
PI0016895 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCCATTTATTCATCTCCGATGAGGAGTTCTCTCGTCACTCCGACGACGCTGCTTTTTTGGCTGAGAAGGCCGATGCTTTCATCCAAGGTCTTCGCAGCGAGCTCGAGACCGTCAGAGCCCAAGCTGATGCTGCTTCAATCACTGCGGAACAGACTTGTTCTCTTCTTGACCAGAAGTTCCTCTCTCTTTCAGCTGAGTTCTCTGACCTCCAGTCTCAGAATGCACAGCTTCAAACGACCCTCGAACACAGGCTCTCCGAGCTTGCAGAAGTCAAGTCCCAAAAACACCAACTCAATTTACTTTCCGTGAGAATACTAATTTTTTTCTCTTTCATTCAATTCGTTTACGCACATGTAATGAATCCCTCCATTTACACCACCTTTCGTTAATTTAAATATTTTAAGCATTGGCTTCTTTGGTGCTTACAGATTGGGAAGGATGGTGAGATAGAGAGGTTAAATACAGAGTTATCTGAACTGCATAAATCAAAAAGACAGTTGATGGAGCTTATTGAGCATAAGGACTTAGAAATTGGTGAAAAAGATTCCACTTTAAAGAGTTATCTTGATAAGATTGTAAGTTCCTTTTACTACTCCGACTTGCCATCCATGTAATGAAATTTGTGGTAATAATTAAAATTTGTGCTTTCCTACTAAAAATGTTTCTTTCTGATCGTTTTGGAGGTCAATTTGTCCGAGACAGCTGCTCAAAGAGAAGCCCGTATAAGCGAGGTCGAAATGGAGTTGGTGCGCTCCCGGGCTGAATTTGCTCGTCTTACACAGGTGATCACTTCCTCATTATCGTCTAGTTTAACCTTTGTTAAGAAACAGATTCACTTTAGACATTTGGATTTTATAATTGATGAATTATCTCTATATGTGATCAAGAATTTAGAAGTTGAAAACGAACTTCCTTCCAGGTATGGGGCTTTGTTGTCACCCTCCATCTTTCATACCCTTCTATCCAAGGGCTTATGGCGATTCCCCTTGGGTATCATTTCAACAGCTTCTTGGAACTATTGTCTGCTTTGGTGTTTGTTTGATGGGAAAGTTTTTTAAAATTTTTAATTCGTCAAGGACTTGCTGAGCACAAAATTGAATTTTCAGGGACCTTTTAGGCACTTTTGAAAGTTTAGGGATAGACACAACCTTAAAGTAGACTAAACTTGTAATTTGATCTTAATTCTGTGTTTTGATTCCTACATATTTCCTATAAAAAAATTCGTTCATATTTATTTCTTTATTCTAAAGAAAAAACTCCTTTCTTCTTATTTTGTGCAGGAGAAAGAACTTATTGAGAGGCATAATGTGTGGCTTAATGATGAATTAACTGCTAAAGTAGGCAATGTCATTGAGCTGCGTAGGCTTCATTCCGATACCGAGGCTGAACTGTCTGCAAAACTTAGAGATGTATGGGGCTTTACAGGAGATTACATTCCATGTCTTACAAAATTTACTGTTGTCAATGCATATCTGGCTGTTCACTTTTTGGTACTTCATTGATTTTAGGTTGAGAGACAGTTGGATGAATGCTCCAGTTCCTTAAAATGGAACAAGGATAGTGTGAAAGAACTTGAGATGAAGCTAACATCTGCACAGGAGGTGTTATATGTTGTTCTATTTTATGCTCAAGAAGTCGAAGTTCTTCCATGTTCTTTTCTATTTTCGAATGCTAGCTAATTCTTACTTGTCCAGGAATTGTGTTCGTCAAGAAGAATGGCTGCAGAAAATGAGGAACGTCTTTGTGCTGAAATATCAACAGTAAGTAGTTTTTTGAACGTTTTTGTTTGACGTTATTTACTTTTTTTATTTGAAATGAAAACTAGCATTATCATTGAAATAATGAAATGAGGCTAATGCTCAAAGTACACGATAGGAGATTGTTGGAATTTCTATTTTTGTACATACATATAGATATTTATCATTTATTGCTTTTATTCTTTCCTTTTTTGTAAAAGGTCTTTCTCCTATATAAGAAAACCAACATTGTATATATTTAATAATAAGGAACAAACAATTTAACTCTCAAATTTAAGTTGGTATTAGAGCCCACAAAGCCAAATAGGTTTTTAGTTCAATAAAAAAATGAGGTTCGACCAAGATTGGTGAACCCAAGAGAGGCACCATCTTGAGGAACATGTTGAGATGTTGAGAATCCCACATTGAAAAAACCAAGGGTATTCACACTCCTTTTTTTTTTTCTGATGAGAAGAGGGACTCACACTCCTTATAAAATAGATGCATTACTCCTCCCGTTGCCAATTGGTTTTGAGATGGAACCCCATTCTATCAAATAAAGACAAAAACCCTTTGAAGAATGCGAGATAGCCTATCTCCTTCATCGGGTTCGAGTAATTCGGCTTCTTCTTCTATGGTTTCGGCTCTTTCCTCACAAGAATCTTCCTCTTCATCTAGTAAAGCCACTGTTTTCCACTAAGGATAAGCATTGGACATATGATCTGTCTGACCGCACCAAAGACACTTTCCAAAGAGGTCAGTTGTATGGATTTCGAGCCTTCTTCTTGGGATCAAGATTTTCTTTCTTTTCACTTCTTTCTTCAGCTTTCTCTTGATCCTTTTCTTTTGCTGCTGGTGGCTGGTTTGTAGTAGTATTCGGTGCATATGCCTTGTTCAAGGAAGTCTCCCACGACCCTTTTCTTTTAGCTCTCTTGGAACGTATTTCATTAATTTCTTCCTCTGTTTCAGCAAATGAACTTGCTTCAGAAAGCCAACTAAAGGGTTAAAGTCTTATCTTTTCCTTGATATCCATGCGTAGGGCTCCCATGAATCTTGCTATTAAATGTTGCTCACTCTCCATCAAGTTTGTTCTTGCACCAAACCGGTGGAACTCTTCCATATACAGTCACTGTTCTTACCCCCTGTCTACGATTTTGATACTGATTATACAGTGTGTGCTCATAGTTTGGCAGTAGAAATCGTTTTTTTCATCAACTTCTTCATGTTTTCCTAGATTGAATCAGCCTCTTTCCTTGCCTTTGCCGATTAACTTCCAATTGGTCCCACCATGCCAATGCACCACCTTTTAACTTTAAAGCTACTAGATGCCTTTTTGTGCTCGGAAGTGTTCATGTAATTGAAGAAGTTTTCCATGTTTTTGATCCATTCCAAGAAGAATTCAATGTTGCGCCTCCCATCGTAACTCAGTAAGTCAATCTTCATTTTGAACTCTTAAGGTTTTCTTCTCTCTTCAAAATGGACACGTTTTCTTCTCCTATATCCATCAAATTCATCGCTTTGATCCTCCTCACTCGAAGAACTCCAATCTTGGAATTCTTCATTCCTTCTTGAAAATTCATCCAAGGTTCTTGGCGTCCTTGATGCTGTCTCTAGTGGCCATATCACCTTGCCTTCTTTCTTGCTGATTTTGACCCAATATTGGCTGCCCGAAACCACGCCTTCCTTGTCTTGCCCACTGTTGATTGAATGCCGGAGCTTCTTCACGATCATGTTGAGGAGGATTCATCAAGTCCAACCTCTGAATTACAACATTCAATGTTTCTTGGATTCCCTTCGATGAAGCTTCAACAGACAGCAAATGTCTTGAAGAAGTTCTTGGCGAAAGGAAGGGAGTATCATCTGCCACTTGTTCTTGAGCGTGCCGCTCCTCCACTATCGGAATGGCAGCCCGCCGGTTGGCCATTTAGTTTGAGGAATCTTGGAAGCTCTGATACCAATTTGGTGTAGCACCAAGAAATCTAATTTTTAGTCAATGAATCTCTCTTTGAAAATGAGATCGGACTTTTATTTATAGAAGGAATTAGCCCTGTTTTTTCTGGCCTTTATATTGGCCCTGTTTTAGACATTATGAGCCTAGGGTTAGGTTTATTCTTTTTATCGCTGTGAGGATATGATGAGGGCACTATGGGGGTGTCAACCTAGTTGAGATGCCCGGGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCTTCTCTTCTCATTGTATAATCCTCTTGTACTTTGAGCTTTTGTCTCTCTATTTTTATTATTTATAATAGTGAGCCTCGTTTCCTTTTCAAAAAGTTTATAGAAGGAATTAGTTACAAAATGTTTAACTAACTAAGATAGTAATTATCATTTAGTTAACTCTTATGCTAGAATTTACAGCAAGGACCTTTCGGCCTTACATCATACATTTAGCTACAATAACACGATTTCAAACCCTCACTTCTTGTAGTATATATCATTTTGTAACCATGTTCTCTCTTAATTTGCAACACAAATTTAATGATTTGTACCCCAGGCACGAACTATTGTTACCCATAGACTATTATAACCCGCATAATATAATAACCAACTCAATGGCTCAAATAGTCCTCGAGTATTCCTCTGATTTTATTCAGATGGTTTTCTAACATGTGACTTAAAAATTATGGAGCTTGGATGAAGCTAATTATTTGATCATTAGAGCTTTGTGTTTATTAACATCGGGGTTGACCATAGTGGTTAATTAAGTGGCCTCGGACACAATGATAACATTGCTTAATTTCCTTGTCAGGTGCTTGCATCTTTGTAGAAACGTGTGAGGTCTAACATCTTACTTGTTTATTAATGTTCTTTTTTCTTGGGTTTTGGTTGCTTTCTATTCTTTCATTTTTCTTTATAAAAACTTCATTTTTCTATCAGTTTTTTACTTGTTTATTAGCTGTTAATGTATTATAGGTGGATTTGATCCATATTTTTGAATTGGCAATTGTCGTAAGATCTAGGTACCTTCGGGTCTCAAAAATAGAATTTTATTTCCAACTGATTCCATATGGAAACATGTCAAACTAATTTTTATTATATATTTTGACATTAGCATTTTATTATATCCCAATGCCCTTAAATTTGCTGTCAAGAGGGAATCACTTGGAAGCAATGAGAGTATAGCGATTCTGACATCTCATTGTTAATTGACTTTGTAGGTCAATAAGCTTGTTGAACTTTACAAAGAAAGTTCTGAGGAGTGGTCTAAGAAGGCAACAGAACTTGAGGGTGTCGTAAA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ATGGCCCATTTATTCATCTCCGATGAGGAGTTCTCTCGTCACTCCGACGACGCTGCTTTTTTGGCTGAGAAGGCCGATGCTTTCATCCAAGGTCTTCGCAGCGAGCTCGAGACCGTCAGAGCCCAAGCTGATGCTGCTTCAATCACTGCGGAACAGACTTGTTCTCTTCTTGACCAGAAGTTCCTCTCTCTTTCAGCTGAGTTCTCTGACCTCCAGTCTCAGAATGCACAGCTTCAAACGACCCTCGAACACAGGCTCTCCGAGCTTGCAGAAGTCAAGTCCCAAAAACACCAACTCAATTTACTTTCCATTGGGAAGGATGGTGAGATAGAGAGGTTAAATACAGAGTTATCTGAACTGCATAAATCAAAAAGACAGTTGATGGAGCTTATTGAGCATAAGGACTTAGAAATTGGTGAAAAAGATTCCACTTTAAAGAGTTATCTTGATAAGATTGTCAATTTGTCCGAGACAGCTGCTCAAAGAGAAGCCCGTATAAGCGAGGTCGAAATGGAGTTGGTGCGCTCCCGGGCTGAATTTGCTCGTCTTACACAGGAATTGTGTTCGTCAAGAAGAATGGCTGCAGAAAATGAGGAACGTCTTTGTGCTGAAATATCAACAGTCAATAAGCTTGTTGAACTTTACAAAGAAAGTTCTGAGGAGTGGTCTAAGAAGGCAACAGAACTTGAGGGTGTCGTAAAAGCCTTGGAGACACATTTGAACCAAATTGAGAGTGATTATAAAGAAAAGCTTGTAAAGGAAGAATCTCAAAGGAATCGTTTGGAAGAGGAGGCTACAAATTTGAAAGTGAAACTGGAAAAGTGTGAAGCGGAGATTGAACTTAGTAGGAAAAGAACGAACTCACTCTTTTCCCCCTTGGCAGCTTTTCTCCAGATTTTGATAAACCCAAAGGAGAATAGTGATGTGGTTGGTGAGAATCACAACTTCGACCCCAGGGTTCCTGTAGGTGTTTCTGGGACAGCATTAGCTGCTTCGCTTTTGCGTGATGGTTGGAGTTTAGCCAAAATGTATGCCAAGTACCAGGAAACTGTGGATGCTTTGCGGCACGAGCAGATGGGAAGGAAAGATGCTGAGGCAGTTCTGCAGAAGGTGCTATATGAACTTGAAGATAAAGCAGAAGTCATTTTAGAGGAAAGAGCGGAACATGAGAGAATGATCGAGTCATATTCCCTGCTAAACCAAAAGTTGCAAAATTCTATATCTGAACAGGAAATCCTGGAGAAAACTCTCCAAGAATTGAAGGCTGATTTGAAGAGACATGAGCGTGATTATTTGTTAATTCATAGAGAGAACATCGACCTTTCAAGACAGGTTACAATTCTTCTAAAGGAATGTCGAGATGTGCAACTTCGCTGTGGATATGAAGGAAATGATGTTCTCGAGAATCTTTCAAAACCTACGTCCTTTGCGATCGATGTGGAATCTGATGCTGACAGAGTTATTTCTGAATATCTTTTAACCTTCAAGGACATAAATGGATTAGTTGAGCAGAATGTCCAGCTTAGAAGCCTTGTACGTAAACTTTCTGTGCAGCTTCAAGATACAGAGCTTGATTTCAAGGAGAAATTGGAGGCTGAACTGAAAAGGAAAACTCAAGAAGCTGCTTCTAGAGTTGAAGCAGTGTTACAAAAAGTTGAAGAGCAGGGGCAGATGATTGAGTCCCTTCATGCTTCCGTCGCCATGTACAAAAGGCTATATGAAGAGGAGCATAAGCGTAATTTGCCTCTTCCCCTGTCTGTTGGAGTTGCTCGAGGTTTGTTTTTATATACTTGTTAA MAHLFISDEEFSRHSDDAAFLAEKADAFIQGLRSELETVRAQADAASITAEQTCSLLDQKFLSLSAEFSDLQSQNAQLQTTLEHRLSELAEVKSQKHQLNLLSIGKDGEIERLNTELSELHKSKRQLMELIEHKDLEIGEKDSTLKSYLDKIVNLSETAAQREARISEVEMELVRSRAEFARLTQELCSSRRMAAENEERLCAEISTVNKLVELYKESSEEWSKKATELEGVVKALETHLNQIESDYKEKLVKEESQRNRLEEEATNLKVKLEKCEAEIELSRKRTNSLFSPLAAFLQILINPKENSDVVGENHNFDPRVPVGVSGTALAASLLRDGWSLAKMYAKYQETVDALRHEQMGRKDAEAVLQKVLYELEDKAEVILEERAEHERMIESYSLLNQKLQNSISEQEILEKTLQELKADLKRHERDYLLIHRENIDLSRQVTILLKECRDVQLRCGYEGNDVLENLSKPTSFAIDVESDADRVISEYLLTFKDINGLVEQNVQLRSLVRKLSVQLQDTELDFKEKLEAELKRKTQEAASRVEAVLQKVEEQGQMIESLHASVAMYKRLYEEEHKRNLPLPLSVGVARGLFLYTC Homology
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4GSN8 (Nuclear-pore anchor OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUA PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 590.5 bits (1521), Expect = 2.1e-167 Identity = 347/650 (53.38%), Postives = 453/650 (69.69%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F1MA98 (Nucleoprotein TPR OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Tpr PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 1.1e-17 Identity = 130/559 (23.26%), Postives = 255/559 (45.62%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P12270 (Nucleoprotein TPR OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TPR PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 6.9e-17 Identity = 142/586 (24.23%), Postives = 262/586 (44.71%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F6ZDS4 (Nucleoprotein TPR OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tpr PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 6.9e-17 Identity = 129/559 (23.08%), Postives = 253/559 (45.26%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A1Z8P9 (Nucleoprotein TPR OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Mtor PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 79.7 bits (195), Expect = 1.2e-13 Identity = 123/606 (20.30%), Postives = 274/606 (45.21%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K927 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G251650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1018.1 bits (2631), Expect = 1.5e-293 Identity = 557/591 (94.25%), Postives = 569/591 (96.28%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V762 (Nuclear-pore anchor isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold357G00370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 994.6 bits (2570), Expect = 1.8e-286 Identity = 564/665 (84.81%), Postives = 570/665 (85.71%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLY3 (nuclear-pore anchor isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455457 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 925.2 bits (2390), Expect = 1.3e-265 Identity = 526/665 (79.10%), Postives = 556/665 (83.61%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GN72 (nuclear-pore anchor isoform X4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455457 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 925.2 bits (2390), Expect = 1.3e-265 Identity = 526/665 (79.10%), Postives = 556/665 (83.61%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I2E6 (nuclear-pore anchor isoform X4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468397 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 924.1 bits (2387), Expect = 3.0e-265 Identity = 525/665 (78.95%), Postives = 555/665 (83.46%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. NCBI nr
Match: KAA0062817.1 (nuclear-pore anchor isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 994.6 bits (2570), Expect = 3.7e-286 Identity = 564/665 (84.81%), Postives = 570/665 (85.71%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. NCBI nr
Match: XP_011659057.1 (nuclear-pore anchor isoform X2 [Cucumis sativus] >KAE8646121.1 hypothetical protein Csa_016255 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 985.3 bits (2546), Expect = 2.3e-283 Identity = 557/665 (83.76%), Postives = 569/665 (85.56%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. NCBI nr
Match: XP_011659056.1 (nuclear-pore anchor isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 985.3 bits (2546), Expect = 2.3e-283 Identity = 557/665 (83.76%), Postives = 569/665 (85.56%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. NCBI nr
Match: XP_038887699.1 (nuclear-pore anchor isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 938.7 bits (2425), Expect = 2.4e-269 Identity = 536/665 (80.60%), Postives = 557/665 (83.76%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. NCBI nr
Match: XP_023511435.1 (nuclear-pore anchor isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 931.8 bits (2407), Expect = 3.0e-267 Identity = 528/665 (79.40%), Postives = 558/665 (83.91%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. TAIR 10
Match: AT1G79280.1 (nuclear pore anchor ) HSP 1 Score: 590.5 bits (1521), Expect = 1.5e-168 Identity = 347/650 (53.38%), Postives = 453/650 (69.69%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. TAIR 10
Match: AT1G79280.3 (nuclear pore anchor ) HSP 1 Score: 590.5 bits (1521), Expect = 1.5e-168 Identity = 347/650 (53.38%), Postives = 453/650 (69.69%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016895 vs. TAIR 10
Match: AT1G79280.2 (nuclear pore anchor ) HSP 1 Score: 590.5 bits (1521), Expect = 1.5e-168 Identity = 347/650 (53.38%), Postives = 453/650 (69.69%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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