
PI0018801 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAATGATGCAAAACCCAGAAGTAGGGTTCTAGCTTTGTTCAAATTCATACGAGGGGAGACTGTGCTGCACACTCCAACAAGAAGGAAGAACCAACATGGGGCGTAGGATGCCGTTGGCCGGAATGGAAACCTCCGTCATGGCTACCGACTCTGTAGAATTCATTGACGTTTCTGTTCCTTCTTCCTCATCAAGAGAGGCCGCCATTACTTCCGTTGCTTCTCAAGCTACCACCTCATTGACTGAGGACCATGCCTCCTGCGTTGTCGTAGGAGATCCTCCAACCTATCTCATCTGGTATGCTCTTTTTCCCTCGCACTTTATTGATTCCGTTCGTCGGTGCAAACAAGCCCAATTCCTCTTCCATTCTTCTTCCGCAACAGGAGGATTCGGAAGATTCTACCTCATGTAGTAGAGTTGCTTGAGTTTTCAACTTCCAACGAGTTTCGTAGGATTGGTTTGCGAATTGCCTTTCCTGAAACACTTCACCCGGCAGTGTTTGTTTGCAAAAATGAGGTTAGTTTCCATTTTCCTAGTCTCAACTTCAGCCTGTTAGAATGTTTCAATGGATTATTAATTGCCGAGGAATGCTGCAGATTAGTTCGTCTATGGGACATCCTTTCTTGATGTATGCAGTGACTTCGTCCGGTTTCGCTTATTGTTTGAAGCTGCGAAATCTTTCCTCATATGTATCCTACTCTGCCATTCCCCTCGATGAGGTTGTGGAGTTTAATCTGCAAAACCATTTGGACAACAAACCAGTAACCAGCGTATCTGCTATATCTGGATGTCTCGTGATAGGGAGAAATGATGGATCAGTTTCATGTTACAAACTTGGGTCGCTTGACCAACATACCCCTGGTATGAGTTTACTTTTCTGTCCATAAAGTGGCTACATTCTGTATTGTTATTTGTCCAAATATGATTGTGAAAGTGGGCGAGTGGGTTACTACCGTATCAATAGGAAGCTTCTTTACCTATTGTAATCTGTCCAAATATGATTGACAATATGGGCAATTGGCTTACTTTTCATACCATTAGGAAGCTCTTTTATGATCCAGAACCGGGACTTGGCTTAAAAGTTAAAACTGTAGGATGCTCTTTGACAATTGTGAAATACCTTCTTGTTTTACTATTTCAAAGTCGTTAGTATTGTTCATTACTACTTAGGATGTGCCACGGGGATGTAAATGCAAACTTACAGCTATCTCCAATTTGTTTTACTTCTTTACTTTTTGTGCCACGCTTCTTTAGAATCCTTAAAACTTGTATTATTTTGTTACATTTAAGCGGTATATCTAACAATGACTATTTATTTATCTTCTAGGCTTTGAACATGAACTACGAGATGATTCAGGATTCAATCGTCTGTTGGGTTTCATTTCAAGGTGCCCATTTATGAAATATCATATTATATAGATTTGCATCTTACTTTTGAAATTTGCTTAGCTTTGTGTCGGATTAAATGATTGGCAATAAGGTTGAGATGCACATATTTGAACATGTATTTCTTAAGAACATTTATAGAAGGATGATAATTAATAAAAATTAGCATTACTTTAAGGTCTTGTCCAAAAAGGTAGCATTATTTAAGATTGTCAATGGAGGTTGGCATTGTAGTTCACATGCTTAAAAGTTAACATTGACAAGCATTTGGAGTGAAGAGTATTTCTTCCCAACAGAAGAGATCTTCAAATTCAGTATTTTGTTGGCTCTTAAGGGCTCAAAGATCAATTCTTATCTTGGAGAGAGCCTGCTGTTTTGTCCAAGCTGAACTCTGTTAGGATCCTACTCTTAAAAACACAATAAATCCCAACAAAGGCAGAAAACAGAGGTGATTCCTCTGGTAGTTTCTGTTGTTTAATCAACCCAACGTTCATTCATCAACAAGGGAATATGTAAAGAAAAACACACAGAAAGAACAAGCCCAACACCTTAGTGAAGGCTGGCAACTTCTCCCTTAAAAGACACAACAGGCTTTTCAAAAAAACCCTACCTCTTAACATTGAGGAACTTCTTAACATAATCCCATTATATTGTAGGGAGACCCATCATTAATCAGAACTGAATGTTCTCTCAAAACCCTTACGAAAACATGGGAAGAAGAGGACCAAGAGTTTCTGTTGGAGTTCCAAGATGTGGAAGTTGAAGGAGAGCCGGAACTCCGGCTACAACACAAACAAACAAAAATGGGGAAGAAGAAGGGTTACCAATGATTCAATTCCTCCTCATGCAATATAAGGAGATATTTAATACCACCAACCAGTTTACCTCCTAAGAGAGAAGTGGATCACCGAATTTTGACAGTGCCAGGACAGAGGCCAGTGAACGTACGACCGTATAAGTATGGTCATCTCCAGAAGGAAGAAATTGAGAAGTTAGTTGAAGAGATGCTGCAAGCGGGGGTTATCAGACCAAGCCACAATCCTTATTCTAGTCCAGTGCTATTAGTAAAGAAGAAAGATGGGGGCTGGCGTTTATGTGTTGACTACGAAAGGCTCAATCAAGTAACAATAGCAGATAAATTTCCAATTCTAGTGATGAGAGAGCTACTTGATGAATTACATGGGGCAACCATATTCTCTAAACTGGATCTACGTTCAGGTTACCATCAAATTAGAATGAGAGAGGAGGATGTGGAGAAGACAACATTCTGGACATACGAGGGTCACTATGAATTTCTGGTGATGTCGTTTGGGTTATCTAATGCACCAGCCACCTTTCAGTCATTGATGAACCATGTATTTAGACCCTTTCTGAGACATTTTGTACTAGTCTTCTTTGATGATATTCTGGTGTATACTACCGATGTAACAGAGCATGAAAAACACTTGGGTATGGTCTTTGCCATCATGAAGGATAATCAATTGTTTGCTAACCGGAAGAAATGTTTGGGGGCAAGATTGAGATTCGTATTACACAAGAGGGGCCGAATAATTGAGGAACTTCTTAACATAATCGTTGTGTGACCCATCTTGTGTAATACGAATCAATCTTGCCCCCAAACTTCCAGGACCTTTATCTCTAAAGTGATCGAACATCCTCTCCTTCAAGTCCGCCCATGACTCAATTTTCTTTCTATTATTACTCCATCTAAACCAGTTAACCTCACCCTGGCCAAAGCTCACTACAACCACTTTAACCTTCTCTACTTCAGATAACTCATTAATCTTGAAAAAGTGTTCAGCACGGTAGACCCAGGATTCCGGATTCTCACTCACGAAAAAGAGGCATCTCCAGCTTCTTGTACTTGCTTTTGTCGATCGTCCCTGCTCCAGCCTCCACAGAAACCTCCGATTCGTTCATCTTCCCTTTAAGCTTCATAAATGAACCATCGAAGTTCCAGATTCATCCCTTCGCCGGTAAGAACTATTTTCTTTTATGTCTTCGGTCATTTGGTTGAATGCTTTCTTTATCTCCGGCATCATTTCCTTTAGGCCCAATAGTTCCTTTTCGGTACTTCCCAACCTTTCATCCAGTTGCTTGGTTGCCATTGATCTCATCACCACCCCCAAATTTTCGGGCTCTGATACCAATATGTTTGGATCCTACTCTTAAAAACACAATAAATCCCAACAAAGGCAGAAAACAGAGGTGATTCCTCTGGTAGTTTCTGTTATTTAATCAACCCAATGTTCATTCATCAACAACAAGGAAATATGTAAAGAAAAACACACAAAAAGAACAAGCCGAACACCTTAGAGAAGGCTGGCAACTTCTCCCCTAAAAGACACAACAGTCTTTTAAAAAAAAACCCTACCTCACCAATCCCTAAAACATTCTATTTATATTCCCTATCATTAGCGGGCCCCACTCCCTATTCTTTTCCTCTATTCTCTCTCTCAGCCTCTGTCTCCTGTACATTTACTACTGTACCCCTCCTTTTATATTTGTAAATAATAGGAGGTCTTACAAACTCTTCCCATTTCTATTCTTTTTTTGATAATTACACCAAGTTATAACGAAATTTGTTTTGGTTGTGTTGCATTCATTTTTGGTTTTATTATTATTACTTTCTTACTTTTTATTCTCCTAATTGGAGATTGTTTTCTTGTAATTTTTTGTTACTTTTTCATTGATCATATAAAAGTTTATTTCTTGTTGGAAAAAAAAATTACTTTGGAAATTTGAGAAGTATTACTTGGTCATTTTCCTTGGTTTCTTTGATTTATTATCATTATTTGATAGATTAGAATATGAACTTTCATTTAATTAAGGAAAAAAAGTTAAGGCAAAAAGGTAAACAACTAGATGTTTCTATGGCAACAAGGTCACGATCCCTATATGTAATGATGTAAATGATAATGACAATTTGGAAGCAATTGTTGGCATCCTATGGGGATCTAAAAAAGGAAATTTGGCATAGGAAGAAATTTGGCATTATTGGCATCCAAGAAAAGGAAATTCTTAAATCCGTTAGTTCTTTGGATGCTGCCGAACTGAACAATGGGCTTTGCTACCCATGAATTGAGAGAAGGAGCTACTCTAGCTCAACTGGAAGAGTTAATTCTTAAAGAAGATAAGTTGTGGTGACAAAAATGTAAACTCGAATGGAGTTTGGAAGGGGATGAGAACACAAAATTTTTCCGTAATTATGCTAATGCTTGAATAAAGAACATTATCAAAGAAATCCTAAAGGAGTCGGGAGAAAGTATCCTGAATGTCTTGAATGAAAGTCGTGTTCTCATAAAGTAAAGTAAGTAAAGTATCATGAGTAAAGTAAGTAAAGTATCATGACTGAGGATTTGATTGTAATTGAGTTTGTCTTACTGTCTTAACATTGGTGGAACCCATTGATACGACTAATACTTTTAAGGGAATGTTGGAAGAACCCTTTTTTAGAAAGAAATCAAAGAAGCTATCGATGACTTACCAGATGGTTATACGGGAGTATTTCGGACAAAGGTTTTGGAACATCGTTAAAGATGATATTCGAAGGTGTTCCATGACTTTTTTGAAAGTGGCATTTTGAATCATTGCGTCAATGAAACCTACA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MGRRMPLAGMETSVMATDSVEFIDVSVPSSSSREAAITSVASQATTSLTEDHASCVVVGDPPTYLIWRIRKILPHVVELLEFSTSNEFRRIGLRIAFPETLHPAVFVCKNEISSSMGHPFLMYAVTSSGFAYCLKLRNLSSYVSYSAIPLDEVVEFNLQNHLDNKPVTSVSAISGCLVIGRNDGSVSCYKLGSLDQHTPGFEHELRDDSGFNRLLGFISRVKLAGAVQDMVISEVCGRQFLFVLHSDGNLRVWDLSCHSRVLNHSMNIATMAEARFVRLWVGQANADKGTIPLAILYKHPEDLSLETIYIYSLRFSWGDRVSLLLEPSPHSIPLNQGGCLDVKLAYDKIWVLKDNALIFLDLLASDGHSGEAQCYALQEEFVADQLFQSADYSSDAVLWITHSIFSSTKDEVVPFISSIFVRRLLQPGVYNERVLRATLLEYSRHWTDSNFQSMTSDELKQEILSLIEDEGATGTPVSIYLWWKTFCTHYIHHWCTDNAPSFILIDNMSAAVGLVRRNSVSLFRCLDNVEQLLDGFSGELDELGGPDIDWIGNDSDSELLFEVLRCVISISRRLGKTTLAIFYESLMSTPIIPFGEIVGRILKILENGYSSSVVMVKRSDLQAGCGWERELADKKNFRKFSIDMMLSLHTLCKKGASWGRVLDVIESFLKYFVPRKMSQKVQPQTSSDANTSILVHATSQISKVMLESALDVLLFLNYMVSASGQIGLLHDDTSRIKLELIPMIEEIICEWHIINFLATTPSESAAVEDFSSQLSLLQIDTYGGKEIWKGKLGKCDFTLASLLLLKMNSSAEGPVYLSTKCLLNPQDLVLATQNFTSWIIWGSSREPSAFLNTSTELAVVLLRHGQYDAVEYLLSVVKAQSQNEKTSHCMQDADGGWSIMHHLLGCCQLGQAHYKLHGPLKERKVHEAICSFFRASSGNRSFQALQSLPHEVGFSSFESTGCVSSIAWKFHYYQWSMQLFEQYNISKGAFEFALAALELVEEAVSPKDNYCDRLPFNESAITVQGRLWANVFKFALDLHQLYDAYCAIISNPDEESKYICLRRFIIVLYECDAIKILCSGELPFIGLAEKVEQELVWKAERSDLLSRPSLYKLLYAFEIHRHNWQKAASYIYLYSARLRTEGTLGDNQFSSSLVLERLNGVSAAINALHLVHPDFAWIEPLVERDAIQSKHYPSKKAKRTVDKQFGRDDTKPQKQHSYIDMKQLENEFVLTSSEYLLSLANIKWPFTDSHLSGVHEAPLELVDLLVQNNFYDMAFSVILRFWRDSALKRELERVFTAMSLKCCPSRLCSSAILNDPRINSLLLISPNGGGDVHGSLDALPSSQQTDGNGHWETLEVYLEKYKGFNARLPLIVVETLLRADSKMELPLWLVLMFKDGRRPKTWGITGEESNPASLFRLYVEYGRYTEATHLLLECMESFASMPPADIINRKRPFSVCFPYNAVQYLWCKIDELIRSGHMVDACEKLRNLLHGALLNHLRLLKVEGDDILSAVA Homology
BLAST of PI0018801 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C811 (Nuclear pore complex protein NUP160 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP160 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1347.0 bits (3485), Expect = 0.0e+00 Identity = 723/1519 (47.60%), Postives = 1000/1519 (65.83%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q12769 (Nuclear pore complex protein Nup160 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=NUP160 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 117.5 bits (293), Expect = 1.3e-24 Identity = 130/488 (26.64%), Postives = 207/488 (42.42%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Z0W3 (Nuclear pore complex protein Nup160 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Nup160 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 111.7 bits (278), Expect = 7.3e-23 Identity = 127/488 (26.02%), Postives = 205/488 (42.01%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C5M5 (nuclear pore complex protein NUP160 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496931 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2952.9 bits (7654), Expect = 0.0e+00 Identity = 1468/1512 (97.09%), Postives = 1484/1512 (98.15%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C511 (nuclear pore complex protein NUP160 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496931 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2947.9 bits (7641), Expect = 0.0e+00 Identity = 1468/1514 (96.96%), Postives = 1484/1514 (98.02%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C4Y2 (nuclear pore complex protein NUP160 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496931 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2941.0 bits (7623), Expect = 0.0e+00 Identity = 1467/1514 (96.90%), Postives = 1483/1514 (97.95%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C685 (nuclear pore complex protein NUP160 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496931 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2919.8 bits (7568), Expect = 0.0e+00 Identity = 1457/1514 (96.24%), Postives = 1472/1514 (97.23%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C516 (nuclear pore complex protein NUP160 isoform X5 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496931 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2905.9 bits (7532), Expect = 0.0e+00 Identity = 1452/1514 (95.90%), Postives = 1467/1514 (96.90%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. NCBI nr
Match: XP_008457194.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP160 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2952.9 bits (7654), Expect = 0.0e+00 Identity = 1468/1512 (97.09%), Postives = 1484/1512 (98.15%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. NCBI nr
Match: XP_008457192.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP160 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2947.9 bits (7641), Expect = 0.0e+00 Identity = 1468/1514 (96.96%), Postives = 1484/1514 (98.02%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. NCBI nr
Match: XP_008457193.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP160 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2941.0 bits (7623), Expect = 0.0e+00 Identity = 1467/1514 (96.90%), Postives = 1483/1514 (97.95%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. NCBI nr
Match: XP_008457195.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP160 isoform X4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2919.8 bits (7568), Expect = 0.0e+00 Identity = 1457/1514 (96.24%), Postives = 1472/1514 (97.23%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. NCBI nr
Match: XP_011649106.1 (nuclear pore complex protein NUP160 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8651777.1 hypothetical protein Csa_005983 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2910.6 bits (7544), Expect = 0.0e+00 Identity = 1446/1513 (95.57%), Postives = 1473/1513 (97.36%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. TAIR 10
Match: AT1G33410.2 (SUPPRESSOR OF AUXIN RESISTANCE1 ) HSP 1 Score: 1355.1 bits (3506), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/1522 (47.70%), Postives = 1004/1522 (65.97%), Query Frame = 0
BLAST of PI0018801 vs. TAIR 10
Match: AT1G33410.1 (SUPPRESSOR OF AUXIN RESISTANCE1 ) HSP 1 Score: 1339.3 bits (3465), Expect = 0.0e+00 Identity = 723/1528 (47.32%), Postives = 1000/1528 (65.45%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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