
PI0009909 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCACAACATTCTTCCTCTTCCCAATCCGATCTATCTCTTTCTCGCAACTCTTCTCTCAGTCGTCTCAACGCTCAGGCTCCTGAGTTCGTCCCCACTCGTCCCTCCACTCGTCCCGATCTACAACCACTGCCTCCTCCACCCAAGCAATCTCCACGTATTCTCATCCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGCTATGATGCATGGTTATCCTCCCCCTCCTCCTGGATCTCCCTTCCATGTTCCCATTCAGACCACCCCTGTCCCTGTCCCTGTCCCCACTCATGTCGTTTCCATTCAAAATCATCCCTATCATCCTCATCATCGCCACCACCACCATTCTCATCACGTTCCTGTGCTTTATCACCCTCATAATCCTCAGTATTATGCGGACAATGGCGGTTTTCATGACCCCGACACGCCGGTTGTGCAGCCAGCTCAGAAGCCTCTGGTTGAGTCCGACTACGCTGCTCCATCTAGGAGTAACTCACCGATGAAGTCTCCCAAAAGCTTTTGAATCAGGTTGCCTTTTTCTTTGGACTACTAGATCTTTTATGTTATGTTCCTCTCTTTGCCAATATTTTGTTATCTGCTAATGGAGCTATTGTGTTTTGGGCCTGCGAATGCTGTTGCTTCTATAGGCATTGAGTTAGCTGCTAGTCGTGGCTACTTGAAAAAGTTTTCAGAACTTGCTGGGAATTTTGTTCTGGTCTCTCTTTTCCTGTTGTCGTTATCTGCAAAATTTATGTTTGCTTGAGACTGTAGATTAGCTACCAACTTGCCTTCTCTGATGTTGGATCTTTGGATGGAAAAAGTGTGTCTGCTATCCGTAATTGATTGCTACCTTTTATGGTCGAGAAAATACGAAACTACAAAGTAAATGTAGCAAGTAAGATCTATCTTTCCAAGAGTGCCTTCTTTAAGCTTAAACATTAAGTGCCATAGAGTTCGTAGAAGATGAAAATGCTGCAAAATTGCTTTCTATTGCTCAGTTTTTCACTTTTGATGAAACTACTCAACTAAATCATATTATGTTGCAGAGAAGAAGGTCTATTCTTTAAGTCAGACAATTACATACATGGTCTGACCCATCTGCTAAAGTGAAGCAAACACCTAGTTCACAATAAAGAAAGCTTCTACCCCATTTGTAGGGAGGTGGAAACTGTTAATTTCTTTCTAACTTTGGTCACATAGGCTTAAATAGGGCTTTGAGGCCTTTTGTTCTAAGAAAGTTATGGTTTTCTTGTGGATCCTTTTTTTTGAAAGACTAAACACCTACGATCAGAGCATCCTTTGAAATTATGGTCTTTTCCTTATTGCCAGAAAGCTTCAGATGCCCTTCTACAGTTAGTTGAAGGCTCTCAATTTAATGCTCAGGCGAAAATCCTTTGGTTCAACGGGATCTCACTCTCCTTTGGAGGCTTTAGTTTGAAAGAAGCTCTAGAATTTTTCATGATCAAGAAACTAACAGCGACTTCTTTTGGAGTTTGAGTACTCTTTTTGCTTCTACTTGATCCTTTACTTCTAAATTCTCTTTTAATTATAGCCTAACCCAAATACTAGTTGGGCTTCTTTTTTGTAAGTTGTTATGTGGGTTTTTCATTTTCATTTTAATTTGTCCCAATTTCAGACACTTATGGGACTCACAAGACGAAAGTAGACATGTTGAGGCATACTCTAGGGATGTGGATGAATTTCGAGAAGAGAAAATGAAGAAATCTATGTTTGAGGTGTAGATGAAAATCTAGGTTTAAGAAAATTGGGTGAAGAATAACCGATGGGGTGTCAACCTAGTTGAGATGCCAGTGTGCACCTAATCCTAGTATGTTCTTGTACTATGAGACTTTGTCTCTTTTCATTAAATCAATGAAAAGTACGTTTCCATTTAAAAAAAAGACAAGAGATGGGAAATATTCGAATATGCCCAACACCATTGAACCCCATGAGTTTATCTAATAAACCCAAGTTTGACAAACTAATGAGGTAAACATGCTGCCCAATTCTAAACTCTCTCCCAAACTCATCCCTTTCCCTTTTAGTCCCTTAATTGTCTAGGGCATCTTGGATCCAACATTGTATAATTACTGATCTACTTCAATATGCTGATGTTTTGGAGGGCTCAAAGCTGTTAGTATATCAATATCTTTTGCTTATAGAAGGGACTGTAGAACATGATCTTGAAGGTTGCATATCAACCTCTGCTTTTTGGGAGGATAGTTAACATACTAACCACCATAACACTTTGGATCATTTATCTGCTGGATGATGACTTTCCATTGTCGTCCATAAGACTAATTGATTGGTTGCAAATTGCATGAAAGGTGATGCTATAAAAGAATCTTTAAAGCTGTCAAATGGATTTTCTCATCTATCGTATAGCTCTTAGGAGTAACAATTGAAGTAGGTACCTTATAAAGTTTCGACTGTTCCTATGACCTGACACTAAGGGGCAAAAAAAAAAAAAAAAATGGAGTGGGTTGTGGAACTATGGATTTTGAAGTTGCTATAGTGGTGAACTGTTTTTTCAGTTTCTTTATGATGTAATTCTTAAAACAGGGAGTTGCTTCACGTATTTATCTCCTTGGCCTGGAGGTGCTGTTCCAATTGTTTATGTAATTGTGCTGAGGTTGGTATCGTTGAGAATAATTAGGCTAATGCCCTTGATGACTGGAAACTACCACTTACACTTGGAAATTGAATAAAATTTAAATCTTCTACTCATAATTAATTACAAAAGGCAGCTATTACTTGTTTTAAGGATGTTGAAGCTGACATTTTCAAGATTATATATAATGCTTGCTGTGACAATAGAATCCAACACTTTGAGGTTTTTGACATTCAGTCCCTGGGTTTTACTTCTGTGATTATTGAAGTAAATTTATGTTGAAAGTTTCTAATGATTGCCAGTTTTAGTAAGTGGGATTATTCCTTAAAGCTTTTGGTGCTCAATATTCTTTCAAATAGTTTAACTTTGGTGTTTTTCTTTGATGACTTTTGAATGATAAATTTAAATGTTTGTGACTGTCCGTCTAGGATGTTGTTTAACAAATGTACTTTGAAAATTGAAGTCAGTAGAAGGTATATAAGTTATCCAAGACTCTTCCAACGGTTATTATTTAAGGGGCCTTTGGGACAAGTACTACATAAGACTATTATAACTACCTCTTGCCACAGTAAATACTATTTAAAAGTATCCAATTAGCTTACAGTAAACACTATTTCATAATCCTCATTTGCTACAGTGTTTTCTATTTGCTACAATTTTTATTATTTTACATTCATCATTTTTTATTATTTGCTACAGTGTTTACTATTTCCCTCTCAAACTAAAGTAGTTTACATCTCAAGCACATACTATTATAACTCAAACTAAAAGAATCTACACCCCAACACAAAGTATTATAATTCAACTATAATAACCAATTCCTTGCCTCAAACGGCCCCTTAAAAGTTGAATGGTTGATTTAGTAGGTTTGGTGCCTCTACTATGTTTTTAAACGTCCAATATTAATTGGATATTTTTGTTAAACTGGAATGCTTTTATCTTTTCTAATAGTTAAAATCTTTGTTTTAGTCTTGTTTTACTCTTTTTATTGGAAAGTCTGAGTATTATGCTTTGTATCCTCCTTTGTACTTTGAGCATTAGATTCAATGAAAGTTCTTATTTCCGTTTGAAAAAAAAAACAAAAGATATTGCTTTCTATACTTTTTGTATAGCCTTGTTCACTTCATTGATTTCTTTGCAAAATCATGGTTTTTAGGTGGAATATTATTTCAGTGATTTAAACTTGGCGACTACTGATCATTTGATGAGGTTCATCAATAAAGATCCCGATGGATATGGTAAGATCCTCTCATGGCATCTTTATTTGAATTTCACAAGTTGATGTGTCGAACTTCTGCTTTTACCATCCCACCACAGGAGGATTGTTTGGTGTTAAATTCACAACTTAATGGTAATTTAGAATGACCTCTTAGAATAGTCAACTGGACTGCCTTCGCCATCTCTCTCTTATGAACCCTTCACCTGAGTAAGGTCCATTTTAATTCAGTTCCTATATCGGTTGTTGCATCATTCAAGAAGATTAAGGCTCTCATTAATAGTCACTTTCAGCTAGCCAATATTTTGCGGAACTCTTCTAAGCTTGTGAGTATTTCATCTGTTCGTGCTTTACCATTGTTGTTCTCGAGTTATTCTCAATTGTCTTTCTAGTTCTGTCCACCTCATGTTTTTTGGTTCAATATGCTGTAGTTGGTAAGTGAAGACGGAAAGAAAGTCAAACGTAAGCAACCATTTTCTGAGTCAGATATGGAGGAGCTGCAAGTAGGGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTGTGTTTTTTTTTTAAATTTTAAATTTAATGTTTCAATAAATTTTGTAAAAATTAGTTTAATTTTAAACCTTGTGGATCGGTTCTGTTTTGCATTTTCACATTTTTGATGGTTCCATCCCATTGTCCAGAATAATATATTATTGATTTTCAAACCAATGCATTAAATCTTTGCATGTTGTCTCTTGTTTTACTTGCCCCCTGTAGTCTCGTATAGTAATTGCGGAGAACTTACCTGAGGATCATTGCCACCAAAACCTCATGAAGATATTTTCTGCTGTTGGGAGGTACAAGTATTGCATGATTTTGTTGCATGTTCTTCAGCAACTTGCTAAAGTTATATTGAATTACCATGCTGCTTTACTCTTTGCCAGTGTTAAGAATATTCGAACTTGTCAACCTCAAATCTCAGATGGTGGAGCTTCTTCAACATCTAAATCCGCAAAAGCTGATGGAGTGCATTACAGTAACAAGGTATACTTATTTGCTGTAGCATGGGGTATCCGGGATTTCTGCTACTATCCTTTTTCTCCTTTAACCTCTAGAATTGCAGGGACAATGCATGATTTCCTTAAAGTCTCTGCTGTAGGGATTATCCTCAATCTCCATAATGATTGGTTCCAAATCAAATGGGGAACACCGGTT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MAQHSSSSQSDLSLSRNSSLSRLNAQAPEFVPTRPSTRPDLQPLPPPPKQSPRILIPSPPPPPPPAMMHGYPPPPPGSPFHVPIQTTPVPVPVPTHVVSIQNHPYHPHHRHHHHSHHVPVLYHPHNPQYYADNGGFHDPDTPVVQPAQKPLVESDYAAPSRSNSPMNDLNLATTDHLMRFINKDPDGYVPISVVASFKKIKALINSHFQLANILRNSSKLLVSEDGKKVKRKQPFSESDMEELQSRIVIAENLPEDHCHQNLMKIFSAVGSVKNIRTCQPQISDGGASSTSKSAKADGVHYSNKLHAFVEYESVELAEKAVAELNDEGNWRNALRLRLMLSCSSKSAPVRGKKGHNGEMNYKDVDTSEQPAIEKHVDDLSDQVDVHPPEQVIILRHSCVVVPLRGLSVPKLQIT Homology
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80567 (La-related protein 6B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LARP6B PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 318.2 bits (814), Expect = 1.4e-85 Identity = 217/426 (50.94%), Postives = 270/426 (63.38%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LHL3 (La-related protein 6C OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LARP6C PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 183.3 bits (464), Expect = 5.4e-45 Identity = 106/239 (44.35%), Postives = 148/239 (61.92%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94A38 (La-related protein 6A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LARP6A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 1.1e-29 Identity = 75/184 (40.76%), Postives = 109/184 (59.24%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZWE3 (La-related protein 7 OS=Danio rerio OX=7955 GN=larp7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 5.7e-10 Identity = 52/159 (32.70%), Postives = 83/159 (52.20%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q28G87 (La-related protein 7 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=larp7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 66.6 bits (161), Expect = 7.4e-10 Identity = 48/159 (30.19%), Postives = 78/159 (49.06%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TGF6 (La-related protein 6B isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold67G003570 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 717.2 bits (1850), Expect = 3.9e-203 Identity = 378/405 (93.33%), Postives = 383/405 (94.57%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BHG3 (la-related protein 6B isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489697 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 716.8 bits (1849), Expect = 5.0e-203 Identity = 377/405 (93.09%), Postives = 383/405 (94.57%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BHP7 (la-related protein 6B isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489697 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 715.7 bits (1846), Expect = 1.1e-202 Identity = 377/404 (93.32%), Postives = 382/404 (94.55%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGU3 (la-related protein 6B isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489697 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 715.7 bits (1846), Expect = 1.1e-202 Identity = 377/404 (93.32%), Postives = 382/404 (94.55%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I3E0 (la-related protein 6B-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470630 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 630.2 bits (1624), Expect = 6.2e-177 Identity = 351/417 (84.17%), Postives = 362/417 (86.81%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. NCBI nr
Match: KAA0041938.1 (la-related protein 6B isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 717.2 bits (1850), Expect = 8.0e-203 Identity = 378/405 (93.33%), Postives = 383/405 (94.57%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. NCBI nr
Match: XP_008447186.1 (PREDICTED: la-related protein 6B isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 716.8 bits (1849), Expect = 1.0e-202 Identity = 377/405 (93.09%), Postives = 383/405 (94.57%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. NCBI nr
Match: XP_031744248.1 (la-related protein 6B isoform X2 [Cucumis sativus] >KAE8646076.1 hypothetical protein Csa_016910 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 716.5 bits (1848), Expect = 1.4e-202 Identity = 379/404 (93.81%), Postives = 382/404 (94.55%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. NCBI nr
Match: XP_008447187.1 (PREDICTED: la-related protein 6B isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 715.7 bits (1846), Expect = 2.3e-202 Identity = 377/404 (93.32%), Postives = 382/404 (94.55%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. NCBI nr
Match: XP_008447184.1 (PREDICTED: la-related protein 6B isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 715.7 bits (1846), Expect = 2.3e-202 Identity = 377/404 (93.32%), Postives = 382/404 (94.55%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. TAIR 10
Match: AT2G43970.1 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 318.2 bits (814), Expect = 1.0e-86 Identity = 217/426 (50.94%), Postives = 270/426 (63.38%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. TAIR 10
Match: AT2G43970.2 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 282.3 bits (721), Expect = 6.1e-76 Identity = 204/426 (47.89%), Postives = 255/426 (59.86%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. TAIR 10
Match: AT3G19090.1 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 183.3 bits (464), Expect = 3.9e-46 Identity = 106/239 (44.35%), Postives = 148/239 (61.92%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. TAIR 10
Match: AT5G46250.1 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 7.8e-31 Identity = 75/184 (40.76%), Postives = 109/184 (59.24%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009909 vs. TAIR 10
Match: AT5G46250.2 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 7.8e-31 Identity = 75/184 (40.76%), Postives = 109/184 (59.24%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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