLIAEILSKHSLLSKSTKSRENTFRLK Homology
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WVV0 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g10910 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 694.1 bits (1790), Expect = 1.4e-198 Identity = 364/609 (59.77%), Postives = 454/609 (74.55%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9S7Q2 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74850, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PTAC2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 1.4e-31 Identity = 105/476 (22.06%), Postives = 203/476 (42.65%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8Y6I0 (Pentatricopeptide repeat-containing protein 10, chloroplastic OS=Zea mays OX=4577 GN=PPR10 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 131.0 bits (328), Expect = 4.9e-29 Identity = 100/475 (21.05%), Postives = 205/475 (43.16%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FIT7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g61990, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g61990 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 9.2e-28 Identity = 89/398 (22.36%), Postives = 190/398 (47.74%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SH60 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g64100 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g64100 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 1.2e-27 Identity = 123/540 (22.78%), Postives = 233/540 (43.15%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CN74 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502713 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1167.5 bits (3019), Expect = 0.0e+00 Identity = 603/674 (89.47%), Postives = 615/674 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ERS3 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436973 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1040.0 bits (2688), Expect = 4.0e-300 Identity = 531/670 (79.25%), Postives = 581/670 (86.72%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IWQ9 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479891 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1037.7 bits (2682), Expect = 2.0e-299 Identity = 530/670 (79.10%), Postives = 583/670 (87.01%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DRU4 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023788 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1021.5 bits (2640), Expect = 1.5e-294 Identity = 525/671 (78.24%), Postives = 575/671 (85.69%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LCK2 (PPR_long domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G842670 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 970.7 bits (2508), Expect = 3.0e-279 Identity = 499/579 (86.18%), Postives = 514/579 (88.77%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. NCBI nr
Match: XP_008464969.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1167.5 bits (3019), Expect = 0.0e+00 Identity = 603/674 (89.47%), Postives = 615/674 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. NCBI nr
Match: XP_004141206.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN59861.2 hypothetical protein Csa_001278 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1139.0 bits (2945), Expect = 0.0e+00 Identity = 587/674 (87.09%), Postives = 606/674 (89.91%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. NCBI nr
Match: XP_031738874.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1130.9 bits (2924), Expect = 0.0e+00 Identity = 582/667 (87.26%), Postives = 601/667 (90.10%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. NCBI nr
Match: XP_031738873.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1129.4 bits (2920), Expect = 0.0e+00 Identity = 581/669 (86.85%), Postives = 602/669 (89.99%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. NCBI nr
Match: XP_038903773.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1090.1 bits (2818), Expect = 0.0e+00 Identity = 558/666 (83.78%), Postives = 590/666 (88.59%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. TAIR 10
Match: AT1G10910.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 694.1 bits (1790), Expect = 1.0e-199 Identity = 364/609 (59.77%), Postives = 454/609 (74.55%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. TAIR 10
Match: AT1G74850.1 (plastid transcriptionally active 2 ) HSP 1 Score: 139.4 bits (350), Expect = 9.7e-33 Identity = 105/476 (22.06%), Postives = 203/476 (42.65%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. TAIR 10
Match: AT5G61990.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 6.5e-29 Identity = 89/398 (22.36%), Postives = 190/398 (47.74%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. TAIR 10
Match: AT1G64100.1 (pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein ) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 8.5e-29 Identity = 123/540 (22.78%), Postives = 233/540 (43.15%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0002947 vs. TAIR 10
Match: AT1G64100.2 (pentatricopeptide (PPR) repeat-containing protein ) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 8.5e-29 Identity = 123/540 (22.78%), Postives = 233/540 (43.15%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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